MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 60723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_015850	CGC	2	6	816612	816617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17002	NC_015850	TGC	2	6	816620	816625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17003	NC_015850	CGGG	2	8	816685	816692	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17004	NC_015850	GCCG	2	8	816711	816718	0 %	0 %	50 %	50 %	340781552
17005	NC_015850	CGG	2	6	816720	816725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781552
17006	NC_015850	T	7	7	816899	816905	0 %	100 %	0 %	0 %	340781552
17007	NC_015850	GCCGC	2	10	816921	816930	0 %	0 %	40 %	60 %	340781552
17008	NC_015850	CGGCA	2	10	816946	816955	20 %	0 %	40 %	40 %	340781552
17009	NC_015850	TCC	2	6	816973	816978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781552
17010	NC_015850	GAC	2	6	817022	817027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781552
17011	NC_015850	T	7	7	817067	817073	0 %	100 %	0 %	0 %	340781552
17012	NC_015850	TC	3	6	817095	817100	0 %	50 %	0 %	50 %	340781552
17013	NC_015850	GGC	2	6	817163	817168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781552
17014	NC_015850	GGAC	2	8	817247	817254	25 %	0 %	50 %	25 %	340781552
17015	NC_015850	CCTG	2	8	817310	817317	0 %	25 %	25 %	50 %	340781552
17016	NC_015850	ACCT	2	8	817401	817408	25 %	25 %	0 %	50 %	340781552
17017	NC_015850	TGG	2	6	817413	817418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781552
17018	NC_015850	GCA	2	6	817490	817495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781552
17019	NC_015850	TGG	2	6	817507	817512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781552
17020	NC_015850	T	6	6	817538	817543	0 %	100 %	0 %	0 %	340781552
17021	NC_015850	GTG	2	6	817551	817556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781552
17022	NC_015850	GT	3	6	817558	817563	0 %	50 %	50 %	0 %	340781552
17023	NC_015850	GAT	2	6	817589	817594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781552
17024	NC_015850	GCT	2	6	817598	817603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781552
17025	NC_015850	GTG	2	6	817605	817610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781552
17026	NC_015850	CCTT	2	8	817639	817646	0 %	50 %	0 %	50 %	340781552
17027	NC_015850	GCC	2	6	817740	817745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781552
17028	NC_015850	CTGG	2	8	817752	817759	0 %	25 %	50 %	25 %	340781552
17029	NC_015850	GTT	2	6	817771	817776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340781552
17030	NC_015850	CCT	2	6	817804	817809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781552
17031	NC_015850	T	7	7	817844	817850	0 %	100 %	0 %	0 %	340781552
17032	NC_015850	GCC	2	6	817950	817955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781552
17033	NC_015850	TGG	2	6	817978	817983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781552
17034	NC_015850	GCTG	2	8	817984	817991	0 %	25 %	50 %	25 %	340781552
17035	NC_015850	GC	3	6	817992	817997	0 %	0 %	50 %	50 %	340781552
17036	NC_015850	AGG	2	6	818005	818010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781552
17037	NC_015850	CCA	2	6	818012	818017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781552
17038	NC_015850	TGG	2	6	818023	818028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781552
17039	NC_015850	GCCC	2	8	818046	818053	0 %	0 %	25 %	75 %	340781552
17040	NC_015850	GGC	2	6	818060	818065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781552
17041	NC_015850	CGAC	2	8	818226	818233	25 %	0 %	25 %	50 %	340781552
17042	NC_015850	GGC	2	6	818303	818308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17043	NC_015850	CCAC	2	8	818391	818398	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
17044	NC_015850	GAG	2	6	818446	818451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17045	NC_015850	CGA	2	6	818487	818492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781553
17046	NC_015850	GTG	2	6	818553	818558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781553
17047	NC_015850	GAT	2	6	818571	818576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781553
17048	NC_015850	CGC	3	9	818660	818668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781553
17049	NC_015850	CTG	2	6	818698	818703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781553
17050	NC_015850	CCA	2	6	818726	818731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781553
17051	NC_015850	CGC	2	6	818791	818796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781554
17052	NC_015850	CGC	2	6	818802	818807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781554
17053	NC_015850	AGA	3	9	818855	818863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340781554
17054	NC_015850	GAGC	2	8	818906	818913	25 %	0 %	50 %	25 %	340781554
17055	NC_015850	AAG	2	6	818985	818990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340781554
17056	NC_015850	ATC	2	6	818997	819002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781554
17057	NC_015850	GC	3	6	819092	819097	0 %	0 %	50 %	50 %	340781554
