MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 60723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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32002	NC_015850	GTC	2	6	1547487	1547492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782249
32003	NC_015850	TACTG	2	10	1547549	1547558	20 %	40 %	20 %	20 %	340782249
32004	NC_015850	CAG	2	6	1547601	1547606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782249
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32061	NC_015850	AGAT	2	8	1550755	1550762	50 %	25 %	25 %	0 %	340782252
32062	NC_015850	G	6	6	1550777	1550782	0 %	0 %	100 %	0 %	340782252
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32101	NC_015850	CAG	2	6	1552580	1552585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782254
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32106	NC_015850	GCACG	2	10	1552657	1552666	20 %	0 %	40 %	40 %	340782254
32107	NC_015850	GTA	2	6	1552787	1552792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782254
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32115	NC_015850	GACA	2	8	1553172	1553179	50 %	0 %	25 %	25 %	340782254
32116	NC_015850	TCC	2	6	1553184	1553189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340782254
32117	NC_015850	TCT	2	6	1553318	1553323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32118	NC_015850	CCG	2	6	1553583	1553588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782256
32119	NC_015850	CG	3	6	1553595	1553600	0 %	0 %	50 %	50 %	340782256
32120	NC_015850	CGC	2	6	1553683	1553688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782256
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32125	NC_015850	A	6	6	1553780	1553785	100 %	0 %	0 %	0 %	340782256
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32141	NC_015850	CGG	2	6	1554340	1554345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782256
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32143	NC_015850	CGG	2	6	1554384	1554389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782256
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32148	NC_015850	TGG	2	6	1554594	1554599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782256
32149	NC_015850	CTG	2	6	1554605	1554610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782256
32150	NC_015850	GCA	2	6	1554700	1554705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782256
32151	NC_015850	CGG	2	6	1554711	1554716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782256
32152	NC_015850	CGG	3	9	1554804	1554812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782256
32153	NC_015850	GC	3	6	1554896	1554901	0 %	0 %	50 %	50 %	340782256
32154	NC_015850	TCA	2	6	1554903	1554908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782256
32155	NC_015850	GGCG	2	8	1554919	1554926	0 %	0 %	75 %	25 %	340782256
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32158	NC_015850	TC	3	6	1555150	1555155	0 %	50 %	0 %	50 %	340782257
32159	NC_015850	GCCGAT	2	12	1555175	1555186	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	340782257
32160	NC_015850	TGG	2	6	1555194	1555199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782257
32161	NC_015850	CTG	2	6	1555268	1555273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782257
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32164	NC_015850	TCG	2	6	1555428	1555433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782257
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32167	NC_015850	CGC	2	6	1555621	1555626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782257
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32169	NC_015850	CTGCA	2	10	1555730	1555739	20 %	20 %	20 %	40 %	340782257
32170	NC_015850	GTCA	2	8	1555784	1555791	25 %	25 %	25 %	25 %	340782257
32171	NC_015850	CGT	2	6	1555825	1555830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782257
32172	NC_015850	CG	4	8	1555838	1555845	0 %	0 %	50 %	50 %	340782257
32173	NC_015850	AGCGCA	2	12	1555881	1555892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782257
32174	NC_015850	ATC	2	6	1555895	1555900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782257
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32181	NC_015850	GGCT	2	8	1556275	1556282	0 %	25 %	50 %	25 %	340782257
32182	NC_015850	CCG	2	6	1556409	1556414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782257
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32184	NC_015850	CCG	2	6	1556516	1556521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782257
32185	NC_015850	GTT	2	6	1556623	1556628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340782258
32186	NC_015850	ATATCC	2	12	1556634	1556645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782258
32187	NC_015850	GTC	2	6	1556695	1556700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782258
32188	NC_015850	CTT	2	6	1556756	1556761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340782258
32189	NC_015850	ACCC	2	8	1556775	1556782	25 %	0 %	0 %	75 %	340782258
32190	NC_015850	AAT	2	6	1556818	1556823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340782258
32191	NC_015850	GCG	2	6	1556912	1556917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782258
32192	NC_015850	CCA	2	6	1556947	1556952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782258
32193	NC_015850	GC	4	8	1556996	1557003	0 %	0 %	50 %	50 %	340782258
32194	NC_015850	CGA	2	6	1557070	1557075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782258
32195	NC_015850	CTG	3	9	1557096	1557104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782258
32196	NC_015850	CCA	2	6	1557112	1557117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782258
32197	NC_015850	CCG	2	6	1557142	1557147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782258
