MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 60723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_015850	TA	3	6	548795	548800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11502	NC_015850	GGC	2	6	548859	548864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781275
11503	NC_015850	CGA	2	6	548886	548891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781275
11504	NC_015850	GTC	2	6	548996	549001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781275
11505	NC_015850	AGG	2	6	549041	549046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781275
11506	NC_015850	TCG	2	6	549074	549079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781275
11507	NC_015850	TGCC	2	8	549129	549136	0 %	25 %	25 %	50 %	340781275
11508	NC_015850	AGG	2	6	549245	549250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781275
11509	NC_015850	GTG	2	6	549277	549282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781275
11510	NC_015850	TGG	2	6	549347	549352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781275
11511	NC_015850	CTG	2	6	549376	549381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781275
11512	NC_015850	CTG	2	6	549445	549450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781275
11513	NC_015850	GC	3	6	549460	549465	0 %	0 %	50 %	50 %	340781275
11514	NC_015850	ACC	2	6	549493	549498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781275
11515	NC_015850	TCCCA	2	10	549499	549508	20 %	20 %	0 %	60 %	340781275
11516	NC_015850	CGC	2	6	549531	549536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781275
11517	NC_015850	GCG	2	6	549606	549611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781275
11518	NC_015850	GCGG	2	8	549663	549670	0 %	0 %	75 %	25 %	340781275
11519	NC_015850	TCG	2	6	549704	549709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781275
11520	NC_015850	TGG	2	6	549923	549928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781275
11521	NC_015850	CCT	2	6	549995	550000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781275
11522	NC_015850	TGC	2	6	550049	550054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781275
11523	NC_015850	CGG	2	6	550109	550114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781275
11524	NC_015850	GCA	2	6	550137	550142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781276
11525	NC_015850	C	6	6	550149	550154	0 %	0 %	0 %	100 %	340781276
11526	NC_015850	GCG	2	6	550159	550164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781276
11527	NC_015850	TCC	2	6	550279	550284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781276
11528	NC_015850	CCG	2	6	550315	550320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781276
11529	NC_015850	GCC	2	6	550332	550337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781276
11530	NC_015850	CAG	2	6	550338	550343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781276
11531	NC_015850	TTG	2	6	550347	550352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340781276
11532	NC_015850	GC	3	6	550368	550373	0 %	0 %	50 %	50 %	340781276
11533	NC_015850	GC	3	6	550422	550427	0 %	0 %	50 %	50 %	340781276
11534	NC_015850	CGT	2	6	550487	550492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781276
11535	NC_015850	CCG	2	6	550535	550540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781276
11536	NC_015850	CGG	2	6	550567	550572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781276
11537	NC_015850	GGC	2	6	550598	550603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781276
11538	NC_015850	ACG	2	6	550738	550743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781276
11539	NC_015850	ACG	2	6	550878	550883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781276
11540	NC_015850	GGT	3	9	550931	550939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781276
11541	NC_015850	GAT	2	6	551033	551038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781276
11542	NC_015850	CTT	2	6	551039	551044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340781276
11543	NC_015850	GTC	2	6	551058	551063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781276
11544	NC_015850	TGG	2	6	551074	551079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781276
11545	NC_015850	TCG	2	6	551086	551091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781276
11546	NC_015850	CGCC	2	8	551127	551134	0 %	0 %	25 %	75 %	340781277
11547	NC_015850	CCG	2	6	551146	551151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781277
11548	NC_015850	GCC	2	6	551179	551184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781277
11549	NC_015850	CCG	2	6	551186	551191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781277
11550	NC_015850	CGC	2	6	551241	551246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781277
11551	NC_015850	GCC	3	9	551300	551308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781277
11552	NC_015850	CCA	2	6	551349	551354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781277
11553	NC_015850	C	6	6	551375	551380	0 %	0 %	0 %	100 %	340781277
11554	NC_015850	TGC	2	6	551439	551444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781277
11555	NC_015850	GCC	2	6	551549	551554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781277
11556	NC_015850	TGG	2	6	551664	551669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781278
11557	NC_015850	GGC	2	6	551768	551773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781278
11558	NC_015850	TGG	2	6	551779	551784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781278
11559	NC_015850	TGA	2	6	551824	551829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781278
11560	NC_015850	ATC	2	6	551880	551885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781278
11561	NC_015850	GTG	2	6	551892	551897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781278
