MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 60723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_015850	CAG	2	6	716896	716901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781458
15003	NC_015850	CCA	2	6	716905	716910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781458
15004	NC_015850	ATG	2	6	716960	716965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781458
15005	NC_015850	GAT	2	6	716999	717004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15006	NC_015850	CCG	3	9	717065	717073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781459
15007	NC_015850	CTT	2	6	717124	717129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340781459
15008	NC_015850	GAT	2	6	717130	717135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781459
15009	NC_015850	AAG	2	6	717143	717148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340781459
15010	NC_015850	ACC	2	6	717263	717268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781459
15011	NC_015850	CCA	2	6	717295	717300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781459
15012	NC_015850	GGC	2	6	717366	717371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781459
15013	NC_015850	CGCAGG	2	12	717398	717409	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	340781459
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15015	NC_015850	AG	3	6	717695	717700	50 %	0 %	50 %	0 %	340781459
15016	NC_015850	GCC	2	6	717713	717718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781459
15017	NC_015850	TCG	2	6	717734	717739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781459
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15021	NC_015850	TTC	2	6	717824	717829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340781459
15022	NC_015850	CCA	2	6	717937	717942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781459
15023	NC_015850	CCA	2	6	718008	718013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781459
15024	NC_015850	GGA	2	6	718036	718041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781459
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15028	NC_015850	TGA	2	6	718401	718406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781459
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15030	NC_015850	TTA	2	6	718574	718579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15031	NC_015850	TCGG	2	8	718580	718587	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15032	NC_015850	CTGG	2	8	718622	718629	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15033	NC_015850	TA	3	6	718632	718637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15034	NC_015850	AGA	2	6	718659	718664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15035	NC_015850	AGG	2	6	718733	718738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781460
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15040	NC_015850	TAGGA	2	10	718891	718900	40 %	20 %	40 %	0 %	340781460
15041	NC_015850	GCGG	2	8	718982	718989	0 %	0 %	75 %	25 %	340781460
15042	NC_015850	TGG	2	6	719076	719081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781460
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15044	NC_015850	CCA	2	6	719150	719155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781460
15045	NC_015850	T	7	7	719198	719204	0 %	100 %	0 %	0 %	340781460
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15048	NC_015850	GGC	2	6	719350	719355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781461
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15053	NC_015850	GTCTC	2	10	719450	719459	0 %	40 %	20 %	40 %	340781461
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15055	NC_015850	GTG	2	6	719534	719539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781461
15056	NC_015850	CTG	2	6	719575	719580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781461
15057	NC_015850	CGG	2	6	719642	719647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781461
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15091	NC_015850	CGT	2	6	720998	721003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781462
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15109	NC_015850	CTG	2	6	721855	721860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15110	NC_015850	GCC	2	6	721972	721977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781463
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15118	NC_015850	GCA	3	9	722321	722329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781463
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15120	NC_015850	TGA	2	6	722387	722392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781463
15121	NC_015850	CCA	2	6	722492	722497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781463
15122	NC_015850	TGA	2	6	722528	722533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781463
15123	NC_015850	GCA	2	6	722579	722584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781463
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15128	NC_015850	CGT	2	6	722738	722743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781463
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15132	NC_015850	GTC	2	6	722820	722825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781463
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15140	NC_015850	A	7	7	723244	723250	100 %	0 %	0 %	0 %	340781463
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15239	NC_015850	GAT	2	6	727977	727982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781468
15240	NC_015850	TGC	2	6	728018	728023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781468
