MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 60723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31002	NC_015850	GCC	2	6	1501430	1501435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782208
31003	NC_015850	C	6	6	1501443	1501448	0 %	0 %	0 %	100 %	340782208
31004	NC_015850	CA	3	6	1501465	1501470	50 %	0 %	0 %	50 %	340782208
31005	NC_015850	GCG	2	6	1501497	1501502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782208
31006	NC_015850	AT	3	6	1501511	1501516	50 %	50 %	0 %	0 %	340782208
31007	NC_015850	CCG	2	6	1501518	1501523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782208
31008	NC_015850	TGGC	2	8	1501535	1501542	0 %	25 %	50 %	25 %	340782208
31009	NC_015850	TTC	2	6	1501547	1501552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340782208
31010	NC_015850	TC	3	6	1501556	1501561	0 %	50 %	0 %	50 %	340782208
31011	NC_015850	GA	3	6	1501572	1501577	50 %	0 %	50 %	0 %	340782208
31012	NC_015850	GTG	2	6	1501604	1501609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782209
31013	NC_015850	TGG	2	6	1501658	1501663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782209
31014	NC_015850	GGC	2	6	1501683	1501688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782209
31015	NC_015850	GTGG	2	8	1501714	1501721	0 %	25 %	75 %	0 %	340782209
31016	NC_015850	GCA	2	6	1501727	1501732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782209
31017	NC_015850	TGG	2	6	1501739	1501744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782209
31018	NC_015850	TGG	3	9	1501754	1501762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782209
31019	NC_015850	CA	3	6	1501806	1501811	50 %	0 %	0 %	50 %	340782209
31020	NC_015850	CCA	2	6	1501865	1501870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782209
31021	NC_015850	GCC	2	6	1501917	1501922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782209
31022	NC_015850	CGG	2	6	1501961	1501966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782209
31023	NC_015850	G	6	6	1501989	1501994	0 %	0 %	100 %	0 %	340782209
31024	NC_015850	TGA	2	6	1502003	1502008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782209
31025	NC_015850	ATC	2	6	1502059	1502064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782209
31026	NC_015850	TTGCAG	2	12	1502191	1502202	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	340782209
31027	NC_015850	GCA	2	6	1502227	1502232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782209
31028	NC_015850	TCA	2	6	1502246	1502251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782209
31029	NC_015850	GGT	2	6	1502295	1502300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782209
31030	NC_015850	CGG	2	6	1502315	1502320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782209
31031	NC_015850	GC	3	6	1502329	1502334	0 %	0 %	50 %	50 %	340782209
31032	NC_015850	T	6	6	1502340	1502345	0 %	100 %	0 %	0 %	340782209
31033	NC_015850	ATC	2	6	1502350	1502355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782209
31034	NC_015850	GGT	3	9	1502394	1502402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782209
31035	NC_015850	GC	3	6	1502407	1502412	0 %	0 %	50 %	50 %	340782209
31036	NC_015850	GGT	2	6	1502421	1502426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782209
31037	NC_015850	TC	3	6	1502475	1502480	0 %	50 %	0 %	50 %	340782209
31038	NC_015850	AGCC	2	8	1502509	1502516	25 %	0 %	25 %	50 %	340782209
31039	NC_015850	GGT	3	9	1502541	1502549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782209
31040	NC_015850	AGC	2	6	1502573	1502578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782209
31041	NC_015850	GCT	2	6	1502589	1502594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782209
31042	NC_015850	GTG	2	6	1502626	1502631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782209
31043	NC_015850	CG	3	6	1502632	1502637	0 %	0 %	50 %	50 %	340782209
31044	NC_015850	GCA	2	6	1502695	1502700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782209
31045	NC_015850	CTG	2	6	1502743	1502748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782210
31046	NC_015850	GAC	2	6	1502759	1502764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782210
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31048	NC_015850	GC	4	8	1502823	1502830	0 %	0 %	50 %	50 %	340782210
31049	NC_015850	GCC	2	6	1502841	1502846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782210
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31052	NC_015850	TCT	2	6	1502930	1502935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340782210
31053	NC_015850	CGCT	2	8	1502961	1502968	0 %	25 %	25 %	50 %	340782210
31054	NC_015850	CGGA	2	8	1503072	1503079	25 %	0 %	50 %	25 %	340782210
31055	NC_015850	TGC	2	6	1503098	1503103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782210
31056	NC_015850	GC	3	6	1503129	1503134	0 %	0 %	50 %	50 %	340782210
31057	NC_015850	GC	3	6	1503221	1503226	0 %	0 %	50 %	50 %	340782210
31058	NC_015850	CGG	2	6	1503253	1503258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782210
31059	NC_015850	TGC	2	6	1503266	1503271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782210
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31062	NC_015850	G	6	6	1503374	1503379	0 %	0 %	100 %	0 %	340782210
31063	NC_015850	CAG	2	6	1503401	1503406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782210
31064	NC_015850	TGC	3	9	1503505	1503513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782210
31065	NC_015850	GGCCAG	2	12	1503540	1503551	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	340782210
31066	NC_015850	GCA	2	6	1503650	1503655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782210
31067	NC_015850	GGA	2	6	1503736	1503741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31068	NC_015850	CGA	2	6	1503825	1503830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782211
31069	NC_015850	GCG	2	6	1503832	1503837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782211
31070	NC_015850	AGG	2	6	1503863	1503868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782211
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31072	NC_015850	GGC	2	6	1503999	1504004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782211
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31074	NC_015850	TGGA	2	8	1504040	1504047	25 %	25 %	50 %	0 %	340782211
