MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 60723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31501	NC_015850	TCA	2	6	1524519	1524524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782227
31502	NC_015850	GCA	2	6	1524537	1524542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782227
31503	NC_015850	TCC	2	6	1524549	1524554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340782227
31504	NC_015850	GCG	2	6	1524599	1524604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782227
31505	NC_015850	T	6	6	1524623	1524628	0 %	100 %	0 %	0 %	340782227
31506	NC_015850	GC	3	6	1524643	1524648	0 %	0 %	50 %	50 %	340782227
31507	NC_015850	GAC	2	6	1524665	1524670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782227
31508	NC_015850	GGC	2	6	1524709	1524714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782227
31509	NC_015850	TCC	2	6	1524726	1524731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340782227
31510	NC_015850	GGT	2	6	1524776	1524781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782227
31511	NC_015850	CGC	3	9	1524821	1524829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782228
31512	NC_015850	ATC	2	6	1524832	1524837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782228
31513	NC_015850	CCG	2	6	1524839	1524844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782228
31514	NC_015850	ATCCGC	2	12	1524849	1524860	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	340782228
31515	NC_015850	CCTGG	2	10	1524913	1524922	0 %	20 %	40 %	40 %	340782228
31516	NC_015850	CCG	2	6	1524934	1524939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782228
31517	NC_015850	CAC	2	6	1524966	1524971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782228
31518	NC_015850	GCG	2	6	1525000	1525005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782228
31519	NC_015850	GAG	2	6	1525006	1525011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782228
31520	NC_015850	CAG	2	6	1525039	1525044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782228
31521	NC_015850	GCAG	2	8	1525065	1525072	25 %	0 %	50 %	25 %	340782228
31522	NC_015850	GCC	2	6	1525141	1525146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782228
31523	NC_015850	ACC	2	6	1525210	1525215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782228
31524	NC_015850	GTC	2	6	1525274	1525279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782228
31525	NC_015850	GCT	2	6	1525284	1525289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782228
31526	NC_015850	TGC	2	6	1525316	1525321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782228
31527	NC_015850	GGAG	2	8	1525413	1525420	25 %	0 %	75 %	0 %	340782228
31528	NC_015850	CGT	2	6	1525425	1525430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782228
31529	NC_015850	CCG	2	6	1525437	1525442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782228
31530	NC_015850	CGT	2	6	1525573	1525578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31531	NC_015850	CCCT	2	8	1525628	1525635	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
31532	NC_015850	GCGG	2	8	1525642	1525649	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
31533	NC_015850	TGG	2	6	1525660	1525665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782229
31534	NC_015850	GCC	2	6	1525725	1525730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782229
31535	NC_015850	GGT	2	6	1525754	1525759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782229
31536	NC_015850	GGC	2	6	1525790	1525795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782229
31537	NC_015850	GC	4	8	1526053	1526060	0 %	0 %	50 %	50 %	340782229
31538	NC_015850	TTG	2	6	1526100	1526105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340782229
31539	NC_015850	ATG	2	6	1526109	1526114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782229
31540	NC_015850	TCG	3	9	1526140	1526148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782229
31541	NC_015850	GCG	2	6	1526216	1526221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782229
31542	NC_015850	GTG	2	6	1526226	1526231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782229
31543	NC_015850	GCC	2	6	1526235	1526240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782229
31544	NC_015850	CCG	2	6	1526242	1526247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782229
31545	NC_015850	GTG	2	6	1526272	1526277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782229
31546	NC_015850	GCA	2	6	1526321	1526326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782229
31547	NC_015850	TGC	3	9	1526329	1526337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782229
31548	NC_015850	ACCC	2	8	1526419	1526426	25 %	0 %	0 %	75 %	340782229
31549	NC_015850	GC	3	6	1526436	1526441	0 %	0 %	50 %	50 %	340782229
31550	NC_015850	GCCC	2	8	1526444	1526451	0 %	0 %	25 %	75 %	340782229
31551	NC_015850	CAG	2	6	1526532	1526537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782229
31552	NC_015850	GC	5	10	1526554	1526563	0 %	0 %	50 %	50 %	340782229
31553	NC_015850	CGG	2	6	1526761	1526766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782229
31554	NC_015850	GCAG	2	8	1526864	1526871	25 %	0 %	50 %	25 %	340782229
31555	NC_015850	GGC	2	6	1526876	1526881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782229
31556	NC_015850	CAC	2	6	1526915	1526920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782229
31557	NC_015850	GAA	2	6	1526969	1526974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340782230
31558	NC_015850	GCT	2	6	1526977	1526982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782230
31559	NC_015850	GCCA	2	8	1526996	1527003	25 %	0 %	25 %	50 %	340782230
31560	NC_015850	TGC	2	6	1527018	1527023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782230
31561	NC_015850	GCTC	2	8	1527031	1527038	0 %	25 %	25 %	50 %	340782230
31562	NC_015850	CAG	2	6	1527044	1527049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782230
