MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome linear

Total Repeats: 45192

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_015508	TTCA	2	8	923121	923128	25 %	50 %	0 %	25 %	332716192
19002	NC_015508	TCAT	2	8	923135	923142	25 %	50 %	0 %	25 %	332716192
19003	NC_015508	TTC	2	6	923220	923225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332716193
19004	NC_015508	GC	3	6	923299	923304	0 %	0 %	50 %	50 %	332716193
19005	NC_015508	TCA	2	6	923377	923382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332716193
19006	NC_015508	GAAC	2	8	923434	923441	50 %	0 %	25 %	25 %	332716193
19007	NC_015508	GCC	2	6	923460	923465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716193
19008	NC_015508	GCT	2	6	923512	923517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716193
19009	NC_015508	CGT	2	6	923537	923542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716193
19010	NC_015508	TGA	2	6	923545	923550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332716193
19011	NC_015508	GCC	2	6	923570	923575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716193
19012	NC_015508	GCA	2	6	923621	923626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716193
19013	NC_015508	GC	4	8	923650	923657	0 %	0 %	50 %	50 %	332716193
19014	NC_015508	CGGT	2	8	923703	923710	0 %	25 %	50 %	25 %	332716193
19015	NC_015508	GC	3	6	923764	923769	0 %	0 %	50 %	50 %	332716193
19016	NC_015508	CGG	4	12	923854	923865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716193
19017	NC_015508	GGC	2	6	924026	924031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716193
19018	NC_015508	CTT	2	6	924047	924052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332716193
19019	NC_015508	GAG	2	6	924053	924058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332716193
19020	NC_015508	CGA	2	6	924073	924078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716193
19021	NC_015508	GC	3	6	924128	924133	0 %	0 %	50 %	50 %	332716193
19022	NC_015508	CGA	2	6	924139	924144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716193
19023	NC_015508	ATG	2	6	924302	924307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19024	NC_015508	CATC	2	8	924328	924335	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
19025	NC_015508	GTT	2	6	924528	924533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332716194
19026	NC_015508	CTTC	2	8	924632	924639	0 %	50 %	0 %	50 %	332716194
19027	NC_015508	ACCGAC	2	12	924654	924665	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	332716194
19028	NC_015508	GCC	2	6	924672	924677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716194
19029	NC_015508	TGA	3	9	924707	924715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332716194
19030	NC_015508	GAT	2	6	924735	924740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332716194
19031	NC_015508	ATG	2	6	924775	924780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332716194
19032	NC_015508	GCC	2	6	924798	924803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716194
19033	NC_015508	GCA	2	6	924849	924854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716194
19034	NC_015508	TCG	2	6	924856	924861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716194
19035	NC_015508	CCG	2	6	924868	924873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716194
19036	NC_015508	CGA	2	6	924881	924886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716194
19037	NC_015508	ACG	2	6	924889	924894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716194
19038	NC_015508	CTT	2	6	924897	924902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332716194
19039	NC_015508	TGA	2	6	924959	924964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332716194
19040	NC_015508	GCTCG	2	10	925014	925023	0 %	20 %	40 %	40 %	332716194
19041	NC_015508	CCT	2	6	925103	925108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332716194
19042	NC_015508	TCA	2	6	925133	925138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332716194
19043	NC_015508	GCC	2	6	925197	925202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716194
19044	NC_015508	GTC	2	6	925278	925283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716194
19045	NC_015508	GCC	2	6	925327	925332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716194
19046	NC_015508	TAT	2	6	925538	925543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19047	NC_015508	GAT	2	6	925615	925620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332716195
19048	NC_015508	GA	3	6	925654	925659	50 %	0 %	50 %	0 %	332716195
19049	NC_015508	GCCGC	2	10	925683	925692	0 %	0 %	40 %	60 %	332716195
19050	NC_015508	GAA	2	6	925730	925735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332716195
19051	NC_015508	GGCGAA	2	12	925903	925914	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	332716195
19052	NC_015508	T	6	6	925937	925942	0 %	100 %	0 %	0 %	332716195
19053	NC_015508	TCA	3	9	925989	925997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332716195
19054	NC_015508	TCTGG	2	10	926005	926014	0 %	40 %	40 %	20 %	332716195
19055	NC_015508	TGG	2	6	926019	926024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332716195
19056	NC_015508	CGG	2	6	926068	926073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716195
19057	NC_015508	CTG	2	6	926078	926083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716195
19058	NC_015508	TCG	2	6	926085	926090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716195
19059	NC_015508	AAG	2	6	926132	926137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332716195
