MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 60723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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51002	NC_015850	TGA	2	6	2492689	2492694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783180
51003	NC_015850	GGCG	2	8	2492719	2492726	0 %	0 %	75 %	25 %	340783180
51004	NC_015850	TGC	2	6	2492728	2492733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783180
51005	NC_015850	GCG	2	6	2492814	2492819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783180
51006	NC_015850	CGA	2	6	2492824	2492829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783180
51007	NC_015850	CGG	2	6	2492836	2492841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783180
51008	NC_015850	GCC	2	6	2492939	2492944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783180
51009	NC_015850	CCA	2	6	2492965	2492970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783180
51010	NC_015850	CTG	2	6	2492993	2492998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783180
51011	NC_015850	CGG	2	6	2493043	2493048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783180
51012	NC_015850	GGA	3	9	2493058	2493066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783180
51013	NC_015850	CGT	2	6	2493155	2493160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783181
51014	NC_015850	TCT	2	6	2493303	2493308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783181
51015	NC_015850	CGG	3	9	2493421	2493429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783182
51016	NC_015850	CGT	2	6	2493451	2493456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783182
51017	NC_015850	CGG	2	6	2493466	2493471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783182
51018	NC_015850	TGA	2	6	2493472	2493477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783182
51019	NC_015850	GGCCA	2	10	2493479	2493488	20 %	0 %	40 %	40 %	340783182
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51024	NC_015850	GC	3	6	2493642	2493647	0 %	0 %	50 %	50 %	340783182
51025	NC_015850	CCG	3	9	2493694	2493702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783182
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51028	NC_015850	CTG	2	6	2493866	2493871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783182
51029	NC_015850	GTC	2	6	2493920	2493925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783182
51030	NC_015850	GAG	2	6	2493950	2493955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783182
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51032	NC_015850	GCG	2	6	2494012	2494017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783182
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51035	NC_015850	CG	3	6	2494123	2494128	0 %	0 %	50 %	50 %	340783182
51036	NC_015850	GCT	2	6	2494159	2494164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783182
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51050	NC_015850	TGAT	2	8	2494479	2494486	25 %	50 %	25 %	0 %	340783182
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51087	NC_015850	CGA	2	6	2496215	2496220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783184
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51115	NC_015850	ACC	2	6	2497321	2497326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783184
51116	NC_015850	GCCC	2	8	2497352	2497359	0 %	0 %	25 %	75 %	340783184
51117	NC_015850	GCC	2	6	2497380	2497385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783184
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51123	NC_015850	GAT	2	6	2497761	2497766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783184
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51203	NC_015850	TCC	2	6	2501195	2501200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51204	NC_015850	CTA	2	6	2501286	2501291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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51212	NC_015850	CGA	2	6	2501719	2501724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783187
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51220	NC_015850	GTCTGA	2	12	2502045	2502056	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	340783187
51221	NC_015850	GCG	2	6	2502071	2502076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783187
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51228	NC_015850	GGT	2	6	2502340	2502345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783187
51229	NC_015850	AC	3	6	2502348	2502353	50 %	0 %	0 %	50 %	340783187
51230	NC_015850	GGC	2	6	2502376	2502381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783187
51231	NC_015850	GAGC	2	8	2502403	2502410	25 %	0 %	50 %	25 %	340783187
51232	NC_015850	GCA	2	6	2502412	2502417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783187
51233	NC_015850	TGG	2	6	2502465	2502470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783187
51234	NC_015850	GCC	2	6	2502524	2502529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783187
51235	NC_015850	GCCC	2	8	2502565	2502572	0 %	0 %	25 %	75 %	340783187
51236	NC_015850	GC	4	8	2502680	2502687	0 %	0 %	50 %	50 %	340783187
51237	NC_015850	GTC	2	6	2502710	2502715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783187
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51239	NC_015850	GGT	2	6	2502749	2502754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783187
