MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 60723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23001	NC_015850	ATC	2	6	1100578	1100583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23002	NC_015850	CAG	2	6	1100645	1100650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23003	NC_015850	GAT	2	6	1100680	1100685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23004	NC_015850	GGT	2	6	1100695	1100700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23005	NC_015850	TC	3	6	1100779	1100784	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23006	NC_015850	AGC	2	6	1100788	1100793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23007	NC_015850	TCA	2	6	1100801	1100806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23008	NC_015850	T	6	6	1100857	1100862	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23009	NC_015850	AGG	2	6	1100893	1100898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23010	NC_015850	CAT	2	6	1101197	1101202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781842
23011	NC_015850	TGG	2	6	1101261	1101266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781842
23012	NC_015850	GGC	2	6	1101269	1101274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781842
23013	NC_015850	CTC	2	6	1101404	1101409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781842
23014	NC_015850	CA	3	6	1101500	1101505	50 %	0 %	0 %	50 %	340781842
23015	NC_015850	GAAT	2	8	1101529	1101536	50 %	25 %	25 %	0 %	340781842
23016	NC_015850	CTT	2	6	1101593	1101598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340781842
23017	NC_015850	TGC	2	6	1101699	1101704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781842
23018	NC_015850	CGA	2	6	1101730	1101735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781842
23019	NC_015850	CG	3	6	1101760	1101765	0 %	0 %	50 %	50 %	340781842
23020	NC_015850	TCCGA	2	10	1101815	1101824	20 %	20 %	20 %	40 %	340781842
23021	NC_015850	CGA	2	6	1101900	1101905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781842
23022	NC_015850	CAG	2	6	1101908	1101913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781842
23023	NC_015850	ACC	2	6	1101957	1101962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781842
23024	NC_015850	CGCC	2	8	1101999	1102006	0 %	0 %	25 %	75 %	340781842
23025	NC_015850	GCT	2	6	1102012	1102017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781842
23026	NC_015850	TCT	2	6	1102033	1102038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340781842
23027	NC_015850	ACC	2	6	1102068	1102073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781842
23028	NC_015850	TCT	2	6	1102081	1102086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340781842
23029	NC_015850	TCGT	2	8	1102143	1102150	0 %	50 %	25 %	25 %	340781842
23030	NC_015850	CCG	2	6	1102153	1102158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781842
23031	NC_015850	ATC	2	6	1102170	1102175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781842
23032	NC_015850	GCC	2	6	1102245	1102250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23033	NC_015850	CGC	2	6	1102273	1102278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23034	NC_015850	GC	3	6	1102277	1102282	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23035	NC_015850	CTG	2	6	1102349	1102354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23036	NC_015850	CCG	2	6	1102364	1102369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23037	NC_015850	CTGG	2	8	1102449	1102456	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23038	NC_015850	TCG	2	6	1102592	1102597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23039	NC_015850	A	7	7	1102617	1102623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23040	NC_015850	GCC	2	6	1102625	1102630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23041	NC_015850	CCA	2	6	1102637	1102642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23042	NC_015850	G	6	6	1102744	1102749	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
23043	NC_015850	GC	3	6	1102857	1102862	0 %	0 %	50 %	50 %	340781843
23044	NC_015850	GA	3	6	1102980	1102985	50 %	0 %	50 %	0 %	340781843
23045	NC_015850	AGCTGT	2	12	1102997	1103008	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	340781843
23046	NC_015850	GC	3	6	1103030	1103035	0 %	0 %	50 %	50 %	340781843
23047	NC_015850	GCCA	2	8	1103040	1103047	25 %	0 %	25 %	50 %	340781843
23048	NC_015850	CCA	2	6	1103064	1103069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781843
23049	NC_015850	AACC	2	8	1103112	1103119	50 %	0 %	0 %	50 %	340781843
23050	NC_015850	GAT	2	6	1103131	1103136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781843
23051	NC_015850	CTGGC	2	10	1103251	1103260	0 %	20 %	40 %	40 %	340781843
23052	NC_015850	GGT	2	6	1103272	1103277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781843
23053	NC_015850	AGA	2	6	1103415	1103420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340781843
23054	NC_015850	GGTG	2	8	1103459	1103466	0 %	25 %	75 %	0 %	340781844
23055	NC_015850	CCTGG	2	10	1103494	1103503	0 %	20 %	40 %	40 %	340781844
23056	NC_015850	CAG	2	6	1103521	1103526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781844
23057	NC_015850	CGA	2	6	1103541	1103546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781844
23058	NC_015850	GCA	2	6	1103550	1103555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781844
23059	NC_015850	CGC	2	6	1103560	1103565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781844
23060	NC_015850	TCT	2	6	1103606	1103611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340781844
23061	NC_015850	TCG	2	6	1103627	1103632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781844
23062	NC_015850	GTC	2	6	1103679	1103684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781845
23063	NC_015850	GGA	2	6	1103732	1103737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781845
23064	NC_015850	TGG	2	6	1103773	1103778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781845
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23068	NC_015850	GCGCTC	2	12	1103859	1103870	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	340781845
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23071	NC_015850	CAG	2	6	1103979	1103984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781845
23072	NC_015850	GAA	2	6	1104030	1104035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340781845
