MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 60723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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38002	NC_015850	CACC	2	8	1845646	1845653	25 %	0 %	0 %	75 %	340782528
38003	NC_015850	AGCC	2	8	1845681	1845688	25 %	0 %	25 %	50 %	340782528
38004	NC_015850	CTC	2	6	1845698	1845703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340782528
38005	NC_015850	GCC	2	6	1845728	1845733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782528
38006	NC_015850	ACG	2	6	1845738	1845743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782528
38007	NC_015850	GC	4	8	1845754	1845761	0 %	0 %	50 %	50 %	340782528
38008	NC_015850	TTC	2	6	1846076	1846081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340782528
38009	NC_015850	ACC	2	6	1846095	1846100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782528
38010	NC_015850	CG	4	8	1846122	1846129	0 %	0 %	50 %	50 %	340782528
38011	NC_015850	CAG	2	6	1846211	1846216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782528
38012	NC_015850	GCC	2	6	1846251	1846256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782528
38013	NC_015850	AGCG	2	8	1846302	1846309	25 %	0 %	50 %	25 %	340782528
38014	NC_015850	CGCCAC	2	12	1846310	1846321	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	340782528
38015	NC_015850	GAG	2	6	1846379	1846384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782528
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38020	NC_015850	GAC	2	6	1846591	1846596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782528
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38023	NC_015850	CAG	2	6	1846655	1846660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782528
38024	NC_015850	GACGA	2	10	1846691	1846700	40 %	0 %	40 %	20 %	340782528
38025	NC_015850	GC	3	6	1846709	1846714	0 %	0 %	50 %	50 %	340782528
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38031	NC_015850	GCCTTG	2	12	1847093	1847104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782529
38032	NC_015850	GAG	2	6	1847197	1847202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782529
38033	NC_015850	GC	3	6	1847242	1847247	0 %	0 %	50 %	50 %	340782529
38034	NC_015850	GTTGCA	2	12	1847277	1847288	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	340782529
38035	NC_015850	GTC	2	6	1847350	1847355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782529
38036	NC_015850	GCG	2	6	1847375	1847380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782529
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38038	NC_015850	GAT	2	6	1847512	1847517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782529
38039	NC_015850	TCT	2	6	1847523	1847528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340782529
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38041	NC_015850	CGA	2	6	1847635	1847640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782529
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38051	NC_015850	CGC	2	6	1848082	1848087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782530
38052	NC_015850	GAT	2	6	1848194	1848199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782530
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38054	NC_015850	CCG	2	6	1848422	1848427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782530
38055	NC_015850	GCT	2	6	1848449	1848454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782530
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38058	NC_015850	TAGGG	2	10	1848524	1848533	20 %	20 %	60 %	0 %	340782530
38059	NC_015850	GCA	2	6	1848584	1848589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782530
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38101	NC_015850	GCAG	2	8	1850827	1850834	25 %	0 %	50 %	25 %	340782533
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38114	NC_015850	GC	3	6	1851437	1851442	0 %	0 %	50 %	50 %	340782533
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38116	NC_015850	GCG	2	6	1851607	1851612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782533
38117	NC_015850	TGC	2	6	1851672	1851677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782533
38118	NC_015850	CGA	2	6	1851700	1851705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782533
38119	NC_015850	ATG	2	6	1851776	1851781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782533
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38123	NC_015850	CTG	3	9	1851881	1851889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782533
38124	NC_015850	CT	3	6	1851898	1851903	0 %	50 %	0 %	50 %	340782533
38125	NC_015850	TCTGG	2	10	1851949	1851958	0 %	40 %	40 %	20 %	340782533
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38129	NC_015850	TGGCC	2	10	1852309	1852318	0 %	20 %	40 %	40 %	340782533
38130	NC_015850	CG	3	6	1852326	1852331	0 %	0 %	50 %	50 %	340782533
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38135	NC_015850	CGC	3	9	1852571	1852579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782533
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38152	NC_015850	C	6	6	1853334	1853339	0 %	0 %	0 %	100 %	340782533
38153	NC_015850	CTG	2	6	1853420	1853425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782533
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38168	NC_015850	AAT	2	6	1854246	1854251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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38171	NC_015850	TAC	2	6	1854286	1854291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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38202	NC_015850	AAC	2	6	1855684	1855689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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38220	NC_015850	CGT	2	6	1856567	1856572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38221	NC_015850	AT	3	6	1856636	1856641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38222	NC_015850	ACA	2	6	1856644	1856649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340782538
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38229	NC_015850	ACC	2	6	1857045	1857050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782538
38230	NC_015850	CCA	2	6	1857072	1857077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38231	NC_015850	CAC	2	6	1857104	1857109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38232	NC_015850	TGA	2	6	1857144	1857149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38233	NC_015850	T	6	6	1857186	1857191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38234	NC_015850	GC	3	6	1857249	1857254	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38235	NC_015850	TCG	2	6	1857331	1857336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38236	NC_015850	CGCC	2	8	1857365	1857372	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
38237	NC_015850	AGG	2	6	1857385	1857390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38238	NC_015850	CGCC	2	8	1857431	1857438	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
38239	NC_015850	GC	3	6	1857446	1857451	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38240	NC_015850	AACCA	2	10	1857456	1857465	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
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38276	NC_015850	TA	3	6	1860122	1860127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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38352	NC_015850	GCCA	2	8	1863786	1863793	25 %	0 %	25 %	50 %	340782545
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38355	NC_015850	CTG	2	6	1864010	1864015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782545
38356	NC_015850	GCT	2	6	1864020	1864025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782545
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38369	NC_015850	CA	3	6	1864490	1864495	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38370	NC_015850	AGCA	2	8	1864513	1864520	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38371	NC_015850	AACC	2	8	1864561	1864568	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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38475	NC_015850	GCA	2	6	1871147	1871152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782555
38476	NC_015850	GAA	2	6	1871383	1871388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340782555
38477	NC_015850	GCC	2	6	1871397	1871402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782555
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38481	NC_015850	TAG	2	6	1871729	1871734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782556
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38483	NC_015850	GTC	2	6	1871811	1871816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782556
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