31563	NC_015850	GC	3	6	1527119	1527124	0 %	0 %	50 %	50 %	340782230
31564	NC_015850	GCG	2	6	1527166	1527171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782230
31565	NC_015850	CGG	3	9	1527230	1527238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782230
31566	NC_015850	CTG	2	6	1527248	1527253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782230
31567	NC_015850	TCC	2	6	1527300	1527305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340782230
31568	NC_015850	GCA	3	9	1527322	1527330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782230
31569	NC_015850	GC	3	6	1527404	1527409	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31570	NC_015850	GGT	2	6	1527452	1527457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31571	NC_015850	T	6	6	1527457	1527462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31572	NC_015850	GCT	2	6	1527572	1527577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31573	NC_015850	GC	3	6	1527607	1527612	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31574	NC_015850	CG	3	6	1527640	1527645	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31575	NC_015850	GGA	2	6	1527676	1527681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782231
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31578	NC_015850	GCC	2	6	1527776	1527781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782231
31579	NC_015850	GCG	2	6	1527782	1527787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782231
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31582	NC_015850	GCC	2	6	1527919	1527924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782231
31583	NC_015850	ACG	2	6	1528010	1528015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782231
31584	NC_015850	ACG	2	6	1528077	1528082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782231
31585	NC_015850	CAG	2	6	1528100	1528105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782231
31586	NC_015850	GCG	2	6	1528150	1528155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782231
31587	NC_015850	AGG	2	6	1528179	1528184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782231
31588	NC_015850	GCA	2	6	1528207	1528212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782231
31589	NC_015850	TAC	2	6	1528234	1528239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782231
31590	NC_015850	CTT	2	6	1528248	1528253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340782231
31591	NC_015850	GCT	2	6	1528334	1528339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782231
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31594	NC_015850	GCA	2	6	1528489	1528494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782231
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31596	NC_015850	GGCCA	2	10	1528595	1528604	20 %	0 %	40 %	40 %	340782231
31597	NC_015850	GTGC	2	8	1528634	1528641	0 %	25 %	50 %	25 %	340782231
31598	NC_015850	GCC	2	6	1528652	1528657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782231
31599	NC_015850	GCA	2	6	1528669	1528674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782231
31600	NC_015850	TGG	2	6	1528753	1528758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782231
31601	NC_015850	GCG	3	9	1528772	1528780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782231
31602	NC_015850	GTG	2	6	1528823	1528828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782231
31603	NC_015850	CAT	2	6	1528889	1528894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782232
31604	NC_015850	CGG	2	6	1528949	1528954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782232
31605	NC_015850	GCG	2	6	1528980	1528985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782232
31606	NC_015850	ATTC	2	8	1529168	1529175	25 %	50 %	0 %	25 %	340782232
31607	NC_015850	GGT	2	6	1529270	1529275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782232
31608	NC_015850	TGG	2	6	1529288	1529293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782232
31609	NC_015850	AAC	2	6	1529344	1529349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340782232
31610	NC_015850	ATC	2	6	1529352	1529357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782232
31611	NC_015850	GATC	2	8	1529411	1529418	25 %	25 %	25 %	25 %	340782232
31612	NC_015850	GGT	2	6	1529483	1529488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782232
31613	NC_015850	TCTG	2	8	1529542	1529549	0 %	50 %	25 %	25 %	340782232
31614	NC_015850	ACG	2	6	1529595	1529600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782232
31615	NC_015850	TCG	2	6	1529767	1529772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782232
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31967	NC_015850	CGC	2	6	1546178	1546183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782249
31968	NC_015850	GAA	2	6	1546190	1546195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340782249
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31970	NC_015850	TCC	2	6	1546288	1546293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340782249
31971	NC_015850	TGC	2	6	1546306	1546311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782249
31972	NC_015850	CGC	2	6	1546319	1546324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782249
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31974	NC_015850	CGCAG	2	10	1546448	1546457	20 %	0 %	40 %	40 %	340782249
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31978	NC_015850	GCG	2	6	1546633	1546638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782249
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31994	NC_015850	CGA	2	6	1547135	1547140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782249
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31997	NC_015850	CGA	2	6	1547225	1547230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782249
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