MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 60723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28502	NC_015850	TGCCAA	2	12	1385034	1385045	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	340782095
28503	NC_015850	CAA	2	6	1385121	1385126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340782095
28504	NC_015850	CTA	2	6	1385154	1385159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782095
28505	NC_015850	GC	3	6	1385207	1385212	0 %	0 %	50 %	50 %	340782095
28506	NC_015850	ACA	2	6	1385225	1385230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340782095
28507	NC_015850	GCACG	2	10	1385289	1385298	20 %	0 %	40 %	40 %	340782095
28508	NC_015850	CAA	2	6	1385367	1385372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340782095
28509	NC_015850	TGG	3	9	1385400	1385408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782095
28510	NC_015850	CGG	2	6	1385426	1385431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782095
28511	NC_015850	ATGGCA	2	12	1385503	1385514	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28512	NC_015850	CTGC	2	8	1385528	1385535	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28513	NC_015850	AGGC	2	8	1385563	1385570	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28514	NC_015850	CG	3	6	1385631	1385636	0 %	0 %	50 %	50 %	340782096
28515	NC_015850	CGC	2	6	1385677	1385682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782096
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28517	NC_015850	GCC	2	6	1385791	1385796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782096
28518	NC_015850	CAAACC	2	12	1385797	1385808	50 %	0 %	0 %	50 %	340782096
28519	NC_015850	GTG	2	6	1385831	1385836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782096
28520	NC_015850	TGG	2	6	1385940	1385945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782096
28521	NC_015850	GGT	2	6	1385971	1385976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782096
28522	NC_015850	GCC	2	6	1385977	1385982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782096
28523	NC_015850	CCG	2	6	1385987	1385992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782096
28524	NC_015850	GCC	3	9	1386001	1386009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782096
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28528	NC_015850	TCG	2	6	1386150	1386155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782096
28529	NC_015850	GTC	2	6	1386177	1386182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782096
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28532	NC_015850	GGC	2	6	1386338	1386343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782096
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28541	NC_015850	GC	3	6	1386815	1386820	0 %	0 %	50 %	50 %	340782097
28542	NC_015850	CCTA	2	8	1386863	1386870	25 %	25 %	0 %	50 %	340782097
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28549	NC_015850	AGC	2	6	1387143	1387148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782097
28550	NC_015850	GC	3	6	1387218	1387223	0 %	0 %	50 %	50 %	340782097
28551	NC_015850	TTA	2	6	1387231	1387236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340782097
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28588	NC_015850	CGG	2	6	1388810	1388815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782098
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28600	NC_015850	AGC	2	6	1389299	1389304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782099
28601	NC_015850	CG	4	8	1389407	1389414	0 %	0 %	50 %	50 %	340782099
28602	NC_015850	CG	3	6	1389498	1389503	0 %	0 %	50 %	50 %	340782099
28603	NC_015850	CTCATG	2	12	1389526	1389537	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	340782099
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28614	NC_015850	CTTTT	2	10	1390069	1390078	0 %	80 %	0 %	20 %	340782099
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28851	NC_015850	CG	3	6	1401626	1401631	0 %	0 %	50 %	50 %	340782111
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28966	NC_015850	GCTGA	2	10	1406706	1406715	20 %	20 %	40 %	20 %	340782115
28967	NC_015850	ATC	2	6	1406733	1406738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782115
28968	NC_015850	GCC	2	6	1406750	1406755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782115
28969	NC_015850	GGT	2	6	1406763	1406768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782115
28970	NC_015850	CGC	2	6	1406769	1406774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782115
28971	NC_015850	G	6	6	1406798	1406803	0 %	0 %	100 %	0 %	340782115
28972	NC_015850	CCTCGG	2	12	1406897	1406908	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	340782115
28973	NC_015850	GCG	2	6	1406998	1407003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782116
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28976	NC_015850	TGG	2	6	1407091	1407096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782116
28977	NC_015850	CG	3	6	1407144	1407149	0 %	0 %	50 %	50 %	340782116
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28981	NC_015850	CGC	2	6	1407327	1407332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782116
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28985	NC_015850	GTC	2	6	1407453	1407458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782117
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28988	NC_015850	CGG	2	6	1407552	1407557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782117
28989	NC_015850	AT	3	6	1407559	1407564	50 %	50 %	0 %	0 %	340782117
28990	NC_015850	AGCA	2	8	1407567	1407574	50 %	0 %	25 %	25 %	340782117
28991	NC_015850	CAC	2	6	1407638	1407643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782117
28992	NC_015850	GGCA	2	8	1407656	1407663	25 %	0 %	50 %	25 %	340782117
28993	NC_015850	TGG	2	6	1407735	1407740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782117
28994	NC_015850	CGGG	2	8	1407773	1407780	0 %	0 %	75 %	25 %	340782117
28995	NC_015850	CG	3	6	1407781	1407786	0 %	0 %	50 %	50 %	340782117
28996	NC_015850	GCG	2	6	1407792	1407797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782117
28997	NC_015850	TTG	2	6	1407800	1407805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340782117
28998	NC_015850	GC	3	6	1407878	1407883	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28999	NC_015850	CGTT	2	8	1407935	1407942	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
29000	NC_015850	TCA	2	6	1407990	1407995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782118

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