32198	NC_015850	AGC	2	6	1557168	1557173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782258
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32200	NC_015850	GGC	2	6	1557231	1557236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782258
32201	NC_015850	CCA	2	6	1557378	1557383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782258
32202	NC_015850	GCG	2	6	1557389	1557394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782258
32203	NC_015850	GCA	2	6	1557428	1557433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32204	NC_015850	CATCGA	2	12	1557454	1557465	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	340782259
32205	NC_015850	AGC	2	6	1557476	1557481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782259
32206	NC_015850	AAC	2	6	1557588	1557593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340782259
32207	NC_015850	TCG	2	6	1557723	1557728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782259
32208	NC_015850	CTG	3	9	1557737	1557745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782259
32209	NC_015850	CTT	2	6	1557757	1557762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340782259
32210	NC_015850	GAC	2	6	1557775	1557780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782259
32211	NC_015850	GGC	2	6	1557838	1557843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782259
32212	NC_015850	TCG	2	6	1558047	1558052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782260
32213	NC_015850	GCC	2	6	1558055	1558060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782260
32214	NC_015850	CCA	2	6	1558081	1558086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782260
32215	NC_015850	GCG	2	6	1558107	1558112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782260
32216	NC_015850	GCG	2	6	1558134	1558139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782260
32217	NC_015850	CAGG	2	8	1558394	1558401	25 %	0 %	50 %	25 %	340782260
32218	NC_015850	CGA	2	6	1558435	1558440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782260
32219	NC_015850	CCGTG	2	10	1558462	1558471	0 %	20 %	40 %	40 %	340782260
32220	NC_015850	TGG	2	6	1558590	1558595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782260
32221	NC_015850	ACG	2	6	1558639	1558644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782260
32222	NC_015850	CTG	2	6	1558765	1558770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782260
32223	NC_015850	AT	3	6	1558981	1558986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32224	NC_015850	CCTA	2	8	1559137	1559144	25 %	25 %	0 %	50 %	340782261
32225	NC_015850	GA	3	6	1559161	1559166	50 %	0 %	50 %	0 %	340782261
32226	NC_015850	GGA	2	6	1559204	1559209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782261
32227	NC_015850	GAC	2	6	1559247	1559252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782261
32228	NC_015850	TGACC	2	10	1559306	1559315	20 %	20 %	20 %	40 %	340782261
32229	NC_015850	CGCC	2	8	1559382	1559389	0 %	0 %	25 %	75 %	340782261
32230	NC_015850	TCA	2	6	1559416	1559421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782261
32231	NC_015850	CTT	2	6	1559523	1559528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340782261
32232	NC_015850	C	6	6	1559536	1559541	0 %	0 %	0 %	100 %	340782261
32233	NC_015850	GCC	2	6	1559628	1559633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782261
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32235	NC_015850	GCC	2	6	1559758	1559763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782261
32236	NC_015850	CGA	2	6	1559780	1559785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782261
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32240	NC_015850	AGC	2	6	1560242	1560247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782262
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32242	NC_015850	TGG	2	6	1560303	1560308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782262
32243	NC_015850	TCG	2	6	1560321	1560326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782262
32244	NC_015850	GCA	2	6	1560334	1560339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782262
32245	NC_015850	CTGC	2	8	1560349	1560356	0 %	25 %	25 %	50 %	340782262
32246	NC_015850	TGC	2	6	1560378	1560383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782262
32247	NC_015850	GGTG	2	8	1560388	1560395	0 %	25 %	75 %	0 %	340782262
32248	NC_015850	GCA	2	6	1560424	1560429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782262
32249	NC_015850	T	6	6	1560430	1560435	0 %	100 %	0 %	0 %	340782262
32250	NC_015850	GGCA	2	8	1560439	1560446	25 %	0 %	50 %	25 %	340782262
32251	NC_015850	A	7	7	1560491	1560497	100 %	0 %	0 %	0 %	340782262
32252	NC_015850	ATG	2	6	1560501	1560506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782262
32253	NC_015850	GAC	3	9	1560544	1560552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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32256	NC_015850	GTG	2	6	1560814	1560819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782263
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32258	NC_015850	TC	3	6	1560992	1560997	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32259	NC_015850	CG	3	6	1561043	1561048	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32260	NC_015850	TCG	2	6	1561158	1561163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32261	NC_015850	AGC	2	6	1561177	1561182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32262	NC_015850	GTA	2	6	1561185	1561190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32263	NC_015850	TCG	2	6	1561191	1561196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32264	NC_015850	CCA	2	6	1561220	1561225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782264
