MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 60723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_015850	GGGC	2	8	930252	930259	0 %	0 %	75 %	25 %	340781676
19502	NC_015850	CGG	2	6	930348	930353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781677
19503	NC_015850	TAT	2	6	930426	930431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340781677
19504	NC_015850	GTG	2	6	930459	930464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781677
19505	NC_015850	ATCC	2	8	930467	930474	25 %	25 %	0 %	50 %	340781677
19506	NC_015850	CGA	2	6	930479	930484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781677
19507	NC_015850	CGCGA	2	10	930502	930511	20 %	0 %	40 %	40 %	340781677
19508	NC_015850	AGCGC	2	10	930538	930547	20 %	0 %	40 %	40 %	340781677
19509	NC_015850	GGC	2	6	930605	930610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781678
19510	NC_015850	GAC	2	6	930619	930624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781678
19511	NC_015850	CGG	2	6	930656	930661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781678
19512	NC_015850	GCC	2	6	930662	930667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781678
19513	NC_015850	TGC	2	6	930672	930677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781678
19514	NC_015850	CGGG	2	8	930724	930731	0 %	0 %	75 %	25 %	340781678
19515	NC_015850	TCG	2	6	930792	930797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781678
19516	NC_015850	TGGC	2	8	930846	930853	0 %	25 %	50 %	25 %	340781678
19517	NC_015850	TGC	3	9	930864	930872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781678
19518	NC_015850	AGC	2	6	930933	930938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781678
19519	NC_015850	GCG	2	6	930943	930948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781678
19520	NC_015850	GC	3	6	930958	930963	0 %	0 %	50 %	50 %	340781678
19521	NC_015850	TCAA	2	8	930975	930982	50 %	25 %	0 %	25 %	340781678
19522	NC_015850	GC	3	6	930996	931001	0 %	0 %	50 %	50 %	340781678
19523	NC_015850	GCA	2	6	931010	931015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781678
19524	NC_015850	TGC	2	6	931047	931052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781678
19525	NC_015850	GGC	2	6	931054	931059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781678
19526	NC_015850	CGC	2	6	931067	931072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781678
19527	NC_015850	GC	3	6	931126	931131	0 %	0 %	50 %	50 %	340781678
19528	NC_015850	GAG	2	6	931166	931171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781678
19529	NC_015850	GGC	2	6	931260	931265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781679
19530	NC_015850	AGC	2	6	931269	931274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781679
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19532	NC_015850	GCCA	2	8	931317	931324	25 %	0 %	25 %	50 %	340781679
19533	NC_015850	GGA	2	6	931341	931346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781679
19534	NC_015850	G	6	6	931356	931361	0 %	0 %	100 %	0 %	340781679
19535	NC_015850	CGC	2	6	931379	931384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781679
19536	NC_015850	TGG	2	6	931411	931416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19537	NC_015850	CGG	2	6	931432	931437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19538	NC_015850	CGC	2	6	931440	931445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19539	NC_015850	GGCCAT	2	12	931469	931480	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	340781680
19540	NC_015850	CGC	2	6	931526	931531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781680
19541	NC_015850	CGG	2	6	931720	931725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781680
19542	NC_015850	TTC	2	6	931770	931775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340781680
19543	NC_015850	CCG	2	6	931796	931801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781680
19544	NC_015850	G	6	6	931870	931875	0 %	0 %	100 %	0 %	340781680
19545	NC_015850	GCT	2	6	931904	931909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781680
19546	NC_015850	GCC	2	6	931944	931949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781680
19547	NC_015850	GCC	2	6	931980	931985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781680
19548	NC_015850	TGC	2	6	932029	932034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781680
19549	NC_015850	TGT	2	6	932053	932058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340781680
19550	NC_015850	GCG	2	6	932072	932077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781680
19551	NC_015850	GC	3	6	932093	932098	0 %	0 %	50 %	50 %	340781680
19552	NC_015850	TTTC	2	8	932114	932121	0 %	75 %	0 %	25 %	340781680
19553	NC_015850	ACG	2	6	932206	932211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781680
19554	NC_015850	CGC	2	6	932261	932266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781680
19555	NC_015850	CGG	2	6	932278	932283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781680
19556	NC_015850	CGG	2	6	932329	932334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781680
19557	NC_015850	CCT	2	6	932426	932431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781680
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19560	NC_015850	CGG	2	6	932476	932481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781680
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19570	NC_015850	GAT	2	6	932807	932812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781680
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19580	NC_015850	TGC	3	9	933256	933264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781680
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19587	NC_015850	CTG	2	6	933555	933560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781680
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19591	NC_015850	ACG	2	6	933622	933627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781680
19592	NC_015850	A	6	6	933660	933665	100 %	0 %	0 %	0 %	340781680
19593	NC_015850	TGTC	2	8	933705	933712	0 %	50 %	25 %	25 %	340781680
19594	NC_015850	GC	3	6	933756	933761	0 %	0 %	50 %	50 %	340781680
19595	NC_015850	CTT	2	6	933865	933870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19596	NC_015850	AGG	2	6	933945	933950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19597	NC_015850	TGGA	2	8	933954	933961	25 %	25 %	50 %	0 %	340781681
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19603	NC_015850	CTG	2	6	934311	934316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781681
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19605	NC_015850	CGG	2	6	934324	934329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781681
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19610	NC_015850	CGG	2	6	934411	934416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781681
19611	NC_015850	GCC	2	6	934479	934484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781681
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19614	NC_015850	TGC	2	6	934558	934563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781681
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19616	NC_015850	GCC	2	6	934611	934616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781681
19617	NC_015850	GGAC	2	8	934667	934674	25 %	0 %	50 %	25 %	340781681
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19619	NC_015850	GCTCAT	2	12	934823	934834	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	340781681
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19978	NC_015850	TGC	2	6	951155	951160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781694
19979	NC_015850	GGGCGT	2	12	951195	951206	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	340781694
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