MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 60723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_015850	GCG	2	6	597930	597935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781333
12502	NC_015850	GGTG	2	8	597983	597990	0 %	25 %	75 %	0 %	340781333
12503	NC_015850	TGG	2	6	598027	598032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781333
12504	NC_015850	TGG	2	6	598054	598059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781333
12505	NC_015850	GAC	2	6	598104	598109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781333
12506	NC_015850	GGT	2	6	598115	598120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781333
12507	NC_015850	TCGGC	2	10	598123	598132	0 %	20 %	40 %	40 %	340781333
12508	NC_015850	GGC	3	9	598190	598198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781333
12509	NC_015850	GGT	2	6	598292	598297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781333
12510	NC_015850	TGAGAT	2	12	598337	598348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781333
12511	NC_015850	CGA	2	6	598363	598368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781333
12512	NC_015850	GGCG	2	8	598424	598431	0 %	0 %	75 %	25 %	340781333
12513	NC_015850	GTT	2	6	598445	598450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340781333
12514	NC_015850	AAG	2	6	598461	598466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340781333
12515	NC_015850	GGT	2	6	598563	598568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781333
12516	NC_015850	GAC	2	6	598616	598621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781333
12517	NC_015850	ACA	2	6	598678	598683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340781333
12518	NC_015850	CGT	2	6	598775	598780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781333
12519	NC_015850	GGT	2	6	598787	598792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781333
12520	NC_015850	AGT	2	6	598795	598800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781333
12521	NC_015850	GCG	2	6	598828	598833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12522	NC_015850	CCG	2	6	598841	598846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12523	NC_015850	AGC	2	6	598881	598886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12524	NC_015850	CCTGC	2	10	598923	598932	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
12525	NC_015850	GCC	2	6	598994	598999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781334
12526	NC_015850	CCA	2	6	599100	599105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781334
12527	NC_015850	GTTTT	2	10	599126	599135	0 %	80 %	20 %	0 %	340781334
12528	NC_015850	GGT	2	6	599164	599169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781334
12529	NC_015850	TGC	2	6	599214	599219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781334
12530	NC_015850	ATC	2	6	599222	599227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781334
12531	NC_015850	TCT	2	6	599238	599243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340781334
12532	NC_015850	G	6	6	599290	599295	0 %	0 %	100 %	0 %	340781334
12533	NC_015850	CGATG	2	10	599309	599318	20 %	20 %	40 %	20 %	340781335
12534	NC_015850	GCAG	2	8	599358	599365	25 %	0 %	50 %	25 %	340781335
12535	NC_015850	GGA	2	6	599397	599402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781335
12536	NC_015850	GGT	2	6	599436	599441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781335
12537	NC_015850	AGA	2	6	599459	599464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340781335
12538	NC_015850	AC	3	6	599544	599549	50 %	0 %	0 %	50 %	340781335
12539	NC_015850	AGG	2	6	599639	599644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781335
12540	NC_015850	GAG	2	6	599737	599742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781335
12541	NC_015850	AGA	2	6	599828	599833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340781335
12542	NC_015850	TTG	2	6	599843	599848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12543	NC_015850	A	6	6	599895	599900	100 %	0 %	0 %	0 %	340781336
12544	NC_015850	GCCC	2	8	599951	599958	0 %	0 %	25 %	75 %	340781336
12545	NC_015850	CAT	2	6	599991	599996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781336
12546	NC_015850	ATC	2	6	600061	600066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781336
12547	NC_015850	GGC	2	6	600135	600140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781336
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12550	NC_015850	CCAAGA	2	12	600218	600229	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	340781336
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12552	NC_015850	GCA	2	6	600354	600359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781337
12553	NC_015850	TGG	2	6	600362	600367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781337
12554	NC_015850	CGA	2	6	600435	600440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781337
12555	NC_015850	GGT	2	6	600492	600497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781337
12556	NC_015850	GCGGT	2	10	600500	600509	0 %	20 %	60 %	20 %	340781337
12557	NC_015850	TCG	2	6	600602	600607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781337
12558	NC_015850	GGA	2	6	600612	600617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781337
12559	NC_015850	CGT	2	6	600687	600692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781337
12560	NC_015850	CGG	2	6	600758	600763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781337
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12563	NC_015850	GGT	2	6	600823	600828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781337
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12565	NC_015850	CTG	2	6	600886	600891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781337
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12569	NC_015850	TCCG	2	8	600996	601003	0 %	25 %	25 %	50 %	340781337
