MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome linear

Total Repeats: 45192

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015508	CAC	2	6	173032	173037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3502	NC_015508	GCG	2	6	173122	173127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715541
3503	NC_015508	CGC	2	6	173128	173133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715541
3504	NC_015508	CAGC	2	8	173212	173219	25 %	0 %	25 %	50 %	332715541
3505	NC_015508	GC	3	6	173218	173223	0 %	0 %	50 %	50 %	332715541
3506	NC_015508	CGA	2	6	173229	173234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715541
3507	NC_015508	CCA	2	6	173244	173249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715541
3508	NC_015508	CCT	2	6	173259	173264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715541
3509	NC_015508	GCA	2	6	173298	173303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715541
3510	NC_015508	AGA	2	6	173315	173320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715541
3511	NC_015508	CGC	2	6	173328	173333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715541
3512	NC_015508	CCG	2	6	173337	173342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715541
3513	NC_015508	CGC	2	6	173386	173391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715541
3514	NC_015508	GAAG	2	8	173474	173481	50 %	0 %	50 %	0 %	332715541
3515	NC_015508	GGC	2	6	173602	173607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715541
3516	NC_015508	CCG	2	6	173675	173680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715541
3517	NC_015508	CTG	2	6	173830	173835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715541
3518	NC_015508	GCG	2	6	173861	173866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715541
3519	NC_015508	CTT	2	6	173874	173879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715541
3520	NC_015508	TGG	2	6	173924	173929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715541
3521	NC_015508	TGC	2	6	174005	174010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715541
3522	NC_015508	GCC	2	6	174181	174186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715541
3523	NC_015508	GTC	2	6	174244	174249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715541
3524	NC_015508	CCG	2	6	174266	174271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715541
3525	NC_015508	CA	3	6	174277	174282	50 %	0 %	0 %	50 %	332715541
3526	NC_015508	ATG	2	6	174287	174292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715541
3527	NC_015508	GC	3	6	174309	174314	0 %	0 %	50 %	50 %	332715541
3528	NC_015508	CGG	2	6	174317	174322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715541
3529	NC_015508	GCTG	2	8	174405	174412	0 %	25 %	50 %	25 %	332715541
3530	NC_015508	GCAC	2	8	174450	174457	25 %	0 %	25 %	50 %	332715541
3531	NC_015508	T	6	6	174475	174480	0 %	100 %	0 %	0 %	332715541
3532	NC_015508	CAA	2	6	174645	174650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_015508	GCTG	2	8	174657	174664	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3534	NC_015508	TGC	2	6	174739	174744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715542
3535	NC_015508	GATC	2	8	174752	174759	25 %	25 %	25 %	25 %	332715542
3536	NC_015508	GCC	2	6	174796	174801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715542
3537	NC_015508	CA	3	6	174810	174815	50 %	0 %	0 %	50 %	332715542
3538	NC_015508	CAG	2	6	174824	174829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715542
3539	NC_015508	GCA	2	6	174844	174849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715542
3540	NC_015508	GACG	2	8	174867	174874	25 %	0 %	50 %	25 %	332715542
3541	NC_015508	GACA	2	8	174883	174890	50 %	0 %	25 %	25 %	332715542
3542	NC_015508	TGC	2	6	174901	174906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715542
3543	NC_015508	GTG	2	6	174957	174962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715542
3544	NC_015508	CCT	2	6	174977	174982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715542
3545	NC_015508	ATC	2	6	175000	175005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715542
3546	NC_015508	CTGG	2	8	175010	175017	0 %	25 %	50 %	25 %	332715542
3547	NC_015508	TTC	2	6	175038	175043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715542
3548	NC_015508	GAG	2	6	175062	175067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332715542
3549	NC_015508	ATC	2	6	175138	175143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715542
3550	NC_015508	TTG	2	6	175151	175156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332715542
3551	NC_015508	CCG	2	6	175198	175203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715542
3552	NC_015508	GCG	2	6	175215	175220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715542
3553	NC_015508	GAC	2	6	175233	175238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715542
3554	NC_015508	CCT	2	6	175255	175260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715542
3555	NC_015508	GCA	2	6	175283	175288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715542
3556	NC_015508	TA	3	6	175299	175304	50 %	50 %	0 %	0 %	332715542
3557	NC_015508	GCC	2	6	175344	175349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715542
3558	NC_015508	CAC	2	6	175460	175465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715542
3559	NC_015508	AGG	2	6	175486	175491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332715542
3560	NC_015508	CAC	2	6	175577	175582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715542
3561	NC_015508	CAG	2	6	175602	175607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715542
3562	NC_015508	A	6	6	175618	175623	100 %	0 %	0 %	0 %	332715542
3563	NC_015508	AAC	2	6	175696	175701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332715543
