MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 60723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
52501	NC_015850	G	7	7	2559794	2559800	0 %	0 %	100 %	0 %	340783242
52502	NC_015850	CGA	2	6	2559826	2559831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783242
52503	NC_015850	CGA	2	6	2559859	2559864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783242
52504	NC_015850	AGG	2	6	2559925	2559930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783242
52505	NC_015850	ATG	2	6	2559945	2559950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783242
52506	NC_015850	GAC	2	6	2559952	2559957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783242
52507	NC_015850	GCG	2	6	2559979	2559984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783242
52508	NC_015850	CCATGG	2	12	2560009	2560020	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	340783242
52509	NC_015850	CCA	2	6	2560183	2560188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783243
52510	NC_015850	GC	3	6	2560195	2560200	0 %	0 %	50 %	50 %	340783243
52511	NC_015850	TCG	2	6	2560212	2560217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783243
52512	NC_015850	CCG	3	9	2560284	2560292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783243
52513	NC_015850	GAT	2	6	2560352	2560357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783243
52514	NC_015850	CAG	2	6	2560412	2560417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783243
52515	NC_015850	G	6	6	2560429	2560434	0 %	0 %	100 %	0 %	340783243
52516	NC_015850	GCT	2	6	2560558	2560563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783243
52517	NC_015850	TCG	2	6	2560611	2560616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783243
52518	NC_015850	TCT	2	6	2560669	2560674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783243
52519	NC_015850	TGG	2	6	2560687	2560692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783243
52520	NC_015850	GGCT	2	8	2560719	2560726	0 %	25 %	50 %	25 %	340783243
52521	NC_015850	CCG	2	6	2560759	2560764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783243
52522	NC_015850	GGGCCA	2	12	2560774	2560785	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	340783243
52523	NC_015850	GGT	2	6	2560802	2560807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783243
52524	NC_015850	GAT	2	6	2560844	2560849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783243
52525	NC_015850	GAG	2	6	2560865	2560870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783243
52526	NC_015850	GCGA	2	8	2560894	2560901	25 %	0 %	50 %	25 %	340783243
52527	NC_015850	CGG	2	6	2560921	2560926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783243
52528	NC_015850	CCG	2	6	2560978	2560983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783243
52529	NC_015850	GACTC	2	10	2561135	2561144	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
52530	NC_015850	TGA	3	9	2561182	2561190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783244
52531	NC_015850	CGC	2	6	2561209	2561214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783244
52532	NC_015850	GCC	2	6	2561253	2561258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783244
52533	NC_015850	GTC	2	6	2561264	2561269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783244
52534	NC_015850	GTC	2	6	2561336	2561341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783244
52535	NC_015850	CGGCG	2	10	2561395	2561404	0 %	0 %	60 %	40 %	340783244
52536	NC_015850	CTC	2	6	2561414	2561419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783244
52537	NC_015850	ACG	2	6	2561463	2561468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783244
52538	NC_015850	GCTGC	2	10	2561571	2561580	0 %	20 %	40 %	40 %	340783245
52539	NC_015850	GCC	2	6	2561593	2561598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783245
52540	NC_015850	GCG	2	6	2561622	2561627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783245
52541	NC_015850	CACC	2	8	2561690	2561697	25 %	0 %	0 %	75 %	340783245
52542	NC_015850	CGG	2	6	2561702	2561707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783245
52543	NC_015850	CAG	2	6	2561770	2561775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783245
52544	NC_015850	CGC	2	6	2561805	2561810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783245
52545	NC_015850	GTG	2	6	2561865	2561870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783245
52546	NC_015850	CGT	2	6	2561888	2561893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783245
52547	NC_015850	GCC	2	6	2561908	2561913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783245
52548	NC_015850	CTG	2	6	2562012	2562017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783245
52549	NC_015850	ACC	2	6	2562046	2562051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783245
52550	NC_015850	GGC	2	6	2562063	2562068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783245
52551	NC_015850	TCG	2	6	2562130	2562135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783245
52552	NC_015850	GCC	2	6	2562191	2562196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783245
52553	NC_015850	GAC	2	6	2562227	2562232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783245
52554	NC_015850	GGC	2	6	2562237	2562242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783245
52555	NC_015850	CCA	2	6	2562377	2562382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783246
52556	NC_015850	CT	3	6	2562384	2562389	0 %	50 %	0 %	50 %	340783246
52557	NC_015850	CCT	2	6	2562406	2562411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783246
52558	NC_015850	GC	3	6	2562452	2562457	0 %	0 %	50 %	50 %	340783246
52559	NC_015850	TGC	2	6	2562514	2562519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783246
52560	NC_015850	GGT	2	6	2562641	2562646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783246
52561	NC_015850	TCG	2	6	2562675	2562680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783246
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52563	NC_015850	TGC	2	6	2562826	2562831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783246
52564	NC_015850	TGA	2	6	2562880	2562885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783246
52565	NC_015850	CCG	2	6	2562963	2562968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783246
52566	NC_015850	TGC	3	9	2562988	2562996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783246
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52568	NC_015850	GCT	2	6	2563074	2563079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783246
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52570	NC_015850	ACC	2	6	2563193	2563198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783246
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52572	NC_015850	GCCCG	2	10	2563223	2563232	0 %	0 %	40 %	60 %	340783246
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52586	NC_015850	GC	3	6	2563801	2563806	0 %	0 %	50 %	50 %	340783247
52587	NC_015850	GC	4	8	2563850	2563857	0 %	0 %	50 %	50 %	340783247
52588	NC_015850	CTT	2	6	2563858	2563863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783247
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52599	NC_015850	CCCA	2	8	2564224	2564231	25 %	0 %	0 %	75 %	340783247
52600	NC_015850	GAG	2	6	2564269	2564274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783247
52601	NC_015850	CTT	2	6	2564281	2564286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783247
52602	NC_015850	GCACC	2	10	2564298	2564307	20 %	0 %	20 %	60 %	340783247
