MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 60723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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52002	NC_015850	GGCCAA	2	12	2537792	2537803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783218
52003	NC_015850	TGC	2	6	2537828	2537833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783218
52004	NC_015850	TGG	2	6	2537834	2537839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783218
52005	NC_015850	GCAC	2	8	2537899	2537906	25 %	0 %	25 %	50 %	340783218
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52007	NC_015850	GTA	2	6	2537979	2537984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783218
52008	NC_015850	CCG	2	6	2538100	2538105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783218
52009	NC_015850	GGT	2	6	2538156	2538161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783218
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52013	NC_015850	TAG	2	6	2538238	2538243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783218
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52024	NC_015850	GCA	2	6	2538847	2538852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783219
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52042	NC_015850	CG	3	6	2539515	2539520	0 %	0 %	50 %	50 %	340783220
52043	NC_015850	CGT	4	12	2539622	2539633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783220
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52116	NC_015850	GCC	2	6	2542211	2542216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783222
52117	NC_015850	GC	3	6	2542262	2542267	0 %	0 %	50 %	50 %	340783222
52118	NC_015850	TCG	2	6	2542374	2542379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783222
52119	NC_015850	CTT	2	6	2542468	2542473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783222
52120	NC_015850	GGT	2	6	2542495	2542500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783222
52121	NC_015850	GCG	2	6	2542503	2542508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783222
52122	NC_015850	GGA	2	6	2542522	2542527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783222
52123	NC_015850	CG	3	6	2542549	2542554	0 %	0 %	50 %	50 %	340783222
52124	NC_015850	GGT	2	6	2542564	2542569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783222
52125	NC_015850	CCG	2	6	2542573	2542578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783222
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52128	NC_015850	TGG	2	6	2542656	2542661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783222
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52130	NC_015850	GCGAC	2	10	2542719	2542728	20 %	0 %	40 %	40 %	340783222
52131	NC_015850	GAC	2	6	2542811	2542816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783222
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52136	NC_015850	GCTG	2	8	2542971	2542978	0 %	25 %	50 %	25 %	340783222
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52138	NC_015850	GGA	2	6	2543072	2543077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52139	NC_015850	CCG	3	9	2543154	2543162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52140	NC_015850	CGA	2	6	2543183	2543188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52141	NC_015850	GAC	2	6	2543211	2543216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52142	NC_015850	CGA	2	6	2543249	2543254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783223
52143	NC_015850	GGA	2	6	2543357	2543362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783223
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52145	NC_015850	CAT	2	6	2543426	2543431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783223
52146	NC_015850	TGG	2	6	2543482	2543487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783223
52147	NC_015850	AGG	2	6	2543509	2543514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783223
52148	NC_015850	GGT	2	6	2543550	2543555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783223
52149	NC_015850	TGC	2	6	2543569	2543574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783223
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52151	NC_015850	CGG	2	6	2543696	2543701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52152	NC_015850	TGC	2	6	2543739	2543744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783224
52153	NC_015850	CGAT	2	8	2543876	2543883	25 %	25 %	25 %	25 %	340783224
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52161	NC_015850	ACA	2	6	2544190	2544195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52162	NC_015850	ATC	2	6	2544243	2544248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783225
52163	NC_015850	TCG	3	9	2544332	2544340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783225
52164	NC_015850	TGC	2	6	2544388	2544393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783225
52165	NC_015850	GC	3	6	2544405	2544410	0 %	0 %	50 %	50 %	340783225
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52192	NC_015850	GGT	2	6	2546019	2546024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783227
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52197	NC_015850	CAG	2	6	2546215	2546220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783227