15241	NC_015850	TGTCCT	2	12	728072	728083	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	340781468
15242	NC_015850	CGCC	2	8	728087	728094	0 %	0 %	25 %	75 %	340781468
15243	NC_015850	GCC	3	9	728137	728145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781468
15244	NC_015850	CGG	2	6	728184	728189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781468
15245	NC_015850	TGG	2	6	728322	728327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781468
15246	NC_015850	CCG	2	6	728378	728383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781468
15247	NC_015850	GGC	2	6	728424	728429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781468
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15250	NC_015850	GGC	2	6	728543	728548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781468
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15252	NC_015850	CGG	2	6	728604	728609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781468
15253	NC_015850	CG	3	6	728612	728617	0 %	0 %	50 %	50 %	340781468
15254	NC_015850	CTG	2	6	728677	728682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781468
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15259	NC_015850	GC	3	6	728759	728764	0 %	0 %	50 %	50 %	340781468
15260	NC_015850	GGC	2	6	728766	728771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781468
15261	NC_015850	GGC	2	6	728783	728788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781468
15262	NC_015850	TGC	2	6	728807	728812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781468
15263	NC_015850	CCT	2	6	728813	728818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781468
15264	NC_015850	GTTC	2	8	728897	728904	0 %	50 %	25 %	25 %	340781469
15265	NC_015850	GCT	3	9	729041	729049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781469
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15267	NC_015850	GCT	2	6	729170	729175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781469
15268	NC_015850	TGG	2	6	729242	729247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781469
15269	NC_015850	CGG	2	6	729278	729283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781469
15270	NC_015850	TCA	2	6	729367	729372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781469
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15272	NC_015850	ACG	2	6	729495	729500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781469
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15274	NC_015850	CTGG	2	8	729695	729702	0 %	25 %	50 %	25 %	340781469
15275	NC_015850	CTGG	2	8	729741	729748	0 %	25 %	50 %	25 %	340781469
15276	NC_015850	TTA	2	6	729899	729904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340781469
15277	NC_015850	T	6	6	729941	729946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15278	NC_015850	GCG	2	6	730005	730010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15279	NC_015850	GTG	2	6	730028	730033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15280	NC_015850	GGC	2	6	730120	730125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781470
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15283	NC_015850	GCT	2	6	730178	730183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781470
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15287	NC_015850	GCT	2	6	730325	730330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781470
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15290	NC_015850	GC	3	6	730770	730775	0 %	0 %	50 %	50 %	340781470
15291	NC_015850	GATGCC	2	12	730776	730787	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	340781470
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15295	NC_015850	AGC	2	6	730954	730959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781470
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15305	NC_015850	GCA	2	6	731323	731328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781470
15306	NC_015850	CAG	2	6	731343	731348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781470
15307	NC_015850	GAG	2	6	731418	731423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781470
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15309	NC_015850	ACC	2	6	731451	731456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781470
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15311	NC_015850	GC	3	6	731525	731530	0 %	0 %	50 %	50 %	340781470
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15317	NC_015850	TGA	2	6	731812	731817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781470
15318	NC_015850	CGA	2	6	731849	731854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781470
15319	NC_015850	GAG	2	6	732006	732011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781470
15320	NC_015850	GCG	2	6	732076	732081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15321	NC_015850	TCG	2	6	732125	732130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781471
15322	NC_015850	GGC	2	6	732217	732222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781471
15323	NC_015850	GCG	2	6	732257	732262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781471
15324	NC_015850	CCA	2	6	732294	732299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781471
15325	NC_015850	TCCCG	2	10	732365	732374	0 %	20 %	20 %	60 %	340781471
15326	NC_015850	ACGG	2	8	732448	732455	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15327	NC_015850	ATA	2	6	732551	732556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340781472
15328	NC_015850	CGG	2	6	732610	732615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781472
