MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 60723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_015850	GC	3	6	907559	907564	0 %	0 %	50 %	50 %	340781653
19003	NC_015850	GC	3	6	907584	907589	0 %	0 %	50 %	50 %	340781653
19004	NC_015850	TGG	2	6	907591	907596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781653
19005	NC_015850	GCC	2	6	907650	907655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781653
19006	NC_015850	GCC	2	6	907665	907670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781653
19007	NC_015850	TCC	2	6	907732	907737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781653
19008	NC_015850	AGG	2	6	907810	907815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781653
19009	NC_015850	CGA	2	6	907829	907834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781653
19010	NC_015850	CG	3	6	907856	907861	0 %	0 %	50 %	50 %	340781653
19011	NC_015850	CGC	2	6	907883	907888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781653
19012	NC_015850	GC	3	6	907949	907954	0 %	0 %	50 %	50 %	340781653
19013	NC_015850	GGC	2	6	908012	908017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781653
19014	NC_015850	TGC	2	6	908053	908058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781653
19015	NC_015850	TC	3	6	908099	908104	0 %	50 %	0 %	50 %	340781653
19016	NC_015850	ATC	2	6	908139	908144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781653
19017	NC_015850	GCT	2	6	908159	908164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781653
19018	NC_015850	CGC	2	6	908186	908191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781653
19019	NC_015850	GCCG	2	8	908201	908208	0 %	0 %	50 %	50 %	340781653
19020	NC_015850	GGCTG	2	10	908240	908249	0 %	20 %	60 %	20 %	340781653
19021	NC_015850	GCA	2	6	908293	908298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781653
19022	NC_015850	GCC	2	6	908361	908366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781653
19023	NC_015850	GC	3	6	908369	908374	0 %	0 %	50 %	50 %	340781653
19024	NC_015850	AGGC	2	8	908385	908392	25 %	0 %	50 %	25 %	340781653
19025	NC_015850	GC	3	6	908523	908528	0 %	0 %	50 %	50 %	340781653
19026	NC_015850	TCG	2	6	908596	908601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781653
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19028	NC_015850	GCC	2	6	908626	908631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781653
19029	NC_015850	GAG	2	6	908646	908651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781653
19030	NC_015850	GTGG	2	8	908703	908710	0 %	25 %	75 %	0 %	340781654
19031	NC_015850	AG	3	6	908796	908801	50 %	0 %	50 %	0 %	340781654
19032	NC_015850	GCC	2	6	908854	908859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781654
19033	NC_015850	CGC	2	6	908873	908878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781654
19034	NC_015850	GTG	3	9	908887	908895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781654
19035	NC_015850	CCCG	2	8	908979	908986	0 %	0 %	25 %	75 %	340781654
19036	NC_015850	CCG	2	6	908993	908998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781654
19037	NC_015850	GCT	2	6	909000	909005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781654
19038	NC_015850	CGG	2	6	909022	909027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781654
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19040	NC_015850	GGA	2	6	909069	909074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19041	NC_015850	CGG	2	6	909077	909082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19042	NC_015850	GGC	2	6	909090	909095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781655
19043	NC_015850	GCA	2	6	909107	909112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781655
19044	NC_015850	CGA	2	6	909126	909131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781655
19045	NC_015850	GCTG	2	8	909213	909220	0 %	25 %	50 %	25 %	340781655
19046	NC_015850	CAC	2	6	909268	909273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781655
19047	NC_015850	CCTC	2	8	909425	909432	0 %	25 %	0 %	75 %	340781655
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19050	NC_015850	TCA	2	6	909653	909658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781655
19051	NC_015850	TCT	2	6	909681	909686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340781655
19052	NC_015850	GGA	2	6	909687	909692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781655
19053	NC_015850	CTG	2	6	909730	909735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781655
19054	NC_015850	CGT	2	6	909744	909749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781655
19055	NC_015850	CTG	2	6	909769	909774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781655
19056	NC_015850	GTG	2	6	909800	909805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781655
19057	NC_015850	GGC	2	6	909914	909919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781655
19058	NC_015850	GC	3	6	909976	909981	0 %	0 %	50 %	50 %	340781655
19059	NC_015850	AGG	2	6	910091	910096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781655
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19061	NC_015850	CTG	2	6	910141	910146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781655
19062	NC_015850	CTT	2	6	910182	910187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340781655
19063	NC_015850	TGC	2	6	910199	910204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781655
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19066	NC_015850	GACG	2	8	910332	910339	25 %	0 %	50 %	25 %	340781655
19067	NC_015850	GCG	2	6	910360	910365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781655
19068	NC_015850	CGC	2	6	910433	910438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781656
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19072	NC_015850	TCCA	2	8	910646	910653	25 %	25 %	0 %	50 %	340781656
19073	NC_015850	CTCA	2	8	910723	910730	25 %	25 %	0 %	50 %	340781656
19074	NC_015850	GGC	2	6	910734	910739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781656
19075	NC_015850	GGCG	2	8	910779	910786	0 %	0 %	75 %	25 %	340781656
19076	NC_015850	GCC	2	6	910855	910860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781656
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19078	NC_015850	ACCC	2	8	910914	910921	25 %	0 %	0 %	75 %	340781656
19079	NC_015850	GATCTG	2	12	910933	910944	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	340781656
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19081	NC_015850	GC	3	6	911063	911068	0 %	0 %	50 %	50 %	340781656
19082	NC_015850	GCC	3	9	911215	911223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781656
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19085	NC_015850	GCG	2	6	911376	911381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781656
19086	NC_015850	GCGCC	2	10	911487	911496	0 %	0 %	40 %	60 %	340781656
19087	NC_015850	GGA	2	6	911520	911525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781656
