MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 60723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_015850	CTAT	2	8	314218	314225	25 %	50 %	0 %	25 %	340781035
6502	NC_015850	TCA	2	6	314323	314328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781035
6503	NC_015850	GTG	2	6	314426	314431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781035
6504	NC_015850	CAT	2	6	314588	314593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781035
6505	NC_015850	CCA	2	6	314596	314601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781035
6506	NC_015850	GCG	2	6	314672	314677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781035
6507	NC_015850	CAT	2	6	314723	314728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781035
6508	NC_015850	GCA	2	6	314744	314749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781035
6509	NC_015850	GAT	2	6	314807	314812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781035
6510	NC_015850	TGC	2	6	314821	314826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781035
6511	NC_015850	CT	3	6	314943	314948	0 %	50 %	0 %	50 %	340781036
6512	NC_015850	CAGGC	2	10	315002	315011	20 %	0 %	40 %	40 %	340781036
6513	NC_015850	GC	3	6	315047	315052	0 %	0 %	50 %	50 %	340781036
6514	NC_015850	ATGCC	2	10	315060	315069	20 %	20 %	20 %	40 %	340781036
6515	NC_015850	GGCG	2	8	315160	315167	0 %	0 %	75 %	25 %	340781036
6516	NC_015850	TGG	2	6	315225	315230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781036
6517	NC_015850	GAC	2	6	315277	315282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781036
6518	NC_015850	ACC	2	6	315304	315309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781036
6519	NC_015850	CGT	2	6	315316	315321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781036
6520	NC_015850	TCTGGC	2	12	315331	315342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781036
6521	NC_015850	GCG	2	6	315416	315421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781036
6522	NC_015850	TGG	2	6	315432	315437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781036
6523	NC_015850	GCGG	2	8	315472	315479	0 %	0 %	75 %	25 %	340781036
6524	NC_015850	GCG	2	6	315483	315488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781036
6525	NC_015850	CGC	2	6	315507	315512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781036
6526	NC_015850	TCGG	2	8	315780	315787	0 %	25 %	50 %	25 %	340781036
6527	NC_015850	TCATCG	2	12	315810	315821	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	340781036
6528	NC_015850	CGT	2	6	315907	315912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6529	NC_015850	ACC	2	6	316056	316061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781037
6530	NC_015850	CCT	2	6	316099	316104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781037
6531	NC_015850	CAG	2	6	316118	316123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781037
6532	NC_015850	CCTG	2	8	316170	316177	0 %	25 %	25 %	50 %	340781037
6533	NC_015850	G	6	6	316192	316197	0 %	0 %	100 %	0 %	340781037
6534	NC_015850	GCG	2	6	316365	316370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781037
6535	NC_015850	CTC	2	6	316406	316411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781037
6536	NC_015850	GGC	2	6	316430	316435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781037
6537	NC_015850	GCT	2	6	316464	316469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781037
6538	NC_015850	CGG	2	6	316480	316485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781037
6539	NC_015850	GCC	2	6	316493	316498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781037
6540	NC_015850	GAA	3	9	316535	316543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340781037
6541	NC_015850	GTT	2	6	316639	316644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340781037
6542	NC_015850	GC	3	6	316691	316696	0 %	0 %	50 %	50 %	340781038
6543	NC_015850	A	6	6	316704	316709	100 %	0 %	0 %	0 %	340781038
6544	NC_015850	GT	3	6	316847	316852	0 %	50 %	50 %	0 %	340781038
6545	NC_015850	GC	3	6	316858	316863	0 %	0 %	50 %	50 %	340781038
6546	NC_015850	G	6	6	316889	316894	0 %	0 %	100 %	0 %	340781038
6547	NC_015850	GAAGC	2	10	316933	316942	40 %	0 %	40 %	20 %	340781038
6548	NC_015850	GC	3	6	316941	316946	0 %	0 %	50 %	50 %	340781038
6549	NC_015850	GC	4	8	316958	316965	0 %	0 %	50 %	50 %	340781038
6550	NC_015850	CAC	2	6	316966	316971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781038
6551	NC_015850	GGC	2	6	316973	316978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781038
6552	NC_015850	GCA	2	6	317048	317053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781038
6553	NC_015850	CCAGGC	2	12	317097	317108	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	340781038
6554	NC_015850	GGC	2	6	317161	317166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781038
6555	NC_015850	CG	3	6	317171	317176	0 %	0 %	50 %	50 %	340781038
6556	NC_015850	CTC	2	6	317193	317198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6557	NC_015850	CTGCG	2	10	317199	317208	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6558	NC_015850	GAG	2	6	317210	317215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6559	NC_015850	GCC	2	6	317230	317235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6560	NC_015850	ATC	2	6	317256	317261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781039
6561	NC_015850	TC	3	6	317328	317333	0 %	50 %	0 %	50 %	340781039
6562	NC_015850	GAC	2	6	317444	317449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781039
6563	NC_015850	CTT	2	6	317518	317523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340781039
