MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome linear

Total Repeats: 45192

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
27501	NC_015508	CAA	2	6	1319558	1319563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332716565
27502	NC_015508	TGAA	2	8	1319597	1319604	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27503	NC_015508	T	7	7	1319647	1319653	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27504	NC_015508	GCC	2	6	1319684	1319689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716566
27505	NC_015508	AGCG	2	8	1319717	1319724	25 %	0 %	50 %	25 %	332716566
27506	NC_015508	TCC	2	6	1319740	1319745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332716566
27507	NC_015508	GCG	2	6	1319753	1319758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716566
27508	NC_015508	A	6	6	1319769	1319774	100 %	0 %	0 %	0 %	332716566
27509	NC_015508	GCT	2	6	1319804	1319809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716566
27510	NC_015508	ACC	2	6	1319824	1319829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332716566
27511	NC_015508	CGT	2	6	1319895	1319900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716566
27512	NC_015508	TGA	2	6	1319906	1319911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332716566
27513	NC_015508	CGC	2	6	1319930	1319935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716566
27514	NC_015508	TTG	2	6	1319941	1319946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332716566
27515	NC_015508	CTC	2	6	1320045	1320050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332716566
27516	NC_015508	GAA	2	6	1320060	1320065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332716566
27517	NC_015508	GTG	2	6	1320109	1320114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332716566
27518	NC_015508	CTT	2	6	1320207	1320212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332716566
27519	NC_015508	GCAC	2	8	1320220	1320227	25 %	0 %	25 %	50 %	332716566
27520	NC_015508	ATT	2	6	1320252	1320257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332716566
27521	NC_015508	TCC	2	6	1320337	1320342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332716566
27522	NC_015508	CTT	2	6	1320360	1320365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27523	NC_015508	GCA	2	6	1320406	1320411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27524	NC_015508	GA	3	6	1320454	1320459	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27525	NC_015508	TAG	2	6	1320516	1320521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27526	NC_015508	CGC	2	6	1320554	1320559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27527	NC_015508	CAT	2	6	1320667	1320672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332716567
27528	NC_015508	CGT	2	6	1320701	1320706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716567
27529	NC_015508	GCC	2	6	1320743	1320748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716567
27530	NC_015508	TTG	2	6	1320780	1320785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332716567
27531	NC_015508	TCT	2	6	1320856	1320861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332716567
27532	NC_015508	CTG	2	6	1320869	1320874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716567
27533	NC_015508	CTT	2	6	1320896	1320901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332716567
27534	NC_015508	TTC	2	6	1320911	1320916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332716567
27535	NC_015508	GTC	2	6	1320926	1320931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716567
27536	NC_015508	CAG	2	6	1320977	1320982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716567
27537	NC_015508	CTC	2	6	1321022	1321027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27538	NC_015508	ACA	2	6	1321045	1321050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27539	NC_015508	GAGC	2	8	1321094	1321101	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27540	NC_015508	GCC	2	6	1321215	1321220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27541	NC_015508	GCA	2	6	1321257	1321262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27542	NC_015508	GAAT	2	8	1321277	1321284	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27543	NC_015508	TTGCG	2	10	1321429	1321438	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
27544	NC_015508	CTC	2	6	1321441	1321446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27545	NC_015508	ATT	2	6	1321498	1321503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27546	NC_015508	CAC	2	6	1321568	1321573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27547	NC_015508	GTT	2	6	1321617	1321622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332716568
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27549	NC_015508	CGATC	2	10	1321644	1321653	20 %	20 %	20 %	40 %	332716568
27550	NC_015508	AGCG	2	8	1321721	1321728	25 %	0 %	50 %	25 %	332716568
27551	NC_015508	CTG	2	6	1321792	1321797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716568
27552	NC_015508	CGG	2	6	1321890	1321895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716568
27553	NC_015508	GAT	2	6	1321923	1321928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332716568
27554	NC_015508	CTG	2	6	1321993	1321998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716568
