MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 60723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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37502	NC_015850	CTC	2	6	1823367	1823372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340782509
37503	NC_015850	CGGTGC	2	12	1823378	1823389	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	340782509
37504	NC_015850	CCG	2	6	1823423	1823428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782509
37505	NC_015850	AAGGCA	2	12	1823476	1823487	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	340782509
37506	NC_015850	ACC	2	6	1823644	1823649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782509
37507	NC_015850	GTC	2	6	1823766	1823771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782509
37508	NC_015850	CGG	2	6	1823780	1823785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782509
37509	NC_015850	CCAG	2	8	1823834	1823841	25 %	0 %	25 %	50 %	340782509
37510	NC_015850	GCT	2	6	1823858	1823863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782509
37511	NC_015850	CGTC	2	8	1823891	1823898	0 %	25 %	25 %	50 %	340782509
37512	NC_015850	GCA	2	6	1823906	1823911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782509
37513	NC_015850	TGC	2	6	1823923	1823928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782509
37514	NC_015850	GTT	2	6	1823958	1823963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340782509
37515	NC_015850	CCA	2	6	1823987	1823992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782509
37516	NC_015850	C	6	6	1824003	1824008	0 %	0 %	0 %	100 %	340782509
37517	NC_015850	CGA	2	6	1824022	1824027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782509
37518	NC_015850	CGC	2	6	1824029	1824034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782509
37519	NC_015850	GC	3	6	1824175	1824180	0 %	0 %	50 %	50 %	340782509
37520	NC_015850	GCA	2	6	1824253	1824258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782509
37521	NC_015850	CGG	2	6	1824278	1824283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782509
37522	NC_015850	CGA	2	6	1824305	1824310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782509
37523	NC_015850	GGC	2	6	1824375	1824380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782509
37524	NC_015850	CGC	2	6	1824390	1824395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782509
37525	NC_015850	GCA	2	6	1824469	1824474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782509
37526	NC_015850	CTG	2	6	1824483	1824488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782509
37527	NC_015850	TGCCG	2	10	1824493	1824502	0 %	20 %	40 %	40 %	340782509
37528	NC_015850	GCA	2	6	1824535	1824540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782509
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37532	NC_015850	CGGG	2	8	1824683	1824690	0 %	0 %	75 %	25 %	340782510
37533	NC_015850	CGG	2	6	1824732	1824737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782510
37534	NC_015850	ACT	2	6	1824750	1824755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782510
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37537	NC_015850	TGA	2	6	1824794	1824799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782510
37538	NC_015850	GGT	2	6	1824806	1824811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782510
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37543	NC_015850	TC	3	6	1825058	1825063	0 %	50 %	0 %	50 %	340782510
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37546	NC_015850	TG	3	6	1825232	1825237	0 %	50 %	50 %	0 %	340782511
37547	NC_015850	GTC	2	6	1825245	1825250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782511
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37554	NC_015850	ACC	2	6	1825659	1825664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782512
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37561	NC_015850	CGTC	2	8	1825984	1825991	0 %	25 %	25 %	50 %	340782512
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37569	NC_015850	CG	3	6	1826208	1826213	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37570	NC_015850	GAAG	2	8	1826257	1826264	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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37584	NC_015850	A	6	6	1826699	1826704	100 %	0 %	0 %	0 %	340782513
37585	NC_015850	CG	3	6	1826720	1826725	0 %	0 %	50 %	50 %	340782513
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37590	NC_015850	CG	3	6	1826901	1826906	0 %	0 %	50 %	50 %	340782513
37591	NC_015850	GGC	2	6	1826925	1826930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782513
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37615	NC_015850	CAT	2	6	1827780	1827785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782514
37616	NC_015850	CCG	2	6	1827854	1827859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782514
37617	NC_015850	GGA	2	6	1827929	1827934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782515
37618	NC_015850	CAT	2	6	1827935	1827940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782515
37619	NC_015850	CGA	2	6	1827949	1827954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782515
37620	NC_015850	TGC	2	6	1827968	1827973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782515
37621	NC_015850	TCG	2	6	1828000	1828005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782515
37622	NC_015850	ACA	2	6	1828042	1828047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340782515
37623	NC_015850	GAA	2	6	1828073	1828078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340782515
37624	NC_015850	GGC	2	6	1828103	1828108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782515
37625	NC_015850	GCA	2	6	1828169	1828174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782515