6564	NC_015850	CGAG	2	8	317568	317575	25 %	0 %	50 %	25 %	340781039
6565	NC_015850	AG	3	6	317603	317608	50 %	0 %	50 %	0 %	340781039
6566	NC_015850	AGA	2	6	317648	317653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340781039
6567	NC_015850	CA	3	6	317706	317711	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6568	NC_015850	ACACC	2	10	317735	317744	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
6569	NC_015850	GCCA	2	8	317754	317761	25 %	0 %	25 %	50 %	340781040
6570	NC_015850	GGC	2	6	317818	317823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781040
6571	NC_015850	TGT	2	6	317934	317939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340781040
6572	NC_015850	GAT	2	6	317941	317946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781040
6573	NC_015850	GTA	2	6	318007	318012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781040
6574	NC_015850	GC	3	6	318023	318028	0 %	0 %	50 %	50 %	340781040
6575	NC_015850	TCC	2	6	318071	318076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781040
6576	NC_015850	GCCCC	2	10	318090	318099	0 %	0 %	20 %	80 %	340781040
6577	NC_015850	ACC	2	6	318104	318109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781040
6578	NC_015850	GAT	2	6	318208	318213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781040
6579	NC_015850	TCA	2	6	318258	318263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781040
6580	NC_015850	ACC	2	6	318338	318343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781040
6581	NC_015850	TGG	2	6	318368	318373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781040
6582	NC_015850	CCG	3	9	318381	318389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781040
6583	NC_015850	CCG	2	6	318410	318415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781040
6584	NC_015850	AG	3	6	318467	318472	50 %	0 %	50 %	0 %	340781040
6585	NC_015850	TCC	2	6	318513	318518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6586	NC_015850	GGT	2	6	318531	318536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6587	NC_015850	G	6	6	318550	318555	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6588	NC_015850	GCC	2	6	318596	318601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6589	NC_015850	CCG	2	6	318690	318695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6590	NC_015850	CGT	2	6	318760	318765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6591	NC_015850	CAT	2	6	318839	318844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781041
6592	NC_015850	ACC	2	6	318867	318872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781041
6593	NC_015850	TGG	2	6	318874	318879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781041
6594	NC_015850	GCC	2	6	318909	318914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781041
6595	NC_015850	CAG	2	6	318918	318923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781041
6596	NC_015850	GGA	2	6	318926	318931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781041
6597	NC_015850	CAT	2	6	318977	318982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781041
6598	NC_015850	GAA	2	6	318986	318991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340781041
6599	NC_015850	CCG	2	6	318994	318999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781041
6600	NC_015850	TCG	2	6	319027	319032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781041
6601	NC_015850	TGC	3	9	319096	319104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781041
6602	NC_015850	TGG	2	6	319105	319110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781041
6603	NC_015850	TCA	2	6	319189	319194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781041
6604	NC_015850	TCA	2	6	319231	319236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781041
6605	NC_015850	GGA	2	6	319274	319279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781041
6606	NC_015850	ACG	2	6	319333	319338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781041
6607	NC_015850	GAT	2	6	319376	319381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781041
6608	NC_015850	CGG	2	6	319402	319407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781041
6609	NC_015850	TGCAGA	2	12	319426	319437	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	340781041
6610	NC_015850	ATT	2	6	319450	319455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340781041
6611	NC_015850	GTG	2	6	319521	319526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781041
6612	NC_015850	GAG	2	6	319611	319616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781041
6613	NC_015850	TCG	2	6	319633	319638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781041
6614	NC_015850	CGA	2	6	319652	319657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781041
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6616	NC_015850	CGA	2	6	319721	319726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781041
6617	NC_015850	GGA	2	6	319856	319861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781041
6618	NC_015850	TGG	2	6	319921	319926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781041
6619	NC_015850	GGA	3	9	320036	320044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781041
6620	NC_015850	CCCG	2	8	320145	320152	0 %	0 %	25 %	75 %	340781041
6621	NC_015850	TCA	2	6	320206	320211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781041
6622	NC_015850	GGA	2	6	320285	320290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781041
6623	NC_015850	GGC	2	6	320335	320340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781041