15329	NC_015850	T	7	7	732657	732663	0 %	100 %	0 %	0 %	340781472
15330	NC_015850	CGC	2	6	732765	732770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781472
15331	NC_015850	GGA	2	6	732832	732837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781472
15332	NC_015850	CAA	2	6	732845	732850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340781472
15333	NC_015850	GC	3	6	732876	732881	0 %	0 %	50 %	50 %	340781472
15334	NC_015850	GGCC	2	8	732893	732900	0 %	0 %	50 %	50 %	340781472
15335	NC_015850	GCG	2	6	732983	732988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781472
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15338	NC_015850	CCA	2	6	733322	733327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781473
15339	NC_015850	CGA	2	6	733433	733438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781473
15340	NC_015850	CG	3	6	733454	733459	0 %	0 %	50 %	50 %	340781473
15341	NC_015850	CACC	2	8	733481	733488	25 %	0 %	0 %	75 %	340781473
15342	NC_015850	ATCCC	2	10	733528	733537	20 %	20 %	0 %	60 %	340781473
15343	NC_015850	TCG	2	6	733564	733569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781473
15344	NC_015850	AG	3	6	733570	733575	50 %	0 %	50 %	0 %	340781473
15345	NC_015850	GC	3	6	733731	733736	0 %	0 %	50 %	50 %	340781474
15346	NC_015850	CCT	2	6	733775	733780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781474
15347	NC_015850	CCA	2	6	733835	733840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781474
15348	NC_015850	TCG	2	6	733924	733929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781474
15349	NC_015850	ATG	2	6	733961	733966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15350	NC_015850	TCG	2	6	733981	733986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781475
15351	NC_015850	GGC	2	6	734082	734087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781475
15352	NC_015850	CGG	2	6	734116	734121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781475
15353	NC_015850	CG	5	10	734170	734179	0 %	0 %	50 %	50 %	340781475
15354	NC_015850	TCT	3	9	734266	734274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340781475
15355	NC_015850	CCT	3	9	734294	734302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781475
15356	NC_015850	CGC	2	6	734303	734308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781475
15357	NC_015850	GC	5	10	734319	734328	0 %	0 %	50 %	50 %	340781475
15358	NC_015850	GCC	2	6	734343	734348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781475
15359	NC_015850	GCA	2	6	734366	734371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781475
15360	NC_015850	GTG	2	6	734457	734462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781475
15361	NC_015850	GAT	2	6	734483	734488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781475
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15368	NC_015850	GCG	2	6	734740	734745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781475
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15371	NC_015850	CGG	2	6	734816	734821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781475
15372	NC_015850	CCCG	2	8	734831	734838	0 %	0 %	25 %	75 %	340781475
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15443	NC_015850	CGC	2	6	737991	737996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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15461	NC_015850	GAC	3	9	739063	739071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781480
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15479	NC_015850	CCA	2	6	739919	739924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781481
15480	NC_015850	TCG	2	6	740033	740038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781481
15481	NC_015850	GCC	2	6	740058	740063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781481
15482	NC_015850	CGCT	2	8	740072	740079	0 %	25 %	25 %	50 %	340781481
15483	NC_015850	AGG	2	6	740185	740190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781481
15484	NC_015850	CG	3	6	740219	740224	0 %	0 %	50 %	50 %	340781481
15485	NC_015850	CTG	2	6	740262	740267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781481
15486	NC_015850	TAC	2	6	740271	740276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781481
15487	NC_015850	AGCGCC	2	12	740308	740319	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	340781481
15488	NC_015850	GGC	2	6	740357	740362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781481
15489	NC_015850	AC	3	6	740363	740368	50 %	0 %	0 %	50 %	340781481
15490	NC_015850	CAG	2	6	740379	740384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781481
15491	NC_015850	GC	3	6	740394	740399	0 %	0 %	50 %	50 %	340781481
15492	NC_015850	GCA	2	6	740412	740417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781481
15493	NC_015850	GCC	3	9	740430	740438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781481
15494	NC_015850	GCGGAC	2	12	740508	740519	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	340781481
15495	NC_015850	CTG	2	6	740571	740576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781481
15496	NC_015850	ATC	2	6	740578	740583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781481
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15498	NC_015850	CGG	2	6	740632	740637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781481
15499	NC_015850	TCA	2	6	740653	740658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781481
15500	NC_015850	CTG	2	6	740661	740666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781481

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