MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 60723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16503	NC_015850	AGA	2	6	793992	793997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340781529
16504	NC_015850	CCG	2	6	794025	794030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781529
16505	NC_015850	TGGT	2	8	794042	794049	0 %	50 %	50 %	0 %	340781529
16506	NC_015850	TCC	2	6	794114	794119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781529
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16511	NC_015850	GCT	2	6	794332	794337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781529
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16513	NC_015850	CG	3	6	794473	794478	0 %	0 %	50 %	50 %	340781529
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16588	NC_015850	CAAG	2	8	798609	798616	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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16592	NC_015850	TGGG	2	8	798829	798836	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
16593	NC_015850	GCCC	2	8	798877	798884	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16594	NC_015850	GTG	2	6	798916	798921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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16603	NC_015850	CGGTG	2	10	799439	799448	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
16604	NC_015850	C	7	7	799462	799468	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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16622	NC_015850	ACGGGT	2	12	800128	800139	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	340781535
16623	NC_015850	GCT	2	6	800190	800195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781535
16624	NC_015850	CCA	2	6	800205	800210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781535
16625	NC_015850	GAT	2	6	800230	800235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781535
16626	NC_015850	ATC	2	6	800258	800263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781535
16627	NC_015850	AATGG	2	10	800324	800333	40 %	20 %	40 %	0 %	340781535
16628	NC_015850	ATG	3	9	800339	800347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781535
16629	NC_015850	ATG	2	6	800354	800359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781535
16630	NC_015850	ACC	2	6	800378	800383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781535
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16633	NC_015850	GGC	2	6	800475	800480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781536
16634	NC_015850	CTGA	2	8	800496	800503	25 %	25 %	25 %	25 %	340781536
16635	NC_015850	GGACT	2	10	800556	800565	20 %	20 %	40 %	20 %	340781536
16636	NC_015850	CTG	2	6	800640	800645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781536
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16643	NC_015850	CTG	2	6	800971	800976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781536
16644	NC_015850	GCT	2	6	801022	801027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781536
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16720	NC_015850	GGACC	2	10	804175	804184	20 %	0 %	40 %	40 %	340781537
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16722	NC_015850	AAT	2	6	804380	804385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16723	NC_015850	ATCG	2	8	804391	804398	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16724	NC_015850	ACG	2	6	804411	804416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16725	NC_015850	GAT	2	6	804445	804450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16726	NC_015850	GCGTT	2	10	804465	804474	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
16727	NC_015850	GCA	2	6	804475	804480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16728	NC_015850	ATC	2	6	804513	804518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16729	NC_015850	CTG	2	6	804556	804561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16730	NC_015850	ATA	2	6	804601	804606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16731	NC_015850	AGAA	2	8	804639	804646	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16732	NC_015850	AT	3	6	804659	804664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16733	NC_015850	A	6	6	804669	804674	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16734	NC_015850	AGA	2	6	804781	804786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340781538
16735	NC_015850	ATGAAG	2	12	804816	804827	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	340781538
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16737	NC_015850	GGC	2	6	804930	804935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781539
16738	NC_015850	CGG	2	6	804995	805000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781539
16739	NC_015850	GCA	2	6	805012	805017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781539
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16984	NC_015850	GGC	2	6	815944	815949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781550
16985	NC_015850	ATC	2	6	815961	815966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781550
16986	NC_015850	GCA	2	6	816118	816123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16987	NC_015850	CTT	2	6	816148	816153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340781551
16988	NC_015850	CAGG	2	8	816160	816167	25 %	0 %	50 %	25 %	340781551
16989	NC_015850	CTC	2	6	816187	816192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781551
16990	NC_015850	CTG	2	6	816211	816216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781551
16991	NC_015850	TGC	2	6	816239	816244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781551
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16999	NC_015850	ATG	2	6	816506	816511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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