MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 60723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8002	NC_015850	GGA	2	6	381652	381657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781107
8003	NC_015850	AGG	2	6	381759	381764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781107
8004	NC_015850	GAC	2	6	381797	381802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781107
8005	NC_015850	GCC	2	6	381818	381823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781107
8006	NC_015850	GGC	2	6	381829	381834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781107
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8008	NC_015850	TGCC	2	8	381894	381901	0 %	25 %	25 %	50 %	340781107
8009	NC_015850	GTT	2	6	381934	381939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340781107
8010	NC_015850	CGG	2	6	381987	381992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781107
8011	NC_015850	GCG	2	6	382207	382212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781107
8012	NC_015850	CCT	2	6	382227	382232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781107
8013	NC_015850	GCC	2	6	382264	382269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781107
8014	NC_015850	CGC	2	6	382500	382505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781108
8015	NC_015850	CTG	2	6	382555	382560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781108
8016	NC_015850	GGC	2	6	382567	382572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781108
8017	NC_015850	GCT	2	6	382578	382583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781108
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8019	NC_015850	CGG	2	6	382650	382655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781108
8020	NC_015850	TCGG	2	8	382673	382680	0 %	25 %	50 %	25 %	340781108
8021	NC_015850	CGA	2	6	382710	382715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781108
8022	NC_015850	CTG	2	6	382786	382791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781108
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8026	NC_015850	GC	3	6	382969	382974	0 %	0 %	50 %	50 %	340781108
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8030	NC_015850	GC	3	6	383127	383132	0 %	0 %	50 %	50 %	340781108
8031	NC_015850	GGA	2	6	383137	383142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781108
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8035	NC_015850	GCA	2	6	383262	383267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781109
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8039	NC_015850	TCT	2	6	383501	383506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340781109
8040	NC_015850	TGG	2	6	383541	383546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781109
8041	NC_015850	GGT	2	6	383605	383610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_015850	GCT	3	9	383678	383686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781110
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8045	NC_015850	TGC	2	6	383794	383799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781110
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8053	NC_015850	GCC	2	6	384058	384063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781111
8054	NC_015850	TGG	2	6	384065	384070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781111
8055	NC_015850	CGT	3	9	384129	384137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781111
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8059	NC_015850	GAC	2	6	384265	384270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781111
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8062	NC_015850	CGT	2	6	384327	384332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781111
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8087	NC_015850	GGT	2	6	385657	385662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781113
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8121	NC_015850	GCT	2	6	387448	387453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781116
8122	NC_015850	CGA	2	6	387520	387525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781116
8123	NC_015850	CGA	2	6	387547	387552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781116
8124	NC_015850	GAC	2	6	387590	387595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781116
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8127	NC_015850	C	6	6	387632	387637	0 %	0 %	0 %	100 %	340781116
8128	NC_015850	GAC	2	6	387638	387643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781116
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8130	NC_015850	GAC	2	6	387773	387778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781116
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8132	NC_015850	GGC	2	6	387811	387816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781116
8133	NC_015850	TGC	2	6	387852	387857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781116
8134	NC_015850	C	6	6	387877	387882	0 %	0 %	0 %	100 %	340781116
8135	NC_015850	GGC	2	6	387889	387894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781116
8136	NC_015850	GGCGC	2	10	387967	387976	0 %	0 %	60 %	40 %	340781116
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8140	NC_015850	GC	3	6	388292	388297	0 %	0 %	50 %	50 %	340781116
8141	NC_015850	TCA	2	6	388302	388307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781116
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8143	NC_015850	CAG	2	6	388367	388372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781116
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8145	NC_015850	TGC	2	6	388413	388418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781116
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8147	NC_015850	CG	3	6	388494	388499	0 %	0 %	50 %	50 %	340781116