52198	NC_015850	GC	3	6	2546249	2546254	0 %	0 %	50 %	50 %	340783227
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52201	NC_015850	AAG	2	6	2546381	2546386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783227
52202	NC_015850	CCGG	2	8	2546474	2546481	0 %	0 %	50 %	50 %	340783227
52203	NC_015850	ACC	2	6	2546486	2546491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783227
52204	NC_015850	CAC	2	6	2546538	2546543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52205	NC_015850	GAT	2	6	2546548	2546553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52206	NC_015850	TCG	2	6	2546609	2546614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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52208	NC_015850	TCAG	2	8	2546685	2546692	25 %	25 %	25 %	25 %	340783228
52209	NC_015850	CGGCG	2	10	2546698	2546707	0 %	0 %	60 %	40 %	340783228
52210	NC_015850	CGC	2	6	2546719	2546724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783228
52211	NC_015850	CAA	2	6	2546767	2546772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783228
52212	NC_015850	CTT	2	6	2546809	2546814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783228
52213	NC_015850	CGC	2	6	2546817	2546822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783228
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52215	NC_015850	GCC	3	9	2546963	2546971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783228
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52217	NC_015850	TGG	2	6	2547066	2547071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783228
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52219	NC_015850	CTGGC	2	10	2547116	2547125	0 %	20 %	40 %	40 %	340783228
52220	NC_015850	CAT	2	6	2547133	2547138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783228
52221	NC_015850	GCG	2	6	2547339	2547344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783228
52222	NC_015850	GC	3	6	2547370	2547375	0 %	0 %	50 %	50 %	340783228
52223	NC_015850	CCG	2	6	2547393	2547398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783228
52224	NC_015850	TCC	2	6	2547453	2547458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783228
52225	NC_015850	GAG	2	6	2547539	2547544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783228
52226	NC_015850	GC	3	6	2547626	2547631	0 %	0 %	50 %	50 %	340783228
52227	NC_015850	GGC	2	6	2547640	2547645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783228
52228	NC_015850	CGC	2	6	2547775	2547780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783228
52229	NC_015850	C	6	6	2547903	2547908	0 %	0 %	0 %	100 %	340783228
52230	NC_015850	TCT	2	6	2547919	2547924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783228
52231	NC_015850	GC	3	6	2547949	2547954	0 %	0 %	50 %	50 %	340783228
52232	NC_015850	CGCAGC	2	12	2548004	2548015	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	340783228
52233	NC_015850	CCG	2	6	2548018	2548023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783228
52234	NC_015850	CGG	2	6	2548177	2548182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783228
52235	NC_015850	ACC	2	6	2548206	2548211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783228
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52332	NC_015850	A	6	6	2552212	2552217	100 %	0 %	0 %	0 %	340783231
52333	NC_015850	GC	3	6	2552249	2552254	0 %	0 %	50 %	50 %	340783231
52334	NC_015850	C	6	6	2552459	2552464	0 %	0 %	0 %	100 %	340783231
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52336	NC_015850	TCCG	2	8	2552495	2552502	0 %	25 %	25 %	50 %	340783231
52337	NC_015850	CTT	2	6	2552541	2552546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783231
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52341	NC_015850	GCG	2	6	2552655	2552660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783231
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52343	NC_015850	GAC	2	6	2552849	2552854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783231
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52345	NC_015850	CGC	2	6	2553009	2553014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783231
52346	NC_015850	CAG	2	6	2553069	2553074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783231
52347	NC_015850	CGTG	2	8	2553165	2553172	0 %	25 %	50 %	25 %	340783231
52348	NC_015850	C	6	6	2553191	2553196	0 %	0 %	0 %	100 %	340783231
52349	NC_015850	TGC	2	6	2553197	2553202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783231
52350	NC_015850	ACC	2	6	2553218	2553223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783231
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52352	NC_015850	TCG	2	6	2553272	2553277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783231
52353	NC_015850	TGC	2	6	2553311	2553316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783231
52354	NC_015850	GC	4	8	2553344	2553351	0 %	0 %	50 %	50 %	340783231
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52359	NC_015850	GGC	2	6	2553600	2553605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783232
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