3564	NC_015508	ATC	2	6	175738	175743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715543
3565	NC_015508	ATC	2	6	175792	175797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715543
3566	NC_015508	TCA	2	6	175820	175825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715543
3567	NC_015508	TTC	2	6	175868	175873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715543
3568	NC_015508	ATC	2	6	175915	175920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715543
3569	NC_015508	CTC	2	6	175927	175932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715543
3570	NC_015508	CTC	2	6	176035	176040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715543
3571	NC_015508	CGTT	2	8	176086	176093	0 %	50 %	25 %	25 %	332715543
3572	NC_015508	GC	3	6	176109	176114	0 %	0 %	50 %	50 %	332715543
3573	NC_015508	CCG	2	6	176176	176181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715544
3574	NC_015508	ATG	2	6	176240	176245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715544
3575	NC_015508	AAC	2	6	176257	176262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332715544
3576	NC_015508	GCGAT	2	10	176357	176366	20 %	20 %	40 %	20 %	332715544
3577	NC_015508	AGC	2	6	176417	176422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715544
3578	NC_015508	CGG	2	6	176472	176477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715544
3579	NC_015508	CAT	2	6	176509	176514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715544
3580	NC_015508	GTG	2	6	176519	176524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715544
3581	NC_015508	GC	3	6	176562	176567	0 %	0 %	50 %	50 %	332715544
3582	NC_015508	ACG	2	6	176573	176578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715544
3583	NC_015508	GAC	2	6	176587	176592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715544
3584	NC_015508	CGC	2	6	176616	176621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715544
3585	NC_015508	CAA	2	6	176646	176651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332715544
3586	NC_015508	CGA	2	6	176784	176789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715544
3587	NC_015508	GCA	2	6	176815	176820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715544
3588	NC_015508	CG	3	6	176853	176858	0 %	0 %	50 %	50 %	332715544
3589	NC_015508	C	6	6	176865	176870	0 %	0 %	0 %	100 %	332715544
3590	NC_015508	ATC	2	6	176909	176914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715544
3591	NC_015508	AGC	2	6	177008	177013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715544
3592	NC_015508	CG	3	6	177025	177030	0 %	0 %	50 %	50 %	332715544
3593	NC_015508	CG	3	6	177042	177047	0 %	0 %	50 %	50 %	332715544
3594	NC_015508	TGG	2	6	177142	177147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715545
3595	NC_015508	GCA	2	6	177149	177154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715545
3596	NC_015508	GTATGC	2	12	177163	177174	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	332715545
3597	NC_015508	GCC	2	6	177190	177195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715545
3598	NC_015508	CAT	2	6	177260	177265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715545
3599	NC_015508	GC	3	6	177270	177275	0 %	0 %	50 %	50 %	332715545
3600	NC_015508	CT	3	6	177290	177295	0 %	50 %	0 %	50 %	332715545
3601	NC_015508	GCA	2	6	177319	177324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715545
3602	NC_015508	GAT	2	6	177353	177358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715545
3603	NC_015508	GCC	2	6	177431	177436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715545
3604	NC_015508	CGT	2	6	177444	177449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715545
3605	NC_015508	GCC	2	6	177498	177503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715545
3606	NC_015508	TTC	2	6	177504	177509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715545
3607	NC_015508	GA	3	6	177598	177603	50 %	0 %	50 %	0 %	332715545
3608	NC_015508	CGC	2	6	177605	177610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715545
3609	NC_015508	GACCC	2	10	177664	177673	20 %	0 %	20 %	60 %	332715545
3610	NC_015508	CCG	3	9	177682	177690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715545
3611	NC_015508	CG	4	8	177701	177708	0 %	0 %	50 %	50 %	332715545
3612	NC_015508	CGAG	2	8	177728	177735	25 %	0 %	50 %	25 %	332715545
3613	NC_015508	TG	3	6	177956	177961	0 %	50 %	50 %	0 %	332715545
3614	NC_015508	CTC	2	6	178056	178061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715545
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3616	NC_015508	CGG	2	6	178187	178192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715545
3617	NC_015508	ACTGA	2	10	178223	178232	40 %	20 %	20 %	20 %	332715545
3618	NC_015508	GCC	2	6	178282	178287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715545
3619	NC_015508	AG	3	6	178307	178312	50 %	0 %	50 %	0 %	332715545
3620	NC_015508	GGCT	2	8	178338	178345	0 %	25 %	50 %	25 %	332715545
3621	NC_015508	GC	3	6	178410	178415	0 %	0 %	50 %	50 %	332715545
3622	NC_015508	CTGCG	2	10	178446	178455	0 %	20 %	40 %	40 %	332715545
3623	NC_015508	TCG	2	6	178459	178464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715545
3624	NC_015508	GCC	2	6	178483	178488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715545
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3626	NC_015508	GA	3	6	178606	178611	50 %	0 %	50 %	0 %	332715545
3627	NC_015508	CAGC	2	8	178613	178620	25 %	0 %	25 %	50 %	332715545
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3643	NC_015508	GAT	2	6	179193	179198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715545
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3654	NC_015508	CT	3	6	179635	179640	0 %	50 %	0 %	50 %	332715546
