MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 60723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
50001	NC_015850	TGC	2	6	2447005	2447010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50002	NC_015850	GCA	2	6	2447011	2447016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50003	NC_015850	GCT	2	6	2447081	2447086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50004	NC_015850	GCCC	2	8	2447192	2447199	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
50005	NC_015850	GGT	2	6	2447210	2447215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50006	NC_015850	TGT	3	9	2447251	2447259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50007	NC_015850	GGT	2	6	2447282	2447287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50008	NC_015850	CTGGC	2	10	2447337	2447346	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
50009	NC_015850	CCA	2	6	2447486	2447491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50010	NC_015850	GCG	2	6	2447518	2447523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50011	NC_015850	CGT	2	6	2447618	2447623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50012	NC_015850	CTG	2	6	2447658	2447663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50013	NC_015850	GCA	2	6	2447677	2447682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50014	NC_015850	CG	3	6	2447698	2447703	0 %	0 %	50 %	50 %	340783134
50015	NC_015850	GCC	2	6	2447735	2447740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783134
50016	NC_015850	CGG	3	9	2447742	2447750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783134
50017	NC_015850	GCG	2	6	2447873	2447878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783134
50018	NC_015850	GC	4	8	2447933	2447940	0 %	0 %	50 %	50 %	340783134
50019	NC_015850	CCG	2	6	2447945	2447950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783134
50020	NC_015850	GGC	2	6	2447998	2448003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783134
50021	NC_015850	TGC	2	6	2448077	2448082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783134
50022	NC_015850	GC	3	6	2448105	2448110	0 %	0 %	50 %	50 %	340783134
50023	NC_015850	ACC	2	6	2448176	2448181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783134
50024	NC_015850	GGC	2	6	2448182	2448187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783134
50025	NC_015850	AGC	2	6	2448200	2448205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783134
50026	NC_015850	CTTC	2	8	2448207	2448214	0 %	50 %	0 %	50 %	340783134
50027	NC_015850	TGGC	2	8	2448215	2448222	0 %	25 %	50 %	25 %	340783134
50028	NC_015850	GCC	2	6	2448260	2448265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783134
50029	NC_015850	AG	3	6	2448278	2448283	50 %	0 %	50 %	0 %	340783134
50030	NC_015850	GCC	2	6	2448299	2448304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783134
50031	NC_015850	GCATCG	2	12	2448311	2448322	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	340783134
50032	NC_015850	GC	4	8	2448364	2448371	0 %	0 %	50 %	50 %	340783134
50033	NC_015850	CTC	2	6	2448478	2448483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783134
50034	NC_015850	TCC	2	6	2448515	2448520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783134
50035	NC_015850	CTG	2	6	2448526	2448531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783134
50036	NC_015850	GCC	2	6	2448534	2448539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783134
50037	NC_015850	CAG	2	6	2448568	2448573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783134
50038	NC_015850	AGC	2	6	2448628	2448633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783135
50039	NC_015850	ACG	2	6	2448657	2448662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783135
50040	NC_015850	TCG	2	6	2448687	2448692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783135
50041	NC_015850	CTCC	2	8	2448707	2448714	0 %	25 %	0 %	75 %	340783135
50042	NC_015850	GCG	2	6	2448715	2448720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783135
50043	NC_015850	CAG	2	6	2448726	2448731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783135
50044	NC_015850	AAC	2	6	2448739	2448744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783135
50045	NC_015850	CTCCAG	2	12	2448747	2448758	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	340783135
50046	NC_015850	GGC	2	6	2448876	2448881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783135
50047	NC_015850	CGG	2	6	2448887	2448892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783135
50048	NC_015850	ACG	2	6	2449019	2449024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50049	NC_015850	TGAG	2	8	2449062	2449069	25 %	25 %	50 %	0 %	340783136
50050	NC_015850	ACG	2	6	2449073	2449078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783136
50051	NC_015850	T	6	6	2449106	2449111	0 %	100 %	0 %	0 %	340783136
50052	NC_015850	GAG	2	6	2449133	2449138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783136
50053	NC_015850	GGC	2	6	2449144	2449149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783136
50054	NC_015850	GAC	2	6	2449208	2449213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783136
50055	NC_015850	ATC	2	6	2449253	2449258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783136
50056	NC_015850	CGA	2	6	2449273	2449278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783136
50057	NC_015850	GAA	2	6	2449315	2449320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783136
50058	NC_015850	ACCA	2	8	2449331	2449338	50 %	0 %	0 %	50 %	340783136
50059	NC_015850	CAC	2	6	2449346	2449351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783136
50060	NC_015850	CGA	2	6	2449435	2449440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783136
50061	NC_015850	CCT	2	6	2449452	2449457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783136
50062	NC_015850	GGC	2	6	2449507	2449512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783136
50063	NC_015850	AGC	2	6	2449554	2449559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783136
50064	NC_015850	CCT	2	6	2449605	2449610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783136
50065	NC_015850	CCG	2	6	2449650	2449655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783136
50066	NC_015850	AAG	2	6	2449673	2449678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783136
50067	NC_015850	GTG	2	6	2449733	2449738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783136
50068	NC_015850	CGC	2	6	2449828	2449833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783136
50069	NC_015850	TAC	2	6	2449841	2449846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783136
50070	NC_015850	CGG	2	6	2449902	2449907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783136
50071	NC_015850	ACT	2	6	2449950	2449955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783136
50072	NC_015850	CTG	2	6	2449969	2449974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783136
50073	NC_015850	CAT	2	6	2449993	2449998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783136