19060	NC_015508	GGC	2	6	926140	926145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716195
19061	NC_015508	CGG	2	6	926193	926198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716195
19062	NC_015508	TGA	2	6	926260	926265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332716195
19063	NC_015508	A	6	6	926347	926352	100 %	0 %	0 %	0 %	332716195
19064	NC_015508	CTG	2	6	926360	926365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716195
19065	NC_015508	GCA	2	6	926386	926391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716195
19066	NC_015508	GCC	2	6	926462	926467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19067	NC_015508	AAT	2	6	926528	926533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19068	NC_015508	CCGC	2	8	926622	926629	0 %	0 %	25 %	75 %	332716196
19069	NC_015508	CTC	2	6	926638	926643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332716196
19070	NC_015508	CCGG	2	8	926659	926666	0 %	0 %	50 %	50 %	332716196
19071	NC_015508	CCATGC	2	12	926727	926738	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	332716196
19072	NC_015508	GCG	2	6	926745	926750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716196
19073	NC_015508	TCG	2	6	926798	926803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716196
19074	NC_015508	ACCAT	2	10	926840	926849	40 %	20 %	0 %	40 %	332716196
19075	NC_015508	TCG	2	6	926853	926858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716196
19076	NC_015508	TCA	2	6	927090	927095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332716197
19077	NC_015508	GTG	2	6	927175	927180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332716197
19078	NC_015508	ACG	2	6	927181	927186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716197
19079	NC_015508	CG	3	6	927233	927238	0 %	0 %	50 %	50 %	332716197
19080	NC_015508	ATG	2	6	927271	927276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332716197
19081	NC_015508	GGC	2	6	927297	927302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716197
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19083	NC_015508	CTGC	2	8	927342	927349	0 %	25 %	25 %	50 %	332716197
19084	NC_015508	TGG	2	6	927373	927378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332716197
19085	NC_015508	TGGT	2	8	927391	927398	0 %	50 %	50 %	0 %	332716197
19086	NC_015508	CAG	3	9	927408	927416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716197
19087	NC_015508	CGC	2	6	927467	927472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716197
19088	NC_015508	CGA	2	6	927536	927541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716197
19089	NC_015508	CG	3	6	927613	927618	0 %	0 %	50 %	50 %	332716197
19090	NC_015508	GGT	2	6	927630	927635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332716197
19091	NC_015508	CTG	2	6	927642	927647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716197
19092	NC_015508	CGC	2	6	927679	927684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716197
19093	NC_015508	CATGA	2	10	927714	927723	40 %	20 %	20 %	20 %	332716197
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19096	NC_015508	GGCG	2	8	927929	927936	0 %	0 %	75 %	25 %	332716198
19097	NC_015508	GCA	2	6	927967	927972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716198
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19099	NC_015508	GAT	2	6	928010	928015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332716198
19100	NC_015508	GCA	2	6	928048	928053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716198
19101	NC_015508	GC	3	6	928082	928087	0 %	0 %	50 %	50 %	332716198
19102	NC_015508	CGA	2	6	928108	928113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716198
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19105	NC_015508	CCG	2	6	928224	928229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716198
19106	NC_015508	GC	3	6	928246	928251	0 %	0 %	50 %	50 %	332716198
19107	NC_015508	AGCC	2	8	928298	928305	25 %	0 %	25 %	50 %	332716198
19108	NC_015508	CAG	2	6	928340	928345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716198
19109	NC_015508	ATG	2	6	928353	928358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332716198
19110	NC_015508	CG	3	6	928360	928365	0 %	0 %	50 %	50 %	332716198
19111	NC_015508	ACG	2	6	928399	928404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716198
19112	NC_015508	GAT	2	6	928445	928450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332716198
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19114	NC_015508	GCCG	2	8	928526	928533	0 %	0 %	50 %	50 %	332716198
19115	NC_015508	CCCCG	2	10	928547	928556	0 %	0 %	20 %	80 %	332716198
19116	NC_015508	ACGGCC	2	12	928572	928583	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	332716198
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19118	NC_015508	GCCAGC	2	12	928665	928676	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	332716198
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19120	NC_015508	CCA	2	6	928795	928800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332716198
19121	NC_015508	CGA	2	6	928849	928854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716198
19122	NC_015508	GCA	2	6	928855	928860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716198
19123	NC_015508	GCC	2	6	929021	929026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716199
19124	NC_015508	CGG	2	6	929031	929036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716199
19125	NC_015508	ATG	2	6	929039	929044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332716199
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19127	NC_015508	CGG	2	6	929108	929113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716199