12570	NC_015850	GC	3	6	601106	601111	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12571	NC_015850	GCC	2	6	601123	601128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12572	NC_015850	GGT	2	6	601184	601189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781338
12573	NC_015850	TGC	2	6	601190	601195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781338
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12575	NC_015850	GGT	2	6	601313	601318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781338
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12582	NC_015850	ATTC	2	8	601676	601683	25 %	50 %	0 %	25 %	340781338
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12585	NC_015850	GCC	2	6	601809	601814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781339
12586	NC_015850	GCGGTG	2	12	601815	601826	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	340781339
12587	NC_015850	GCC	3	9	601839	601847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781339
12588	NC_015850	GGC	2	6	601848	601853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781339
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12591	NC_015850	GGT	2	6	601943	601948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781339
12592	NC_015850	GC	3	6	601949	601954	0 %	0 %	50 %	50 %	340781339
12593	NC_015850	GAAG	2	8	601973	601980	50 %	0 %	50 %	0 %	340781339
12594	NC_015850	TGG	2	6	601990	601995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781339
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12597	NC_015850	GTA	2	6	602099	602104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12598	NC_015850	TGGC	2	8	602117	602124	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12599	NC_015850	TTA	2	6	602147	602152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12600	NC_015850	GGT	2	6	602158	602163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12601	NC_015850	TCT	2	6	602182	602187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12602	NC_015850	AGCG	2	8	602189	602196	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12603	NC_015850	CG	3	6	602198	602203	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12604	NC_015850	CGG	2	6	602342	602347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781340
12605	NC_015850	GC	3	6	602350	602355	0 %	0 %	50 %	50 %	340781340
12606	NC_015850	AGG	2	6	602357	602362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781340
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12610	NC_015850	TCA	2	6	602639	602644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781340
12611	NC_015850	TTC	2	6	602695	602700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340781340
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12614	NC_015850	ATC	2	6	602755	602760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781340
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12617	NC_015850	GCT	2	6	602853	602858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781340
12618	NC_015850	GC	3	6	602859	602864	0 %	0 %	50 %	50 %	340781340
12619	NC_015850	TTC	2	6	602899	602904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340781340
12620	NC_015850	TCT	2	6	602939	602944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340781340
12621	NC_015850	CGG	2	6	602978	602983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781340
12622	NC_015850	GTG	3	9	603016	603024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781340
12623	NC_015850	GCG	2	6	603025	603030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781340
12624	NC_015850	GAGC	2	8	603066	603073	25 %	0 %	50 %	25 %	340781340
12625	NC_015850	TGGG	2	8	603074	603081	0 %	25 %	75 %	0 %	340781340
12626	NC_015850	AGG	2	6	603086	603091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781340
12627	NC_015850	TGG	2	6	603140	603145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781340
12628	NC_015850	GGC	2	6	603171	603176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781340
12629	NC_015850	CG	3	6	603204	603209	0 %	0 %	50 %	50 %	340781340
12630	NC_015850	CG	4	8	603303	603310	0 %	0 %	50 %	50 %	340781340
12631	NC_015850	TTC	2	6	603403	603408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340781340
12632	NC_015850	TC	3	6	603426	603431	0 %	50 %	0 %	50 %	340781340
12633	NC_015850	CGG	2	6	603457	603462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781340
12634	NC_015850	CAT	2	6	603510	603515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781340
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12636	NC_015850	CGA	2	6	603564	603569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781340
12637	NC_015850	CGT	2	6	603589	603594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781340
12638	NC_015850	CCTGGC	2	12	603672	603683	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	340781340
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12642	NC_015850	CCCA	2	8	603892	603899	25 %	0 %	0 %	75 %	340781340
12643	NC_015850	CGG	2	6	604012	604017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781340
12644	NC_015850	CGA	2	6	604034	604039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781340
12645	NC_015850	GGT	2	6	604044	604049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781340
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12650	NC_015850	GGC	2	6	604227	604232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781340
12651	NC_015850	ACG	3	9	604256	604264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781340
12652	NC_015850	CG	3	6	604270	604275	0 %	0 %	50 %	50 %	340781340
12653	NC_015850	TGG	2	6	604334	604339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781340
12654	NC_015850	GTG	2	6	604357	604362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781340
