MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 60723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
51501	NC_015850	CGCA	2	8	2514538	2514545	25 %	0 %	25 %	50 %	340783201
51502	NC_015850	AC	4	8	2514613	2514620	50 %	0 %	0 %	50 %	340783201
51503	NC_015850	ATC	2	6	2514624	2514629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783201
51504	NC_015850	GGA	2	6	2514643	2514648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783201
51505	NC_015850	CGC	2	6	2514709	2514714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783201
51506	NC_015850	CG	3	6	2514742	2514747	0 %	0 %	50 %	50 %	340783201
51507	NC_015850	CTG	2	6	2514769	2514774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783201
51508	NC_015850	TGG	2	6	2514816	2514821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783201
51509	NC_015850	CGTC	2	8	2514859	2514866	0 %	25 %	25 %	50 %	340783201
51510	NC_015850	CAGCC	2	10	2514884	2514893	20 %	0 %	20 %	60 %	340783201
51511	NC_015850	GAG	2	6	2514911	2514916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783201
51512	NC_015850	GC	3	6	2514970	2514975	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51513	NC_015850	CGG	3	9	2514990	2514998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783202
51514	NC_015850	CGG	2	6	2515331	2515336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783202
51515	NC_015850	CAAGCC	2	12	2515428	2515439	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	340783202
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51517	NC_015850	CTG	2	6	2515564	2515569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783202
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51519	NC_015850	GC	3	6	2515670	2515675	0 %	0 %	50 %	50 %	340783202
51520	NC_015850	GAC	2	6	2515708	2515713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783202
51521	NC_015850	GCG	2	6	2515760	2515765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783202
51522	NC_015850	CGA	2	6	2515772	2515777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783202
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51537	NC_015850	GAT	2	6	2516230	2516235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783202
51538	NC_015850	GGC	2	6	2516266	2516271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783202
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51540	NC_015850	GCCA	2	8	2516317	2516324	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51541	NC_015850	CCTT	2	8	2516466	2516473	0 %	50 %	0 %	50 %	340783203
51542	NC_015850	CGT	2	6	2516488	2516493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783203
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51544	NC_015850	CGT	2	6	2516593	2516598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783203
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51550	NC_015850	GAT	2	6	2517010	2517015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783203
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51554	NC_015850	GAA	2	6	2517159	2517164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783203
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51558	NC_015850	GCCG	2	8	2517256	2517263	0 %	0 %	50 %	50 %	340783203
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51583	NC_015850	CGAC	2	8	2518329	2518336	25 %	0 %	25 %	50 %	340783203
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51587	NC_015850	CCA	2	6	2518606	2518611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783204
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51589	NC_015850	GGT	2	6	2518685	2518690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783204
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51600	NC_015850	CTG	2	6	2519358	2519363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783205
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51607	NC_015850	GC	3	6	2519626	2519631	0 %	0 %	50 %	50 %	340783205
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51612	NC_015850	GC	3	6	2519744	2519749	0 %	0 %	50 %	50 %	340783206
51613	NC_015850	G	6	6	2519795	2519800	0 %	0 %	100 %	0 %	340783206
51614	NC_015850	CGC	2	6	2519805	2519810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783206
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51616	NC_015850	GCCC	2	8	2519883	2519890	0 %	0 %	25 %	75 %	340783206
51617	NC_015850	CCAT	2	8	2519895	2519902	25 %	25 %	0 %	50 %	340783206
51618	NC_015850	GCA	2	6	2520025	2520030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783206
51619	NC_015850	CGG	2	6	2520042	2520047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783206
51620	NC_015850	CG	3	6	2520194	2520199	0 %	0 %	50 %	50 %	340783207
51621	NC_015850	GCG	2	6	2520213	2520218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783207
51622	NC_015850	CAC	2	6	2520246	2520251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783207
51623	NC_015850	CCGT	2	8	2520295	2520302	0 %	25 %	25 %	50 %	340783207
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51625	NC_015850	ACA	2	6	2520395	2520400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783207
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51628	NC_015850	GCC	3	9	2520541	2520549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783207
51629	NC_015850	CCAC	2	8	2520574	2520581	25 %	0 %	0 %	75 %	340783207
51630	NC_015850	TGA	2	6	2520674	2520679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783207
51631	NC_015850	GCT	2	6	2520689	2520694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783207
51632	NC_015850	CG	3	6	2520800	2520805	0 %	0 %	50 %	50 %	340783207
51633	NC_015850	CCA	4	12	2520821	2520832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783207
51634	NC_015850	CGCC	2	8	2520839	2520846	0 %	0 %	25 %	75 %	340783207
51635	NC_015850	GTC	2	6	2520918	2520923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783207
51636	NC_015850	GC	3	6	2520931	2520936	0 %	0 %	50 %	50 %	340783207
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51642	NC_015850	GCA	2	6	2521103	2521108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783207
51643	NC_015850	CAG	2	6	2521119	2521124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783207
51644	NC_015850	CGC	2	6	2521175	2521180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783207
51645	NC_015850	CTC	2	6	2521185	2521190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783207
51646	NC_015850	CGC	2	6	2521238	2521243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783207
51647	NC_015850	CCA	3	9	2521268	2521276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783207
51648	NC_015850	CGC	2	6	2521287	2521292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783207
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51650	NC_015850	TCG	2	6	2521336	2521341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783207
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51652	NC_015850	TGA	2	6	2521433	2521438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783207
51653	NC_015850	ACC	2	6	2521485	2521490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783207
51654	NC_015850	CAC	2	6	2521572	2521577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783207
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51656	NC_015850	CTC	2	6	2521620	2521625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783207
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51658	NC_015850	TGGTGA	2	12	2521643	2521654	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	340783207
51659	NC_015850	ACG	2	6	2521684	2521689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783207
