MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 60723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
25501	NC_015850	CGG	2	6	1233264	1233269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781959
25502	NC_015850	GAT	2	6	1233277	1233282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781959
25503	NC_015850	CAT	2	6	1233551	1233556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25504	NC_015850	GCAA	2	8	1233562	1233569	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25505	NC_015850	TGG	2	6	1233622	1233627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25506	NC_015850	AGG	2	6	1233632	1233637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25507	NC_015850	CCA	2	6	1233639	1233644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781961
25508	NC_015850	TCG	2	6	1233685	1233690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781961
25509	NC_015850	GAA	2	6	1233707	1233712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340781961
25510	NC_015850	TGCA	2	8	1233843	1233850	25 %	25 %	25 %	25 %	340781961
25511	NC_015850	CCG	2	6	1233859	1233864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781961
25512	NC_015850	CCGGG	2	10	1234052	1234061	0 %	0 %	60 %	40 %	340781961
25513	NC_015850	GCG	2	6	1234093	1234098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781961
25514	NC_015850	CCA	2	6	1234166	1234171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25515	NC_015850	GAC	2	6	1234214	1234219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25516	NC_015850	ACC	2	6	1234235	1234240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25517	NC_015850	GCA	2	6	1234346	1234351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25518	NC_015850	GAC	2	6	1234396	1234401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25519	NC_015850	GAC	2	6	1234457	1234462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25520	NC_015850	TCC	2	6	1234463	1234468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25521	NC_015850	GAC	2	6	1234520	1234525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25522	NC_015850	GAT	2	6	1234526	1234531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25523	NC_015850	GAC	2	6	1234636	1234641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25524	NC_015850	GAC	2	6	1234699	1234704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25525	NC_015850	TAT	2	6	1234707	1234712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25526	NC_015850	GAC	2	6	1234760	1234765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25527	NC_015850	GAC	2	6	1234821	1234826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25528	NC_015850	CGT	2	6	1234831	1234836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25529	NC_015850	GAC	2	6	1234882	1234887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25530	NC_015850	GAC	2	6	1234943	1234948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25531	NC_015850	GAC	2	6	1235004	1235009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25532	NC_015850	CCA	2	6	1235015	1235020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25533	NC_015850	GAC	2	6	1235065	1235070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25534	NC_015850	GAC	2	6	1235126	1235131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25535	NC_015850	CGG	2	6	1235161	1235166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25536	NC_015850	GAC	2	6	1235187	1235192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25537	NC_015850	GAC	2	6	1235249	1235254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25538	NC_015850	CACT	2	8	1235292	1235299	25 %	25 %	0 %	50 %	340781962
25539	NC_015850	CCA	2	6	1235306	1235311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781962
25540	NC_015850	GGCA	2	8	1235317	1235324	25 %	0 %	50 %	25 %	340781962
25541	NC_015850	CAG	2	6	1235388	1235393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781962
25542	NC_015850	CGC	2	6	1235416	1235421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781962
25543	NC_015850	CAC	2	6	1235507	1235512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781962
25544	NC_015850	GC	3	6	1235528	1235533	0 %	0 %	50 %	50 %	340781962
25545	NC_015850	CCAG	2	8	1235566	1235573	25 %	0 %	25 %	50 %	340781962
25546	NC_015850	TCC	2	6	1235647	1235652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781962
25547	NC_015850	GTC	2	6	1235709	1235714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781962
25548	NC_015850	CCA	2	6	1235759	1235764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781962
25549	NC_015850	GCA	2	6	1235855	1235860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781962
25550	NC_015850	CAG	2	6	1235892	1235897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781962
25551	NC_015850	CAGGCT	2	12	1236036	1236047	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	340781962
25552	NC_015850	CAC	2	6	1236075	1236080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781962
25553	NC_015850	CCGA	2	8	1236142	1236149	25 %	0 %	25 %	50 %	340781962
25554	NC_015850	GCG	2	6	1236161	1236166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781962
25555	NC_015850	GTC	2	6	1236174	1236179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781962
25556	NC_015850	CGA	2	6	1236180	1236185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781962
25557	NC_015850	GCG	2	6	1236200	1236205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781962
25558	NC_015850	CAG	2	6	1236228	1236233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781962
