MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 60723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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34003	NC_015850	GAG	2	6	1653899	1653904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782348
34004	NC_015850	GT	3	6	1653996	1654001	0 %	50 %	50 %	0 %	340782348
34005	NC_015850	GCC	2	6	1654096	1654101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782348
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34009	NC_015850	CGC	2	6	1654158	1654163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782348
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34019	NC_015850	TAC	2	6	1654736	1654741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782348
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34021	NC_015850	GA	3	6	1654782	1654787	50 %	0 %	50 %	0 %	340782348
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34104	NC_015850	CG	3	6	1658846	1658851	0 %	0 %	50 %	50 %	340782354
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34118	NC_015850	GAG	2	6	1659637	1659642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782356
34119	NC_015850	ACC	2	6	1659668	1659673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782356
34120	NC_015850	GAC	2	6	1659692	1659697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782356
34121	NC_015850	CGG	2	6	1659711	1659716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782356
34122	NC_015850	CGG	2	6	1659744	1659749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782356
34123	NC_015850	CTGG	2	8	1659772	1659779	0 %	25 %	50 %	25 %	340782356
34124	NC_015850	GGCG	2	8	1659873	1659880	0 %	0 %	75 %	25 %	340782356
34125	NC_015850	CGT	2	6	1660017	1660022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782356
34126	NC_015850	CTG	2	6	1660024	1660029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782356
34127	NC_015850	CA	3	6	1660034	1660039	50 %	0 %	0 %	50 %	340782356
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34130	NC_015850	G	6	6	1660196	1660201	0 %	0 %	100 %	0 %	340782356
34131	NC_015850	TGG	2	6	1660274	1660279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782356
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34134	NC_015850	TGC	2	6	1660397	1660402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782356
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34138	NC_015850	ATG	2	6	1660516	1660521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782356
34139	NC_015850	TGG	2	6	1660527	1660532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782356
34140	NC_015850	T	7	7	1660583	1660589	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34141	NC_015850	TGG	2	6	1660659	1660664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782357
34142	NC_015850	CAT	2	6	1660681	1660686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782357
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34144	NC_015850	CGGG	2	8	1660735	1660742	0 %	0 %	75 %	25 %	340782357
34145	NC_015850	CTG	2	6	1660751	1660756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782357
34146	NC_015850	ATA	2	6	1660857	1660862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34147	NC_015850	CTG	2	6	1660887	1660892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782358
34148	NC_015850	GTCA	2	8	1660935	1660942	25 %	25 %	25 %	25 %	340782358
34149	NC_015850	GAG	2	6	1661004	1661009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782358
34150	NC_015850	GC	3	6	1661123	1661128	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34151	NC_015850	AGC	2	6	1661170	1661175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782359
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34180	NC_015850	TGC	2	6	1662746	1662751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782361
34181	NC_015850	CA	3	6	1662824	1662829	50 %	0 %	0 %	50 %	340782361
34182	NC_015850	AGGACC	2	12	1662854	1662865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782361
34183	NC_015850	CGG	2	6	1662866	1662871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782361
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34213	NC_015850	ATC	2	6	1664076	1664081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782363
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34217	NC_015850	GTACG	2	10	1664252	1664261	20 %	20 %	40 %	20 %	340782363
34218	NC_015850	CAG	3	9	1664303	1664311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782363
34219	NC_015850	CTG	2	6	1664420	1664425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782363
34220	NC_015850	GAAA	2	8	1664469	1664476	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34221	NC_015850	ACT	2	6	1664647	1664652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34222	NC_015850	ACC	2	6	1664684	1664689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34223	NC_015850	TGG	2	6	1664707	1664712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34224	NC_015850	CCT	2	6	1664795	1664800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340782364
34225	NC_015850	CAC	2	6	1664846	1664851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782364
34226	NC_015850	CAA	2	6	1664952	1664957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340782364
34227	NC_015850	CGA	2	6	1665088	1665093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782365
34228	NC_015850	CTT	2	6	1665163	1665168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340782365
34229	NC_015850	ATG	2	6	1665246	1665251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782365
34230	NC_015850	ACGT	2	8	1665285	1665292	25 %	25 %	25 %	25 %	340782365
34231	NC_015850	GCA	2	6	1665340	1665345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782365
34232	NC_015850	TCC	2	6	1665552	1665557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340782365
34233	NC_015850	T	7	7	1665695	1665701	0 %	100 %	0 %	0 %	340782365
34234	NC_015850	CGC	2	6	1665774	1665779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782365
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34237	NC_015850	AGCG	2	8	1665884	1665891	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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34354	NC_015850	CTG	2	6	1672471	1672476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782373
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