MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 60723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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35502	NC_015850	CG	3	6	1729034	1729039	0 %	0 %	50 %	50 %	340782423
35503	NC_015850	ACC	2	6	1729171	1729176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782423
35504	NC_015850	CGC	2	6	1729194	1729199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782423
35505	NC_015850	CCA	2	6	1729212	1729217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782423
35506	NC_015850	CGCC	2	8	1729221	1729228	0 %	0 %	25 %	75 %	340782423
35507	NC_015850	CCA	2	6	1729334	1729339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782423
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35509	NC_015850	CGA	2	6	1729373	1729378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782423
35510	NC_015850	CGA	2	6	1729538	1729543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782424
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35513	NC_015850	CTC	2	6	1729744	1729749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340782424
35514	NC_015850	CGC	2	6	1729775	1729780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782424
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35516	NC_015850	CTG	2	6	1729981	1729986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782424
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35731	NC_015850	GCCAT	2	10	1739807	1739816	20 %	20 %	20 %	40 %	340782434
35732	NC_015850	TGC	2	6	1739906	1739911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782434
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35967	NC_015850	CCA	2	6	1751306	1751311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782441
35968	NC_015850	GC	3	6	1751315	1751320	0 %	0 %	50 %	50 %	340782441
35969	NC_015850	CGA	2	6	1751369	1751374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782441
35970	NC_015850	CGA	2	6	1751402	1751407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782441
35971	NC_015850	ACC	2	6	1751410	1751415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782441
35972	NC_015850	GTG	2	6	1751513	1751518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35973	NC_015850	GAG	2	6	1751540	1751545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35974	NC_015850	CGGG	2	8	1751602	1751609	0 %	0 %	75 %	25 %	340782442
35975	NC_015850	CGA	2	6	1751704	1751709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782442
35976	NC_015850	CGA	2	6	1751800	1751805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782442
35977	NC_015850	CCT	2	6	1751815	1751820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340782442
35978	NC_015850	GCG	2	6	1751862	1751867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782442
35979	NC_015850	GCC	2	6	1751918	1751923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782442
35980	NC_015850	CTG	2	6	1751924	1751929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782442
35981	NC_015850	CAG	2	6	1751930	1751935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782442
35982	NC_015850	CTA	2	6	1751971	1751976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782442
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35984	NC_015850	CGT	2	6	1752102	1752107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782443
35985	NC_015850	TGG	2	6	1752127	1752132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782443
35986	NC_015850	CGA	2	6	1752179	1752184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782443
35987	NC_015850	GCA	2	6	1752188	1752193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782443
35988	NC_015850	CGG	2	6	1752197	1752202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782443
35989	NC_015850	GC	3	6	1752240	1752245	0 %	0 %	50 %	50 %	340782443
35990	NC_015850	GTC	2	6	1752263	1752268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782443
35991	NC_015850	GCC	2	6	1752271	1752276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782443
35992	NC_015850	CGGCAT	2	12	1752383	1752394	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	340782443
35993	NC_015850	TGGC	2	8	1752407	1752414	0 %	25 %	50 %	25 %	340782443
35994	NC_015850	CG	3	6	1752553	1752558	0 %	0 %	50 %	50 %	340782444
35995	NC_015850	GGC	2	6	1752600	1752605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782444
35996	NC_015850	CGC	2	6	1752620	1752625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782444
35997	NC_015850	AAT	2	6	1752637	1752642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340782444
35998	NC_015850	GCT	2	6	1752688	1752693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782444
35999	NC_015850	CCGC	2	8	1752705	1752712	0 %	0 %	25 %	75 %	340782444
36000	NC_015850	GCC	2	6	1752804	1752809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782444

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