11562	NC_015850	GGT	2	6	551921	551926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781278
11563	NC_015850	CGA	2	6	551939	551944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781278
11564	NC_015850	GC	3	6	551978	551983	0 %	0 %	50 %	50 %	340781278
11565	NC_015850	GGTCAG	2	12	551988	551999	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	340781278
11566	NC_015850	GCC	2	6	552002	552007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781278
11567	NC_015850	AGCA	2	8	552051	552058	50 %	0 %	25 %	25 %	340781278
11568	NC_015850	GTC	2	6	552091	552096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781278
11569	NC_015850	TGG	3	9	552109	552117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781278
11570	NC_015850	TCA	2	6	552142	552147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781278
11571	NC_015850	ATC	2	6	552168	552173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781278
11572	NC_015850	GAA	2	6	552204	552209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340781278
11573	NC_015850	TGG	2	6	552217	552222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781278
11574	NC_015850	TCA	2	6	552259	552264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781278
11575	NC_015850	GGA	2	6	552269	552274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781278
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11577	NC_015850	TGGC	2	8	552329	552336	0 %	25 %	50 %	25 %	340781278
11578	NC_015850	GGT	2	6	552374	552379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781278
11579	NC_015850	TGG	2	6	552382	552387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781278
11580	NC_015850	CG	4	8	552454	552461	0 %	0 %	50 %	50 %	340781278
11581	NC_015850	GAGGTG	2	12	552468	552479	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	340781278
11582	NC_015850	GGC	2	6	552552	552557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781279
11583	NC_015850	GC	3	6	552632	552637	0 %	0 %	50 %	50 %	340781279
11584	NC_015850	TGC	2	6	552768	552773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781279
11585	NC_015850	GCG	2	6	552778	552783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781279
11586	NC_015850	GCT	2	6	552858	552863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781279
11587	NC_015850	GGC	2	6	552864	552869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781279
11588	NC_015850	CTT	2	6	552915	552920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340781279
11589	NC_015850	GCTG	2	8	552935	552942	0 %	25 %	50 %	25 %	340781279
11590	NC_015850	GGGCCC	2	12	552974	552985	0 %	0 %	50 %	50 %	340781279
11591	NC_015850	CGG	2	6	553044	553049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781279
11592	NC_015850	GCCTGG	2	12	553114	553125	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	340781279
11593	NC_015850	CG	3	6	553144	553149	0 %	0 %	50 %	50 %	340781279
11594	NC_015850	GGC	2	6	553155	553160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781279
11595	NC_015850	TGC	2	6	553172	553177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781279
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11597	NC_015850	CTC	2	6	553252	553257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781279
11598	NC_015850	CGC	2	6	553343	553348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781279
11599	NC_015850	CACGC	2	10	553450	553459	20 %	0 %	20 %	60 %	340781279
11600	NC_015850	GCCA	2	8	553480	553487	25 %	0 %	25 %	50 %	340781279
11601	NC_015850	TAC	2	6	553495	553500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781279
11602	NC_015850	GCC	2	6	553504	553509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781279
11603	NC_015850	CGCTG	2	10	553532	553541	0 %	20 %	40 %	40 %	340781279
11604	NC_015850	AGC	2	6	553550	553555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781279
11605	NC_015850	GTG	2	6	553741	553746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781279
11606	NC_015850	CTG	2	6	553762	553767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781279
11607	NC_015850	GGC	2	6	553827	553832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781279
11608	NC_015850	CCA	2	6	553871	553876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781279
11609	NC_015850	CCG	2	6	553889	553894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781279
11610	NC_015850	TCG	2	6	553937	553942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781279
11611	NC_015850	ACC	2	6	553981	553986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781279
11612	NC_015850	CTGGCG	2	12	554038	554049	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	340781279
11613	NC_015850	TGG	2	6	554050	554055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781279
11614	NC_015850	CGG	2	6	554095	554100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11615	NC_015850	GTG	3	9	554154	554162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11616	NC_015850	CGG	2	6	554194	554199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11617	NC_015850	CG	3	6	554253	554258	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11618	NC_015850	GTGGC	2	10	554314	554323	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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11620	NC_015850	GC	3	6	554363	554368	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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11989	NC_015850	TCG	2	6	574644	574649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781306
11990	NC_015850	TGG	2	6	574657	574662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781306
11991	NC_015850	TCC	2	6	574664	574669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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