MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 60723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_015850	CGG	2	6	524811	524816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781256
11002	NC_015850	AG	3	6	524899	524904	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11003	NC_015850	A	6	6	524952	524957	100 %	0 %	0 %	0 %	340781257
11004	NC_015850	A	6	6	524969	524974	100 %	0 %	0 %	0 %	340781257
11005	NC_015850	GGTC	2	8	525006	525013	0 %	25 %	50 %	25 %	340781257
11006	NC_015850	GCA	2	6	525034	525039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781257
11007	NC_015850	TGC	2	6	525075	525080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781257
11008	NC_015850	GCT	2	6	525111	525116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781257
11009	NC_015850	ATC	2	6	525224	525229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781257
11010	NC_015850	ACA	2	6	525333	525338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340781257
11011	NC_015850	GTT	2	6	525396	525401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340781257
11012	NC_015850	GGC	2	6	525474	525479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781257
11013	NC_015850	GCG	2	6	525532	525537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781257
11014	NC_015850	CGG	2	6	525642	525647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781257
11015	NC_015850	GC	3	6	525658	525663	0 %	0 %	50 %	50 %	340781257
11016	NC_015850	TA	3	6	525766	525771	50 %	50 %	0 %	0 %	340781257
11017	NC_015850	CGT	2	6	525773	525778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781257
11018	NC_015850	CA	3	6	525849	525854	50 %	0 %	0 %	50 %	340781257
11019	NC_015850	TGG	2	6	525879	525884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781257
11020	NC_015850	TAT	2	6	525898	525903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340781257
11021	NC_015850	GCG	2	6	525931	525936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781257
11022	NC_015850	CGA	2	6	525960	525965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781257
11023	NC_015850	GCA	2	6	526099	526104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781257
11024	NC_015850	CTAC	2	8	526115	526122	25 %	25 %	0 %	50 %	340781257
11025	NC_015850	CTGG	2	8	526159	526166	0 %	25 %	50 %	25 %	340781257
11026	NC_015850	TGC	2	6	526233	526238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781257
11027	NC_015850	TGC	2	6	526334	526339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781257
11028	NC_015850	GACA	2	8	526359	526366	50 %	0 %	25 %	25 %	340781257
11029	NC_015850	GGT	2	6	526549	526554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781257
11030	NC_015850	TGG	2	6	526573	526578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781257
11031	NC_015850	TG	3	6	526641	526646	0 %	50 %	50 %	0 %	340781258
11032	NC_015850	TCG	2	6	526885	526890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781258
11033	NC_015850	TTG	2	6	527014	527019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340781258
11034	NC_015850	GCGT	2	8	527139	527146	0 %	25 %	50 %	25 %	340781258
11035	NC_015850	TCG	2	6	527164	527169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781258
11036	NC_015850	AGC	2	6	527266	527271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781258
11037	NC_015850	GCT	2	6	527288	527293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781258
11038	NC_015850	GGT	2	6	527336	527341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781258
11039	NC_015850	CGG	2	6	527359	527364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781258
11040	NC_015850	AGA	2	6	527366	527371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340781258
11041	NC_015850	ATGCG	2	10	527410	527419	20 %	20 %	40 %	20 %	340781258
11042	NC_015850	TTG	2	6	527434	527439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340781258
11043	NC_015850	TGGT	2	8	527503	527510	0 %	50 %	50 %	0 %	340781258
11044	NC_015850	CAG	2	6	527535	527540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781258
11045	NC_015850	CGC	2	6	527585	527590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781258
11046	NC_015850	GC	4	8	527589	527596	0 %	0 %	50 %	50 %	340781258
11047	NC_015850	ACT	2	6	527597	527602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781258
11048	NC_015850	CTG	2	6	527785	527790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781259
11049	NC_015850	ACA	2	6	527861	527866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340781259
11050	NC_015850	ATT	2	6	527917	527922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340781259
11051	NC_015850	GAC	2	6	528025	528030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781259
11052	NC_015850	TGG	2	6	528152	528157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781259
11053	NC_015850	GTT	2	6	528219	528224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340781259
11054	NC_015850	TGG	2	6	528315	528320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781259
11055	NC_015850	TCCG	2	8	528322	528329	0 %	25 %	25 %	50 %	340781259
11056	NC_015850	GGT	2	6	528348	528353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781259
11057	NC_015850	GGT	2	6	528363	528368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781259
11058	NC_015850	AGT	2	6	528444	528449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781259
11059	NC_015850	CAG	2	6	528592	528597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781259
11060	NC_015850	CTG	2	6	528636	528641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781259
11061	NC_015850	GATT	2	8	528701	528708	25 %	50 %	25 %	0 %	340781259
11062	NC_015850	ATG	2	6	528733	528738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781259
11063	NC_015850	GCG	2	6	528914	528919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781259
11064	NC_015850	CAGG	2	8	529029	529036	25 %	0 %	50 %	25 %	340781259
11065	NC_015850	GAAG	2	8	529079	529086	50 %	0 %	50 %	0 %	340781259
11066	NC_015850	ATA	2	6	529118	529123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340781259
11067	NC_015850	GA	4	8	529142	529149	50 %	0 %	50 %	0 %	340781259
11068	NC_015850	A	7	7	529163	529169	100 %	0 %	0 %	0 %	340781259
11069	NC_015850	CTG	2	6	529241	529246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11070	NC_015850	A	6	6	529249	529254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11071	NC_015850	TCGG	2	8	529259	529266	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11072	NC_015850	AAT	2	6	529279	529284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11073	NC_015850	G	8	8	529329	529336	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11074	NC_015850	ATCC	2	8	529470	529477	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11075	NC_015850	GCC	2	6	529526	529531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11076	NC_015850	CGC	2	6	529535	529540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11077	NC_015850	CGG	2	6	529607	529612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11078	NC_015850	GCC	2	6	529809	529814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11079	NC_015850	CGC	2	6	529818	529823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11080	NC_015850	CGG	2	6	529890	529895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781260
11081	NC_015850	GTT	2	6	529949	529954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340781260