51240	NC_015850	GAGT	2	8	2502807	2502814	25 %	25 %	50 %	0 %	340783187
51241	NC_015850	AGCCA	2	10	2502845	2502854	40 %	0 %	20 %	40 %	340783187
51242	NC_015850	TGC	2	6	2502858	2502863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783187
51243	NC_015850	GGT	2	6	2502890	2502895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783187
51244	NC_015850	CCG	2	6	2502918	2502923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783187
51245	NC_015850	GC	3	6	2502988	2502993	0 %	0 %	50 %	50 %	340783187
51246	NC_015850	CCAGG	2	10	2503055	2503064	20 %	0 %	40 %	40 %	340783187
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51250	NC_015850	GCAGGA	2	12	2503294	2503305	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
51251	NC_015850	CAT	2	6	2503308	2503313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783188
51252	NC_015850	TGG	3	9	2503340	2503348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783188
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51259	NC_015850	GCC	2	6	2503900	2503905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783188
51260	NC_015850	CAC	2	6	2503955	2503960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783188
51261	NC_015850	CGC	2	6	2503998	2504003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783188
51262	NC_015850	GCGG	2	8	2504116	2504123	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
51263	NC_015850	CCAT	2	8	2504239	2504246	25 %	25 %	0 %	50 %	340783189
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51265	NC_015850	TGGTGC	2	12	2504429	2504440	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	340783189
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51267	NC_015850	GGCG	2	8	2504483	2504490	0 %	0 %	75 %	25 %	340783189
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51281	NC_015850	GTA	2	6	2505060	2505065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783189
51282	NC_015850	CGT	2	6	2505155	2505160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783189
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51291	NC_015850	C	6	6	2505581	2505586	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
51292	NC_015850	ACCA	2	8	2505695	2505702	50 %	0 %	0 %	50 %	340783191
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51296	NC_015850	GCAC	2	8	2505935	2505942	25 %	0 %	25 %	50 %	340783191
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51320	NC_015850	CG	3	6	2506701	2506706	0 %	0 %	50 %	50 %	340783192
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51326	NC_015850	GCC	2	6	2507027	2507032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51327	NC_015850	GGC	2	6	2507094	2507099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783193
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51330	NC_015850	GTG	2	6	2507175	2507180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783193
51331	NC_015850	GA	3	6	2507203	2507208	50 %	0 %	50 %	0 %	340783193
51332	NC_015850	CCGA	2	8	2507246	2507253	25 %	0 %	25 %	50 %	340783193
51333	NC_015850	CTC	2	6	2507307	2507312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783193
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51335	NC_015850	CGGG	2	8	2507356	2507363	0 %	0 %	75 %	25 %	340783193
51336	NC_015850	CAC	2	6	2507375	2507380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783193
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51339	NC_015850	GGC	2	6	2507520	2507525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783193
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51341	NC_015850	ACC	2	6	2507607	2507612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783193
51342	NC_015850	ACG	2	6	2507636	2507641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783193
51343	NC_015850	GAG	2	6	2507661	2507666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783193
51344	NC_015850	TCG	2	6	2507757	2507762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783193
51345	NC_015850	ACGG	2	8	2507766	2507773	25 %	0 %	50 %	25 %	340783193
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51347	NC_015850	GCC	2	6	2507922	2507927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783193
51348	NC_015850	TCC	2	6	2507947	2507952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783193
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51412	NC_015850	AG	3	6	2510416	2510421	50 %	0 %	50 %	0 %	340783196
51413	NC_015850	ATCAGT	2	12	2510479	2510490	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	340783196
51414	NC_015850	GGT	2	6	2510495	2510500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783196
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51423	NC_015850	GGGTAA	2	12	2510762	2510773	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	340783196
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51427	NC_015850	CTG	2	6	2511129	2511134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783196
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51430	NC_015850	GCT	2	6	2511220	2511225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783196
51431	NC_015850	G	6	6	2511237	2511242	0 %	0 %	100 %	0 %	340783196
51432	NC_015850	TGG	2	6	2511357	2511362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783196
51433	NC_015850	GCG	2	6	2511371	2511376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783196