37626	NC_015850	GCT	2	6	1828202	1828207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782515
37627	NC_015850	CAA	2	6	1828277	1828282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340782515
37628	NC_015850	GGT	2	6	1828316	1828321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782515
37629	NC_015850	ACG	2	6	1828330	1828335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782515
37630	NC_015850	CGC	2	6	1828349	1828354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782515
37631	NC_015850	GGC	2	6	1828361	1828366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782515
37632	NC_015850	CGACAT	2	12	1828391	1828402	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	340782515
37633	NC_015850	GCG	2	6	1828440	1828445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782515
37634	NC_015850	CAG	2	6	1828509	1828514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782515
37635	NC_015850	CCTGT	2	10	1828547	1828556	0 %	40 %	20 %	40 %	340782516
37636	NC_015850	GTG	2	6	1828566	1828571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782516
37637	NC_015850	TGC	2	6	1828575	1828580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782516
37638	NC_015850	GCT	2	6	1828587	1828592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782516
37639	NC_015850	GCC	2	6	1828631	1828636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782516
37640	NC_015850	TCG	2	6	1828962	1828967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782516
37641	NC_015850	AAG	2	6	1828979	1828984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340782516
37642	NC_015850	TGG	2	6	1829023	1829028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782516
37643	NC_015850	AGA	2	6	1829040	1829045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340782516
37644	NC_015850	GATGCA	2	12	1829050	1829061	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	340782516
37645	NC_015850	ATG	2	6	1829112	1829117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782517
37646	NC_015850	AGCAG	2	10	1829118	1829127	40 %	0 %	40 %	20 %	340782517
37647	NC_015850	GCA	2	6	1829135	1829140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782517
37648	NC_015850	ATC	2	6	1829148	1829153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782517
37649	NC_015850	GCCT	2	8	1829181	1829188	0 %	25 %	25 %	50 %	340782517
37650	NC_015850	GACAGC	2	12	1829295	1829306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782517
37651	NC_015850	CGGC	2	8	1829307	1829314	0 %	0 %	50 %	50 %	340782517
37652	NC_015850	ACG	2	6	1829317	1829322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782517
37653	NC_015850	ACG	2	6	1829332	1829337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782517
37654	NC_015850	CCGCAT	2	12	1829345	1829356	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	340782517
37655	NC_015850	TCCTC	2	10	1829377	1829386	0 %	40 %	0 %	60 %	340782517
37656	NC_015850	TGG	2	6	1829428	1829433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782517
37657	NC_015850	TTCC	2	8	1829773	1829780	0 %	50 %	0 %	50 %	340782517
37658	NC_015850	CG	3	6	1829941	1829946	0 %	0 %	50 %	50 %	340782517
37659	NC_015850	A	6	6	1829974	1829979	100 %	0 %	0 %	0 %	340782517
37660	NC_015850	CACC	2	8	1830047	1830054	25 %	0 %	0 %	75 %	340782517
37661	NC_015850	TCG	2	6	1830061	1830066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782517
37662	NC_015850	GAA	2	6	1830104	1830109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340782517
37663	NC_015850	GCCA	2	8	1830198	1830205	25 %	0 %	25 %	50 %	340782517
37664	NC_015850	AGG	3	9	1830217	1830225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782517
37665	NC_015850	GCAAGC	2	12	1830247	1830258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782517
37666	NC_015850	GCCA	2	8	1830303	1830310	25 %	0 %	25 %	50 %	340782517
37667	NC_015850	CAG	2	6	1830410	1830415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782517
37668	NC_015850	CG	3	6	1830445	1830450	0 %	0 %	50 %	50 %	340782517
37669	NC_015850	GTG	2	6	1830462	1830467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782517
37670	NC_015850	CTG	2	6	1830483	1830488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782517
37671	NC_015850	ACA	2	6	1830514	1830519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340782517
37672	NC_015850	GC	3	6	1830573	1830578	0 %	0 %	50 %	50 %	340782517
37673	NC_015850	CAC	2	6	1830590	1830595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782517
37674	NC_015850	GCG	2	6	1830600	1830605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782517
37675	NC_015850	GTGGG	2	10	1830623	1830632	0 %	20 %	80 %	0 %	340782517
37676	NC_015850	CGG	3	9	1830647	1830655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782517
37677	NC_015850	CCAG	2	8	1830700	1830707	25 %	0 %	25 %	50 %	340782517
37678	NC_015850	GGT	2	6	1830708	1830713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782517
37679	NC_015850	GCG	2	6	1830736	1830741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782517
37680	NC_015850	GTG	2	6	1830786	1830791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782517
37681	NC_015850	CGG	2	6	1830868	1830873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782517
37682	NC_015850	ATC	2	6	1830933	1830938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782517
37683	NC_015850	CAG	2	6	1831008	1831013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782517
37684	NC_015850	CCA	2	6	1831015	1831020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782517
37685	NC_015850	GTG	2	6	1831024	1831029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782517
37686	NC_015850	C	6	6	1831075	1831080	0 %	0 %	0 %	100 %	340782517
