MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome linear

Total Repeats: 45192

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_015508	CCT	2	6	853350	853355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332716136
17502	NC_015508	GCC	2	6	853376	853381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716136
17503	NC_015508	CGC	2	6	853445	853450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716136
17504	NC_015508	GCC	2	6	853486	853491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716136
17505	NC_015508	GTCA	2	8	853540	853547	25 %	25 %	25 %	25 %	332716136
17506	NC_015508	CGC	2	6	853552	853557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716136
17507	NC_015508	CGGC	2	8	853651	853658	0 %	0 %	50 %	50 %	332716136
17508	NC_015508	CGC	2	6	853680	853685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716136
17509	NC_015508	CTG	2	6	853714	853719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716136
17510	NC_015508	GGC	3	9	853720	853728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716136
17511	NC_015508	ATG	2	6	853751	853756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332716136
17512	NC_015508	CAC	2	6	853771	853776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332716136
17513	NC_015508	GTCC	2	8	853806	853813	0 %	25 %	25 %	50 %	332716136
17514	NC_015508	CGTC	2	8	853827	853834	0 %	25 %	25 %	50 %	332716136
17515	NC_015508	GC	3	6	853854	853859	0 %	0 %	50 %	50 %	332716136
17516	NC_015508	ATG	2	6	853882	853887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332716136
17517	NC_015508	CTT	2	6	853933	853938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332716136
17518	NC_015508	CCG	2	6	853986	853991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716136
17519	NC_015508	CCG	2	6	854024	854029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716136
17520	NC_015508	GGC	2	6	854102	854107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17521	NC_015508	AGCGA	2	10	854118	854127	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
17522	NC_015508	CGC	2	6	854183	854188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17523	NC_015508	CAA	2	6	854191	854196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17524	NC_015508	GGC	2	6	854280	854285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716137
17525	NC_015508	GGCA	2	8	854352	854359	25 %	0 %	50 %	25 %	332716137
17526	NC_015508	TCG	2	6	854487	854492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716138
17527	NC_015508	CGTT	2	8	854511	854518	0 %	50 %	25 %	25 %	332716138
17528	NC_015508	T	6	6	854560	854565	0 %	100 %	0 %	0 %	332716138
17529	NC_015508	ATG	2	6	854594	854599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17530	NC_015508	CGG	2	6	854600	854605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17531	NC_015508	T	8	8	854645	854652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17532	NC_015508	GCA	2	6	854671	854676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716139
17533	NC_015508	GCGCCT	2	12	854677	854688	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	332716139
17534	NC_015508	TGC	2	6	854702	854707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716139
17535	NC_015508	CTT	2	6	854746	854751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332716139
17536	NC_015508	TCA	2	6	854773	854778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332716139
17537	NC_015508	AGC	2	6	854809	854814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716139
17538	NC_015508	GC	3	6	854877	854882	0 %	0 %	50 %	50 %	332716139
17539	NC_015508	CCA	2	6	854971	854976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332716139
17540	NC_015508	CCG	2	6	854979	854984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716139
17541	NC_015508	AAG	2	6	854985	854990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332716139
17542	NC_015508	GATC	2	8	855008	855015	25 %	25 %	25 %	25 %	332716139
17543	NC_015508	CCGTA	2	10	855019	855028	20 %	20 %	20 %	40 %	332716139
17544	NC_015508	TGGCG	2	10	855040	855049	0 %	20 %	60 %	20 %	332716139
17545	NC_015508	CA	3	6	855057	855062	50 %	0 %	0 %	50 %	332716139
17546	NC_015508	GTTG	2	8	855122	855129	0 %	50 %	50 %	0 %	332716139
17547	NC_015508	GAT	2	6	855143	855148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332716139
17548	NC_015508	GGCT	2	8	855162	855169	0 %	25 %	50 %	25 %	332716139
17549	NC_015508	TGA	2	6	855238	855243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332716139
17550	NC_015508	ATA	2	6	855254	855259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332716139
17551	NC_015508	GCCC	2	8	855280	855287	0 %	0 %	25 %	75 %	332716139
17552	NC_015508	C	6	6	855285	855290	0 %	0 %	0 %	100 %	332716139
17553	NC_015508	GAA	3	9	855296	855304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332716139
17554	NC_015508	TCA	2	6	855340	855345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332716139
17555	NC_015508	TCG	2	6	855384	855389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716139
17556	NC_015508	AT	3	6	855390	855395	50 %	50 %	0 %	0 %	332716139
17557	NC_015508	GC	3	6	855412	855417	0 %	0 %	50 %	50 %	332716139
17558	NC_015508	GC	3	6	855436	855441	0 %	0 %	50 %	50 %	332716139
17559	NC_015508	TTC	2	6	855456	855461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332716139
17560	NC_015508	CTC	2	6	855482	855487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332716139
17561	NC_015508	TCC	2	6	855492	855497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332716139
17562	NC_015508	GCG	2	6	855573	855578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716139