25559	NC_015850	GAC	2	6	1236396	1236401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25560	NC_015850	GGT	2	6	1236413	1236418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25561	NC_015850	GAC	3	9	1236457	1236465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25562	NC_015850	GCC	2	6	1236484	1236489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25563	NC_015850	CG	3	6	1236571	1236576	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25564	NC_015850	GAC	2	6	1236579	1236584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25565	NC_015850	TGCC	2	8	1236595	1236602	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25566	NC_015850	GAC	2	6	1236640	1236645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25567	NC_015850	CTAT	2	8	1236661	1236668	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25568	NC_015850	CG	3	6	1236686	1236691	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25569	NC_015850	GAC	2	6	1236694	1236699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25570	NC_015850	CTC	2	6	1236723	1236728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25571	NC_015850	GAC	2	6	1236755	1236760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25572	NC_015850	CG	3	6	1236808	1236813	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25573	NC_015850	GAC	2	6	1236816	1236821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25574	NC_015850	GAC	2	6	1236872	1236877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25575	NC_015850	GAC	2	6	1236933	1236938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25576	NC_015850	GAC	2	6	1236994	1236999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25577	NC_015850	AC	3	6	1237011	1237016	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25578	NC_015850	ACGC	2	8	1237047	1237054	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
25579	NC_015850	CCG	2	6	1237081	1237086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25580	NC_015850	CGG	2	6	1237089	1237094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25581	NC_015850	CCA	2	6	1237191	1237196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781963
25582	NC_015850	CGA	2	6	1237218	1237223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781963
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25584	NC_015850	CAG	2	6	1237384	1237389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781963
25585	NC_015850	GT	4	8	1237411	1237418	0 %	50 %	50 %	0 %	340781963
25586	NC_015850	GTC	2	6	1237486	1237491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781963
25587	NC_015850	CTC	2	6	1237570	1237575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781964
25588	NC_015850	TCT	2	6	1237580	1237585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340781964
25589	NC_015850	CCA	2	6	1237616	1237621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781964
25590	NC_015850	CAT	2	6	1237863	1237868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781964
25591	NC_015850	ATCC	2	8	1237983	1237990	25 %	25 %	0 %	50 %	340781964
25592	NC_015850	CAC	2	6	1238007	1238012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781964
25593	NC_015850	CGT	2	6	1238018	1238023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781964
25594	NC_015850	TTC	2	6	1238086	1238091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340781964
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25596	NC_015850	GTC	2	6	1238202	1238207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781964
25597	NC_015850	GCCCC	2	10	1238211	1238220	0 %	0 %	20 %	80 %	340781964
25598	NC_015850	CGGG	2	8	1238367	1238374	0 %	0 %	75 %	25 %	340781965
25599	NC_015850	GTCCA	2	10	1238439	1238448	20 %	20 %	20 %	40 %	340781965
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25601	NC_015850	CG	3	6	1238643	1238648	0 %	0 %	50 %	50 %	340781965
25602	NC_015850	ACG	2	6	1238655	1238660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781965
25603	NC_015850	CCA	2	6	1238757	1238762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781965
25604	NC_015850	GTGCG	2	10	1238800	1238809	0 %	20 %	60 %	20 %	340781965
25605	NC_015850	GA	3	6	1238811	1238816	50 %	0 %	50 %	0 %	340781965
25606	NC_015850	GCC	2	6	1238840	1238845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781965
25607	NC_015850	CGC	2	6	1238894	1238899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781965
25608	NC_015850	C	6	6	1238910	1238915	0 %	0 %	0 %	100 %	340781965
25609	NC_015850	CAGAGG	2	12	1238919	1238930	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	340781965
25610	NC_015850	GCA	3	9	1238935	1238943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781965
25611	NC_015850	AGC	2	6	1239023	1239028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781966
25612	NC_015850	CGA	2	6	1239049	1239054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781966
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25614	NC_015850	TCC	2	6	1239188	1239193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781966
25615	NC_015850	CGG	2	6	1239198	1239203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781966
25616	NC_015850	CAG	2	6	1239211	1239216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781966
25617	NC_015850	TCG	2	6	1239284	1239289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781966
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25619	NC_015850	CTT	2	6	1239331	1239336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340781966
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25621	NC_015850	CTT	2	6	1239409	1239414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340781966
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