MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 60723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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53615	NC_015850	GAG	2	6	2610140	2610145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783295
53616	NC_015850	ATC	2	6	2610191	2610196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783295
53617	NC_015850	CGA	2	6	2610211	2610216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783295
53618	NC_015850	ACC	2	6	2610231	2610236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783295
53619	NC_015850	TGC	2	6	2610354	2610359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783295
53620	NC_015850	GGCCGA	2	12	2610421	2610432	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	340783295
53621	NC_015850	CGC	2	6	2610434	2610439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783295
53622	NC_015850	ATC	2	6	2610441	2610446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783295
53623	NC_015850	GGC	2	6	2610497	2610502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783295
53624	NC_015850	TCT	2	6	2610507	2610512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783295
53625	NC_015850	GGC	2	6	2610558	2610563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783295
53626	NC_015850	GGC	2	6	2610578	2610583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783295
53627	NC_015850	TGCGCG	2	12	2610840	2610851	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	340783295
53628	NC_015850	GAC	2	6	2610863	2610868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783295
53629	NC_015850	TCT	2	6	2610876	2610881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783295
53630	NC_015850	GCC	2	6	2610882	2610887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783295
53631	NC_015850	CGA	2	6	2611009	2611014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783295
53632	NC_015850	GGCC	2	8	2611060	2611067	0 %	0 %	50 %	50 %	340783295
53633	NC_015850	GCA	2	6	2611158	2611163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783295
53634	NC_015850	GCC	2	6	2611227	2611232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783295
53635	NC_015850	CAT	2	6	2611240	2611245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783295
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53637	NC_015850	CCCA	2	8	2611334	2611341	25 %	0 %	0 %	75 %	340783295
53638	NC_015850	GGT	2	6	2611342	2611347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783295
53639	NC_015850	GTCCA	2	10	2611391	2611400	20 %	20 %	20 %	40 %	340783295
53640	NC_015850	CGGCG	2	10	2611405	2611414	0 %	0 %	60 %	40 %	340783295
53641	NC_015850	CGT	2	6	2611501	2611506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783295
53642	NC_015850	GGC	2	6	2611522	2611527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783295
53643	NC_015850	GGC	2	6	2611591	2611596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783295
53644	NC_015850	GCA	2	6	2611778	2611783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783296
53645	NC_015850	GGATCT	2	12	2611795	2611806	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	340783296
53646	NC_015850	CCCG	2	8	2611831	2611838	0 %	0 %	25 %	75 %	340783296
53647	NC_015850	GCA	2	6	2611888	2611893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783296
53648	NC_015850	GGA	2	6	2612002	2612007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783296
53649	NC_015850	GTG	2	6	2612117	2612122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783296
53650	NC_015850	AAC	2	6	2612124	2612129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783296
53651	NC_015850	GATGGT	2	12	2612152	2612163	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	340783296
53652	NC_015850	GAA	2	6	2612176	2612181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783296
53653	NC_015850	CTT	2	6	2612275	2612280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783297
53654	NC_015850	AAG	2	6	2612297	2612302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783297
53655	NC_015850	GAG	2	6	2612425	2612430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53656	NC_015850	AAG	2	6	2612480	2612485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783298
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53658	NC_015850	TGA	2	6	2612553	2612558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783298
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53660	NC_015850	AAG	2	6	2612594	2612599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783298
53661	NC_015850	CGC	2	6	2612635	2612640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783298
53662	NC_015850	CCT	2	6	2612683	2612688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783298
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53664	NC_015850	TGG	2	6	2612763	2612768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783298
53665	NC_015850	ACAGC	2	10	2612782	2612791	40 %	0 %	20 %	40 %	340783298
53666	NC_015850	CCT	2	6	2612843	2612848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783299
53667	NC_015850	A	6	6	2612926	2612931	100 %	0 %	0 %	0 %	340783299
53668	NC_015850	GC	3	6	2612980	2612985	0 %	0 %	50 %	50 %	340783299
53669	NC_015850	GAC	2	6	2613019	2613024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783299
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53671	NC_015850	TGG	2	6	2613074	2613079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783299
53672	NC_015850	GCC	2	6	2613088	2613093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783299
53673	NC_015850	GCA	2	6	2613129	2613134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783299
53674	NC_015850	TTC	2	6	2613181	2613186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783299
53675	NC_015850	GAC	2	6	2613229	2613234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783299
53676	NC_015850	CCG	2	6	2613263	2613268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783299
53677	NC_015850	GAC	2	6	2613307	2613312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783299
53678	NC_015850	CTT	2	6	2613525	2613530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783299
53679	NC_015850	CCT	2	6	2613563	2613568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783299
53680	NC_015850	CGG	2	6	2613590	2613595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783299
53681	NC_015850	GCTG	2	8	2613656	2613663	0 %	25 %	50 %	25 %	340783299
53682	NC_015850	GCTTT	2	10	2613737	2613746	0 %	60 %	20 %	20 %	340783299
53683	NC_015850	TGC	2	6	2613773	2613778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783299
53684	NC_015850	CTT	2	6	2613804	2613809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783299
53685	NC_015850	CAG	2	6	2613896	2613901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783300
53686	NC_015850	CGT	2	6	2613989	2613994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783300
53687	NC_015850	GGT	2	6	2614085	2614090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783300
53688	NC_015850	GCT	2	6	2614098	2614103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783300
53689	NC_015850	GTGC	2	8	2614121	2614128	0 %	25 %	50 %	25 %	340783300
