MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome linear

Total Repeats: 45192

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27011	NC_015508	TGACCG	2	12	1295798	1295809	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	332716538
27012	NC_015508	CG	3	6	1295828	1295833	0 %	0 %	50 %	50 %	332716538
27013	NC_015508	CAAA	2	8	1295907	1295914	75 %	0 %	0 %	25 %	332716538
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27119	NC_015508	GCT	3	9	1300977	1300985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716546
27120	NC_015508	GCC	2	6	1300987	1300992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716546
27121	NC_015508	ACGA	2	8	1301032	1301039	50 %	0 %	25 %	25 %	332716546
27122	NC_015508	ACAG	2	8	1301123	1301130	50 %	0 %	25 %	25 %	332716546
27123	NC_015508	CAG	2	6	1301212	1301217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716546
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27125	NC_015508	CGT	2	6	1301263	1301268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716546
27126	NC_015508	CGA	2	6	1301346	1301351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716546
27127	NC_015508	AGC	2	6	1301434	1301439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716547
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27130	NC_015508	CAC	2	6	1301571	1301576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332716547
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27132	NC_015508	CGC	2	6	1301675	1301680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716547
27133	NC_015508	TCGA	2	8	1301698	1301705	25 %	25 %	25 %	25 %	332716547
27134	NC_015508	GC	3	6	1301723	1301728	0 %	0 %	50 %	50 %	332716547
27135	NC_015508	GTG	3	9	1301788	1301796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332716547
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27138	NC_015508	CAGG	2	8	1301852	1301859	25 %	0 %	50 %	25 %	332716547
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27142	NC_015508	GCG	2	6	1302056	1302061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716547
27143	NC_015508	CGA	2	6	1302078	1302083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716547
27144	NC_015508	GCG	2	6	1302097	1302102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716547
27145	NC_015508	TGA	2	6	1302146	1302151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332716547
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27149	NC_015508	AGCGTC	2	12	1302254	1302265	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	332716548
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27156	NC_015508	GCC	3	9	1302500	1302508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716548
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27159	NC_015508	GCA	2	6	1302567	1302572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716548
27160	NC_015508	GTT	2	6	1302607	1302612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332716548
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27171	NC_015508	ACG	2	6	1302959	1302964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716548
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27193	NC_015508	A	6	6	1304068	1304073	100 %	0 %	0 %	0 %	332716549
27194	NC_015508	TGC	2	6	1304114	1304119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716549
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27197	NC_015508	CGGC	2	8	1304194	1304201	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27198	NC_015508	AGGA	2	8	1304282	1304289	50 %	0 %	50 %	0 %	332716550
27199	NC_015508	GC	3	6	1304318	1304323	0 %	0 %	50 %	50 %	332716550
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27203	NC_015508	TTC	2	6	1304486	1304491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332716550
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27206	NC_015508	GC	3	6	1304733	1304738	0 %	0 %	50 %	50 %	332716551
27207	NC_015508	CGAGG	2	10	1304762	1304771	20 %	0 %	60 %	20 %	332716551
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27215	NC_015508	GCCTTC	2	12	1305072	1305083	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	332716551
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27217	NC_015508	GGC	2	6	1305188	1305193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716551
27218	NC_015508	GCC	2	6	1305236	1305241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716551
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27221	NC_015508	GTGCC	2	10	1305352	1305361	0 %	20 %	40 %	40 %	332716551
27222	NC_015508	GAC	2	6	1305392	1305397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716551
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27224	NC_015508	GCG	2	6	1305445	1305450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716551
27225	NC_015508	TGA	2	6	1305472	1305477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332716551
27226	NC_015508	AGCG	2	8	1305494	1305501	25 %	0 %	50 %	25 %	332716551
27227	NC_015508	GCTG	2	8	1305532	1305539	0 %	25 %	50 %	25 %	332716551
27228	NC_015508	CCA	2	6	1305559	1305564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332716551
