MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 60723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_015850	ACC	2	6	766365	766370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781508
16003	NC_015850	T	6	6	766417	766422	0 %	100 %	0 %	0 %	340781508
16004	NC_015850	ACC	2	6	766472	766477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781508
16005	NC_015850	TGG	2	6	766521	766526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781508
16006	NC_015850	CT	3	6	766534	766539	0 %	50 %	0 %	50 %	340781508
16007	NC_015850	GCCT	2	8	766634	766641	0 %	25 %	25 %	50 %	340781508
16008	NC_015850	CCA	2	6	766644	766649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781508
16009	NC_015850	CGG	2	6	766662	766667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781508
16010	NC_015850	CTG	2	6	766720	766725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16011	NC_015850	CGA	2	6	766882	766887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16012	NC_015850	GAA	2	6	766935	766940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340781509
16013	NC_015850	CTT	2	6	766964	766969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340781509
16014	NC_015850	TTC	2	6	766995	767000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340781509
16015	NC_015850	CAGC	2	8	767033	767040	25 %	0 %	25 %	50 %	340781509
16016	NC_015850	CCTG	2	8	767086	767093	0 %	25 %	25 %	50 %	340781509
16017	NC_015850	GGA	3	9	767198	767206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781509
16018	NC_015850	GCCT	2	8	767218	767225	0 %	25 %	25 %	50 %	340781509
16019	NC_015850	CGA	2	6	767247	767252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781509
16020	NC_015850	GA	3	6	767335	767340	50 %	0 %	50 %	0 %	340781509
16021	NC_015850	AGG	2	6	767357	767362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781509
16022	NC_015850	GGA	2	6	767399	767404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781509
16023	NC_015850	CTG	2	6	767406	767411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781509
16024	NC_015850	CGCA	2	8	767533	767540	25 %	0 %	25 %	50 %	340781509
16025	NC_015850	TCA	2	6	767544	767549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781509
16026	NC_015850	TGA	2	6	767570	767575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781509
16027	NC_015850	TCA	2	6	767692	767697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781509
16028	NC_015850	TGCCTA	2	12	767747	767758	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	340781509
16029	NC_015850	ATG	2	6	767844	767849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781509
16030	NC_015850	TGC	2	6	767855	767860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781509
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16032	NC_015850	GCT	2	6	767972	767977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16033	NC_015850	TGGAT	2	10	768056	768065	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
16034	NC_015850	TTCC	2	8	768114	768121	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16035	NC_015850	GTC	2	6	768164	768169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16036	NC_015850	ATG	2	6	768207	768212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781510
16037	NC_015850	GAC	2	6	768302	768307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781510
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16039	NC_015850	GAG	2	6	768437	768442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781510
16040	NC_015850	TCC	2	6	768444	768449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781510
16041	NC_015850	CG	3	6	768457	768462	0 %	0 %	50 %	50 %	340781510
16042	NC_015850	GTGTT	2	10	768474	768483	0 %	60 %	40 %	0 %	340781510
16043	NC_015850	GCA	2	6	768510	768515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16044	NC_015850	CGG	2	6	768536	768541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16045	NC_015850	GTT	2	6	768603	768608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16046	NC_015850	CCG	2	6	768678	768683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16047	NC_015850	GGT	2	6	768699	768704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16048	NC_015850	GCTG	2	8	768773	768780	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16049	NC_015850	CTCG	2	8	768859	768866	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16050	NC_015850	CGA	2	6	768935	768940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16051	NC_015850	CGA	2	6	768996	769001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16052	NC_015850	GGC	2	6	769086	769091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16053	NC_015850	CTA	2	6	769163	769168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16054	NC_015850	ATGC	2	8	769182	769189	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16055	NC_015850	TTA	2	6	769203	769208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16056	NC_015850	ACT	2	6	769314	769319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781511
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16059	NC_015850	TGGC	2	8	769514	769521	0 %	25 %	50 %	25 %	340781511
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16062	NC_015850	TGA	2	6	769719	769724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781511
16063	NC_015850	GT	3	6	769821	769826	0 %	50 %	50 %	0 %	340781511
16064	NC_015850	TCG	2	6	769881	769886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781511
16065	NC_015850	TTG	2	6	769890	769895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340781511
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16090	NC_015850	CTT	2	6	770951	770956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340781511
16091	NC_015850	CA	3	6	770965	770970	50 %	0 %	0 %	50 %	340781511
16092	NC_015850	CGA	2	6	771001	771006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781511
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16094	NC_015850	GCAA	2	8	771037	771044	50 %	0 %	25 %	25 %	340781511
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16102	NC_015850	ACAG	2	8	771540	771547	50 %	0 %	25 %	25 %	340781511
16103	NC_015850	GGTTT	2	10	771576	771585	0 %	60 %	40 %	0 %	340781511
16104	NC_015850	ACG	2	6	771626	771631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781511
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16111	NC_015850	CAGT	2	8	772106	772113	25 %	25 %	25 %	25 %	340781512
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16486	NC_015850	TAG	2	6	793090	793095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16487	NC_015850	CTGCT	2	10	793116	793125	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
16488	NC_015850	TGA	2	6	793189	793194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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