MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 60723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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55003	NC_015850	CGG	2	6	2674118	2674123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783370
55004	NC_015850	CCG	2	6	2674129	2674134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783370
55005	NC_015850	GCCC	2	8	2674179	2674186	0 %	0 %	25 %	75 %	340783370
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55351	NC_015850	GGT	2	6	2688199	2688204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783381
55352	NC_015850	GCG	2	6	2688207	2688212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783381
55353	NC_015850	GCCAG	2	10	2688233	2688242	20 %	0 %	40 %	40 %	340783381
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55359	NC_015850	GGC	2	6	2688606	2688611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783382
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55362	NC_015850	TGC	2	6	2688745	2688750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783382
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55378	NC_015850	CG	3	6	2689649	2689654	0 %	0 %	50 %	50 %	340783383
55379	NC_015850	AGG	2	6	2689690	2689695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783383
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55449	NC_015850	CGCC	2	8	2692521	2692528	0 %	0 %	25 %	75 %	340783386
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55460	NC_015850	GCG	4	12	2692944	2692955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783386
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55462	NC_015850	GGCATT	2	12	2693147	2693158	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	340783386
55463	NC_015850	GC	3	6	2693185	2693190	0 %	0 %	50 %	50 %	340783386
55464	NC_015850	CTC	2	6	2693204	2693209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783386
55465	NC_015850	CCA	2	6	2693212	2693217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783386
55466	NC_015850	GCC	2	6	2693253	2693258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783386
55467	NC_015850	GTC	2	6	2693265	2693270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783386
55468	NC_015850	CGC	2	6	2693301	2693306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783386
55469	NC_015850	CGC	2	6	2693324	2693329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783386
55470	NC_015850	CGC	2	6	2693406	2693411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55471	NC_015850	CAGTC	2	10	2693415	2693424	20 %	20 %	20 %	40 %	340783387
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55473	NC_015850	GCTGC	2	10	2693506	2693515	0 %	20 %	40 %	40 %	340783387
55474	NC_015850	CGC	3	9	2693522	2693530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783387
55475	NC_015850	TGC	2	6	2693569	2693574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783387
55476	NC_015850	CCCA	2	8	2693606	2693613	25 %	0 %	0 %	75 %	340783387
55477	NC_015850	CCA	2	6	2693644	2693649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783387
55478	NC_015850	CGA	2	6	2693698	2693703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783387
55479	NC_015850	GGT	2	6	2693815	2693820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783387
55480	NC_015850	GGT	2	6	2693833	2693838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783387
55481	NC_015850	CGC	2	6	2693927	2693932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783387
55482	NC_015850	GCT	2	6	2693965	2693970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783387
55483	NC_015850	GGT	2	6	2693971	2693976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783387
55484	NC_015850	TTC	2	6	2694071	2694076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783387
55485	NC_015850	CAG	2	6	2694104	2694109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783387
55486	NC_015850	GTC	2	6	2694155	2694160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783387
55487	NC_015850	GAT	2	6	2694191	2694196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783387
55488	NC_015850	GCT	2	6	2694202	2694207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783387
55489	NC_015850	CGT	3	9	2694217	2694225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783387
55490	NC_015850	CAG	2	6	2694230	2694235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783387
55491	NC_015850	CGC	2	6	2694471	2694476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783387
55492	NC_015850	GAT	2	6	2694497	2694502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783387
55493	NC_015850	GCC	2	6	2694509	2694514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783387
55494	NC_015850	GGC	2	6	2694515	2694520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783387
55495	NC_015850	GC	3	6	2694540	2694545	0 %	0 %	50 %	50 %	340783387
55496	NC_015850	TCC	2	6	2694585	2694590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783387
55497	NC_015850	CGG	2	6	2694601	2694606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783387
55498	NC_015850	TGC	2	6	2694624	2694629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783387
55499	NC_015850	CCG	2	6	2694639	2694644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783387
55500	NC_015850	GCCA	2	8	2694665	2694672	25 %	0 %	25 %	50 %	340783387

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