27229	NC_015508	CGC	2	6	1305579	1305584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716551
27230	NC_015508	ATA	2	6	1305653	1305658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332716551
27231	NC_015508	ATA	2	6	1305662	1305667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332716551
27232	NC_015508	AGC	2	6	1305783	1305788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716551
27233	NC_015508	GGC	2	6	1305821	1305826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716551
27234	NC_015508	CAT	2	6	1305989	1305994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332716551
27235	NC_015508	CTT	2	6	1306047	1306052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332716552
27236	NC_015508	TCG	2	6	1306093	1306098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716552
27237	NC_015508	GTT	2	6	1306158	1306163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332716552
27238	NC_015508	TCC	2	6	1306207	1306212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332716552
27239	NC_015508	TGA	2	6	1306237	1306242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332716552
27240	NC_015508	AGT	2	6	1306274	1306279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332716552
27241	NC_015508	CTCAT	2	10	1306291	1306300	20 %	40 %	0 %	40 %	332716552
27242	NC_015508	GCC	2	6	1306303	1306308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716552
27243	NC_015508	GCA	3	9	1306349	1306357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716552
27244	NC_015508	GCG	2	6	1306448	1306453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716552
27245	NC_015508	CGC	2	6	1306509	1306514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716552
27246	NC_015508	GCT	2	6	1306535	1306540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716552
27247	NC_015508	TGG	2	6	1306562	1306567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332716552
27248	NC_015508	GAA	2	6	1306578	1306583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332716552
27249	NC_015508	CGT	2	6	1306589	1306594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716552
27250	NC_015508	AGC	2	6	1306681	1306686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716552
27251	NC_015508	CGAA	2	8	1306697	1306704	50 %	0 %	25 %	25 %	332716552
27252	NC_015508	CG	3	6	1306714	1306719	0 %	0 %	50 %	50 %	332716552
27253	NC_015508	CAGAT	2	10	1306744	1306753	40 %	20 %	20 %	20 %	332716552
27254	NC_015508	CGC	2	6	1306761	1306766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716552
27255	NC_015508	CGC	2	6	1306840	1306845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716552
27256	NC_015508	GCAT	2	8	1306921	1306928	25 %	25 %	25 %	25 %	332716552
27257	NC_015508	CCA	2	6	1306930	1306935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332716552
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27260	NC_015508	GC	3	6	1307182	1307187	0 %	0 %	50 %	50 %	332716553
27261	NC_015508	CG	3	6	1307209	1307214	0 %	0 %	50 %	50 %	332716553
27262	NC_015508	GAC	2	6	1307246	1307251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716553
27263	NC_015508	GA	3	6	1307310	1307315	50 %	0 %	50 %	0 %	332716553
27264	NC_015508	CGT	2	6	1307395	1307400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716553
27265	NC_015508	CGC	2	6	1307419	1307424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716553
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27268	NC_015508	CAGC	2	8	1307485	1307492	25 %	0 %	25 %	50 %	332716553
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27270	NC_015508	GC	3	6	1307513	1307518	0 %	0 %	50 %	50 %	332716553
27271	NC_015508	CCT	2	6	1307599	1307604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332716553
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27276	NC_015508	GC	3	6	1307943	1307948	0 %	0 %	50 %	50 %	332716553
27277	NC_015508	CTC	3	9	1307977	1307985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332716554
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27286	NC_015508	TCG	2	6	1308296	1308301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716554
27287	NC_015508	CCTT	2	8	1308323	1308330	0 %	50 %	0 %	50 %	332716554
27288	NC_015508	CG	3	6	1308358	1308363	0 %	0 %	50 %	50 %	332716554
27289	NC_015508	CGG	2	6	1308395	1308400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716554
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27293	NC_015508	GAGC	2	8	1308556	1308563	25 %	0 %	50 %	25 %	332716554
27294	NC_015508	GCC	2	6	1308586	1308591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716554
27295	NC_015508	GCCT	2	8	1308709	1308716	0 %	25 %	25 %	50 %	332716554
27296	NC_015508	GCC	2	6	1308725	1308730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716554
27297	NC_015508	CAG	2	6	1308759	1308764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716554
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27299	NC_015508	GTG	2	6	1308794	1308799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332716554
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27302	NC_015508	TGA	2	6	1308895	1308900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332716555