11082	NC_015850	CGG	2	6	529955	529960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781260
11083	NC_015850	CG	3	6	530024	530029	0 %	0 %	50 %	50 %	340781260
11084	NC_015850	GCG	2	6	530061	530066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781260
11085	NC_015850	CGG	3	9	530084	530092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781260
11086	NC_015850	TGA	2	6	530093	530098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781260
11087	NC_015850	GGCGC	2	10	530121	530130	0 %	0 %	60 %	40 %	340781260
11088	NC_015850	TGA	2	6	530138	530143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781260
11089	NC_015850	TCG	2	6	530227	530232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781260
11090	NC_015850	GCG	2	6	530291	530296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781260
11091	NC_015850	CGCC	2	8	530422	530429	0 %	0 %	25 %	75 %	340781260
11092	NC_015850	GCA	2	6	530462	530467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781260
11093	NC_015850	GC	3	6	530624	530629	0 %	0 %	50 %	50 %	340781260
11094	NC_015850	GGC	2	6	530688	530693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781260
11095	NC_015850	CTG	2	6	530775	530780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781260
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11098	NC_015850	GCA	2	6	530993	530998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781260
11099	NC_015850	GTG	2	6	531021	531026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781260
11100	NC_015850	GAT	2	6	531030	531035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781260
11101	NC_015850	TCT	2	6	531044	531049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340781260
11102	NC_015850	GAG	2	6	531060	531065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781260
11103	NC_015850	CGG	3	9	531089	531097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781260
11104	NC_015850	CGT	2	6	531128	531133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781260
11105	NC_015850	GCG	2	6	531142	531147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781260
11106	NC_015850	GAT	2	6	531195	531200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781260
11107	NC_015850	AGG	2	6	531220	531225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781260
11108	NC_015850	GC	3	6	531248	531253	0 %	0 %	50 %	50 %	340781260
11109	NC_015850	TGC	2	6	531267	531272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781260
11110	NC_015850	CTTGTC	2	12	531292	531303	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11111	NC_015850	ATT	2	6	531311	531316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11112	NC_015850	TGC	2	6	531351	531356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781261
11113	NC_015850	TGG	2	6	531361	531366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781261
11114	NC_015850	GC	3	6	531372	531377	0 %	0 %	50 %	50 %	340781261
11115	NC_015850	TCG	2	6	531499	531504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781261
11116	NC_015850	GGC	2	6	531526	531531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781261
11117	NC_015850	GCCA	2	8	531565	531572	25 %	0 %	25 %	50 %	340781261
11118	NC_015850	ACC	2	6	531580	531585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781261
11119	NC_015850	GCG	2	6	531632	531637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781261
11120	NC_015850	TGC	2	6	531686	531691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781261
11121	NC_015850	TC	3	6	531713	531718	0 %	50 %	0 %	50 %	340781261
11122	NC_015850	CG	3	6	531719	531724	0 %	0 %	50 %	50 %	340781261
11123	NC_015850	ATC	2	6	531739	531744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781261
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11126	NC_015850	TCG	2	6	531841	531846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781261
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11181	NC_015850	GCTT	2	8	534729	534736	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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11183	NC_015850	A	6	6	534785	534790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11184	NC_015850	CAG	2	6	534806	534811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11221	NC_015850	CGG	2	6	536496	536501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781265
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11233	NC_015850	GCC	2	6	536833	536838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781265
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11240	NC_015850	CCGA	2	8	537352	537359	25 %	0 %	25 %	50 %	340781265
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11242	NC_015850	GGC	2	6	537433	537438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781266
11243	NC_015850	CTG	2	6	537551	537556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781266
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11246	NC_015850	GC	3	6	537760	537765	0 %	0 %	50 %	50 %	340781266
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11251	NC_015850	CGG	2	6	538093	538098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11252	NC_015850	GCA	2	6	538116	538121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11255	NC_015850	GTC	2	6	538277	538282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781267
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11350	NC_015850	GC	3	6	542098	542103	0 %	0 %	50 %	50 %	340781269
11351	NC_015850	GGC	2	6	542119	542124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781269
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11356	NC_015850	GGC	2	6	542293	542298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781269
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11359	NC_015850	ATC	2	6	542452	542457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781269
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11362	NC_015850	CTA	2	6	542550	542555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781269
11363	NC_015850	CGA	2	6	542667	542672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781269
11364	NC_015850	TTG	2	6	542756	542761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340781269
11365	NC_015850	G	6	6	542810	542815	0 %	0 %	100 %	0 %	340781269
11366	NC_015850	CGC	2	6	542840	542845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781269
11367	NC_015850	CGG	2	6	542916	542921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781269
11368	NC_015850	GCT	2	6	542925	542930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781269
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11397	NC_015850	TGC	2	6	544238	544243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11398	NC_015850	GCCT	2	8	544304	544311	0 %	25 %	25 %	50 %	340781271
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11468	NC_015850	TCAT	2	8	547002	547009	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11469	NC_015850	TAGCA	2	10	547015	547024	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11470	NC_015850	GGC	2	6	547035	547040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11473	NC_015850	GCGCC	2	10	547306	547315	0 %	0 %	40 %	60 %	340781274
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11484	NC_015850	TGA	2	6	547952	547957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781274
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