17563	NC_015508	CAC	3	9	855593	855601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332716139
17564	NC_015508	TTG	2	6	855612	855617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332716139
17565	NC_015508	GAG	2	6	855620	855625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332716139
17566	NC_015508	TCGA	2	8	855630	855637	25 %	25 %	25 %	25 %	332716139
17567	NC_015508	TTC	2	6	855656	855661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332716139
17568	NC_015508	CCG	2	6	855673	855678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716139
17569	NC_015508	GAT	2	6	855770	855775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332716139
17570	NC_015508	ATG	2	6	855798	855803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332716139
17571	NC_015508	CGAT	2	8	855862	855869	25 %	25 %	25 %	25 %	332716140
17572	NC_015508	TGC	2	6	855927	855932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716140
17573	NC_015508	CCGTG	2	10	855953	855962	0 %	20 %	40 %	40 %	332716140
17574	NC_015508	CGG	2	6	856028	856033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716140
17575	NC_015508	GGTCC	2	10	856118	856127	0 %	20 %	40 %	40 %	332716140
17576	NC_015508	AACC	2	8	856264	856271	50 %	0 %	0 %	50 %	332716140
17577	NC_015508	CCG	2	6	856280	856285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716140
17578	NC_015508	TCA	2	6	856456	856461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332716140
17579	NC_015508	GCC	2	6	856507	856512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716140
17580	NC_015508	CTT	2	6	856518	856523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332716140
17581	NC_015508	TCC	2	6	856591	856596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17582	NC_015508	GCC	2	6	856740	856745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716141
17583	NC_015508	CAGAT	2	10	856783	856792	40 %	20 %	20 %	20 %	332716141
17584	NC_015508	CTC	2	6	856809	856814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332716141
17585	NC_015508	CGC	2	6	856841	856846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716141
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17587	NC_015508	TGG	2	6	856961	856966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332716141
17588	NC_015508	ACC	2	6	856972	856977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332716141
17589	NC_015508	CGA	2	6	857042	857047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716141
17590	NC_015508	TTG	2	6	857062	857067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332716141
17591	NC_015508	GCT	2	6	857090	857095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716141
17592	NC_015508	CGC	2	6	857102	857107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716141
17593	NC_015508	ATG	2	6	857113	857118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332716141
17594	NC_015508	GT	3	6	857157	857162	0 %	50 %	50 %	0 %	332716141
17595	NC_015508	CGCTGG	2	12	857311	857322	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	332716141
17596	NC_015508	CCG	2	6	857323	857328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716141
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17598	NC_015508	CGC	2	6	857379	857384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716141
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17600	NC_015508	CTC	2	6	857520	857525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332716141
17601	NC_015508	TGA	2	6	857546	857551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332716141
17602	NC_015508	GCAAT	2	10	857584	857593	40 %	20 %	20 %	20 %	332716141
17603	NC_015508	AGC	2	6	857629	857634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716141
17604	NC_015508	CGT	2	6	857648	857653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716141
17605	NC_015508	GCG	2	6	857760	857765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716142
17606	NC_015508	ACGGC	2	10	857809	857818	20 %	0 %	40 %	40 %	332716142
17607	NC_015508	ATT	2	6	857885	857890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332716142
17608	NC_015508	ATC	2	6	857976	857981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332716142
17609	NC_015508	ACG	2	6	857985	857990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716142
17610	NC_015508	GCA	2	6	858010	858015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716142
17611	NC_015508	GCC	2	6	858060	858065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716142
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17613	NC_015508	AGC	2	6	858108	858113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716142
17614	NC_015508	GCA	2	6	858187	858192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716142
17615	NC_015508	ATC	2	6	858210	858215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332716142
17616	NC_015508	ATG	2	6	858240	858245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332716142
17617	NC_015508	GAA	2	6	858254	858259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332716142
17618	NC_015508	GAT	2	6	858317	858322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332716142
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17620	NC_015508	AG	3	6	858495	858500	50 %	0 %	50 %	0 %	332716142
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17983	NC_015508	CGT	2	6	875445	875450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716155
17984	NC_015508	GAC	3	9	875473	875481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716155
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