17058	NC_015850	GCG	2	6	819155	819160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781554
17059	NC_015850	CCGC	2	8	819200	819207	0 %	0 %	25 %	75 %	340781554
17060	NC_015850	AGG	2	6	819211	819216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781554
17061	NC_015850	CCT	2	6	819233	819238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781554
17062	NC_015850	CAA	2	6	819281	819286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340781554
17063	NC_015850	CGC	2	6	819307	819312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781554
17064	NC_015850	ACA	2	6	819346	819351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340781554
17065	NC_015850	CAT	2	6	819377	819382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781554
17066	NC_015850	TCTCG	2	10	819386	819395	0 %	40 %	20 %	40 %	340781554
17067	NC_015850	TCG	2	6	819424	819429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781554
17068	NC_015850	GCA	2	6	819461	819466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781554
17069	NC_015850	ATC	2	6	819490	819495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781554
17070	NC_015850	CGA	2	6	819524	819529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781554
17071	NC_015850	GAG	2	6	819537	819542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781554
17072	NC_015850	GTC	2	6	819576	819581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781554
17073	NC_015850	TCC	2	6	819582	819587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781554
17074	NC_015850	CGA	2	6	819593	819598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781554
17075	NC_015850	GCCA	2	8	819599	819606	25 %	0 %	25 %	50 %	340781554
17076	NC_015850	CTG	2	6	819684	819689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781554
17077	NC_015850	ACA	2	6	819718	819723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340781554
17078	NC_015850	CGT	2	6	819725	819730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781554
17079	NC_015850	GCG	2	6	819757	819762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781554
17080	NC_015850	T	6	6	819795	819800	0 %	100 %	0 %	0 %	340781554
17081	NC_015850	GCG	2	6	819804	819809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781554
17082	NC_015850	GAG	2	6	819819	819824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781554
17083	NC_015850	GGT	2	6	819825	819830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781554
17084	NC_015850	CAT	2	6	819839	819844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781554
17085	NC_015850	TGG	2	6	819856	819861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781554
17086	NC_015850	GATG	2	8	819875	819882	25 %	25 %	50 %	0 %	340781554
17087	NC_015850	CAA	2	6	819977	819982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340781554
17088	NC_015850	CGC	2	6	819993	819998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781554
17089	NC_015850	GCT	2	6	820004	820009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781554
17090	NC_015850	CCG	2	6	820015	820020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781554
17091	NC_015850	CTG	2	6	820092	820097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781554
17092	NC_015850	CGG	2	6	820161	820166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17093	NC_015850	ATCC	2	8	820252	820259	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17094	NC_015850	AGC	2	6	820379	820384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781555
17095	NC_015850	CCG	3	9	820394	820402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781555
17096	NC_015850	GCGG	2	8	820512	820519	0 %	0 %	75 %	25 %	340781556
17097	NC_015850	CGC	2	6	820551	820556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781556
17098	NC_015850	TCG	2	6	820709	820714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781556
17099	NC_015850	TGGGGC	2	12	820742	820753	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	340781556
17100	NC_015850	AAGGC	2	10	820787	820796	40 %	0 %	40 %	20 %	340781556
17101	NC_015850	CGT	2	6	820875	820880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781556
17102	NC_015850	TGG	2	6	820902	820907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781556
17103	NC_015850	CGC	2	6	820926	820931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781556
17104	NC_015850	ACG	2	6	820991	820996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781556
17105	NC_015850	GCACG	2	10	821001	821010	20 %	0 %	40 %	40 %	340781556
17106	NC_015850	TCG	2	6	821018	821023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781556
17107	NC_015850	GCC	2	6	821026	821031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781556
17108	NC_015850	GC	3	6	821119	821124	0 %	0 %	50 %	50 %	340781556
17109	NC_015850	TGC	2	6	821126	821131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781556
17110	NC_015850	GTT	2	6	821150	821155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340781556
17111	NC_015850	ACG	2	6	821213	821218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781556
17112	NC_015850	CGT	2	6	821274	821279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781556
