MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 60723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
58501	NC_015850	GGC	2	6	2831247	2831252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783515
58502	NC_015850	A	7	7	2831298	2831304	100 %	0 %	0 %	0 %	340783515
58503	NC_015850	CGT	2	6	2831361	2831366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783515
58504	NC_015850	CGG	2	6	2831388	2831393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783515
58505	NC_015850	TGG	2	6	2831405	2831410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783515
58506	NC_015850	GCA	2	6	2831484	2831489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783515
58507	NC_015850	GGT	2	6	2831490	2831495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783515
58508	NC_015850	TTG	2	6	2831504	2831509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340783515
58509	NC_015850	GCC	2	6	2831576	2831581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783516
58510	NC_015850	CTG	2	6	2831637	2831642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783516
58511	NC_015850	CTG	2	6	2831667	2831672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783516
58512	NC_015850	GCC	2	6	2831730	2831735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783516
58513	NC_015850	CGA	2	6	2831771	2831776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783516
58514	NC_015850	GTG	2	6	2831787	2831792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783516
58515	NC_015850	AGCCC	2	10	2831840	2831849	20 %	0 %	20 %	60 %	340783516
58516	NC_015850	GCA	2	6	2831873	2831878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783516
58517	NC_015850	GCC	2	6	2831895	2831900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783516
58518	NC_015850	GCC	2	6	2831948	2831953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783516
58519	NC_015850	CGAGGC	2	12	2832089	2832100	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	340783516
58520	NC_015850	CGC	2	6	2832107	2832112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783516
58521	NC_015850	TCA	2	6	2832130	2832135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783516
58522	NC_015850	CGG	2	6	2832148	2832153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783516
58523	NC_015850	CGAC	2	8	2832164	2832171	25 %	0 %	25 %	50 %	340783516
58524	NC_015850	CG	4	8	2832205	2832212	0 %	0 %	50 %	50 %	340783516
58525	NC_015850	CTACCC	2	12	2832275	2832286	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	340783516
58526	NC_015850	TCG	2	6	2832301	2832306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783516
58527	NC_015850	GCA	2	6	2832353	2832358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783516
58528	NC_015850	GCC	2	6	2832396	2832401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783516
58529	NC_015850	ATCGC	2	10	2832418	2832427	20 %	20 %	20 %	40 %	340783516
58530	NC_015850	GCC	2	6	2832436	2832441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783516
58531	NC_015850	GCA	2	6	2832463	2832468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783516
58532	NC_015850	TCG	2	6	2832475	2832480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783516
58533	NC_015850	GA	3	6	2832490	2832495	50 %	0 %	50 %	0 %	340783516
58534	NC_015850	GCG	2	6	2832534	2832539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783516
58535	NC_015850	GCC	3	9	2832585	2832593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783516
58536	NC_015850	GTC	2	6	2832621	2832626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783516
58537	NC_015850	GCAG	2	8	2832659	2832666	25 %	0 %	50 %	25 %	340783516
58538	NC_015850	GCC	2	6	2832675	2832680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783516
58539	NC_015850	TGG	2	6	2832712	2832717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783516
58540	NC_015850	CAT	2	6	2832788	2832793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783516
58541	NC_015850	CGGG	2	8	2832811	2832818	0 %	0 %	75 %	25 %	340783516
58542	NC_015850	CGC	2	6	2832824	2832829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783516
58543	NC_015850	TAGG	2	8	2832909	2832916	25 %	25 %	50 %	0 %	340783516
58544	NC_015850	CGGG	2	8	2832924	2832931	0 %	0 %	75 %	25 %	340783517
58545	NC_015850	GCA	2	6	2833016	2833021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783517
58546	NC_015850	AGA	2	6	2833028	2833033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783517
58547	NC_015850	CG	3	6	2833064	2833069	0 %	0 %	50 %	50 %	340783517
58548	NC_015850	TCC	2	6	2833115	2833120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783517
58549	NC_015850	CGA	2	6	2833137	2833142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783517
58550	NC_015850	TGC	2	6	2833272	2833277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783517
58551	NC_015850	GAC	2	6	2833288	2833293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783517
58552	NC_015850	CGC	2	6	2833428	2833433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783518
58553	NC_015850	CCA	2	6	2833465	2833470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783518
58554	NC_015850	CCA	2	6	2833498	2833503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783518
58555	NC_015850	TGG	2	6	2833531	2833536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783518
58556	NC_015850	GCT	3	9	2833551	2833559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783518
58557	NC_015850	GCC	2	6	2833566	2833571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783518
58558	NC_015850	CG	3	6	2833702	2833707	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58559	NC_015850	CAT	2	6	2833734	2833739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58560	NC_015850	AGG	2	6	2833747	2833752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58561	NC_015850	CGC	3	9	2833779	2833787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58562	NC_015850	CCT	2	6	2833839	2833844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783519
58563	NC_015850	TCG	2	6	2833868	2833873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783519
58564	NC_015850	ACCCG	2	10	2833890	2833899	20 %	0 %	20 %	60 %	340783519
58565	NC_015850	GGC	2	6	2833948	2833953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783519
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58567	NC_015850	GC	3	6	2834017	2834022	0 %	0 %	50 %	50 %	340783519
58568	NC_015850	GGCCTG	2	12	2834023	2834034	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	340783519
58569	NC_015850	GCC	2	6	2834065	2834070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783519
58570	NC_015850	TGC	2	6	2834177	2834182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783519
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58572	NC_015850	TCG	2	6	2834234	2834239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783519
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58580	NC_015850	GC	3	6	2834530	2834535	0 %	0 %	50 %	50 %	340783520
58581	NC_015850	GTA	2	6	2834556	2834561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783520
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58583	NC_015850	GGC	2	6	2834730	2834735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783520
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58587	NC_015850	GC	3	6	2834821	2834826	0 %	0 %	50 %	50 %	340783520
58588	NC_015850	GCGG	2	8	2834835	2834842	0 %	0 %	75 %	25 %	340783520
58589	NC_015850	CTG	2	6	2834862	2834867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783520
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58598	NC_015850	TC	3	6	2835276	2835281	0 %	50 %	0 %	50 %	340783521
58599	NC_015850	GCG	2	6	2835380	2835385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783521
58600	NC_015850	AGGGC	2	10	2835414	2835423	20 %	0 %	60 %	20 %	340783521
58601	NC_015850	GCC	2	6	2835453	2835458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783521
58602	NC_015850	CGC	2	6	2835476	2835481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783521
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58604	NC_015850	CAG	2	6	2835692	2835697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783521
58605	NC_015850	CGT	2	6	2835719	2835724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783521
58606	NC_015850	CACCGC	2	12	2835725	2835736	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	340783521
58607	NC_015850	CGGCG	2	10	2835739	2835748	0 %	0 %	60 %	40 %	340783521
58608	NC_015850	CAG	2	6	2835779	2835784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783521
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58611	NC_015850	CCG	2	6	2835831	2835836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783521
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58614	NC_015850	CG	3	6	2836043	2836048	0 %	0 %	50 %	50 %	340783522
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58978	NC_015850	AGC	2	6	2853448	2853453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783533
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58982	NC_015850	CGG	2	6	2853520	2853525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783533
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