53690	NC_015850	TTG	2	6	2614149	2614154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340783300
53691	NC_015850	G	6	6	2614189	2614194	0 %	0 %	100 %	0 %	340783300
53692	NC_015850	TGCTC	2	10	2614210	2614219	0 %	40 %	20 %	40 %	340783300
53693	NC_015850	GCA	2	6	2614246	2614251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783300
53694	NC_015850	CTG	2	6	2614257	2614262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783300
53695	NC_015850	TC	3	6	2614391	2614396	0 %	50 %	0 %	50 %	340783300
53696	NC_015850	GC	3	6	2614418	2614423	0 %	0 %	50 %	50 %	340783300
53697	NC_015850	GCA	2	6	2614451	2614456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783300
53698	NC_015850	GCT	2	6	2614538	2614543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783300
53699	NC_015850	GGA	2	6	2614547	2614552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783300
53700	NC_015850	ACC	2	6	2614573	2614578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783300
53701	NC_015850	GCG	2	6	2614592	2614597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783300
53702	NC_015850	GTG	2	6	2614623	2614628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783300
53703	NC_015850	CGG	2	6	2614697	2614702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783300
53704	NC_015850	CAT	2	6	2614823	2614828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783300
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53706	NC_015850	CCG	2	6	2614862	2614867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783300
53707	NC_015850	GCG	2	6	2614919	2614924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783300
53708	NC_015850	GCA	2	6	2614944	2614949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783300
53709	NC_015850	GCG	2	6	2614963	2614968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783300
53710	NC_015850	CGG	3	9	2614990	2614998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783300
53711	NC_015850	CAC	2	6	2615022	2615027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783300
53712	NC_015850	CCG	2	6	2615137	2615142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783300
53713	NC_015850	GCC	2	6	2615216	2615221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783300
53714	NC_015850	GCCA	2	8	2615305	2615312	25 %	0 %	25 %	50 %	340783300
53715	NC_015850	GC	3	6	2615366	2615371	0 %	0 %	50 %	50 %	340783300
53716	NC_015850	GC	3	6	2615436	2615441	0 %	0 %	50 %	50 %	340783300
53717	NC_015850	GAC	2	6	2615451	2615456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783300
53718	NC_015850	GCT	2	6	2615525	2615530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783300
53719	NC_015850	GCA	2	6	2615558	2615563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783300
53720	NC_015850	GCA	2	6	2615609	2615614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783300
53721	NC_015850	CGGCC	2	10	2615642	2615651	0 %	0 %	40 %	60 %	340783300
53722	NC_015850	GTG	2	6	2615681	2615686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783300
53723	NC_015850	GCA	2	6	2615827	2615832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783300
53724	NC_015850	GC	3	6	2615836	2615841	0 %	0 %	50 %	50 %	340783300
53725	NC_015850	GGC	2	6	2615879	2615884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783300
53726	NC_015850	TCT	2	6	2615890	2615895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783300
53727	NC_015850	GCG	2	6	2615969	2615974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783300
53728	NC_015850	TGC	2	6	2616019	2616024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783300
53729	NC_015850	GGC	2	6	2616038	2616043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783300
53730	NC_015850	GCT	2	6	2616128	2616133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783300
53731	NC_015850	GAC	2	6	2616144	2616149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783300
53732	NC_015850	AG	3	6	2616185	2616190	50 %	0 %	50 %	0 %	340783300
53733	NC_015850	CGC	2	6	2616197	2616202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783300
53734	NC_015850	TGT	2	6	2616280	2616285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340783301
53735	NC_015850	TCG	2	6	2616325	2616330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783301
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53737	NC_015850	CGG	2	6	2616474	2616479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783301
53738	NC_015850	GTG	2	6	2616480	2616485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783301
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53740	NC_015850	TCG	2	6	2616699	2616704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783302
53741	NC_015850	CTA	2	6	2616705	2616710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783302
53742	NC_015850	GC	4	8	2616733	2616740	0 %	0 %	50 %	50 %	340783302
53743	NC_015850	CCAC	2	8	2616827	2616834	25 %	0 %	0 %	75 %	340783302
53744	NC_015850	GGA	2	6	2616858	2616863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783302
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53749	NC_015850	ATCGG	2	10	2617088	2617097	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
53750	NC_015850	CGG	2	6	2617115	2617120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53751	NC_015850	CCT	2	6	2617140	2617145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53752	NC_015850	CGT	2	6	2617158	2617163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53753	NC_015850	CCA	2	6	2617289	2617294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53754	NC_015850	CGC	2	6	2617299	2617304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53755	NC_015850	GTC	2	6	2617351	2617356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783303
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53758	NC_015850	GGT	2	6	2617473	2617478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783303
53759	NC_015850	AGT	2	6	2617597	2617602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783303
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53761	NC_015850	AGT	2	6	2617640	2617645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783303
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53827	NC_015850	GCA	2	6	2620989	2620994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783305
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53834	NC_015850	CAGTTC	2	12	2621299	2621310	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	340783305
53835	NC_015850	GC	3	6	2621339	2621344	0 %	0 %	50 %	50 %	340783305
53836	NC_015850	GAAG	2	8	2621412	2621419	50 %	0 %	50 %	0 %	340783305
53837	NC_015850	G	6	6	2621421	2621426	0 %	0 %	100 %	0 %	340783305
53838	NC_015850	CCA	2	6	2621429	2621434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783305
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53842	NC_015850	GGCAG	2	10	2621586	2621595	20 %	0 %	60 %	20 %	340783305
53843	NC_015850	CCA	2	6	2621628	2621633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783305
53844	NC_015850	CGT	2	6	2621655	2621660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783305
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