6624	NC_015850	GC	3	6	320450	320455	0 %	0 %	50 %	50 %	340781041
6625	NC_015850	CTG	2	6	320478	320483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781041
6626	NC_015850	GGC	2	6	320510	320515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781041
6627	NC_015850	TGG	2	6	320542	320547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781041
6628	NC_015850	CGC	2	6	320554	320559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781041
6629	NC_015850	CATCCG	2	12	320564	320575	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	340781041
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6632	NC_015850	GGCTG	2	10	320700	320709	0 %	20 %	60 %	20 %	340781042
6633	NC_015850	TGA	2	6	320714	320719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781042
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6636	NC_015850	GCA	2	6	320873	320878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781042
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6642	NC_015850	CCG	2	6	321074	321079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781042
6643	NC_015850	TCC	2	6	321136	321141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781042
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6648	NC_015850	TGA	2	6	321484	321489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781043
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6650	NC_015850	CG	3	6	321724	321729	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6651	NC_015850	TGC	2	6	321859	321864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781044
6652	NC_015850	GAC	2	6	321915	321920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781044
6653	NC_015850	TGC	2	6	322024	322029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781044
6654	NC_015850	G	6	6	322034	322039	0 %	0 %	100 %	0 %	340781044
6655	NC_015850	GTGGAG	2	12	322050	322061	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	340781044
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6664	NC_015850	GAG	3	9	322410	322418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781044
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6667	NC_015850	GTCG	2	8	322641	322648	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6668	NC_015850	CCTT	2	8	322649	322656	0 %	50 %	0 %	50 %	340781045
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6676	NC_015850	GAG	2	6	323293	323298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6702	NC_015850	TGA	2	6	324595	324600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781047
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6732	NC_015850	CGA	2	6	325793	325798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781049
6733	NC_015850	CGGTA	2	10	325811	325820	20 %	20 %	40 %	20 %	340781049
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6740	NC_015850	GCG	2	6	326067	326072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781049
6741	NC_015850	CG	3	6	326077	326082	0 %	0 %	50 %	50 %	340781049
6742	NC_015850	CTGGAT	2	12	326184	326195	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	340781049
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6955	NC_015850	TACC	2	8	335432	335439	25 %	25 %	0 %	50 %	340781058
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6960	NC_015850	GACC	2	8	335531	335538	25 %	0 %	25 %	50 %	340781058
6961	NC_015850	TGC	2	6	335575	335580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781058
6962	NC_015850	GCC	2	6	335781	335786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781058
6963	NC_015850	GGC	2	6	335825	335830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6964	NC_015850	GCG	2	6	335931	335936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781059
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6966	NC_015850	CGG	2	6	336041	336046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781059
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6968	NC_015850	TTC	2	6	336160	336165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340781059
6969	NC_015850	CGA	2	6	336171	336176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781059
6970	NC_015850	TCGGCG	2	12	336230	336241	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	340781059
6971	NC_015850	ATGGC	2	10	336333	336342	20 %	20 %	40 %	20 %	340781059
6972	NC_015850	CGG	2	6	336406	336411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781059
6973	NC_015850	GGC	2	6	336438	336443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781059
6974	NC_015850	ACG	2	6	336464	336469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781059
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6978	NC_015850	TGG	3	9	336605	336613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781059
6979	NC_015850	CCATGG	2	12	336728	336739	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	340781059
6980	NC_015850	CGC	2	6	336762	336767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781059
6981	NC_015850	GGC	2	6	336774	336779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781059
6982	NC_015850	CCAT	2	8	336815	336822	25 %	25 %	0 %	50 %	340781059
6983	NC_015850	CG	3	6	336837	336842	0 %	0 %	50 %	50 %	340781059
6984	NC_015850	CTGGGG	2	12	336960	336971	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	340781059
6985	NC_015850	A	6	6	336995	337000	100 %	0 %	0 %	0 %	340781059
6986	NC_015850	CCTCG	2	10	337009	337018	0 %	20 %	20 %	60 %	340781059
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6991	NC_015850	GGC	2	6	337197	337202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781059
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