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27306	NC_015508	CGG	2	6	1308994	1308999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716555
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27309	NC_015508	CAG	2	6	1309236	1309241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716555
27310	NC_015508	CCT	2	6	1309369	1309374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332716555
27311	NC_015508	TCAA	2	8	1309375	1309382	50 %	25 %	0 %	25 %	332716555
27312	NC_015508	GTT	2	6	1309384	1309389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332716555
27313	NC_015508	TC	3	6	1309434	1309439	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27314	NC_015508	ATG	2	6	1309448	1309453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27315	NC_015508	ATA	2	6	1309468	1309473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27316	NC_015508	GAGGC	2	10	1309640	1309649	20 %	0 %	60 %	20 %	332716556
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27318	NC_015508	GCGG	2	8	1309813	1309820	0 %	0 %	75 %	25 %	332716556
27319	NC_015508	CGG	3	9	1309818	1309826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716556
27320	NC_015508	TG	3	6	1309859	1309864	0 %	50 %	50 %	0 %	332716556
27321	NC_015508	GCA	2	6	1309872	1309877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716556
27322	NC_015508	ACCG	2	8	1309918	1309925	25 %	0 %	25 %	50 %	332716556
27323	NC_015508	CAT	2	6	1309996	1310001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332716556
27324	NC_015508	GTCAGC	2	12	1310183	1310194	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	332716556
27325	NC_015508	GAT	2	6	1310203	1310208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332716556
27326	NC_015508	CGC	2	6	1310209	1310214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716556
27327	NC_015508	T	6	6	1310247	1310252	0 %	100 %	0 %	0 %	332716556
27328	NC_015508	GCG	2	6	1310279	1310284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716556
27329	NC_015508	ACC	2	6	1310434	1310439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332716556
27330	NC_015508	CGA	2	6	1310448	1310453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716556
27331	NC_015508	CAT	2	6	1310457	1310462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332716556
27332	NC_015508	AT	3	6	1310502	1310507	50 %	50 %	0 %	0 %	332716556
27333	NC_015508	GGC	2	6	1310539	1310544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716556
27334	NC_015508	CGC	2	6	1310556	1310561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716556
27335	NC_015508	CCG	2	6	1310681	1310686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716556
27336	NC_015508	GTT	2	6	1310752	1310757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27337	NC_015508	GAA	2	6	1310879	1310884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332716557
27338	NC_015508	CGA	2	6	1310905	1310910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716557
27339	NC_015508	CGC	2	6	1310914	1310919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716557
27340	NC_015508	CAC	2	6	1310975	1310980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332716557
27341	NC_015508	CAT	2	6	1310981	1310986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332716557
27342	NC_015508	GC	3	6	1311100	1311105	0 %	0 %	50 %	50 %	332716557
27343	NC_015508	GCT	3	9	1311121	1311129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716557
27344	NC_015508	CCG	2	6	1311132	1311137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716557
27345	NC_015508	TTC	2	6	1311156	1311161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332716557
27346	NC_015508	TGA	2	6	1311376	1311381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332716557
27347	NC_015508	ACG	2	6	1311459	1311464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716557
27348	NC_015508	TTG	2	6	1311528	1311533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332716557
27349	NC_015508	GTC	2	6	1311662	1311667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716558
27350	NC_015508	TAA	2	6	1311677	1311682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332716558
27351	NC_015508	TGCG	2	8	1311737	1311744	0 %	25 %	50 %	25 %	332716558
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27381	NC_015508	ATT	2	6	1313299	1313304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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27467	NC_015508	GTC	2	6	1317783	1317788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716563
27468	NC_015508	CGG	2	6	1317853	1317858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716563
27469	NC_015508	ATC	2	6	1317876	1317881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332716563
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27497	NC_015508	CGT	2	6	1319100	1319105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716565
27498	NC_015508	CGA	2	6	1319180	1319185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716565
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27500	NC_015508	AGC	2	6	1319509	1319514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716565

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