MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 60723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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37002	NC_015850	CAA	2	6	1798662	1798667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340782483
37003	NC_015850	GCC	2	6	1798705	1798710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782483
37004	NC_015850	CAA	2	6	1798728	1798733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340782483
37005	NC_015850	GCT	2	6	1798776	1798781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782483
37006	NC_015850	ACA	2	6	1798796	1798801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340782483
37007	NC_015850	CAC	2	6	1798804	1798809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782483
37008	NC_015850	AAGCA	2	10	1798925	1798934	60 %	0 %	20 %	20 %	340782483
37009	NC_015850	GCG	2	6	1798943	1798948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782483
37010	NC_015850	GCA	3	9	1798968	1798976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782483
37011	NC_015850	GCC	2	6	1799021	1799026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782484
37012	NC_015850	TGC	2	6	1799029	1799034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782484
37013	NC_015850	GCG	2	6	1799049	1799054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782484
37014	NC_015850	CTG	2	6	1799061	1799066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782484
37015	NC_015850	GCCACC	2	12	1799086	1799097	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	340782484
37016	NC_015850	CGA	2	6	1799141	1799146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782484
37017	NC_015850	TGC	2	6	1799150	1799155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782484
37018	NC_015850	CAGC	2	8	1799201	1799208	25 %	0 %	25 %	50 %	340782484
37019	NC_015850	GGCACG	2	12	1799229	1799240	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	340782484
37020	NC_015850	CAC	2	6	1799292	1799297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782484
37021	NC_015850	CAC	2	6	1799367	1799372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782484
37022	NC_015850	C	6	6	1799443	1799448	0 %	0 %	0 %	100 %	340782484
37023	NC_015850	GC	3	6	1799484	1799489	0 %	0 %	50 %	50 %	340782484
37024	NC_015850	CAG	2	6	1799517	1799522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782484
37025	NC_015850	CCCG	2	8	1799534	1799541	0 %	0 %	25 %	75 %	340782484
37026	NC_015850	AAC	2	6	1799572	1799577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340782484
37027	NC_015850	TGC	2	6	1799587	1799592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782484
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37030	NC_015850	CCG	2	6	1799723	1799728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782484
37031	NC_015850	GAC	2	6	1799793	1799798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782484
37032	NC_015850	GGA	2	6	1799893	1799898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782485
37033	NC_015850	GCC	2	6	1799922	1799927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782485
37034	NC_015850	G	6	6	1799990	1799995	0 %	0 %	100 %	0 %	340782485
37035	NC_015850	GAG	2	6	1800041	1800046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782485
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37037	NC_015850	GC	4	8	1800133	1800140	0 %	0 %	50 %	50 %	340782485
37038	NC_015850	TCC	2	6	1800183	1800188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340782485
37039	NC_015850	GC	3	6	1800201	1800206	0 %	0 %	50 %	50 %	340782485
37040	NC_015850	GCG	2	6	1800219	1800224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782485
37041	NC_015850	CG	3	6	1800223	1800228	0 %	0 %	50 %	50 %	340782485
37042	NC_015850	CTG	2	6	1800237	1800242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782485
37043	NC_015850	CAG	2	6	1800263	1800268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782485
37044	NC_015850	CGT	2	6	1800271	1800276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782485
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37049	NC_015850	GA	3	6	1800378	1800383	50 %	0 %	50 %	0 %	340782485
37050	NC_015850	CA	3	6	1800387	1800392	50 %	0 %	0 %	50 %	340782485
37051	NC_015850	GGAAA	2	10	1800437	1800446	60 %	0 %	40 %	0 %	340782485
37052	NC_015850	CCGC	2	8	1800451	1800458	0 %	0 %	25 %	75 %	340782485
37053	NC_015850	ACC	2	6	1800522	1800527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782485
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37055	NC_015850	ACC	3	9	1800657	1800665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782485
37056	NC_015850	CGA	2	6	1800753	1800758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782485
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37058	NC_015850	CAAGT	2	10	1800852	1800861	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
37059	NC_015850	CACCG	2	10	1800917	1800926	20 %	0 %	20 %	60 %	340782486
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37067	NC_015850	CAC	2	6	1801270	1801275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37068	NC_015850	AC	3	6	1801283	1801288	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37069	NC_015850	TCG	2	6	1801297	1801302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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37072	NC_015850	CTT	2	6	1801681	1801686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340782488
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37075	NC_015850	CAGG	2	8	1801812	1801819	25 %	0 %	50 %	25 %	340782488
37076	NC_015850	CG	3	6	1801824	1801829	0 %	0 %	50 %	50 %	340782488
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37084	NC_015850	CGC	2	6	1802279	1802284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782490
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37088	NC_015850	TCCC	2	8	1802488	1802495	0 %	25 %	0 %	75 %	340782490
37089	NC_015850	CGA	2	6	1802505	1802510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782490
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37091	NC_015850	CAC	3	9	1802539	1802547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782490
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37102	NC_015850	GAT	2	6	1803100	1803105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782490
37103	NC_015850	GTC	2	6	1803268	1803273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782490
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37109	NC_015850	ACG	2	6	1803848	1803853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782490
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37114	NC_015850	GATGGG	2	12	1804069	1804080	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	340782490
37115	NC_015850	CAT	2	6	1804096	1804101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782490
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37219	NC_015850	GC	3	6	1808753	1808758	0 %	0 %	50 %	50 %	340782494