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19146	NC_015508	TAAA	2	8	929960	929967	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19147	NC_015508	CG	3	6	929986	929991	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19148	NC_015508	ACA	2	6	930015	930020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19149	NC_015508	TGGAGA	2	12	930025	930036	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
19150	NC_015508	CGGA	2	8	930060	930067	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19151	NC_015508	CTC	2	6	930082	930087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19152	NC_015508	CCCG	2	8	930099	930106	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19153	NC_015508	TGC	2	6	930377	930382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19161	NC_015508	GCGCA	2	10	930656	930665	20 %	0 %	40 %	40 %	332716200
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19177	NC_015508	CAG	2	6	931410	931415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19178	NC_015508	GAC	2	6	931468	931473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19223	NC_015508	CGT	2	6	933663	933668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716203
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19230	NC_015508	GCCA	2	8	934014	934021	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19231	NC_015508	CGC	2	6	934084	934089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716204
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19235	NC_015508	GTCG	2	8	934178	934185	0 %	25 %	50 %	25 %	332716204
19236	NC_015508	TGC	2	6	934187	934192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716204
19237	NC_015508	ATC	2	6	934232	934237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332716204
19238	NC_015508	GCG	2	6	934441	934446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716204
19239	NC_015508	TGC	2	6	934471	934476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716204
19240	NC_015508	CTC	2	6	934535	934540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332716204
19241	NC_015508	CTT	2	6	934601	934606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332716204
19242	NC_015508	AGG	2	6	934624	934629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332716204
19243	NC_015508	CCGA	2	8	934644	934651	25 %	0 %	25 %	50 %	332716204
19244	NC_015508	CGT	2	6	934691	934696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716204
19245	NC_015508	GTG	2	6	934776	934781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332716204
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19269	NC_015508	CAGG	2	8	935550	935557	25 %	0 %	50 %	25 %	332716204
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19277	NC_015508	GGAT	2	8	936072	936079	25 %	25 %	50 %	0 %	332716205
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19296	NC_015508	GC	3	6	936990	936995	0 %	0 %	50 %	50 %	332716206
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19349	NC_015508	CAT	2	6	939241	939246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332716207
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19354	NC_015508	GC	3	6	939506	939511	0 %	0 %	50 %	50 %	332716207
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19359	NC_015508	GC	3	6	939652	939657	0 %	0 %	50 %	50 %	332716207
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19476	NC_015508	TA	3	6	945797	945802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19477	NC_015508	ATG	2	6	945812	945817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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19481	NC_015508	GTC	2	6	945916	945921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716214
19482	NC_015508	GAC	2	6	945927	945932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716214
19483	NC_015508	GCT	2	6	945933	945938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716214
19484	NC_015508	TATCG	2	10	945939	945948	20 %	40 %	20 %	20 %	332716214
19485	NC_015508	CCA	2	6	945965	945970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332716214
19486	NC_015508	CTG	2	6	945973	945978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716214
19487	NC_015508	CTT	2	6	946000	946005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332716214
19488	NC_015508	CGA	2	6	946059	946064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716214
19489	NC_015508	CTG	2	6	946102	946107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716214
19490	NC_015508	CAA	2	6	946134	946139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332716214
19491	NC_015508	CAC	2	6	946200	946205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332716214
19492	NC_015508	TGC	2	6	946253	946258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716214
19493	NC_015508	CTG	2	6	946345	946350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716214
19494	NC_015508	TGC	2	6	946418	946423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716214
19495	NC_015508	TCA	2	6	946442	946447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332716214
19496	NC_015508	TCG	2	6	946457	946462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716214
19497	NC_015508	GAT	2	6	946473	946478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332716214
19498	NC_015508	GCCGC	2	10	946487	946496	0 %	0 %	40 %	60 %	332716214
19499	NC_015508	TCG	2	6	946637	946642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716214
19500	NC_015508	GCG	2	6	946643	946648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716214

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