17113	NC_015850	GTG	2	6	821344	821349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781556
17114	NC_015850	GC	3	6	821506	821511	0 %	0 %	50 %	50 %	340781556
17115	NC_015850	GCTG	2	8	821532	821539	0 %	25 %	50 %	25 %	340781556
17116	NC_015850	CGC	2	6	821592	821597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781556
17117	NC_015850	CAT	2	6	821640	821645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781556
17118	NC_015850	GCG	3	9	821695	821703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781556
17119	NC_015850	TCG	2	6	821706	821711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781556
17120	NC_015850	GC	3	6	821722	821727	0 %	0 %	50 %	50 %	340781556
17121	NC_015850	A	6	6	821861	821866	100 %	0 %	0 %	0 %	340781557
17122	NC_015850	CTG	2	6	821894	821899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781558
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17222	NC_015850	GCGAT	2	10	826525	826534	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
17223	NC_015850	AGGG	2	8	826554	826561	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
17224	NC_015850	GAC	2	6	826566	826571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17226	NC_015850	GCT	2	6	826605	826610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781563
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17230	NC_015850	GT	3	6	826718	826723	0 %	50 %	50 %	0 %	340781563
17231	NC_015850	GGC	2	6	826784	826789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781563
17232	NC_015850	CAA	2	6	826842	826847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340781563
17233	NC_015850	TGA	2	6	826919	826924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781563
17234	NC_015850	AGAT	2	8	826939	826946	50 %	25 %	25 %	0 %	340781563
17235	NC_015850	CCG	2	6	826954	826959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781563
17236	NC_015850	CGA	2	6	827048	827053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781563
17237	NC_015850	A	7	7	827101	827107	100 %	0 %	0 %	0 %	340781563
17238	NC_015850	CGC	2	6	827144	827149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17239	NC_015850	GGA	2	6	827190	827195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17240	NC_015850	CGC	2	6	827290	827295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781564
17241	NC_015850	GGGC	2	8	827317	827324	0 %	0 %	75 %	25 %	340781564
17242	NC_015850	TTG	2	6	827399	827404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340781564
17243	NC_015850	TGCC	2	8	827433	827440	0 %	25 %	25 %	50 %	340781564
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17281	NC_015850	GCTG	2	8	828892	828899	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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17357	NC_015850	GC	4	8	832131	832138	0 %	0 %	50 %	50 %	340781569
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17363	NC_015850	CGA	2	6	832445	832450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781570
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17477	NC_015850	GCT	2	6	837212	837217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781576
17478	NC_015850	GCG	2	6	837220	837225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781576
17479	NC_015850	CGGA	2	8	837235	837242	25 %	0 %	50 %	25 %	340781576
17480	NC_015850	AGG	2	6	837271	837276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781577
17481	NC_015850	GTG	2	6	837330	837335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781577
17482	NC_015850	GGA	2	6	837425	837430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781577
17483	NC_015850	TGC	2	6	837475	837480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781577
17484	NC_015850	GCG	2	6	837515	837520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781577
17485	NC_015850	GCGGA	2	10	837522	837531	20 %	0 %	60 %	20 %	340781577
17486	NC_015850	CAT	2	6	837545	837550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781577
17487	NC_015850	CGA	2	6	837608	837613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781577
17488	NC_015850	CGC	2	6	837634	837639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781577
17489	NC_015850	GCT	2	6	837665	837670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781577
17490	NC_015850	CTG	2	6	837720	837725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781577
17491	NC_015850	CGA	2	6	837755	837760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781577
17492	NC_015850	TGG	2	6	837766	837771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781577
17493	NC_015850	CCA	2	6	837811	837816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781577
17494	NC_015850	CTG	2	6	837846	837851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781577
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17498	NC_015850	TGG	2	6	838012	838017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781577
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17500	NC_015850	GCT	3	9	838054	838062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781578

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