50074	NC_015850	TGA	2	6	2450076	2450081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783136
50075	NC_015850	CAC	2	6	2450104	2450109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783136
50076	NC_015850	ACT	2	6	2450151	2450156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783136
50077	NC_015850	CAT	2	6	2450164	2450169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783136
50078	NC_015850	GGC	2	6	2450185	2450190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783136
50079	NC_015850	TGG	2	6	2450259	2450264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783136
50080	NC_015850	CAAGGC	2	12	2450287	2450298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783136
50081	NC_015850	CCA	2	6	2450367	2450372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783136
50082	NC_015850	GCCCC	2	10	2450425	2450434	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
50083	NC_015850	CGG	2	6	2450435	2450440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50084	NC_015850	T	7	7	2450444	2450450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50085	NC_015850	CAG	2	6	2450532	2450537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783137
50086	NC_015850	ATC	2	6	2450583	2450588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783138
50087	NC_015850	CAA	2	6	2450596	2450601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783138
50088	NC_015850	GT	3	6	2450605	2450610	0 %	50 %	50 %	0 %	340783138
50089	NC_015850	CGTC	2	8	2450632	2450639	0 %	25 %	25 %	50 %	340783138
50090	NC_015850	GAG	2	6	2450699	2450704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783138
50091	NC_015850	CCG	2	6	2450754	2450759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783138
50092	NC_015850	AAG	2	6	2450795	2450800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783138
50093	NC_015850	GCC	2	6	2450813	2450818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783138
50094	NC_015850	GCT	2	6	2450854	2450859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783138
50095	NC_015850	GGGGC	2	10	2450882	2450891	0 %	0 %	80 %	20 %	340783139
50096	NC_015850	CGG	3	9	2450905	2450913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783139
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50098	NC_015850	CTCGC	2	10	2450957	2450966	0 %	20 %	20 %	60 %	340783139
50099	NC_015850	GGT	2	6	2451010	2451015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783139
50100	NC_015850	GTA	2	6	2451091	2451096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783139
50101	NC_015850	GGC	2	6	2451097	2451102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783139
50102	NC_015850	CCGT	2	8	2451105	2451112	0 %	25 %	25 %	50 %	340783139
50103	NC_015850	ACC	2	6	2451149	2451154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783139
50104	NC_015850	TCCT	2	8	2451160	2451167	0 %	50 %	0 %	50 %	340783139
50105	NC_015850	CTG	2	6	2451178	2451183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783139
50106	NC_015850	CGC	2	6	2451284	2451289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783139
50107	NC_015850	CCG	2	6	2451338	2451343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783139
50108	NC_015850	CCA	2	6	2451355	2451360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783139
50109	NC_015850	CAG	2	6	2451388	2451393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783139
50110	NC_015850	GAT	2	6	2451563	2451568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783140
50111	NC_015850	CGC	2	6	2451579	2451584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783140
50112	NC_015850	AAACGG	2	12	2451634	2451645	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	340783140
50113	NC_015850	GCC	2	6	2451685	2451690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783140
50114	NC_015850	TCT	2	6	2451774	2451779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783140
50115	NC_015850	TGC	2	6	2451930	2451935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50116	NC_015850	GC	3	6	2451934	2451939	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50117	NC_015850	CAT	2	6	2451953	2451958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783141
50118	NC_015850	T	6	6	2451997	2452002	0 %	100 %	0 %	0 %	340783141
50119	NC_015850	GAA	2	6	2452047	2452052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783141
50120	NC_015850	CG	3	6	2452299	2452304	0 %	0 %	50 %	50 %	340783141
50121	NC_015850	GCAA	2	8	2452348	2452355	50 %	0 %	25 %	25 %	340783141
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50172	NC_015850	CTTG	2	8	2454775	2454782	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50173	NC_015850	GC	3	6	2454783	2454788	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50174	NC_015850	ACG	2	6	2454792	2454797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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50206	NC_015850	GTCG	2	8	2456556	2456563	0 %	25 %	50 %	25 %	340783148
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50222	NC_015850	GT	3	6	2457049	2457054	0 %	50 %	50 %	0 %	340783148
50223	NC_015850	CTC	3	9	2457072	2457080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783148
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50226	NC_015850	GC	3	6	2457195	2457200	0 %	0 %	50 %	50 %	340783148
50227	NC_015850	CG	3	6	2457220	2457225	0 %	0 %	50 %	50 %	340783148
50228	NC_015850	GCC	2	6	2457226	2457231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783148
50229	NC_015850	CAG	2	6	2457300	2457305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783148
50230	NC_015850	GAA	2	6	2457351	2457356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783148
50231	NC_015850	CT	3	6	2457366	2457371	0 %	50 %	0 %	50 %	340783148
50232	NC_015850	TGA	2	6	2457402	2457407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50233	NC_015850	CCTC	2	8	2457408	2457415	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
50234	NC_015850	CAACG	2	10	2457447	2457456	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
50235	NC_015850	AGT	2	6	2457478	2457483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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50237	NC_015850	CAG	2	6	2457605	2457610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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50349	NC_015850	GAGG	2	8	2463684	2463691	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
50350	NC_015850	GTTC	2	8	2463726	2463733	0 %	50 %	25 %	25 %	340783152
50351	NC_015850	CGG	2	6	2463753	2463758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783152
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50470	NC_015850	CCG	2	6	2469336	2469341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783157
50471	NC_015850	GCC	2	6	2469362	2469367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783157
50472	NC_015850	AGC	2	6	2469371	2469376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783157
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