MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 60723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
49501	NC_015850	GCC	2	6	2425660	2425665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783112
49502	NC_015850	CGT	2	6	2425728	2425733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783112
49503	NC_015850	GCCGAG	2	12	2425789	2425800	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	340783112
49504	NC_015850	GTC	2	6	2425810	2425815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783112
49505	NC_015850	CCAA	2	8	2426032	2426039	50 %	0 %	0 %	50 %	340783112
49506	NC_015850	AACA	2	8	2426071	2426078	75 %	0 %	0 %	25 %	340783112
49507	NC_015850	GGC	2	6	2426100	2426105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783112
49508	NC_015850	T	7	7	2426195	2426201	0 %	100 %	0 %	0 %	340783113
49509	NC_015850	GCC	2	6	2426220	2426225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783113
49510	NC_015850	GTG	2	6	2426318	2426323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783113
49511	NC_015850	TAC	2	6	2426403	2426408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783113
49512	NC_015850	CCTG	2	8	2426446	2426453	0 %	25 %	25 %	50 %	340783113
49513	NC_015850	GGT	2	6	2426490	2426495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783113
49514	NC_015850	CGC	2	6	2426507	2426512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783113
49515	NC_015850	GCG	2	6	2426539	2426544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783113
49516	NC_015850	CTG	3	9	2426553	2426561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783113
49517	NC_015850	CGG	2	6	2426564	2426569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783113
49518	NC_015850	CGG	2	6	2426611	2426616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783113
49519	NC_015850	TGG	2	6	2426620	2426625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783113
49520	NC_015850	CTG	2	6	2426637	2426642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783113
49521	NC_015850	GAC	2	6	2426649	2426654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783113
49522	NC_015850	GCT	2	6	2426724	2426729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783113
49523	NC_015850	TGG	2	6	2426917	2426922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783113
49524	NC_015850	CAG	2	6	2426934	2426939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783113
49525	NC_015850	AAG	2	6	2426991	2426996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783113
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49527	NC_015850	TCG	2	6	2427070	2427075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783113
49528	NC_015850	ATC	2	6	2427090	2427095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783113
49529	NC_015850	TCA	2	6	2427199	2427204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783113
49530	NC_015850	GCA	2	6	2427222	2427227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783113
49531	NC_015850	CAGC	2	8	2427266	2427273	25 %	0 %	25 %	50 %	340783113
49532	NC_015850	GCT	2	6	2427335	2427340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783113
49533	NC_015850	CCT	2	6	2427376	2427381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783113
49534	NC_015850	TTAC	2	8	2427463	2427470	25 %	50 %	0 %	25 %	340783113
49535	NC_015850	CAT	2	6	2427515	2427520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783113
49536	NC_015850	ACA	2	6	2427535	2427540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783113
49537	NC_015850	CTA	2	6	2427557	2427562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783113
49538	NC_015850	CAG	2	6	2427564	2427569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783113
49539	NC_015850	CGA	2	6	2427617	2427622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783113
49540	NC_015850	ATC	2	6	2427631	2427636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783113
49541	NC_015850	GGC	2	6	2427657	2427662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783113
49542	NC_015850	GAA	2	6	2427680	2427685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783113
49543	NC_015850	T	6	6	2427745	2427750	0 %	100 %	0 %	0 %	340783113
49544	NC_015850	CAA	2	6	2427809	2427814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783113
49545	NC_015850	AGT	2	6	2427877	2427882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49546	NC_015850	T	8	8	2427921	2427928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49547	NC_015850	GAT	2	6	2428104	2428109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783114
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49549	NC_015850	CGC	2	6	2428255	2428260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783114
49550	NC_015850	GAG	2	6	2428276	2428281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783114
49551	NC_015850	TCA	2	6	2428388	2428393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783114
49552	NC_015850	TCT	2	6	2428415	2428420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783114
49553	NC_015850	CAT	2	6	2428434	2428439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783114
49554	NC_015850	GCG	2	6	2428473	2428478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783114
49555	NC_015850	GAA	2	6	2428531	2428536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783114
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49566	NC_015850	GC	3	6	2429083	2429088	0 %	0 %	50 %	50 %	340783114
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49583	NC_015850	CGG	2	6	2429865	2429870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783115
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49587	NC_015850	CTG	2	6	2430100	2430105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783116
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49615	NC_015850	GCG	2	6	2431099	2431104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783117
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49630	NC_015850	CA	3	6	2431776	2431781	50 %	0 %	0 %	50 %	340783117
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49691	NC_015850	GCG	2	6	2434439	2434444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783119
49692	NC_015850	GGCT	2	8	2434528	2434535	0 %	25 %	50 %	25 %	340783119
49693	NC_015850	CG	3	6	2434536	2434541	0 %	0 %	50 %	50 %	340783119
49694	NC_015850	GAG	2	6	2434659	2434664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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49700	NC_015850	CCTGTG	2	12	2434939	2434950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783120
49701	NC_015850	GCT	2	6	2434970	2434975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783121
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49712	NC_015850	GATG	2	8	2435532	2435539	25 %	25 %	50 %	0 %	340783121
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49717	NC_015850	GGGC	2	8	2435613	2435620	0 %	0 %	75 %	25 %	340783122
49718	NC_015850	GC	3	6	2435643	2435648	0 %	0 %	50 %	50 %	340783122
49719	NC_015850	TCG	2	6	2435662	2435667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783122
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49721	NC_015850	CTGT	2	8	2435776	2435783	0 %	50 %	25 %	25 %	340783122
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49723	NC_015850	CCT	2	6	2435791	2435796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783122
49724	NC_015850	GAA	2	6	2435919	2435924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783122
49725	NC_015850	CG	3	6	2435948	2435953	0 %	0 %	50 %	50 %	340783122
49726	NC_015850	GTC	2	6	2435973	2435978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783122
49727	NC_015850	CGA	2	6	2435993	2435998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783122
49728	NC_015850	GA	3	6	2436002	2436007	50 %	0 %	50 %	0 %	340783122
49729	NC_015850	GCGCA	2	10	2436013	2436022	20 %	0 %	40 %	40 %	340783122
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49848	NC_015850	TGC	2	6	2440866	2440871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783127
49849	NC_015850	GCT	2	6	2440915	2440920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783127
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49905	NC_015850	TTCCG	2	10	2443032	2443041	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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49917	NC_015850	CGC	2	6	2443475	2443480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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49947	NC_015850	GC	3	6	2444747	2444752	0 %	0 %	50 %	50 %	340783132
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49950	NC_015850	TCCCG	2	10	2444837	2444846	0 %	20 %	20 %	60 %	340783132
49951	NC_015850	GCTG	2	8	2444850	2444857	0 %	25 %	50 %	25 %	340783132
49952	NC_015850	TGC	2	6	2444914	2444919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783132
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49958	NC_015850	GTC	3	9	2445302	2445310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783132
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49961	NC_015850	GTC	2	6	2445393	2445398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783132
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49992	NC_015850	CGCC	2	8	2446557	2446564	0 %	0 %	25 %	75 %	340783133
49993	NC_015850	TCGG	2	8	2446613	2446620	0 %	25 %	50 %	25 %	340783133
49994	NC_015850	TCT	2	6	2446706	2446711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783133
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49997	NC_015850	CGC	2	6	2446854	2446859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783133
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49999	NC_015850	CGAGGC	2	12	2446911	2446922	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	340783133
50000	NC_015850	GTCGA	2	10	2446960	2446969	20 %	20 %	40 %	20 %	340783133

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