37220	NC_015850	CGT	2	6	1808760	1808765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782494
37221	NC_015850	TGG	2	6	1808820	1808825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782494
37222	NC_015850	GGCGA	2	10	1808861	1808870	20 %	0 %	60 %	20 %	340782494
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37224	NC_015850	ATCC	2	8	1808923	1808930	25 %	25 %	0 %	50 %	340782494
37225	NC_015850	GC	3	6	1808965	1808970	0 %	0 %	50 %	50 %	340782494
37226	NC_015850	ATG	2	6	1808993	1808998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782494
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37232	NC_015850	GATA	2	8	1809354	1809361	50 %	25 %	25 %	0 %	340782494
37233	NC_015850	GGGAAT	2	12	1809481	1809492	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	340782494
37234	NC_015850	GCC	2	6	1809497	1809502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782494
37235	NC_015850	GCCACG	2	12	1809530	1809541	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	340782494
37236	NC_015850	TGC	2	6	1809560	1809565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782494
37237	NC_015850	GCCA	2	8	1809605	1809612	25 %	0 %	25 %	50 %	340782494
37238	NC_015850	ATG	2	6	1809617	1809622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782494
37239	NC_015850	GCT	2	6	1809642	1809647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782494
37240	NC_015850	GC	3	6	1809668	1809673	0 %	0 %	50 %	50 %	340782494
37241	NC_015850	CAG	2	6	1809737	1809742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782494
37242	NC_015850	GATC	2	8	1809765	1809772	25 %	25 %	25 %	25 %	340782494
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37245	NC_015850	GGC	2	6	1809803	1809808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782494
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37249	NC_015850	CGGG	2	8	1810233	1810240	0 %	0 %	75 %	25 %	340782495
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37265	NC_015850	CA	3	6	1810795	1810800	50 %	0 %	0 %	50 %	340782495
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37304	NC_015850	CGG	2	6	1813013	1813018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782498
37305	NC_015850	GAT	2	6	1813089	1813094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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37307	NC_015850	GTG	2	6	1813301	1813306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782499
37308	NC_015850	GA	3	6	1813349	1813354	50 %	0 %	50 %	0 %	340782499
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37312	NC_015850	CT	3	6	1813481	1813486	0 %	50 %	0 %	50 %	340782499
37313	NC_015850	GGCTC	2	10	1813672	1813681	0 %	20 %	40 %	40 %	340782499
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37318	NC_015850	CGAG	2	8	1813902	1813909	25 %	0 %	50 %	25 %	340782499
37319	NC_015850	GCC	2	6	1813982	1813987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782499
37320	NC_015850	CAG	2	6	1814030	1814035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782499
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37324	NC_015850	GCT	2	6	1814200	1814205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782499
37325	NC_015850	ATC	2	6	1814246	1814251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782499
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37329	NC_015850	GC	3	6	1814369	1814374	0 %	0 %	50 %	50 %	340782499
37330	NC_015850	TGC	2	6	1814431	1814436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782499
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37332	NC_015850	CTGGCG	2	12	1814505	1814516	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	340782500
37333	NC_015850	CG	3	6	1814515	1814520	0 %	0 %	50 %	50 %	340782500
37334	NC_015850	TCA	2	6	1814599	1814604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782500
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37336	NC_015850	GCA	2	6	1814987	1814992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782500
37337	NC_015850	TGGA	2	8	1815012	1815019	25 %	25 %	50 %	0 %	340782500
37338	NC_015850	CGA	2	6	1815089	1815094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782500
37339	NC_015850	CG	4	8	1815109	1815116	0 %	0 %	50 %	50 %	340782500
37340	NC_015850	GCG	2	6	1815149	1815154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782500
37341	NC_015850	TCG	2	6	1815394	1815399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782500
37342	NC_015850	GCAGCG	2	12	1815404	1815415	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	340782500
37343	NC_015850	CGT	2	6	1815462	1815467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782500
37344	NC_015850	GCG	2	6	1815496	1815501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782500
37345	NC_015850	TGC	2	6	1815530	1815535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782500
37346	NC_015850	CTGG	2	8	1815537	1815544	0 %	25 %	50 %	25 %	340782500
37347	NC_015850	GCA	2	6	1815568	1815573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782500
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37465	NC_015850	ACC	2	6	1821574	1821579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782508
37466	NC_015850	ACC	2	6	1821645	1821650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782508
37467	NC_015850	GCC	2	6	1821694	1821699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782508
37468	NC_015850	CAC	2	6	1821768	1821773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782508
37469	NC_015850	ATG	2	6	1821787	1821792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782508
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37478	NC_015850	GC	3	6	1822196	1822201	0 %	0 %	50 %	50 %	340782508
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37487	NC_015850	CGG	2	6	1822721	1822726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782508
37488	NC_015850	CTC	2	6	1822770	1822775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340782508
37489	NC_015850	TCG	2	6	1822789	1822794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782508
37490	NC_015850	CGC	2	6	1822811	1822816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782508
37491	NC_015850	GC	4	8	1822856	1822863	0 %	0 %	50 %	50 %	340782508
37492	NC_015850	ACG	2	6	1822864	1822869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782508
37493	NC_015850	A	6	6	1823007	1823012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37494	NC_015850	CCG	2	6	1823023	1823028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37495	NC_015850	AGGT	2	8	1823107	1823114	25 %	25 %	50 %	0 %	340782509
37496	NC_015850	GC	3	6	1823115	1823120	0 %	0 %	50 %	50 %	340782509
37497	NC_015850	CCA	2	6	1823159	1823164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782509
37498	NC_015850	TGCG	2	8	1823259	1823266	0 %	25 %	50 %	25 %	340782509
37499	NC_015850	GGTG	2	8	1823294	1823301	0 %	25 %	75 %	0 %	340782509
37500	NC_015850	GC	3	6	1823325	1823330	0 %	0 %	50 %	50 %	340782509

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