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23074	NC_015850	GCG	2	6	1104141	1104146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781845
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23082	NC_015850	CCAG	2	8	1104874	1104881	25 %	0 %	25 %	50 %	340781846
23083	NC_015850	GGCG	2	8	1104889	1104896	0 %	0 %	75 %	25 %	340781846
23084	NC_015850	GTC	2	6	1104902	1104907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781846
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23090	NC_015850	TC	3	6	1105156	1105161	0 %	50 %	0 %	50 %	340781846
23091	NC_015850	GAG	2	6	1105184	1105189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781846
23092	NC_015850	CGT	2	6	1105198	1105203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781846
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23104	NC_015850	GATC	2	8	1105738	1105745	25 %	25 %	25 %	25 %	340781846
23105	NC_015850	CCA	2	6	1105792	1105797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23106	NC_015850	GT	3	6	1105827	1105832	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23107	NC_015850	TCC	2	6	1105856	1105861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23108	NC_015850	CGT	2	6	1105903	1105908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781847
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23113	NC_015850	GGC	2	6	1106212	1106217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23114	NC_015850	GTT	2	6	1106383	1106388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23115	NC_015850	TCC	2	6	1106430	1106435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23116	NC_015850	CCT	2	6	1106502	1106507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781848
23117	NC_015850	TCGCT	2	10	1106569	1106578	0 %	40 %	20 %	40 %	340781848
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23119	NC_015850	ATA	2	6	1106846	1106851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340781848
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23235	NC_015850	ACC	2	6	1113809	1113814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781855
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23239	NC_015850	GAA	2	6	1114124	1114129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340781856
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23348	NC_015850	CGGT	2	8	1119597	1119604	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23349	NC_015850	GAC	2	6	1119645	1119650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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23351	NC_015850	CTT	2	6	1119728	1119733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23352	NC_015850	CGC	2	6	1119821	1119826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23353	NC_015850	ACG	2	6	1119845	1119850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23354	NC_015850	ACCGA	2	10	1119878	1119887	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
23355	NC_015850	AAGA	2	8	1119970	1119977	75 %	0 %	25 %	0 %	340781860
23356	NC_015850	CGG	3	9	1120016	1120024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781860
23357	NC_015850	GAC	2	6	1120032	1120037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781860
23358	NC_015850	CAG	2	6	1120038	1120043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781860
23359	NC_015850	ACC	2	6	1120072	1120077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781860
23360	NC_015850	CGG	2	6	1120082	1120087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781860
23361	NC_015850	CGG	2	6	1120097	1120102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781860
23362	NC_015850	CCA	2	6	1120109	1120114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781860
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23373	NC_015850	GGA	2	6	1120514	1120519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781862
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23426	NC_015850	CA	3	6	1123596	1123601	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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23453	NC_015850	A	6	6	1124543	1124548	100 %	0 %	0 %	0 %	340781865
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23468	NC_015850	CGG	2	6	1125304	1125309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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23472	NC_015850	CGT	2	6	1125492	1125497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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23474	NC_015850	GCGAC	2	10	1125653	1125662	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
23475	NC_015850	AAT	2	6	1125712	1125717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340781866
23476	NC_015850	GC	3	6	1125766	1125771	0 %	0 %	50 %	50 %	340781866
23477	NC_015850	CTG	2	6	1125810	1125815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781866
23478	NC_015850	TCA	2	6	1125826	1125831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781866
23479	NC_015850	ACG	2	6	1125861	1125866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781866
23480	NC_015850	CGATA	2	10	1125908	1125917	40 %	20 %	20 %	20 %	340781866
23481	NC_015850	CGC	2	6	1125993	1125998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781866
23482	NC_015850	CAG	2	6	1126056	1126061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781866
23483	NC_015850	GCA	2	6	1126132	1126137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781866
23484	NC_015850	CAT	2	6	1126241	1126246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781866
23485	NC_015850	CAA	2	6	1126251	1126256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340781866
23486	NC_015850	TCG	2	6	1126432	1126437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781866
23487	NC_015850	CGA	2	6	1126465	1126470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781866
23488	NC_015850	ACC	2	6	1126477	1126482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781866
23489	NC_015850	TTCC	2	8	1126490	1126497	0 %	50 %	0 %	50 %	340781866
23490	NC_015850	GTAG	2	8	1126535	1126542	25 %	25 %	50 %	0 %	340781866
23491	NC_015850	GC	3	6	1126584	1126589	0 %	0 %	50 %	50 %	340781866
23492	NC_015850	TCC	2	6	1126654	1126659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781866
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23499	NC_015850	ACG	2	6	1127161	1127166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781866
23500	NC_015850	GCTC	2	8	1127185	1127192	0 %	25 %	25 %	50 %	340781866

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