MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 60723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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53002	NC_015850	GC	3	6	2582193	2582198	0 %	0 %	50 %	50 %	340783269
53003	NC_015850	GCC	2	6	2582205	2582210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783269
53004	NC_015850	GC	3	6	2582260	2582265	0 %	0 %	50 %	50 %	340783269
53005	NC_015850	GCCGTG	2	12	2582271	2582282	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	340783269
53006	NC_015850	GCG	2	6	2582341	2582346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783269
53007	NC_015850	GC	3	6	2582411	2582416	0 %	0 %	50 %	50 %	340783269
53008	NC_015850	GC	3	6	2582453	2582458	0 %	0 %	50 %	50 %	340783269
53009	NC_015850	TG	3	6	2582466	2582471	0 %	50 %	50 %	0 %	340783269
53010	NC_015850	CTA	2	6	2582555	2582560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783269
53011	NC_015850	GGC	2	6	2582573	2582578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783269
53012	NC_015850	CACC	2	8	2582582	2582589	25 %	0 %	0 %	75 %	340783269
53013	NC_015850	C	6	6	2582665	2582670	0 %	0 %	0 %	100 %	340783269
53014	NC_015850	GGA	2	6	2582714	2582719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783269
53015	NC_015850	GGC	2	6	2582720	2582725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783269
53016	NC_015850	TGC	3	9	2582731	2582739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783269
53017	NC_015850	CGC	2	6	2582790	2582795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783269
53018	NC_015850	GCTGC	2	10	2582804	2582813	0 %	20 %	40 %	40 %	340783269
53019	NC_015850	CGC	2	6	2582844	2582849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783269
53020	NC_015850	CGG	3	9	2582871	2582879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53021	NC_015850	GCA	2	6	2582888	2582893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53022	NC_015850	GT	3	6	2582912	2582917	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53023	NC_015850	GGC	3	9	2583015	2583023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783270
53024	NC_015850	TCT	2	6	2583037	2583042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783270
53025	NC_015850	GGGC	2	8	2583167	2583174	0 %	0 %	75 %	25 %	340783270
53026	NC_015850	GTCG	2	8	2583195	2583202	0 %	25 %	50 %	25 %	340783270
53027	NC_015850	GCC	2	6	2583230	2583235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783270
53028	NC_015850	GCA	2	6	2583260	2583265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783270
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53032	NC_015850	GCA	2	6	2583564	2583569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53033	NC_015850	TGGA	2	8	2583578	2583585	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
53034	NC_015850	A	6	6	2583679	2583684	100 %	0 %	0 %	0 %	340783271
53035	NC_015850	CAT	2	6	2583706	2583711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783271
53036	NC_015850	GCT	2	6	2583768	2583773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783271
53037	NC_015850	CGA	2	6	2583779	2583784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783271
53038	NC_015850	AT	3	6	2583791	2583796	50 %	50 %	0 %	0 %	340783271
53039	NC_015850	GTC	2	6	2583853	2583858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783271
53040	NC_015850	TGA	2	6	2583960	2583965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783271
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53042	NC_015850	CACC	2	8	2584029	2584036	25 %	0 %	0 %	75 %	340783271
53043	NC_015850	AAG	2	6	2584085	2584090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783271
53044	NC_015850	ATG	2	6	2584100	2584105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783271
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53053	NC_015850	GTG	2	6	2584415	2584420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783271
53054	NC_015850	A	6	6	2584421	2584426	100 %	0 %	0 %	0 %	340783271
53055	NC_015850	TCC	2	6	2584457	2584462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783271
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53057	NC_015850	GTTG	2	8	2584587	2584594	0 %	50 %	50 %	0 %	340783271
53058	NC_015850	TGA	2	6	2584611	2584616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783271
53059	NC_015850	TCCCG	2	10	2584665	2584674	0 %	20 %	20 %	60 %	340783271
53060	NC_015850	GCAG	2	8	2584700	2584707	25 %	0 %	50 %	25 %	340783271
53061	NC_015850	GGC	2	6	2584725	2584730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783271
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53063	NC_015850	CTC	2	6	2584761	2584766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53064	NC_015850	AG	3	6	2584890	2584895	50 %	0 %	50 %	0 %	340783272
53065	NC_015850	GTA	2	6	2584901	2584906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783272
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53072	NC_015850	GCC	2	6	2585169	2585174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783272
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53078	NC_015850	GTA	2	6	2585684	2585689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783272
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53099	NC_015850	CG	5	10	2587255	2587264	0 %	0 %	50 %	50 %	340783272
53100	NC_015850	CTC	2	6	2587265	2587270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783272
53101	NC_015850	CTGG	2	8	2587372	2587379	0 %	25 %	50 %	25 %	340783272
53102	NC_015850	CCA	2	6	2587396	2587401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783272
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53110	NC_015850	TG	3	6	2587701	2587706	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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53116	NC_015850	CG	4	8	2588137	2588144	0 %	0 %	50 %	50 %	340783273
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53118	NC_015850	GCG	2	6	2588188	2588193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783273
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53220	NC_015850	GC	3	6	2592589	2592594	0 %	0 %	50 %	50 %	340783276
53221	NC_015850	GGCGC	2	10	2592639	2592648	0 %	0 %	60 %	40 %	340783276
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53225	NC_015850	GGCGAG	2	12	2592952	2592963	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	340783276
53226	NC_015850	GCT	2	6	2592990	2592995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783276
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53229	NC_015850	CCTTG	2	10	2593056	2593065	0 %	40 %	20 %	40 %	340783276
53230	NC_015850	GCG	2	6	2593105	2593110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783276
53231	NC_015850	GC	3	6	2593140	2593145	0 %	0 %	50 %	50 %	340783276
53232	NC_015850	ATC	2	6	2593183	2593188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783276
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53235	NC_015850	GCA	2	6	2593248	2593253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783276