19088	NC_015850	GC	3	6	911547	911552	0 %	0 %	50 %	50 %	340781656
19089	NC_015850	AACGGA	2	12	911646	911657	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	340781656
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19091	NC_015850	AGC	2	6	911720	911725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781656
19092	NC_015850	GGC	2	6	911784	911789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781656
19093	NC_015850	GCA	2	6	911858	911863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781657
19094	NC_015850	CCG	2	6	911872	911877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781657
19095	NC_015850	TGG	3	9	911905	911913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781657
19096	NC_015850	CTG	2	6	911940	911945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781657
19097	NC_015850	GAC	2	6	911969	911974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781657
19098	NC_015850	CCTGGC	3	18	911975	911992	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	340781657
19099	NC_015850	CG	3	6	912014	912019	0 %	0 %	50 %	50 %	340781657
19100	NC_015850	CG	3	6	912083	912088	0 %	0 %	50 %	50 %	340781657
19101	NC_015850	TGG	2	6	912133	912138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781657
19102	NC_015850	AATC	2	8	912143	912150	50 %	25 %	0 %	25 %	340781657
19103	NC_015850	T	7	7	912242	912248	0 %	100 %	0 %	0 %	340781657
19104	NC_015850	CAT	2	6	912323	912328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781657
19105	NC_015850	CGG	4	12	912349	912360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781657
19106	NC_015850	CG	3	6	912388	912393	0 %	0 %	50 %	50 %	340781657
19107	NC_015850	TGC	2	6	912487	912492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781657
19108	NC_015850	TC	3	6	912539	912544	0 %	50 %	0 %	50 %	340781657
19109	NC_015850	CTG	2	6	912555	912560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781657
19110	NC_015850	GCG	2	6	912566	912571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781657
19111	NC_015850	CTG	3	9	912663	912671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781657
19112	NC_015850	GTC	2	6	912741	912746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781658
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19114	NC_015850	CGC	2	6	912814	912819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781658
19115	NC_015850	CAA	2	6	912832	912837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340781658
19116	NC_015850	CAT	2	6	912871	912876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781658
19117	NC_015850	GGC	2	6	912892	912897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781658
19118	NC_015850	CTG	2	6	912899	912904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781658
19119	NC_015850	TCCC	2	8	912930	912937	0 %	25 %	0 %	75 %	340781658
19120	NC_015850	GCT	2	6	912943	912948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781658
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19122	NC_015850	TGC	2	6	912969	912974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781658
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19124	NC_015850	GTT	2	6	913012	913017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340781658
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19127	NC_015850	CTG	2	6	913133	913138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781658
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19152	NC_015850	GCT	2	6	914150	914155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781659
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19229	NC_015850	GAT	2	6	917538	917543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781661
19230	NC_015850	G	6	6	917544	917549	0 %	0 %	100 %	0 %	340781661
19231	NC_015850	GGCG	2	8	917564	917571	0 %	0 %	75 %	25 %	340781661
19232	NC_015850	TTC	2	6	917586	917591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340781661
19233	NC_015850	GATC	2	8	917678	917685	25 %	25 %	25 %	25 %	340781661
19234	NC_015850	A	6	6	917689	917694	100 %	0 %	0 %	0 %	340781661
19235	NC_015850	GACA	2	8	917723	917730	50 %	0 %	25 %	25 %	340781661
19236	NC_015850	CA	3	6	917733	917738	50 %	0 %	0 %	50 %	340781661
19237	NC_015850	ATGG	2	8	917785	917792	25 %	25 %	50 %	0 %	340781661
19238	NC_015850	TGGGCC	2	12	917806	917817	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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19247	NC_015850	A	6	6	918368	918373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19346	NC_015850	TTTAC	2	10	922351	922360	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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19348	NC_015850	GATTG	2	10	922411	922420	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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19478	NC_015850	TGG	2	6	929363	929368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19479	NC_015850	CAGGG	2	10	929373	929382	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
19480	NC_015850	GAG	2	6	929474	929479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19481	NC_015850	GCGTT	2	10	929502	929511	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
19482	NC_015850	GGC	2	6	929551	929556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781675
19483	NC_015850	GGC	2	6	929572	929577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781675
19484	NC_015850	GTG	2	6	929637	929642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781675
19485	NC_015850	GCG	2	6	929660	929665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781675
19486	NC_015850	CG	3	6	929669	929674	0 %	0 %	50 %	50 %	340781675
19487	NC_015850	GGGT	2	8	929694	929701	0 %	25 %	75 %	0 %	340781675
19488	NC_015850	TGG	2	6	929709	929714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781675
19489	NC_015850	CAT	2	6	929722	929727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781675
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19491	NC_015850	CAT	2	6	929856	929861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781676
19492	NC_015850	CAG	2	6	929905	929910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781676
19493	NC_015850	GGA	2	6	929973	929978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781676
19494	NC_015850	GAA	2	6	929986	929991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340781676
19495	NC_015850	TCAG	2	8	930011	930018	25 %	25 %	25 %	25 %	340781676
19496	NC_015850	CTG	4	12	930022	930033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781676
19497	NC_015850	CGCC	2	8	930061	930068	0 %	0 %	25 %	75 %	340781676
19498	NC_015850	TGC	2	6	930095	930100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781676
19499	NC_015850	GCCGAG	2	12	930142	930153	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	340781676
19500	NC_015850	GCA	2	6	930231	930236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781676

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