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52607	NC_015850	CGG	2	6	2564577	2564582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783247
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52615	NC_015850	GAT	2	6	2564827	2564832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783247
52616	NC_015850	CCA	2	6	2564849	2564854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783247
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52633	NC_015850	CGGC	2	8	2565515	2565522	0 %	0 %	50 %	50 %	340783248
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52646	NC_015850	CTG	2	6	2566042	2566047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783248
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52713	NC_015850	GCC	2	6	2569494	2569499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52714	NC_015850	ACG	2	6	2569541	2569546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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52716	NC_015850	TGGAG	2	10	2569969	2569978	20 %	20 %	60 %	0 %	340783253
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52718	NC_015850	CTG	2	6	2570043	2570048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783253
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52732	NC_015850	GC	3	6	2570642	2570647	0 %	0 %	50 %	50 %	340783253
52733	NC_015850	TCA	2	6	2570665	2570670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783253
52734	NC_015850	CAT	2	6	2570702	2570707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783253
52735	NC_015850	CGC	2	6	2570789	2570794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783253
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52737	NC_015850	CTGG	2	8	2570858	2570865	0 %	25 %	50 %	25 %	340783253
52738	NC_015850	GCCGTC	2	12	2570898	2570909	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	340783253
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52742	NC_015850	GC	3	6	2571006	2571011	0 %	0 %	50 %	50 %	340783254
52743	NC_015850	CGAG	2	8	2571018	2571025	25 %	0 %	50 %	25 %	340783254
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52745	NC_015850	T	6	6	2571210	2571215	0 %	100 %	0 %	0 %	340783254
52746	NC_015850	CGACA	2	10	2571218	2571227	40 %	0 %	20 %	40 %	340783254
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52748	NC_015850	CTGG	2	8	2571298	2571305	0 %	25 %	50 %	25 %	340783254
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52754	NC_015850	CGC	2	6	2571409	2571414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783254
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52756	NC_015850	TCGCTT	2	12	2571481	2571492	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	340783254
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52758	NC_015850	GC	3	6	2571620	2571625	0 %	0 %	50 %	50 %	340783254
52759	NC_015850	TGA	2	6	2571633	2571638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783254
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52767	NC_015850	CGC	2	6	2572141	2572146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783255
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52772	NC_015850	TGGCTG	2	12	2572332	2572343	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	340783255
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52787	NC_015850	TGC	3	9	2572986	2572994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783256
52788	NC_015850	GC	3	6	2573010	2573015	0 %	0 %	50 %	50 %	340783256
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52790	NC_015850	GCC	2	6	2573216	2573221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783256
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52792	NC_015850	GCTCAA	2	12	2573251	2573262	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	340783256
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52794	NC_015850	TGG	2	6	2573343	2573348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783256
52795	NC_015850	CGA	2	6	2573410	2573415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783256
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52798	NC_015850	GCCG	2	8	2573539	2573546	0 %	0 %	50 %	50 %	340783257
52799	NC_015850	GCA	2	6	2573551	2573556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783257
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52801	NC_015850	CTC	2	6	2573668	2573673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783257
52802	NC_015850	TGC	2	6	2573690	2573695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783257
52803	NC_015850	GAT	2	6	2573799	2573804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783257
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52805	NC_015850	GCA	2	6	2573835	2573840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783257
52806	NC_015850	CTGGCC	2	12	2573860	2573871	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	340783257
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52813	NC_015850	TGG	2	6	2574163	2574168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783257
52814	NC_015850	CCG	2	6	2574193	2574198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783257
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52816	NC_015850	TCG	2	6	2574272	2574277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783257
52817	NC_015850	TCC	2	6	2574284	2574289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783257
52818	NC_015850	CTTT	2	8	2574312	2574319	0 %	75 %	0 %	25 %	340783257
52819	NC_015850	TGC	2	6	2574410	2574415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783257
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52824	NC_015850	TCA	2	6	2574725	2574730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783257
52825	NC_015850	GGC	2	6	2574735	2574740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783257
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52828	NC_015850	GTC	2	6	2574828	2574833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783258
52829	NC_015850	GCC	2	6	2574852	2574857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783258
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52831	NC_015850	GTG	2	6	2574993	2574998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783258
52832	NC_015850	TGG	2	6	2575036	2575041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783258
52833	NC_015850	AAG	2	6	2575071	2575076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783258
52834	NC_015850	CGG	2	6	2575147	2575152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783258
52835	NC_015850	ACG	2	6	2575207	2575212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783258
52836	NC_015850	AAC	2	6	2575216	2575221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783258
52837	NC_015850	CGA	2	6	2575253	2575258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783258
52838	NC_015850	CGT	2	6	2575283	2575288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783258
52839	NC_015850	ATCG	2	8	2575290	2575297	25 %	25 %	25 %	25 %	340783258
52840	NC_015850	CGC	2	6	2575367	2575372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783258
52841	NC_015850	GGC	2	6	2575391	2575396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783258
52842	NC_015850	CCGGC	2	10	2575430	2575439	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
52843	NC_015850	CGGG	3	12	2575445	2575456	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
52844	NC_015850	GGA	2	6	2575520	2575525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783259
52845	NC_015850	GAG	2	6	2575566	2575571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783259
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