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51441	NC_015850	C	6	6	2511642	2511647	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
51442	NC_015850	TCG	2	6	2511893	2511898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783197
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51445	NC_015850	CG	5	10	2512033	2512042	0 %	0 %	50 %	50 %	340783197
51446	NC_015850	GGT	2	6	2512050	2512055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783197
51447	NC_015850	GC	3	6	2512140	2512145	0 %	0 %	50 %	50 %	340783197
51448	NC_015850	GCG	2	6	2512161	2512166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51449	NC_015850	CCG	2	6	2512175	2512180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51450	NC_015850	GC	3	6	2512343	2512348	0 %	0 %	50 %	50 %	340783198
51451	NC_015850	CTGC	2	8	2512377	2512384	0 %	25 %	25 %	50 %	340783198
51452	NC_015850	GC	3	6	2512401	2512406	0 %	0 %	50 %	50 %	340783198
51453	NC_015850	CTC	2	6	2512417	2512422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783198
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51456	NC_015850	TGT	2	6	2512551	2512556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340783198
51457	NC_015850	GCG	2	6	2512567	2512572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783198
51458	NC_015850	TTC	2	6	2512592	2512597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783198
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51461	NC_015850	CGA	2	6	2512758	2512763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783198
51462	NC_015850	GCT	2	6	2512834	2512839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783198
51463	NC_015850	CTG	2	6	2512858	2512863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783198
51464	NC_015850	TGA	2	6	2513039	2513044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783199
51465	NC_015850	GCG	2	6	2513116	2513121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783199
51466	NC_015850	CCT	2	6	2513123	2513128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783199
51467	NC_015850	CGG	2	6	2513168	2513173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783199
51468	NC_015850	GCCGC	2	10	2513184	2513193	0 %	0 %	40 %	60 %	340783199
51469	NC_015850	AGCC	2	8	2513194	2513201	25 %	0 %	25 %	50 %	340783199
51470	NC_015850	CGC	2	6	2513269	2513274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783199
51471	NC_015850	CCG	2	6	2513297	2513302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783199
51472	NC_015850	TTG	2	6	2513317	2513322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340783199
51473	NC_015850	GTC	2	6	2513323	2513328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783199
51474	NC_015850	GC	3	6	2513368	2513373	0 %	0 %	50 %	50 %	340783199
51475	NC_015850	CTC	2	6	2513390	2513395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51476	NC_015850	TCG	2	6	2513459	2513464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783200
51477	NC_015850	GCC	2	6	2513480	2513485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783200
51478	NC_015850	GCGCCG	2	12	2513506	2513517	0 %	0 %	50 %	50 %	340783200
51479	NC_015850	CCAA	2	8	2513543	2513550	50 %	0 %	0 %	50 %	340783200
51480	NC_015850	CGC	2	6	2513567	2513572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783200
51481	NC_015850	CCA	2	6	2513608	2513613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783200
51482	NC_015850	ATC	2	6	2513693	2513698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783200
51483	NC_015850	AGC	2	6	2513714	2513719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783200
51484	NC_015850	CGC	2	6	2513750	2513755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783200
51485	NC_015850	GCG	2	6	2513791	2513796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783200
51486	NC_015850	CCAGCA	2	12	2513829	2513840	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	340783200
51487	NC_015850	GCA	2	6	2513856	2513861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783200
51488	NC_015850	GGC	2	6	2513944	2513949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783200
51489	NC_015850	AGC	2	6	2514020	2514025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783200
51490	NC_015850	CGC	2	6	2514130	2514135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783200
51491	NC_015850	CAG	2	6	2514142	2514147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783200
51492	NC_015850	TCCAC	2	10	2514163	2514172	20 %	20 %	0 %	60 %	340783200
51493	NC_015850	GATC	2	8	2514196	2514203	25 %	25 %	25 %	25 %	340783200
51494	NC_015850	GCA	2	6	2514268	2514273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783201
51495	NC_015850	TATC	2	8	2514328	2514335	25 %	50 %	0 %	25 %	340783201
51496	NC_015850	TCG	2	6	2514369	2514374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783201
51497	NC_015850	CCG	2	6	2514399	2514404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783201
51498	NC_015850	CCG	2	6	2514412	2514417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783201
51499	NC_015850	CAC	2	6	2514452	2514457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783201
51500	NC_015850	GGC	2	6	2514470	2514475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783201

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