MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 60723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
29501	NC_015850	GC	3	6	1430109	1430114	0 %	0 %	50 %	50 %	340782136
29502	NC_015850	GTC	2	6	1430299	1430304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782136
29503	NC_015850	CGA	2	6	1430313	1430318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782136
29504	NC_015850	CGC	2	6	1430413	1430418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782136
29505	NC_015850	TCG	2	6	1430477	1430482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782136
29506	NC_015850	CAA	2	6	1430535	1430540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340782136
29507	NC_015850	AGG	2	6	1430576	1430581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782136
29508	NC_015850	CGA	2	6	1430604	1430609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782136
29509	NC_015850	CGG	2	6	1430614	1430619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782136
29510	NC_015850	CATC	2	8	1430769	1430776	25 %	25 %	0 %	50 %	340782136
29511	NC_015850	AAG	2	6	1430827	1430832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340782136
29512	NC_015850	GACC	2	8	1430910	1430917	25 %	0 %	25 %	50 %	340782136
29513	NC_015850	TCG	3	9	1430930	1430938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782136
29514	NC_015850	TCA	2	6	1430999	1431004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782136
29515	NC_015850	CG	4	8	1431048	1431055	0 %	0 %	50 %	50 %	340782136
29516	NC_015850	ACCCTG	2	12	1431121	1431132	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	340782136
29517	NC_015850	GGC	2	6	1431147	1431152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782136
29518	NC_015850	CGG	3	9	1431168	1431176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782136
29519	NC_015850	GCA	2	6	1431201	1431206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782136
29520	NC_015850	CG	3	6	1431210	1431215	0 %	0 %	50 %	50 %	340782136
29521	NC_015850	ACC	2	6	1431232	1431237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782136
29522	NC_015850	GAA	2	6	1431280	1431285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340782136
29523	NC_015850	CGC	2	6	1431300	1431305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782137
29524	NC_015850	AG	3	6	1431360	1431365	50 %	0 %	50 %	0 %	340782137
29525	NC_015850	GCG	2	6	1431688	1431693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29526	NC_015850	CGT	2	6	1431695	1431700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782139
29527	NC_015850	TGG	2	6	1431711	1431716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782139
29528	NC_015850	TGG	2	6	1431757	1431762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782139
29529	NC_015850	CG	3	6	1431786	1431791	0 %	0 %	50 %	50 %	340782139
29530	NC_015850	ACC	2	6	1431826	1431831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782139
29531	NC_015850	CGA	2	6	1431848	1431853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782139
29532	NC_015850	GTC	2	6	1431922	1431927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782139
29533	NC_015850	CCG	2	6	1431932	1431937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782139
29534	NC_015850	CTG	2	6	1431978	1431983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782139
29535	NC_015850	TC	3	6	1432001	1432006	0 %	50 %	0 %	50 %	340782139
29536	NC_015850	AGG	2	6	1432015	1432020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782139
29537	NC_015850	TGC	2	6	1432021	1432026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782139
29538	NC_015850	CTG	2	6	1432092	1432097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782139
29539	NC_015850	GAC	2	6	1432104	1432109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782139
29540	NC_015850	CGT	3	9	1432185	1432193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782139
29541	NC_015850	AAG	2	6	1432219	1432224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340782139
29542	NC_015850	CAT	2	6	1432226	1432231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782139
29543	NC_015850	GCG	2	6	1432243	1432248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782139
29544	NC_015850	CGG	2	6	1432285	1432290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782139
29545	NC_015850	CGCA	2	8	1432338	1432345	25 %	0 %	25 %	50 %	340782139
29546	NC_015850	CTG	3	9	1432440	1432448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782139
29547	NC_015850	GTG	2	6	1432449	1432454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782139
29548	NC_015850	GGCG	2	8	1432510	1432517	0 %	0 %	75 %	25 %	340782139
29549	NC_015850	CTG	2	6	1432521	1432526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782139
29550	NC_015850	CGA	2	6	1432535	1432540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782139
29551	NC_015850	GTA	2	6	1432647	1432652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782139
29552	NC_015850	GACTCC	2	12	1432673	1432684	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	340782139
29553	NC_015850	CTG	2	6	1432689	1432694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782139
29554	NC_015850	CG	3	6	1432876	1432881	0 %	0 %	50 %	50 %	340782140
29555	NC_015850	GGCC	2	8	1432962	1432969	0 %	0 %	50 %	50 %	340782140
29556	NC_015850	GGA	2	6	1432975	1432980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782140
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29558	NC_015850	TGC	2	6	1433118	1433123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782140
29559	NC_015850	GGC	2	6	1433125	1433130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782140
29560	NC_015850	GC	3	6	1433129	1433134	0 %	0 %	50 %	50 %	340782140
29561	NC_015850	GGA	2	6	1433143	1433148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782140
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29564	NC_015850	GTC	2	6	1433300	1433305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782140
29565	NC_015850	GC	3	6	1433312	1433317	0 %	0 %	50 %	50 %	340782140
29566	NC_015850	GCG	2	6	1433321	1433326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782140
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29582	NC_015850	GTC	2	6	1433788	1433793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782141
29583	NC_015850	GCAGC	2	10	1433847	1433856	20 %	0 %	40 %	40 %	340782141
29584	NC_015850	TGG	3	9	1433930	1433938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782141
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29588	NC_015850	TGG	2	6	1433997	1434002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782141
29589	NC_015850	CAT	2	6	1434024	1434029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782141
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29592	NC_015850	A	7	7	1434236	1434242	100 %	0 %	0 %	0 %	340782142
29593	NC_015850	C	6	6	1434278	1434283	0 %	0 %	0 %	100 %	340782142
29594	NC_015850	CAGATC	2	12	1434292	1434303	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	340782142
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29596	NC_015850	GC	3	6	1434358	1434363	0 %	0 %	50 %	50 %	340782142
29597	NC_015850	GC	3	6	1434365	1434370	0 %	0 %	50 %	50 %	340782142
29598	NC_015850	GTG	2	6	1434548	1434553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782142
29599	NC_015850	ATCTT	2	10	1434557	1434566	20 %	60 %	0 %	20 %	340782142
29600	NC_015850	CGT	2	6	1434603	1434608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782142
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29602	NC_015850	CAT	2	6	1434675	1434680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782142
29603	NC_015850	CAG	2	6	1434685	1434690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782142
29604	NC_015850	GCCCA	2	10	1434716	1434725	20 %	0 %	20 %	60 %	340782142
29605	NC_015850	GCG	2	6	1434728	1434733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782142
29606	NC_015850	TGC	2	6	1434830	1434835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782142
29607	NC_015850	CGG	2	6	1434902	1434907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782142
29608	NC_015850	GCG	2	6	1435047	1435052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782142
29609	NC_015850	CTG	2	6	1435126	1435131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782142
29610	NC_015850	GCG	3	9	1435242	1435250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782142
29611	NC_015850	GCA	2	6	1435287	1435292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782142
29612	NC_015850	TGC	2	6	1435328	1435333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782142
29613	NC_015850	AGC	2	6	1435394	1435399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782142
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29615	NC_015850	CCG	2	6	1435520	1435525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782142
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29730	NC_015850	T	8	8	1440200	1440207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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