37687	NC_015850	AGG	2	6	1831180	1831185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782517
37688	NC_015850	GCT	2	6	1831196	1831201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782517
37689	NC_015850	CGT	2	6	1831220	1831225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782517
37690	NC_015850	CGG	2	6	1831229	1831234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782517
37691	NC_015850	GGCT	2	8	1831302	1831309	0 %	25 %	50 %	25 %	340782517
37692	NC_015850	GGC	2	6	1831377	1831382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782517
37693	NC_015850	GGA	2	6	1831406	1831411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782517
37694	NC_015850	GATCG	2	10	1831439	1831448	20 %	20 %	40 %	20 %	340782518
37695	NC_015850	CCA	2	6	1831479	1831484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782518
37696	NC_015850	GCT	2	6	1831492	1831497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782518
37697	NC_015850	GCC	2	6	1831499	1831504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782518
37698	NC_015850	CAT	2	6	1831537	1831542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782518
37699	NC_015850	CG	4	8	1831604	1831611	0 %	0 %	50 %	50 %	340782518
37700	NC_015850	CGG	3	9	1831669	1831677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782518
37701	NC_015850	TCAT	2	8	1831728	1831735	25 %	50 %	0 %	25 %	340782518
37702	NC_015850	CGA	2	6	1831750	1831755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782518
37703	NC_015850	CTG	2	6	1831793	1831798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782518
37704	NC_015850	CG	3	6	1831844	1831849	0 %	0 %	50 %	50 %	340782518
37705	NC_015850	GC	3	6	1831897	1831902	0 %	0 %	50 %	50 %	340782518
37706	NC_015850	GC	4	8	1831942	1831949	0 %	0 %	50 %	50 %	340782518
37707	NC_015850	CAT	2	6	1832035	1832040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37708	NC_015850	CCT	2	6	1832113	1832118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340782519
37709	NC_015850	CGA	2	6	1832176	1832181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782519
37710	NC_015850	CGC	2	6	1832188	1832193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782519
37711	NC_015850	CCTGC	2	10	1832204	1832213	0 %	20 %	20 %	60 %	340782519
37712	NC_015850	GAG	2	6	1832270	1832275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782519
37713	NC_015850	GCA	2	6	1832287	1832292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782519
37714	NC_015850	GCT	2	6	1832314	1832319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782519
37715	NC_015850	TCG	2	6	1832391	1832396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782519
37716	NC_015850	ACG	2	6	1832438	1832443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782519
37717	NC_015850	CTG	2	6	1832444	1832449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782519
37718	NC_015850	TGG	2	6	1832454	1832459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782519
37719	NC_015850	GGC	2	6	1832471	1832476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782519
37720	NC_015850	CG	3	6	1832532	1832537	0 %	0 %	50 %	50 %	340782519
37721	NC_015850	CGT	2	6	1832539	1832544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782519
37722	NC_015850	TCA	2	6	1832622	1832627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782519
37723	NC_015850	GAG	2	6	1832654	1832659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782519
37724	NC_015850	GGT	2	6	1832737	1832742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782519
37725	NC_015850	GC	3	6	1832744	1832749	0 %	0 %	50 %	50 %	340782519
37726	NC_015850	AAG	2	6	1832757	1832762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340782519
37727	NC_015850	GC	3	6	1832770	1832775	0 %	0 %	50 %	50 %	340782519
37728	NC_015850	GCC	2	6	1832816	1832821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782519
37729	NC_015850	GCC	2	6	1832876	1832881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782519
37730	NC_015850	CTG	2	6	1832903	1832908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782519
37731	NC_015850	TCG	2	6	1832940	1832945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782519
37732	NC_015850	GGGCT	2	10	1832949	1832958	0 %	20 %	60 %	20 %	340782519
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37773	NC_015850	TCA	2	6	1834725	1834730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782521
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37786	NC_015850	GC	3	6	1835271	1835276	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37787	NC_015850	ATC	2	6	1835331	1835336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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37790	NC_015850	CG	3	6	1835485	1835490	0 %	0 %	50 %	50 %	340782522
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37851	NC_015850	CTG	2	6	1837856	1837861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782522
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37925	NC_015850	CTG	2	6	1841766	1841771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782524
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37933	NC_015850	TTCG	2	8	1842335	1842342	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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37938	NC_015850	CGG	2	6	1842482	1842487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782525
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37957	NC_015850	GC	3	6	1843555	1843560	0 %	0 %	50 %	50 %	340782526
37958	NC_015850	TGC	2	6	1843626	1843631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782526
37959	NC_015850	GTA	2	6	1843827	1843832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782526
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