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53342	NC_015850	CGA	2	6	2598013	2598018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783284
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53348	NC_015850	TCTGC	2	10	2598455	2598464	0 %	40 %	20 %	40 %	340783285
53349	NC_015850	CGA	2	6	2598470	2598475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783285
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53351	NC_015850	GC	3	6	2598568	2598573	0 %	0 %	50 %	50 %	340783285
53352	NC_015850	GGC	2	6	2598629	2598634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783285
53353	NC_015850	GGA	2	6	2598638	2598643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783285
53354	NC_015850	CGC	2	6	2598650	2598655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783285
53355	NC_015850	CTT	2	6	2598659	2598664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783285
53356	NC_015850	GCCA	2	8	2598781	2598788	25 %	0 %	25 %	50 %	340783285
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53360	NC_015850	CAT	2	6	2598878	2598883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783285
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53362	NC_015850	CAA	2	6	2598923	2598928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783285
53363	NC_015850	CGG	2	6	2598929	2598934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783285
53364	NC_015850	CTG	2	6	2599014	2599019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783285
53365	NC_015850	CGG	2	6	2599028	2599033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783285
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53369	NC_015850	GAC	2	6	2599185	2599190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783285
53370	NC_015850	GCTG	2	8	2599282	2599289	0 %	25 %	50 %	25 %	340783285
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53381	NC_015850	TCT	2	6	2599599	2599604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783286
53382	NC_015850	ACC	2	6	2599608	2599613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783286
53383	NC_015850	CGC	2	6	2599627	2599632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783286
53384	NC_015850	TGG	2	6	2599650	2599655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783286
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53388	NC_015850	ATC	2	6	2599782	2599787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783286
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53414	NC_015850	GGCT	2	8	2600987	2600994	0 %	25 %	50 %	25 %	340783286
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53432	NC_015850	GTGGC	2	10	2601780	2601789	0 %	20 %	60 %	20 %	340783286
53433	NC_015850	CG	3	6	2601809	2601814	0 %	0 %	50 %	50 %	340783286
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53449	NC_015850	TGG	2	6	2602360	2602365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783287
53450	NC_015850	TCG	2	6	2602390	2602395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783287
53451	NC_015850	GGCG	2	8	2602403	2602410	0 %	0 %	75 %	25 %	340783287
53452	NC_015850	CTT	2	6	2602448	2602453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783287
53453	NC_015850	TCG	2	6	2602528	2602533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783287
53454	NC_015850	GCT	2	6	2602697	2602702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783287
53455	NC_015850	CTG	2	6	2602719	2602724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783287
53456	NC_015850	GATCA	2	10	2602770	2602779	40 %	20 %	20 %	20 %	340783287
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53458	NC_015850	CCA	2	6	2602885	2602890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783288
53459	NC_015850	GCG	2	6	2603051	2603056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783288
53460	NC_015850	GAG	2	6	2603139	2603144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783288
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53462	NC_015850	TCT	2	6	2603200	2603205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783288
53463	NC_015850	TCG	2	6	2603242	2603247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783288
53464	NC_015850	ACA	2	6	2603296	2603301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783288
53465	NC_015850	GCT	2	6	2603309	2603314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783288
53466	NC_015850	GGC	2	6	2603357	2603362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783288
53467	NC_015850	GAC	2	6	2603402	2603407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783289
53468	NC_015850	T	6	6	2603413	2603418	0 %	100 %	0 %	0 %	340783289
53469	NC_015850	CTG	2	6	2603439	2603444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783289
53470	NC_015850	TCA	2	6	2603458	2603463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783289
53471	NC_015850	CCGC	2	8	2603464	2603471	0 %	0 %	25 %	75 %	340783289
53472	NC_015850	CTT	2	6	2603507	2603512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783289
53473	NC_015850	CTG	2	6	2603532	2603537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783289
53474	NC_015850	GTG	2	6	2603610	2603615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783289
53475	NC_015850	ATG	2	6	2603616	2603621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783289
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53477	NC_015850	CGC	2	6	2603711	2603716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783289
53478	NC_015850	TGCC	2	8	2603746	2603753	0 %	25 %	25 %	50 %	340783289
53479	NC_015850	CGC	2	6	2603756	2603761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783289
53480	NC_015850	ACA	2	6	2603779	2603784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783289
53481	NC_015850	AC	3	6	2603809	2603814	50 %	0 %	0 %	50 %	340783289
53482	NC_015850	GCG	2	6	2603838	2603843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783289
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53486	NC_015850	CGGC	2	8	2603921	2603928	0 %	0 %	50 %	50 %	340783289
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53490	NC_015850	TGG	2	6	2604237	2604242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783290
53491	NC_015850	GAC	2	6	2604275	2604280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783290
53492	NC_015850	CGA	2	6	2604283	2604288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783290
53493	NC_015850	TCT	2	6	2604350	2604355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783291
53494	NC_015850	GGCG	2	8	2604374	2604381	0 %	0 %	75 %	25 %	340783291
53495	NC_015850	GT	3	6	2604532	2604537	0 %	50 %	50 %	0 %	340783291
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53497	NC_015850	ACG	2	6	2604652	2604657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783291
53498	NC_015850	CG	3	6	2604668	2604673	0 %	0 %	50 %	50 %	340783291
53499	NC_015850	TGA	2	6	2604721	2604726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783291
53500	NC_015850	CAA	2	6	2604728	2604733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783291

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