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32267	NC_015850	AGCA	2	8	1561350	1561357	50 %	0 %	25 %	25 %	340782264
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32302	NC_015850	GCA	2	6	1563345	1563350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782265
32303	NC_015850	GCA	2	6	1563447	1563452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782265
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32313	NC_015850	GCT	2	6	1564077	1564082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782265
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32317	NC_015850	CCTC	2	8	1564471	1564478	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
32318	NC_015850	TAC	2	6	1564495	1564500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32319	NC_015850	TCAT	2	8	1564577	1564584	25 %	50 %	0 %	25 %	340782266
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32328	NC_015850	GGCT	2	8	1564984	1564991	0 %	25 %	50 %	25 %	340782266
32329	NC_015850	GC	3	6	1565021	1565026	0 %	0 %	50 %	50 %	340782266
32330	NC_015850	ATC	2	6	1565085	1565090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782266
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32332	NC_015850	ATC	2	6	1565166	1565171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782266
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32334	NC_015850	GCA	2	6	1565229	1565234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782266
32335	NC_015850	TGTAGG	2	12	1565247	1565258	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	340782266
32336	NC_015850	ACA	2	6	1565266	1565271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340782266
32337	NC_015850	CCA	2	6	1565299	1565304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782266
32338	NC_015850	A	6	6	1565329	1565334	100 %	0 %	0 %	0 %	340782266
32339	NC_015850	CGC	2	6	1565335	1565340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782266
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32341	NC_015850	GTG	2	6	1565361	1565366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782266
32342	NC_015850	AGT	2	6	1565418	1565423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782266
32343	NC_015850	GTA	2	6	1565471	1565476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782266
32344	NC_015850	CCG	2	6	1565518	1565523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782266
32345	NC_015850	A	6	6	1565603	1565608	100 %	0 %	0 %	0 %	340782266
32346	NC_015850	GACC	2	8	1565611	1565618	25 %	0 %	25 %	50 %	340782266
32347	NC_015850	GAT	2	6	1565687	1565692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782266
32348	NC_015850	ATG	2	6	1565703	1565708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782266
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32467	NC_015850	CGG	2	6	1571564	1571569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782270
32468	NC_015850	GGCC	2	8	1571573	1571580	0 %	0 %	50 %	50 %	340782270
32469	NC_015850	TCC	2	6	1571587	1571592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340782270
32470	NC_015850	CGA	2	6	1571612	1571617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782270
32471	NC_015850	ACG	2	6	1571650	1571655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782270
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32474	NC_015850	TGA	2	6	1571750	1571755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782270
32475	NC_015850	TCC	2	6	1571773	1571778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340782270
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32478	NC_015850	GAC	2	6	1571817	1571822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782270
32479	NC_015850	GCC	2	6	1572019	1572024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782270
32480	NC_015850	CTG	2	6	1572132	1572137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782270
32481	NC_015850	CG	3	6	1572166	1572171	0 %	0 %	50 %	50 %	340782270
32482	NC_015850	TCG	2	6	1572235	1572240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782270
32483	NC_015850	GCA	2	6	1572253	1572258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782270
32484	NC_015850	GAG	2	6	1572291	1572296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782270
32485	NC_015850	GAT	3	9	1572338	1572346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32486	NC_015850	TAGGC	2	10	1572350	1572359	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
32487	NC_015850	CGT	2	6	1572489	1572494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782271
32488	NC_015850	AGAT	2	8	1572634	1572641	50 %	25 %	25 %	0 %	340782271
32489	NC_015850	GGA	2	6	1572656	1572661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782271
32490	NC_015850	GCT	2	6	1572761	1572766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782271
32491	NC_015850	GCC	2	6	1572787	1572792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782271
32492	NC_015850	GCA	2	6	1572821	1572826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782271
32493	NC_015850	GC	3	6	1572876	1572881	0 %	0 %	50 %	50 %	340782271
32494	NC_015850	GTC	2	6	1572906	1572911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782271
32495	NC_015850	GTCGTG	2	12	1572993	1573004	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	340782271
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32497	NC_015850	GCCCA	2	10	1573024	1573033	20 %	0 %	20 %	60 %	340782271
32498	NC_015850	CCA	2	6	1573056	1573061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782271
32499	NC_015850	GA	3	6	1573075	1573080	50 %	0 %	50 %	0 %	340782271
32500	NC_015850	CCG	2	6	1573087	1573092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782271

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