MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome linear

Total Repeats: 45192

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28003	NC_015508	ACA	2	6	1343070	1343075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332716585
28004	NC_015508	GCC	2	6	1343111	1343116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716585
28005	NC_015508	TGGC	2	8	1343128	1343135	0 %	25 %	50 %	25 %	332716585
28006	NC_015508	GGC	2	6	1343147	1343152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716585
28007	NC_015508	GCA	3	9	1343166	1343174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716585
28008	NC_015508	CGCCAT	2	12	1343185	1343196	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	332716585
28009	NC_015508	GGC	2	6	1343204	1343209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716585
28010	NC_015508	TGC	2	6	1343212	1343217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716585
28011	NC_015508	CAC	2	6	1343254	1343259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332716585
28012	NC_015508	CGG	2	6	1343268	1343273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716585
28013	NC_015508	GCG	2	6	1343318	1343323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716585
28014	NC_015508	TCT	2	6	1343331	1343336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332716585
28015	NC_015508	GC	3	6	1343383	1343388	0 %	0 %	50 %	50 %	332716585
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28017	NC_015508	CTTG	2	8	1343431	1343438	0 %	50 %	25 %	25 %	332716585
28018	NC_015508	TGCCG	2	10	1343485	1343494	0 %	20 %	40 %	40 %	332716585
28019	NC_015508	CTG	2	6	1343501	1343506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716585
28020	NC_015508	AAC	2	6	1343507	1343512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332716585
28021	NC_015508	GC	3	6	1343520	1343525	0 %	0 %	50 %	50 %	332716585
28022	NC_015508	CGGA	2	8	1343562	1343569	25 %	0 %	50 %	25 %	332716585
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28026	NC_015508	TGC	2	6	1343826	1343831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716585
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28032	NC_015508	GC	4	8	1344214	1344221	0 %	0 %	50 %	50 %	332716586
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28044	NC_015508	CGATG	2	10	1344827	1344836	20 %	20 %	40 %	20 %	332716586
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28049	NC_015508	TTA	2	6	1345052	1345057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28050	NC_015508	ACG	2	6	1345101	1345106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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28053	NC_015508	GGC	2	6	1345246	1345251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716587
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28077	NC_015508	GCT	2	6	1346307	1346312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716587
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28083	NC_015508	CGGT	2	8	1346789	1346796	0 %	25 %	50 %	25 %	332716588
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28089	NC_015508	TCAG	2	8	1347044	1347051	25 %	25 %	25 %	25 %	332716588
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28112	NC_015508	GC	3	6	1347861	1347866	0 %	0 %	50 %	50 %	332716588
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28116	NC_015508	CGA	2	6	1348001	1348006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716588
28117	NC_015508	TTTCG	2	10	1348074	1348083	0 %	60 %	20 %	20 %	332716588
28118	NC_015508	GCC	2	6	1348102	1348107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716588
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28121	NC_015508	GACG	2	8	1348227	1348234	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28122	NC_015508	TGC	2	6	1348394	1348399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716589
28123	NC_015508	CGA	2	6	1348400	1348405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716589
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28213	NC_015508	CTG	2	6	1352704	1352709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716591
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28216	NC_015508	A	6	6	1352858	1352863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28217	NC_015508	GC	3	6	1352890	1352895	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28218	NC_015508	ACCAG	2	10	1352914	1352923	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
28219	NC_015508	ATA	2	6	1352927	1352932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28220	NC_015508	AAAT	2	8	1352993	1353000	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28221	NC_015508	ACAA	2	8	1353023	1353030	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
28222	NC_015508	AT	3	6	1353068	1353073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28223	NC_015508	CAT	2	6	1353104	1353109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28224	NC_015508	GGTC	2	8	1353183	1353190	0 %	25 %	50 %	25 %	332716592
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28226	NC_015508	CCGG	2	8	1353243	1353250	0 %	0 %	50 %	50 %	332716592
28227	NC_015508	CCG	2	6	1353282	1353287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716592
28228	NC_015508	GACC	2	8	1353306	1353313	25 %	0 %	25 %	50 %	332716592
28229	NC_015508	GC	3	6	1353342	1353347	0 %	0 %	50 %	50 %	332716592
28230	NC_015508	GCTG	2	8	1353414	1353421	0 %	25 %	50 %	25 %	332716592
28231	NC_015508	CCG	3	9	1353428	1353436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716592
28232	NC_015508	GGC	2	6	1353489	1353494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716592
28233	NC_015508	AC	4	8	1353505	1353512	50 %	0 %	0 %	50 %	332716592
28234	NC_015508	GCCAT	2	10	1353544	1353553	20 %	20 %	20 %	40 %	332716592
28235	NC_015508	ACCC	2	8	1353570	1353577	25 %	0 %	0 %	75 %	332716592
28236	NC_015508	GAA	2	6	1353619	1353624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332716592
28237	NC_015508	TCG	2	6	1353629	1353634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716592
28238	NC_015508	TGA	2	6	1353807	1353812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332716592
28239	NC_015508	GAT	2	6	1353856	1353861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332716592
28240	NC_015508	TGA	2	6	1353879	1353884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332716592
28241	NC_015508	GAC	2	6	1353907	1353912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716592