31075	NC_015850	GTCCA	2	10	1504050	1504059	20 %	20 %	20 %	40 %	340782211
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31078	NC_015850	GTCCA	2	10	1504223	1504232	20 %	20 %	20 %	40 %	340782212
31079	NC_015850	CGA	2	6	1504239	1504244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782212
31080	NC_015850	GGGC	2	8	1504252	1504259	0 %	0 %	75 %	25 %	340782212
31081	NC_015850	TAC	2	6	1504262	1504267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782212
31082	NC_015850	GC	3	6	1504297	1504302	0 %	0 %	50 %	50 %	340782212
31083	NC_015850	CAG	2	6	1504306	1504311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782212
31084	NC_015850	TTC	2	6	1504314	1504319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340782212
31085	NC_015850	CTT	2	6	1504374	1504379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340782212
31086	NC_015850	GCG	2	6	1504404	1504409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782212
31087	NC_015850	TCC	2	6	1504421	1504426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340782212
31088	NC_015850	GGC	2	6	1504459	1504464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782212
31089	NC_015850	CAG	2	6	1504544	1504549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782212
31090	NC_015850	TCA	2	6	1504557	1504562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782212
31091	NC_015850	CAG	2	6	1504577	1504582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782212
31092	NC_015850	GCAGGG	2	12	1504657	1504668	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	340782212
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31096	NC_015850	ACG	2	6	1504848	1504853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782212
31097	NC_015850	TGG	2	6	1504888	1504893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782212
31098	NC_015850	G	6	6	1504924	1504929	0 %	0 %	100 %	0 %	340782212
31099	NC_015850	GGA	2	6	1504937	1504942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782212
31100	NC_015850	CAGT	2	8	1504957	1504964	25 %	25 %	25 %	25 %	340782212
31101	NC_015850	GGC	2	6	1505011	1505016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782212
31102	NC_015850	GCA	2	6	1505029	1505034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782212
31103	NC_015850	CGC	2	6	1505158	1505163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782212
31104	NC_015850	AGC	2	6	1505246	1505251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782212
31105	NC_015850	G	6	6	1505302	1505307	0 %	0 %	100 %	0 %	340782212
31106	NC_015850	GT	3	6	1505343	1505348	0 %	50 %	50 %	0 %	340782212
31107	NC_015850	CCCA	2	8	1505387	1505394	25 %	0 %	0 %	75 %	340782212
31108	NC_015850	CAGC	2	8	1505448	1505455	25 %	0 %	25 %	50 %	340782212
31109	NC_015850	GGT	2	6	1505569	1505574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782212
31110	NC_015850	CGT	2	6	1505653	1505658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782212
31111	NC_015850	CAG	2	6	1505659	1505664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782212
31112	NC_015850	G	6	6	1505759	1505764	0 %	0 %	100 %	0 %	340782212
31113	NC_015850	TC	3	6	1505779	1505784	0 %	50 %	0 %	50 %	340782212
31114	NC_015850	CGC	2	6	1505851	1505856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782212
31115	NC_015850	GGC	2	6	1505863	1505868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782212
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31234	NC_015850	CGA	2	6	1512261	1512266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782216
31235	NC_015850	CGA	2	6	1512411	1512416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782216
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31464	NC_015850	GGC	2	6	1522783	1522788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782226
31465	NC_015850	TCG	2	6	1522880	1522885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782226
31466	NC_015850	CAG	2	6	1522981	1522986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782226
31467	NC_015850	AGC	2	6	1522999	1523004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782226
31468	NC_015850	CGGG	2	8	1523006	1523013	0 %	0 %	75 %	25 %	340782226
31469	NC_015850	GGC	2	6	1523014	1523019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782226
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31475	NC_015850	CAG	2	6	1523341	1523346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782226
31476	NC_015850	TGG	2	6	1523348	1523353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782226
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31478	NC_015850	GCG	2	6	1523381	1523386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782226
31479	NC_015850	AGC	2	6	1523434	1523439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782226
31480	NC_015850	TGG	2	6	1523449	1523454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782226
31481	NC_015850	CAG	2	6	1523455	1523460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782226
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31487	NC_015850	GGC	2	6	1523757	1523762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782226
31488	NC_015850	GTC	2	6	1523767	1523772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782226
31489	NC_015850	GGC	2	6	1523863	1523868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782227
31490	NC_015850	GCC	2	6	1523915	1523920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782227
31491	NC_015850	CCTC	2	8	1524000	1524007	0 %	25 %	0 %	75 %	340782227
31492	NC_015850	CGG	2	6	1524097	1524102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782227
31493	NC_015850	TGGA	2	8	1524131	1524138	25 %	25 %	50 %	0 %	340782227
31494	NC_015850	CGCT	2	8	1524139	1524146	0 %	25 %	25 %	50 %	340782227
31495	NC_015850	TCA	2	6	1524159	1524164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782227
31496	NC_015850	CATC	2	8	1524232	1524239	25 %	25 %	0 %	50 %	340782227
31497	NC_015850	ATG	2	6	1524269	1524274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782227
31498	NC_015850	GCG	2	6	1524384	1524389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782227
31499	NC_015850	GCG	2	6	1524398	1524403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782227
31500	NC_015850	CGA	2	6	1524511	1524516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782227

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