MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 60723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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36002	NC_015850	GCC	2	6	1752894	1752899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782444
36003	NC_015850	GAT	2	6	1752907	1752912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782444
36004	NC_015850	CCA	2	6	1752983	1752988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782444
36005	NC_015850	GCA	2	6	1753018	1753023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782444
36006	NC_015850	TGC	2	6	1753024	1753029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782444
36007	NC_015850	CAA	2	6	1753178	1753183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340782444
36008	NC_015850	ACG	2	6	1753245	1753250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782444
36009	NC_015850	GAT	2	6	1753365	1753370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782445
36010	NC_015850	CAC	2	6	1753384	1753389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782445
36011	NC_015850	GAC	2	6	1753398	1753403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782445
36012	NC_015850	GAC	2	6	1753437	1753442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782445
36013	NC_015850	ACG	2	6	1753466	1753471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782445
36014	NC_015850	CGT	2	6	1753503	1753508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782445
36015	NC_015850	ACG	2	6	1753510	1753515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782445
36016	NC_015850	GCG	2	6	1753544	1753549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782445
36017	NC_015850	CCA	2	6	1753608	1753613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782445
36018	NC_015850	CAG	2	6	1753639	1753644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782445
36019	NC_015850	GCG	2	6	1753693	1753698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782445
36020	NC_015850	GTG	2	6	1753703	1753708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782445
36021	NC_015850	GCC	2	6	1753737	1753742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782445
36022	NC_015850	AGG	2	6	1753781	1753786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782445
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36024	NC_015850	GCG	2	6	1753845	1753850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782445
36025	NC_015850	GCA	2	6	1753854	1753859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782445
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36027	NC_015850	CCA	2	6	1753950	1753955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782445
36028	NC_015850	CCA	2	6	1753981	1753986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782445
36029	NC_015850	TGC	2	6	1753988	1753993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782445
36030	NC_015850	CTG	2	6	1754005	1754010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782445
36031	NC_015850	CG	3	6	1754015	1754020	0 %	0 %	50 %	50 %	340782445
36032	NC_015850	CCCT	2	8	1754060	1754067	0 %	25 %	0 %	75 %	340782446
36033	NC_015850	CTG	3	9	1754146	1754154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782446
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36039	NC_015850	TCC	2	6	1754421	1754426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340782446
36040	NC_015850	AGC	3	9	1754559	1754567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782446
36041	NC_015850	GAC	2	6	1754647	1754652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782446
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36043	NC_015850	CCCG	2	8	1754821	1754828	0 %	0 %	25 %	75 %	340782446
36044	NC_015850	GCC	2	6	1754851	1754856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782446
36045	NC_015850	GC	3	6	1754873	1754878	0 %	0 %	50 %	50 %	340782446
36046	NC_015850	CGC	2	6	1754933	1754938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36047	NC_015850	GAGGC	2	10	1754939	1754948	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
36048	NC_015850	TGC	2	6	1754954	1754959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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36051	NC_015850	GCT	2	6	1755000	1755005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782447
36052	NC_015850	TTC	2	6	1755013	1755018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340782447
36053	NC_015850	CAT	2	6	1755037	1755042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782447
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36055	NC_015850	CATCTT	2	12	1755082	1755093	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	340782447
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36059	NC_015850	GCCG	2	8	1755391	1755398	0 %	0 %	50 %	50 %	340782447
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36066	NC_015850	GAAGGA	2	12	1755727	1755738	50 %	0 %	50 %	0 %	340782447
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36088	NC_015850	CCCT	2	8	1756842	1756849	0 %	25 %	0 %	75 %	340782449
36089	NC_015850	TCG	2	6	1756869	1756874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782449
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36100	NC_015850	GCA	2	6	1757227	1757232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782450
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36343	NC_015850	GCAAG	2	10	1768828	1768837	40 %	0 %	40 %	20 %	340782460
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36348	NC_015850	TCC	2	6	1769236	1769241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340782461
36349	NC_015850	CTG	2	6	1769244	1769249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782461
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36359	NC_015850	CCTTCG	2	12	1769641	1769652	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	340782461
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36417	NC_015850	GCT	2	6	1771887	1771892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782461
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36424	NC_015850	GAC	3	9	1772246	1772254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36425	NC_015850	TCC	2	6	1772311	1772316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340782462
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36428	NC_015850	GC	3	6	1772551	1772556	0 %	0 %	50 %	50 %	340782462
36429	NC_015850	GAC	2	6	1772573	1772578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782462
36430	NC_015850	CTGC	2	8	1772585	1772592	0 %	25 %	25 %	50 %	340782462
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36441	NC_015850	GCTG	2	8	1773071	1773078	0 %	25 %	50 %	25 %	340782462
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36449	NC_015850	GGC	2	6	1773303	1773308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782462
36450	NC_015850	GGCGC	2	10	1773312	1773321	0 %	0 %	60 %	40 %	340782462
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36452	NC_015850	CGC	2	6	1773351	1773356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782462
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36454	NC_015850	GAT	2	6	1773516	1773521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782462
36455	NC_015850	C	6	6	1773620	1773625	0 %	0 %	0 %	100 %	340782462
36456	NC_015850	CCG	2	6	1773644	1773649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782462
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36460	NC_015850	GCGG	2	8	1773804	1773811	0 %	0 %	75 %	25 %	340782462
36461	NC_015850	CCCA	2	8	1773858	1773865	25 %	0 %	0 %	75 %	340782462
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36463	NC_015850	CCA	2	6	1773893	1773898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782462
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36489	NC_015850	TGA	2	6	1775165	1775170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782462
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36491	NC_015850	CG	3	6	1775217	1775222	0 %	0 %	50 %	50 %	340782462
36492	NC_015850	CCA	2	6	1775225	1775230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782462
36493	NC_015850	GAA	2	6	1775255	1775260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36494	NC_015850	GTCTCA	2	12	1775305	1775316	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	340782463
36495	NC_015850	CGA	2	6	1775351	1775356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782463
36496	NC_015850	CAG	2	6	1775369	1775374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782463
36497	NC_015850	CG	3	6	1775375	1775380	0 %	0 %	50 %	50 %	340782463
36498	NC_015850	ACG	2	6	1775389	1775394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782463
36499	NC_015850	CAC	2	6	1775432	1775437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782463
36500	NC_015850	C	7	7	1775437	1775443	0 %	0 %	0 %	100 %	340782463

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