28242	NC_015508	CCG	2	6	1353923	1353928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716592
28243	NC_015508	CGA	2	6	1353987	1353992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716592
28244	NC_015508	CCG	2	6	1353996	1354001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716592
28245	NC_015508	A	6	6	1354018	1354023	100 %	0 %	0 %	0 %	332716592
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28251	NC_015508	CGG	2	6	1354317	1354322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716592
28252	NC_015508	GCT	2	6	1354356	1354361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716592
28253	NC_015508	CAG	2	6	1354372	1354377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716592
28254	NC_015508	GACG	2	8	1354432	1354439	25 %	0 %	50 %	25 %	332716592
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28256	NC_015508	GCCG	3	12	1354560	1354571	0 %	0 %	50 %	50 %	332716592
28257	NC_015508	AT	3	6	1354620	1354625	50 %	50 %	0 %	0 %	332716592
28258	NC_015508	CTT	2	6	1354660	1354665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332716593
28259	NC_015508	GATG	2	8	1354681	1354688	25 %	25 %	50 %	0 %	332716593
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28262	NC_015508	C	6	6	1354820	1354825	0 %	0 %	0 %	100 %	332716593
28263	NC_015508	TGG	2	6	1354888	1354893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332716593
28264	NC_015508	TGA	2	6	1354903	1354908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332716593
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28267	NC_015508	GC	3	6	1355052	1355057	0 %	0 %	50 %	50 %	332716593
28268	NC_015508	ACG	3	9	1355124	1355132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716593
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28289	NC_015508	CGG	2	6	1355743	1355748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716594
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28302	NC_015508	TG	3	6	1356434	1356439	0 %	50 %	50 %	0 %	332716594
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28306	NC_015508	GCTG	2	8	1356645	1356652	0 %	25 %	50 %	25 %	332716594
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28315	NC_015508	AAC	2	6	1357224	1357229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28316	NC_015508	TGT	2	6	1357241	1357246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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28319	NC_015508	TGA	2	6	1357367	1357372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332716595
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28322	NC_015508	CG	3	6	1357555	1357560	0 %	0 %	50 %	50 %	332716595
28323	NC_015508	TCT	2	6	1357562	1357567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332716595
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28337	NC_015508	CGA	2	6	1358111	1358116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716595
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28342	NC_015508	ACG	2	6	1358376	1358381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716596
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28344	NC_015508	GCC	2	6	1358442	1358447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716596
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28347	NC_015508	CG	3	6	1358500	1358505	0 %	0 %	50 %	50 %	332716596
28348	NC_015508	GATC	2	8	1358512	1358519	25 %	25 %	25 %	25 %	332716596
28349	NC_015508	CCA	2	6	1358581	1358586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332716596
28350	NC_015508	GCA	2	6	1358614	1358619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716596
28351	NC_015508	TAA	2	6	1358625	1358630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332716596
28352	NC_015508	TCA	2	6	1358722	1358727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332716596
28353	NC_015508	GCG	2	6	1358761	1358766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716596
28354	NC_015508	ATGA	2	8	1358768	1358775	50 %	25 %	25 %	0 %	332716596
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28362	NC_015508	GCG	2	6	1359068	1359073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716596
28363	NC_015508	CCA	2	6	1359094	1359099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332716596
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28417	NC_015508	CTG	2	6	1361416	1361421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716598
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28426	NC_015508	GCG	2	6	1361966	1361971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716599
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28446	NC_015508	GC	3	6	1363255	1363260	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28447	NC_015508	TCA	2	6	1363273	1363278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28448	NC_015508	TCCATG	2	12	1363287	1363298	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28449	NC_015508	TCC	2	6	1363319	1363324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28450	NC_015508	TGG	2	6	1363497	1363502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28451	NC_015508	GGC	2	6	1363577	1363582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28452	NC_015508	T	7	7	1363618	1363624	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28453	NC_015508	T	6	6	1363639	1363644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28454	NC_015508	TTG	2	6	1363669	1363674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332716601
28455	NC_015508	CCA	2	6	1363682	1363687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332716601
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28457	NC_015508	CG	3	6	1363812	1363817	0 %	0 %	50 %	50 %	332716601
28458	NC_015508	CCAT	2	8	1363834	1363841	25 %	25 %	0 %	50 %	332716601
28459	NC_015508	GAAG	2	8	1363920	1363927	50 %	0 %	50 %	0 %	332716601
28460	NC_015508	GCG	2	6	1363968	1363973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716601
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28462	NC_015508	TCA	2	6	1364012	1364017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332716601
28463	NC_015508	CGC	2	6	1364379	1364384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716602
28464	NC_015508	GCT	2	6	1364406	1364411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716602
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28466	NC_015508	CGG	2	6	1364529	1364534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716602
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