MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome linear

Total Repeats: 45192

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
35501	NC_015508	GAA	2	6	1690746	1690751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35502	NC_015508	TGG	2	6	1690768	1690773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35503	NC_015508	GAA	2	6	1690794	1690799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35504	NC_015508	AAG	2	6	1690969	1690974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35505	NC_015508	AGT	2	6	1691037	1691042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35506	NC_015508	GCGA	2	8	1691044	1691051	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35507	NC_015508	ATG	2	6	1691073	1691078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35508	NC_015508	CGA	2	6	1691271	1691276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35509	NC_015508	AGTT	2	8	1691437	1691444	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35510	NC_015508	GAG	2	6	1691705	1691710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35511	NC_015508	AC	3	6	1691724	1691729	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35512	NC_015508	CGTC	2	8	1691742	1691749	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35513	NC_015508	CAA	2	6	1691760	1691765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35514	NC_015508	AAC	2	6	1691828	1691833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35515	NC_015508	AGC	2	6	1691851	1691856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35516	NC_015508	CAT	2	6	1691857	1691862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35517	NC_015508	AAAG	2	8	1691865	1691872	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35518	NC_015508	GCT	2	6	1692022	1692027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35519	NC_015508	GA	3	6	1692076	1692081	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35520	NC_015508	TGG	2	6	1692199	1692204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35521	NC_015508	GT	3	6	1692219	1692224	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35522	NC_015508	GCG	2	6	1692250	1692255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35523	NC_015508	GGT	2	6	1692309	1692314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35524	NC_015508	GA	3	6	1692339	1692344	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35525	NC_015508	GAA	2	6	1692386	1692391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35526	NC_015508	ATG	2	6	1692415	1692420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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35528	NC_015508	AGGG	2	8	1692528	1692535	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
35529	NC_015508	CTGAA	2	10	1692545	1692554	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
35530	NC_015508	CGG	2	6	1692566	1692571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35531	NC_015508	GGT	2	6	1692784	1692789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35532	NC_015508	ACC	2	6	1692837	1692842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35533	NC_015508	ATCCGG	2	12	1692876	1692887	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35534	NC_015508	TGG	2	6	1692897	1692902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35535	NC_015508	GC	3	6	1692944	1692949	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35536	NC_015508	TGG	2	6	1692952	1692957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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35538	NC_015508	GGT	2	6	1693060	1693065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35539	NC_015508	TGA	2	6	1693121	1693126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35540	NC_015508	GTT	2	6	1693151	1693156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35541	NC_015508	CGT	2	6	1693255	1693260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35542	NC_015508	TGG	2	6	1693348	1693353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35543	NC_015508	TGT	2	6	1693357	1693362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35544	NC_015508	TA	3	6	1693388	1693393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35545	NC_015508	AACC	2	8	1693429	1693436	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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35548	NC_015508	CTT	2	6	1693544	1693549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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35550	NC_015508	CAT	2	6	1693582	1693587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35551	NC_015508	CGA	2	6	1693667	1693672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35552	NC_015508	TTAAA	2	10	1693721	1693730	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35553	NC_015508	ACA	2	6	1693759	1693764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35554	NC_015508	TGG	2	6	1693804	1693809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35555	NC_015508	GGC	2	6	1693819	1693824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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35557	NC_015508	TCT	2	6	1693936	1693941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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35559	NC_015508	CAA	3	9	1694267	1694275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35560	NC_015508	GTT	2	6	1694467	1694472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35561	NC_015508	GCAG	2	8	1694494	1694501	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35562	NC_015508	TCTA	2	8	1694508	1694515	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35563	NC_015508	ATC	2	6	1694583	1694588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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35567	NC_015508	GCTC	2	8	1694748	1694755	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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35595	NC_015508	TCCGGA	2	12	1695977	1695988	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	332716899
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35618	NC_015508	TTC	2	6	1697209	1697214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35619	NC_015508	TCC	2	6	1697332	1697337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332716900
35620	NC_015508	GA	3	6	1697412	1697417	50 %	0 %	50 %	0 %	332716900
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35858	NC_015508	CGGTC	2	10	1709236	1709245	0 %	20 %	40 %	40 %	332716909
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35862	NC_015508	TG	3	6	1709364	1709369	0 %	50 %	50 %	0 %	332716909
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35877	NC_015508	GGTC	2	8	1710175	1710182	0 %	25 %	50 %	25 %	332716909
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35935	NC_015508	ATCGC	2	10	1712929	1712938	20 %	20 %	20 %	40 %	332716911
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35937	NC_015508	CTGT	2	8	1713005	1713012	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
35938	NC_015508	CTG	2	6	1713041	1713046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35939	NC_015508	TTTTGA	2	12	1713063	1713074	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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35942	NC_015508	GCG	2	6	1713118	1713123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716912
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35952	NC_015508	TGGCC	2	10	1713593	1713602	0 %	20 %	40 %	40 %	332716912
35953	NC_015508	GCC	3	9	1713612	1713620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716912
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35957	NC_015508	C	6	6	1713969	1713974	0 %	0 %	0 %	100 %	332716912
35958	NC_015508	CGG	2	6	1714028	1714033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716912
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35961	NC_015508	TGC	2	6	1714116	1714121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716912
35962	NC_015508	TCGG	2	8	1714132	1714139	0 %	25 %	50 %	25 %	332716912
35963	NC_015508	GCA	2	6	1714237	1714242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716912
35964	NC_015508	CAGAA	2	10	1714323	1714332	60 %	0 %	20 %	20 %	332716912
35965	NC_015508	GC	3	6	1714375	1714380	0 %	0 %	50 %	50 %	332716912
35966	NC_015508	ATG	2	6	1714381	1714386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332716912
35967	NC_015508	CCGAT	2	10	1714403	1714412	20 %	20 %	20 %	40 %	332716912
35968	NC_015508	GGC	2	6	1714431	1714436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716912
35969	NC_015508	GTCG	2	8	1714489	1714496	0 %	25 %	50 %	25 %	332716912
35970	NC_015508	CGT	2	6	1714542	1714547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716912
35971	NC_015508	CCAG	2	8	1714607	1714614	25 %	0 %	25 %	50 %	332716912
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35973	NC_015508	CGC	2	6	1714676	1714681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716912
35974	NC_015508	GC	4	8	1714743	1714750	0 %	0 %	50 %	50 %	332716912
35975	NC_015508	GTC	2	6	1714785	1714790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35976	NC_015508	CCG	2	6	1714800	1714805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35977	NC_015508	CAGG	2	8	1714862	1714869	25 %	0 %	50 %	25 %	332716913
35978	NC_015508	CCA	2	6	1714871	1714876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332716913
35979	NC_015508	CCAGCC	2	12	1714896	1714907	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	332716913
35980	NC_015508	CGG	2	6	1714911	1714916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716913
35981	NC_015508	GAT	2	6	1714929	1714934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332716913
35982	NC_015508	GTG	2	6	1714945	1714950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332716913
35983	NC_015508	GGC	2	6	1714970	1714975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716913
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35989	NC_015508	GCT	2	6	1715246	1715251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716914
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35991	NC_015508	ATC	2	6	1715285	1715290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332716914
35992	NC_015508	GGC	2	6	1715291	1715296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716914
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35994	NC_015508	TCG	2	6	1715489	1715494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716914
35995	NC_015508	ACA	2	6	1715582	1715587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35996	NC_015508	CAG	2	6	1715627	1715632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716915
35997	NC_015508	GC	3	6	1715663	1715668	0 %	0 %	50 %	50 %	332716915
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35999	NC_015508	CGG	2	6	1715790	1715795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716915
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