12655	NC_015850	GCC	2	6	604378	604383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781340
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12661	NC_015850	GTG	2	6	604702	604707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781340
12662	NC_015850	GGA	2	6	604710	604715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781340
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12668	NC_015850	CGG	2	6	605000	605005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781340
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12673	NC_015850	GAG	2	6	605290	605295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781340
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12684	NC_015850	TCGA	2	8	605930	605937	25 %	25 %	25 %	25 %	340781340
12685	NC_015850	TACATG	2	12	605953	605964	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	340781340
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12688	NC_015850	ATGC	2	8	605995	606002	25 %	25 %	25 %	25 %	340781340
12689	NC_015850	CAG	2	6	606034	606039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781340
12690	NC_015850	GGC	2	6	606046	606051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781340
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12692	NC_015850	CGA	2	6	606153	606158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781340
12693	NC_015850	CATCGA	2	12	606270	606281	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	340781340
12694	NC_015850	AAGG	2	8	606317	606324	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12695	NC_015850	GAA	2	6	606372	606377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340781341
12696	NC_015850	GTATCG	2	12	606391	606402	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	340781341
12697	NC_015850	GGTCCT	2	12	606421	606432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781341
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12699	NC_015850	GCG	2	6	606620	606625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781341
12700	NC_015850	TC	3	6	606684	606689	0 %	50 %	0 %	50 %	340781341
12701	NC_015850	GTG	3	9	606762	606770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781341
12702	NC_015850	TCG	2	6	606856	606861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781341
12703	NC_015850	GC	3	6	606896	606901	0 %	0 %	50 %	50 %	340781341
12704	NC_015850	ACCAAG	2	12	606963	606974	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	340781341
12705	NC_015850	GAT	2	6	607037	607042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781341
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12710	NC_015850	AGG	2	6	607228	607233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781341
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12712	NC_015850	CAA	2	6	607286	607291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340781341
12713	NC_015850	CTG	2	6	607353	607358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781341
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12715	NC_015850	GTG	2	6	607395	607400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781341
12716	NC_015850	CAA	2	6	607475	607480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340781341
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12720	NC_015850	AAGGC	2	10	607657	607666	40 %	0 %	40 %	20 %	340781341
12721	NC_015850	ATG	2	6	607779	607784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781341
12722	NC_015850	CCA	2	6	607786	607791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781341
12723	NC_015850	ACA	2	6	607792	607797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340781341
12724	NC_015850	CAT	2	6	607823	607828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781341
12725	NC_015850	TAC	2	6	607860	607865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781341
12726	NC_015850	GC	3	6	607877	607882	0 %	0 %	50 %	50 %	340781341
12727	NC_015850	GC	3	6	607885	607890	0 %	0 %	50 %	50 %	340781341
12728	NC_015850	GC	3	6	607965	607970	0 %	0 %	50 %	50 %	340781341
12729	NC_015850	GAC	2	6	608003	608008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781341
12730	NC_015850	GCT	2	6	608021	608026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781341
12731	NC_015850	CAT	2	6	608060	608065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781341
12732	NC_015850	AAG	2	6	608082	608087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340781341
12733	NC_015850	TCA	2	6	608101	608106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781341
12734	NC_015850	GGT	2	6	608193	608198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781341
12735	NC_015850	CGC	2	6	608227	608232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781341
12736	NC_015850	AGG	2	6	608266	608271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781341
12737	NC_015850	ACA	2	6	608326	608331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340781341
12738	NC_015850	GGT	2	6	608333	608338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781341
12739	NC_015850	CGAC	2	8	608356	608363	25 %	0 %	25 %	50 %	340781341
12740	NC_015850	ATG	2	6	608379	608384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781341
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12851	NC_015850	TG	3	6	613046	613051	0 %	50 %	50 %	0 %	340781344
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12862	NC_015850	CAT	2	6	613577	613582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781344
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12979	NC_015850	GAA	2	6	619320	619325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340781355
12980	NC_015850	GCA	2	6	619343	619348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781355
12981	NC_015850	TGA	2	6	619420	619425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781355
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