27555	NC_015508	GGC	2	6	1322038	1322043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716568
27556	NC_015508	GCGG	2	8	1322050	1322057	0 %	0 %	75 %	25 %	332716568
27557	NC_015508	CGGG	2	8	1322084	1322091	0 %	0 %	75 %	25 %	332716568
27558	NC_015508	GAA	2	6	1322176	1322181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332716568
27559	NC_015508	TGA	2	6	1322187	1322192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332716568
27560	NC_015508	CCA	2	6	1322304	1322309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332716568
27561	NC_015508	T	6	6	1322328	1322333	0 %	100 %	0 %	0 %	332716568
27562	NC_015508	ATG	2	6	1322378	1322383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332716568
27563	NC_015508	TTG	2	6	1322384	1322389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332716568
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27568	NC_015508	CG	3	6	1322606	1322611	0 %	0 %	50 %	50 %	332716569
27569	NC_015508	CATGAC	2	12	1322664	1322675	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	332716569
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27572	NC_015508	AAG	2	6	1322757	1322762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332716569
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27574	NC_015508	GACA	2	8	1322781	1322788	50 %	0 %	25 %	25 %	332716569
27575	NC_015508	GAT	2	6	1322817	1322822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332716569
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27577	NC_015508	CG	3	6	1322844	1322849	0 %	0 %	50 %	50 %	332716569
27578	NC_015508	GCA	2	6	1322933	1322938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716569
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27580	NC_015508	GGAT	2	8	1322983	1322990	25 %	25 %	50 %	0 %	332716569
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27582	NC_015508	GC	3	6	1323174	1323179	0 %	0 %	50 %	50 %	332716569
27583	NC_015508	CGA	2	6	1323209	1323214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716569
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27585	NC_015508	GCG	2	6	1323355	1323360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716569
27586	NC_015508	TGA	2	6	1323362	1323367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332716569
27587	NC_015508	TGCC	2	8	1323416	1323423	0 %	25 %	25 %	50 %	332716569
27588	NC_015508	CCA	2	6	1323425	1323430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332716569
27589	NC_015508	ACG	2	6	1323475	1323480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716569
27590	NC_015508	TGA	3	9	1323494	1323502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332716569
27591	NC_015508	TCG	2	6	1323589	1323594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716569
27592	NC_015508	ATC	2	6	1323634	1323639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332716569
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27596	NC_015508	CG	4	8	1323713	1323720	0 %	0 %	50 %	50 %	332716569
27597	NC_015508	GCC	2	6	1323725	1323730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716569
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27599	NC_015508	GGT	2	6	1323768	1323773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332716569
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27602	NC_015508	GGC	2	6	1323943	1323948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716569
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27606	NC_015508	CAG	2	6	1324198	1324203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716570
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27609	NC_015508	CCA	2	6	1324255	1324260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332716570
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27613	NC_015508	GC	3	6	1324347	1324352	0 %	0 %	50 %	50 %	332716570
27614	NC_015508	GAC	2	6	1324411	1324416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716570
27615	NC_015508	CG	3	6	1324464	1324469	0 %	0 %	50 %	50 %	332716570
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27617	NC_015508	ATG	2	6	1324652	1324657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332716570
27618	NC_015508	GGA	2	6	1324675	1324680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332716570
27619	NC_015508	CGG	2	6	1324716	1324721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716570
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27629	NC_015508	GCA	2	6	1324983	1324988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716570
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27701	NC_015508	TCA	2	6	1327854	1327859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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27719	NC_015508	CG	4	8	1328818	1328825	0 %	0 %	50 %	50 %	332716574
27720	NC_015508	GAC	2	6	1328850	1328855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716574
27721	NC_015508	CGGGC	2	10	1328891	1328900	0 %	0 %	60 %	40 %	332716574
27722	NC_015508	CCTG	2	8	1328902	1328909	0 %	25 %	25 %	50 %	332716574
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27727	NC_015508	CG	3	6	1329134	1329139	0 %	0 %	50 %	50 %	332716575
27728	NC_015508	GCG	2	6	1329206	1329211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716575
27729	NC_015508	CATCGA	2	12	1329226	1329237	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	332716575
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