MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 60723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_015850	TTCA	2	8	498420	498427	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10502	NC_015850	G	6	6	498480	498485	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10503	NC_015850	TTGT	2	8	498555	498562	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10504	NC_015850	T	6	6	498567	498572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10505	NC_015850	GCT	2	6	498573	498578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10506	NC_015850	CGA	2	6	498635	498640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10507	NC_015850	AGTC	2	8	498674	498681	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10508	NC_015850	T	6	6	498725	498730	0 %	100 %	0 %	0 %	340781231
10509	NC_015850	TGG	2	6	498754	498759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781231
10510	NC_015850	CCG	2	6	498835	498840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781231
10511	NC_015850	CGA	3	9	498866	498874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781231
10512	NC_015850	TTC	2	6	498918	498923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340781231
10513	NC_015850	A	7	7	499073	499079	100 %	0 %	0 %	0 %	340781231
10514	NC_015850	CGC	2	6	499125	499130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781231
10515	NC_015850	TCA	2	6	499156	499161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781231
10516	NC_015850	CTGC	2	8	499246	499253	0 %	25 %	25 %	50 %	340781231
10517	NC_015850	TCGT	2	8	499279	499286	0 %	50 %	25 %	25 %	340781231
10518	NC_015850	CGC	2	6	499322	499327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781231
10519	NC_015850	GTT	2	6	499340	499345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340781231
10520	NC_015850	CG	3	6	499347	499352	0 %	0 %	50 %	50 %	340781231
10521	NC_015850	GCG	2	6	499390	499395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781231
10522	NC_015850	G	6	6	499414	499419	0 %	0 %	100 %	0 %	340781231
10523	NC_015850	CTG	2	6	499429	499434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781231
10524	NC_015850	GCA	2	6	499512	499517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781231
10525	NC_015850	TCC	2	6	499568	499573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781231
10526	NC_015850	GCG	2	6	499699	499704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781231
10527	NC_015850	GC	3	6	499725	499730	0 %	0 %	50 %	50 %	340781231
10528	NC_015850	ATT	2	6	499759	499764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340781231
10529	NC_015850	GCA	2	6	499811	499816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781231
10530	NC_015850	CCA	2	6	499854	499859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781231
10531	NC_015850	CAGAGC	14	84	499864	499947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781231
10532	NC_015850	TGC	2	6	499987	499992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781231
10533	NC_015850	CCGGC	2	10	500029	500038	0 %	0 %	40 %	60 %	340781231
10534	NC_015850	CAG	2	6	500078	500083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781231
10535	NC_015850	CAG	2	6	500121	500126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781231
10536	NC_015850	GATC	2	8	500154	500161	25 %	25 %	25 %	25 %	340781231
10537	NC_015850	AAC	2	6	500167	500172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340781231
10538	NC_015850	TC	3	6	500179	500184	0 %	50 %	0 %	50 %	340781231
10539	NC_015850	CCAC	2	8	500200	500207	25 %	0 %	0 %	75 %	340781231
10540	NC_015850	GAT	2	6	500243	500248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781231
10541	NC_015850	GCG	2	6	500257	500262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781231
10542	NC_015850	CGG	2	6	500269	500274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781231
10543	NC_015850	GCC	2	6	500326	500331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781231
10544	NC_015850	GGC	2	6	500333	500338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781231
10545	NC_015850	CTG	2	6	500367	500372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781231
10546	NC_015850	GTC	2	6	500387	500392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781231
10547	NC_015850	TCCA	2	8	500412	500419	25 %	25 %	0 %	50 %	340781231
10548	NC_015850	GC	3	6	500451	500456	0 %	0 %	50 %	50 %	340781231
10549	NC_015850	GCGCT	2	10	500536	500545	0 %	20 %	40 %	40 %	340781231
10550	NC_015850	CG	3	6	500595	500600	0 %	0 %	50 %	50 %	340781231
10551	NC_015850	GGC	2	6	500627	500632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781231
10552	NC_015850	GCC	2	6	500649	500654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781231
10553	NC_015850	GCC	2	6	500775	500780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781231
10554	NC_015850	CGG	2	6	500797	500802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781231
10555	NC_015850	GCACTG	2	12	500811	500822	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	340781231
10556	NC_015850	CG	3	6	500844	500849	0 %	0 %	50 %	50 %	340781231
10557	NC_015850	AG	3	6	500978	500983	50 %	0 %	50 %	0 %	340781231
10558	NC_015850	GAC	2	6	501120	501125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781231
10559	NC_015850	GAG	2	6	501144	501149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781231
10560	NC_015850	TCG	2	6	501202	501207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781231
10561	NC_015850	GGC	2	6	501230	501235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781231