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51662	NC_015850	TGA	2	6	2521757	2521762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783207
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51664	NC_015850	CGC	3	9	2521915	2521923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783207
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51666	NC_015850	TCG	2	6	2521954	2521959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783207
51667	NC_015850	GCG	2	6	2521971	2521976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783207
51668	NC_015850	CGC	2	6	2521979	2521984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783207
51669	NC_015850	TCG	2	6	2521996	2522001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783207
51670	NC_015850	T	6	6	2522016	2522021	0 %	100 %	0 %	0 %	340783207
51671	NC_015850	GCA	2	6	2522038	2522043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783207
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51673	NC_015850	GCC	2	6	2522095	2522100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783207
51674	NC_015850	GAC	3	9	2522105	2522113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783207
51675	NC_015850	CGC	2	6	2522127	2522132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783207
51676	NC_015850	CGT	2	6	2522154	2522159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783207
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51679	NC_015850	CCG	2	6	2522294	2522299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783207
51680	NC_015850	GCC	2	6	2522314	2522319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783207
51681	NC_015850	CCG	3	9	2522324	2522332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783207
51682	NC_015850	TCC	2	6	2522353	2522358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783207
51683	NC_015850	GGT	2	6	2522362	2522367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783207
51684	NC_015850	GCG	2	6	2522375	2522380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783207
51685	NC_015850	CTC	2	6	2522436	2522441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783207
51686	NC_015850	GCTGGT	2	12	2522535	2522546	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	340783207
51687	NC_015850	GCT	2	6	2522618	2522623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783207
51688	NC_015850	CCG	2	6	2522648	2522653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783207
51689	NC_015850	CTT	2	6	2522658	2522663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783207
51690	NC_015850	GGCC	2	8	2522666	2522673	0 %	0 %	50 %	50 %	340783207
51691	NC_015850	GCC	3	9	2522671	2522679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783207
51692	NC_015850	GCA	2	6	2522719	2522724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783207
51693	NC_015850	CAC	2	6	2522777	2522782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51694	NC_015850	GC	5	10	2522815	2522824	0 %	0 %	50 %	50 %	340783208
51695	NC_015850	CCA	2	6	2522863	2522868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783208
51696	NC_015850	CCG	2	6	2522908	2522913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783208
51697	NC_015850	CGG	2	6	2522983	2522988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783208
51698	NC_015850	ACC	2	6	2523000	2523005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783208
51699	NC_015850	TTG	2	6	2523027	2523032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340783208
51700	NC_015850	CTC	2	6	2523074	2523079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783208
51701	NC_015850	CCT	2	6	2523127	2523132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783208
51702	NC_015850	GTC	2	6	2523191	2523196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783208
51703	NC_015850	CTG	2	6	2523203	2523208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783208
51704	NC_015850	CTT	2	6	2523226	2523231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783208
51705	NC_015850	GCTG	2	8	2523286	2523293	0 %	25 %	50 %	25 %	340783208
51706	NC_015850	GCT	2	6	2523337	2523342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783208
51707	NC_015850	TCG	2	6	2523378	2523383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783208
51708	NC_015850	GAT	2	6	2523386	2523391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783208
51709	NC_015850	CCG	2	6	2523403	2523408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783208
51710	NC_015850	TGA	2	6	2523421	2523426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783208
51711	NC_015850	TGA	2	6	2523487	2523492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783208
51712	NC_015850	CA	3	6	2523521	2523526	50 %	0 %	0 %	50 %	340783208
51713	NC_015850	CGC	2	6	2523596	2523601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783208
51714	NC_015850	AGC	2	6	2523663	2523668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783208
51715	NC_015850	GA	4	8	2523682	2523689	50 %	0 %	50 %	0 %	340783208
51716	NC_015850	CG	3	6	2523703	2523708	0 %	0 %	50 %	50 %	340783208
51717	NC_015850	CCG	2	6	2523713	2523718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783208
51718	NC_015850	ATC	2	6	2523774	2523779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783208
51719	NC_015850	GAT	2	6	2523818	2523823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783208
51720	NC_015850	GAC	2	6	2523848	2523853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783208
51721	NC_015850	TGA	2	6	2523859	2523864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783208
51722	NC_015850	CGA	2	6	2523892	2523897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783208
51723	NC_015850	TGC	2	6	2523953	2523958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783208
51724	NC_015850	TCC	2	6	2524071	2524076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783208
51725	NC_015850	CCA	2	6	2524087	2524092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783208
51726	NC_015850	GTG	2	6	2524110	2524115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783208
51727	NC_015850	GAC	2	6	2524142	2524147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783208
51728	NC_015850	CGTCCA	2	12	2524376	2524387	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	340783209
51729	NC_015850	GAC	2	6	2524598	2524603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783209
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51731	NC_015850	GCA	2	6	2524685	2524690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783209
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51855	NC_015850	GCC	2	6	2531568	2531573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783212
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51968	NC_015850	GGCTG	2	10	2536535	2536544	0 %	20 %	60 %	20 %	340783217
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51993	NC_015850	GCA	2	6	2537492	2537497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783217
51994	NC_015850	GGC	2	6	2537499	2537504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783217
51995	NC_015850	CAG	2	6	2537513	2537518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783217
51996	NC_015850	CAA	2	6	2537523	2537528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783217
51997	NC_015850	GC	3	6	2537571	2537576	0 %	0 %	50 %	50 %	340783217
51998	NC_015850	TCGC	2	8	2537613	2537620	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51999	NC_015850	GGGTA	2	10	2537721	2537730	20 %	20 %	60 %	0 %	340783218
52000	NC_015850	TGC	2	6	2537747	2537752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783218

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