8148	NC_015850	CTT	2	6	388519	388524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340781116
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8151	NC_015850	CCGCCA	2	12	388563	388574	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	340781116
8152	NC_015850	GGA	2	6	388606	388611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781116
8153	NC_015850	GCA	2	6	388615	388620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781116
8154	NC_015850	CCG	2	6	388678	388683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781116
8155	NC_015850	GCCA	2	8	388724	388731	25 %	0 %	25 %	50 %	340781116
8156	NC_015850	CGG	2	6	388736	388741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781116
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8158	NC_015850	CG	3	6	388950	388955	0 %	0 %	50 %	50 %	340781117
8159	NC_015850	ACG	2	6	389048	389053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781117
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8181	NC_015850	TGCG	2	8	390215	390222	0 %	25 %	50 %	25 %	340781119
8182	NC_015850	TCA	2	6	390237	390242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781119
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8184	NC_015850	ATC	2	6	390296	390301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781119
8185	NC_015850	ATCG	2	8	390401	390408	25 %	25 %	25 %	25 %	340781119
8186	NC_015850	CGCCTG	2	12	390458	390469	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	340781119
8187	NC_015850	CG	3	6	390481	390486	0 %	0 %	50 %	50 %	340781119
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8189	NC_015850	GC	3	6	390610	390615	0 %	0 %	50 %	50 %	340781120
8190	NC_015850	TCG	2	6	390623	390628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781120
8191	NC_015850	TCCGGC	2	12	390640	390651	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	340781120
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8194	NC_015850	TGG	2	6	390722	390727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781120
8195	NC_015850	GCG	2	6	390772	390777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781120
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8200	NC_015850	CG	3	6	391095	391100	0 %	0 %	50 %	50 %	340781120
8201	NC_015850	TGC	2	6	391118	391123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781120
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8204	NC_015850	GC	3	6	391267	391272	0 %	0 %	50 %	50 %	340781120
8205	NC_015850	GCCCGC	2	12	391282	391293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781120
8206	NC_015850	G	6	6	391380	391385	0 %	0 %	100 %	0 %	340781120
8207	NC_015850	AGG	2	6	391436	391441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781120
8208	NC_015850	TGC	2	6	391507	391512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781121
8209	NC_015850	TTTC	2	8	391539	391546	0 %	75 %	0 %	25 %	340781121
8210	NC_015850	AGGCG	2	10	391667	391676	20 %	0 %	60 %	20 %	340781121
8211	NC_015850	CGA	2	6	391711	391716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781121
8212	NC_015850	GC	6	12	391741	391752	0 %	0 %	50 %	50 %	340781121
8213	NC_015850	GC	4	8	391787	391794	0 %	0 %	50 %	50 %	340781121
8214	NC_015850	T	7	7	392028	392034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8215	NC_015850	CAC	2	6	392093	392098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781122
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8219	NC_015850	GCT	2	6	392232	392237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781122
8220	NC_015850	CGC	2	6	392273	392278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781122
8221	NC_015850	CCG	2	6	392287	392292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781122
8222	NC_015850	GAA	2	6	392334	392339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340781122
8223	NC_015850	AAG	2	6	392367	392372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340781122
8224	NC_015850	GAT	2	6	392375	392380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781122
8225	NC_015850	ACC	2	6	392389	392394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8226	NC_015850	T	6	6	392429	392434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8227	NC_015850	CGC	2	6	392462	392467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781123
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8229	NC_015850	CCGG	2	8	392547	392554	0 %	0 %	50 %	50 %	340781123
8230	NC_015850	CCG	2	6	392596	392601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781123
8231	NC_015850	GCA	2	6	392712	392717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781123
8232	NC_015850	TCC	2	6	392733	392738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781123
8233	NC_015850	TGAC	2	8	392760	392767	25 %	25 %	25 %	25 %	340781123
8234	NC_015850	CCG	2	6	392863	392868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781123
8235	NC_015850	GCTG	2	8	392918	392925	0 %	25 %	50 %	25 %	340781123
8236	NC_015850	CAC	2	6	393020	393025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781123
8237	NC_015850	GTA	2	6	393050	393055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781123
8238	NC_015850	A	6	6	393055	393060	100 %	0 %	0 %	0 %	340781123
8239	NC_015850	TGA	2	6	393079	393084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781123
8240	NC_015850	GTG	2	6	393097	393102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781123
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8242	NC_015850	GAC	2	6	393365	393370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781123
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8487	NC_015850	GC	3	6	404313	404318	0 %	0 %	50 %	50 %	340781138
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