10562	NC_015850	AGG	2	6	501238	501243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781231
10563	NC_015850	GCC	2	6	501261	501266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781231
10564	NC_015850	CG	3	6	501278	501283	0 %	0 %	50 %	50 %	340781231
10565	NC_015850	ACG	2	6	501286	501291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781231
10566	NC_015850	CTG	2	6	501342	501347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781231
10567	NC_015850	GCA	2	6	501416	501421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781231
10568	NC_015850	GGC	2	6	501477	501482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10569	NC_015850	GCG	2	6	501494	501499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10570	NC_015850	CCAT	2	8	501559	501566	25 %	25 %	0 %	50 %	340781232
10571	NC_015850	AAGGGC	2	12	501582	501593	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	340781232
10572	NC_015850	GTA	2	6	501600	501605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781232
10573	NC_015850	GGC	2	6	501639	501644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781232
10574	NC_015850	GCG	3	9	501712	501720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781232
10575	NC_015850	CGG	2	6	501726	501731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781232
10576	NC_015850	CG	3	6	501850	501855	0 %	0 %	50 %	50 %	340781232
10577	NC_015850	AGC	2	6	501875	501880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781232
10578	NC_015850	G	6	6	501911	501916	0 %	0 %	100 %	0 %	340781232
10579	NC_015850	ACC	2	6	502002	502007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781232
10580	NC_015850	CG	3	6	502029	502034	0 %	0 %	50 %	50 %	340781232
10581	NC_015850	CCAG	2	8	502051	502058	25 %	0 %	25 %	50 %	340781232
10582	NC_015850	G	6	6	502065	502070	0 %	0 %	100 %	0 %	340781232
10583	NC_015850	GAC	2	6	502086	502091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781232
10584	NC_015850	GAC	2	6	502161	502166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781232
10585	NC_015850	GCA	2	6	502187	502192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781232
10586	NC_015850	GCC	2	6	502237	502242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781232
10587	NC_015850	GCCA	2	8	502258	502265	25 %	0 %	25 %	50 %	340781232
10588	NC_015850	GTT	2	6	502374	502379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340781232
10589	NC_015850	CCA	2	6	502424	502429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781232
10590	NC_015850	AGA	2	6	502436	502441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340781232
10591	NC_015850	GCC	2	6	502473	502478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781232
10592	NC_015850	GTGG	2	8	502552	502559	0 %	25 %	75 %	0 %	340781232
10593	NC_015850	TGC	2	6	502577	502582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781232
10594	NC_015850	AGC	2	6	502591	502596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781232
10595	NC_015850	TCG	2	6	502614	502619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10596	NC_015850	CCG	2	6	502625	502630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10597	NC_015850	ACTC	2	8	502705	502712	25 %	25 %	0 %	50 %	340781233
10598	NC_015850	TGG	2	6	502772	502777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781233
10599	NC_015850	ACC	2	6	502792	502797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781233
10600	NC_015850	AGCTGT	2	12	502884	502895	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	340781233
10601	NC_015850	ACC	2	6	502911	502916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781233
10602	NC_015850	GC	3	6	502984	502989	0 %	0 %	50 %	50 %	340781233
10603	NC_015850	ACC	2	6	502997	503002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781233
10604	NC_015850	GCC	2	6	503098	503103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781233
10605	NC_015850	GTG	2	6	503141	503146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781233
10606	NC_015850	TAGCGA	2	12	503147	503158	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	340781233
10607	NC_015850	GCC	2	6	503224	503229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781233
10608	NC_015850	GCT	2	6	503242	503247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781233
10609	NC_015850	GCC	2	6	503266	503271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781233
10610	NC_015850	CCTG	2	8	503291	503298	0 %	25 %	25 %	50 %	340781233
10611	NC_015850	AGC	2	6	503323	503328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781233
10612	NC_015850	G	6	6	503346	503351	0 %	0 %	100 %	0 %	340781233
10613	NC_015850	CTC	2	6	503380	503385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10614	NC_015850	GTAGGG	2	12	503396	503407	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	340781234
10615	NC_015850	TGC	2	6	503408	503413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781234
10616	NC_015850	GCG	2	6	503429	503434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781234
10617	NC_015850	CGG	2	6	503470	503475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781234
10618	NC_015850	CG	3	6	503495	503500	0 %	0 %	50 %	50 %	340781234
10619	NC_015850	GTG	2	6	503616	503621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781234
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10621	NC_015850	CGC	3	9	503694	503702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781234
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10985	NC_015850	TGC	2	6	523980	523985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781255
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