MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 60723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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35002	NC_015850	CCA	2	6	1703670	1703675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782398
35003	NC_015850	ATA	2	6	1703731	1703736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340782398
35004	NC_015850	CGCAC	2	10	1703776	1703785	20 %	0 %	20 %	60 %	340782398
35005	NC_015850	CGC	2	6	1703841	1703846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782398
35006	NC_015850	TCC	2	6	1703875	1703880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340782398
35007	NC_015850	T	6	6	1703949	1703954	0 %	100 %	0 %	0 %	340782398
35008	NC_015850	A	6	6	1703989	1703994	100 %	0 %	0 %	0 %	340782398
35009	NC_015850	GTC	2	6	1704049	1704054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782398
35010	NC_015850	GTG	2	6	1704055	1704060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782398
35011	NC_015850	CGC	2	6	1704081	1704086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782398
35012	NC_015850	CGC	2	6	1704090	1704095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782398
35013	NC_015850	CAA	2	6	1704099	1704104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340782398
35014	NC_015850	GC	3	6	1704105	1704110	0 %	0 %	50 %	50 %	340782398
35015	NC_015850	CCGCT	2	10	1704131	1704140	0 %	20 %	20 %	60 %	340782398
35016	NC_015850	GCG	2	6	1704171	1704176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782398
35017	NC_015850	GTC	2	6	1704225	1704230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782398
35018	NC_015850	TCCG	2	8	1704476	1704483	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35019	NC_015850	GTCG	2	8	1704484	1704491	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
35020	NC_015850	GACC	2	8	1704585	1704592	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35021	NC_015850	CAG	2	6	1704621	1704626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35022	NC_015850	TGA	2	6	1704737	1704742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782399
35023	NC_015850	GC	3	6	1704847	1704852	0 %	0 %	50 %	50 %	340782399
35024	NC_015850	ATCA	2	8	1704880	1704887	50 %	25 %	0 %	25 %	340782399
35025	NC_015850	GC	3	6	1704967	1704972	0 %	0 %	50 %	50 %	340782399
35026	NC_015850	GAA	2	6	1705009	1705014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340782399
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35028	NC_015850	GCA	2	6	1705221	1705226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35029	NC_015850	CCG	3	9	1705274	1705282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782400
35030	NC_015850	TCG	2	6	1705399	1705404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782400
35031	NC_015850	CTG	2	6	1705422	1705427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782400
35032	NC_015850	CGC	2	6	1705440	1705445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782400
35033	NC_015850	ATC	2	6	1705455	1705460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782400
35034	NC_015850	TTC	2	6	1705470	1705475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340782400
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35036	NC_015850	TGC	2	6	1705546	1705551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782400
35037	NC_015850	GCA	2	6	1705745	1705750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782400
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35039	NC_015850	GC	3	6	1705804	1705809	0 %	0 %	50 %	50 %	340782400
35040	NC_015850	GGC	2	6	1705812	1705817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782400
35041	NC_015850	GTT	2	6	1705823	1705828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340782400
35042	NC_015850	ACT	2	6	1705996	1706001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35043	NC_015850	TTC	2	6	1706068	1706073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340782401
35044	NC_015850	CCA	2	6	1706082	1706087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782401
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35046	NC_015850	TTG	2	6	1706273	1706278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340782401
35047	NC_015850	CACGAG	2	12	1706290	1706301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782401
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35049	NC_015850	ATC	2	6	1706336	1706341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782401
35050	NC_015850	TGA	2	6	1706388	1706393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782401
35051	NC_015850	TCGA	2	8	1706416	1706423	25 %	25 %	25 %	25 %	340782401
35052	NC_015850	GCA	2	6	1706445	1706450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782401
35053	NC_015850	CGC	2	6	1706481	1706486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35054	NC_015850	GGC	2	6	1706493	1706498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35055	NC_015850	ACTC	2	8	1706514	1706521	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
35056	NC_015850	CAC	2	6	1706538	1706543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35057	NC_015850	AT	3	6	1706582	1706587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35058	NC_015850	CGT	2	6	1706625	1706630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35059	NC_015850	CGA	2	6	1706654	1706659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35060	NC_015850	CCTC	2	8	1706781	1706788	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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35075	NC_015850	GCGG	2	8	1707746	1707753	0 %	0 %	75 %	25 %	340782402
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35085	NC_015850	CA	3	6	1708172	1708177	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35086	NC_015850	TTCTG	2	10	1708230	1708239	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
35087	NC_015850	TA	6	12	1708245	1708256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35088	NC_015850	AAT	2	6	1708258	1708263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35089	NC_015850	TCGG	2	8	1708280	1708287	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
35090	NC_015850	CGG	2	6	1708297	1708302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35091	NC_015850	AAGG	2	8	1708382	1708389	50 %	0 %	50 %	0 %	340782403
35092	NC_015850	AGGC	2	8	1708425	1708432	25 %	0 %	50 %	25 %	340782403
35093	NC_015850	GCC	2	6	1708463	1708468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782403
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35097	NC_015850	TCCT	2	8	1708634	1708641	0 %	50 %	0 %	50 %	340782403
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35101	NC_015850	TCGG	2	8	1708776	1708783	0 %	25 %	50 %	25 %	340782403
35102	NC_015850	GGC	2	6	1708796	1708801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782403
35103	NC_015850	ATC	2	6	1708817	1708822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782403
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35109	NC_015850	TGG	2	6	1709109	1709114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782403
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35119	NC_015850	GGC	2	6	1709507	1709512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782403
35120	NC_015850	AAGGCC	2	12	1709579	1709590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782403
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35233	NC_015850	CT	3	6	1716010	1716015	0 %	50 %	0 %	50 %	340782408
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35353	NC_015850	TCATTG	2	12	1721243	1721254	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	340782413
35354	NC_015850	CG	3	6	1721348	1721353	0 %	0 %	50 %	50 %	340782413
35355	NC_015850	T	6	6	1721368	1721373	0 %	100 %	0 %	0 %	340782413
35356	NC_015850	CG	3	6	1721469	1721474	0 %	0 %	50 %	50 %	340782413
35357	NC_015850	GCG	2	6	1721541	1721546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782413
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35363	NC_015850	ACA	2	6	1721863	1721868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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