3655	NC_015508	GCC	2	6	179643	179648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715546
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3682	NC_015508	CCGT	2	8	180742	180749	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3683	NC_015508	ATA	2	6	180788	180793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3684	NC_015508	AG	3	6	180842	180847	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3685	NC_015508	GC	4	8	180912	180919	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3686	NC_015508	CGC	2	6	181046	181051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715547
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3688	NC_015508	GCC	2	6	181203	181208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715547
3689	NC_015508	GGCT	2	8	181251	181258	0 %	25 %	50 %	25 %	332715547
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3692	NC_015508	TCG	2	6	181345	181350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715547
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3725	NC_015508	GAC	2	6	182655	182660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715548
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3731	NC_015508	CGA	2	6	182867	182872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715548
3732	NC_015508	CG	3	6	182886	182891	0 %	0 %	50 %	50 %	332715548
3733	NC_015508	ACCA	2	8	182949	182956	50 %	0 %	0 %	50 %	332715548
3734	NC_015508	GTC	2	6	182968	182973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715548
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3740	NC_015508	TGTCG	2	10	183153	183162	0 %	40 %	40 %	20 %	332715548
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3744	NC_015508	GCA	2	6	183360	183365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715549
3745	NC_015508	TTC	2	6	183420	183425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715549
3746	NC_015508	CTT	2	6	183467	183472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715549
3747	NC_015508	TGA	2	6	183553	183558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715549
3748	NC_015508	CCGA	2	8	183561	183568	25 %	0 %	25 %	50 %	332715549
3749	NC_015508	CCAG	2	8	183598	183605	25 %	0 %	25 %	50 %	332715549
3750	NC_015508	TGGC	2	8	183608	183615	0 %	25 %	50 %	25 %	332715549
3751	NC_015508	CAT	2	6	183632	183637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715549
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3800	NC_015508	CTG	2	6	186357	186362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715551
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3822	NC_015508	GCG	2	6	187461	187466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715552
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3845	NC_015508	A	6	6	188963	188968	100 %	0 %	0 %	0 %	332715553
3846	NC_015508	ATCAGG	2	12	188991	189002	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	332715553
3847	NC_015508	CAGC	2	8	189100	189107	25 %	0 %	25 %	50 %	332715554
3848	NC_015508	CGC	4	12	189142	189153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715554
3849	NC_015508	CCA	2	6	189167	189172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715554
3850	NC_015508	CGC	2	6	189235	189240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715554
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3852	NC_015508	GA	3	6	189329	189334	50 %	0 %	50 %	0 %	332715554
3853	NC_015508	TCT	2	6	189348	189353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715554
3854	NC_015508	GCG	2	6	189366	189371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715554
3855	NC_015508	GAC	2	6	189385	189390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715554
3856	NC_015508	TCT	2	6	189495	189500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715554
3857	NC_015508	TCA	2	6	189657	189662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715554
3858	NC_015508	GCC	2	6	189668	189673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715554
3859	NC_015508	GGC	2	6	189676	189681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715554
3860	NC_015508	GTC	2	6	189688	189693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715554
3861	NC_015508	GGGC	2	8	189708	189715	0 %	0 %	75 %	25 %	332715554
3862	NC_015508	TGG	2	6	189840	189845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715554
3863	NC_015508	CAT	2	6	189897	189902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715554
3864	NC_015508	CGG	2	6	189903	189908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715554
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3986	NC_015508	CGTTGC	2	12	195839	195850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715562
3987	NC_015508	CCG	2	6	195851	195856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715562
3988	NC_015508	CGA	2	6	195903	195908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715562
3989	NC_015508	TCA	2	6	195926	195931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715562
3990	NC_015508	CG	3	6	195947	195952	0 %	0 %	50 %	50 %	332715562
3991	NC_015508	GCCG	2	8	195972	195979	0 %	0 %	50 %	50 %	332715562
3992	NC_015508	CG	3	6	196059	196064	0 %	0 %	50 %	50 %	332715562
3993	NC_015508	GA	3	6	196116	196121	50 %	0 %	50 %	0 %	332715562
3994	NC_015508	TGC	2	6	196134	196139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715562
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3997	NC_015508	CG	3	6	196194	196199	0 %	0 %	50 %	50 %	332715562
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3999	NC_015508	GC	3	6	196334	196339	0 %	0 %	50 %	50 %	332715563
4000	NC_015508	GC	3	6	196343	196348	0 %	0 %	50 %	50 %	332715563

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