MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome linear

Total Repeats: 45192

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_015508	CAT	2	6	829336	829341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332716110
17003	NC_015508	TTCCGG	2	12	829348	829359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716110
17004	NC_015508	GAC	2	6	829363	829368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716110
17005	NC_015508	GGC	2	6	829570	829575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716110
17006	NC_015508	GCC	2	6	829637	829642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716110
17007	NC_015508	GGC	2	6	829661	829666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716110
17008	NC_015508	AGC	2	6	829671	829676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716110
17009	NC_015508	CTT	2	6	829696	829701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332716110
17010	NC_015508	CAC	2	6	829807	829812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332716110
17011	NC_015508	CTT	2	6	829838	829843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332716110
17012	NC_015508	A	7	7	829990	829996	100 %	0 %	0 %	0 %	332716111
17013	NC_015508	CCG	2	6	829997	830002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716111
17014	NC_015508	TGC	2	6	830096	830101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716111
17015	NC_015508	CCT	2	6	830105	830110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332716111
17016	NC_015508	CGG	2	6	830112	830117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716111
17017	NC_015508	GCACC	2	10	830135	830144	20 %	0 %	20 %	60 %	332716111
17018	NC_015508	CCG	2	6	830150	830155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716111
17019	NC_015508	CAT	2	6	830157	830162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332716111
17020	NC_015508	CAA	3	9	830190	830198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332716111
17021	NC_015508	GCA	2	6	830205	830210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716111
17022	NC_015508	CAT	2	6	830223	830228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332716111
17023	NC_015508	ATG	2	6	830236	830241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332716111
17024	NC_015508	AAGG	2	8	830263	830270	50 %	0 %	50 %	0 %	332716111
17025	NC_015508	GAC	2	6	830295	830300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716111
17026	NC_015508	GC	3	6	830367	830372	0 %	0 %	50 %	50 %	332716111
17027	NC_015508	A	6	6	830387	830392	100 %	0 %	0 %	0 %	332716111
17028	NC_015508	GAAG	2	8	830418	830425	50 %	0 %	50 %	0 %	332716111
17029	NC_015508	CAT	2	6	830448	830453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332716111
17030	NC_015508	CGA	2	6	830496	830501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716111
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17032	NC_015508	CAA	2	6	830787	830792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332716111
17033	NC_015508	GCT	2	6	830797	830802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716111
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17039	NC_015508	CCG	2	6	831084	831089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716111
17040	NC_015508	CAC	2	6	831090	831095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332716111
17041	NC_015508	CCG	2	6	831128	831133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716111
17042	NC_015508	GAG	2	6	831202	831207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332716111
17043	NC_015508	CGG	2	6	831248	831253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716111
17044	NC_015508	CTT	2	6	831282	831287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332716111
17045	NC_015508	GAA	2	6	831344	831349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332716111
17046	NC_015508	CGG	2	6	831375	831380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17047	NC_015508	TGG	2	6	831463	831468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17048	NC_015508	GGC	2	6	831485	831490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716112
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17050	NC_015508	TGA	2	6	831553	831558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332716112
17051	NC_015508	GAAG	2	8	831590	831597	50 %	0 %	50 %	0 %	332716112
17052	NC_015508	TCG	2	6	831604	831609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716112
17053	NC_015508	CG	5	10	831631	831640	0 %	0 %	50 %	50 %	332716112
17054	NC_015508	CGCCGG	2	12	831679	831690	0 %	0 %	50 %	50 %	332716112
17055	NC_015508	CAT	2	6	831710	831715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332716112
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17057	NC_015508	CAA	2	6	831746	831751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332716112
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17060	NC_015508	GAAA	2	8	831869	831876	75 %	0 %	25 %	0 %	332716112
17061	NC_015508	GGCA	2	8	832064	832071	25 %	0 %	50 %	25 %	332716113
17062	NC_015508	CGG	2	6	832080	832085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716113
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17086	NC_015508	TGGA	2	8	832985	832992	25 %	25 %	50 %	0 %	332716113
17087	NC_015508	GC	3	6	832994	832999	0 %	0 %	50 %	50 %	332716113
17088	NC_015508	TGC	2	6	833011	833016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716113
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17099	NC_015508	TTC	2	6	833654	833659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332716114
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17101	NC_015508	GC	3	6	833863	833868	0 %	0 %	50 %	50 %	332716114
17102	NC_015508	AGC	2	6	833976	833981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716114
17103	NC_015508	GC	3	6	833985	833990	0 %	0 %	50 %	50 %	332716114
17104	NC_015508	CGC	2	6	834013	834018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716114
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17107	NC_015508	GC	3	6	834304	834309	0 %	0 %	50 %	50 %	332716114
17108	NC_015508	AAT	2	6	834325	834330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332716114
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17112	NC_015508	CGG	2	6	834406	834411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716114
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17115	NC_015508	CGC	2	6	834583	834588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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17117	NC_015508	A	6	6	834641	834646	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17118	NC_015508	CGG	2	6	834781	834786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716115
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17242	NC_015508	TCG	2	6	840528	840533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716120
17243	NC_015508	GGC	2	6	840534	840539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716120
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17265	NC_015508	GCCC	2	8	841439	841446	0 %	0 %	25 %	75 %	332716121
17266	NC_015508	GC	5	10	841451	841460	0 %	0 %	50 %	50 %	332716121
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17273	NC_015508	GCCC	2	8	842029	842036	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
17274	NC_015508	GGC	2	6	842086	842091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17275	NC_015508	CA	3	6	842149	842154	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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17326	NC_015508	CAAT	2	8	844724	844731	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17327	NC_015508	ATGGA	2	10	844745	844754	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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17329	NC_015508	GACC	2	8	844786	844793	25 %	0 %	25 %	50 %	332716127
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17350	NC_015508	CCTG	2	8	845621	845628	0 %	25 %	25 %	50 %	332716127
17351	NC_015508	GCA	2	6	845676	845681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716127
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17354	NC_015508	CGC	3	9	845821	845829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17355	NC_015508	AAGA	2	8	845956	845963	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17356	NC_015508	GAT	2	6	846027	846032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17357	NC_015508	GGA	2	6	846046	846051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17358	NC_015508	TG	3	6	846088	846093	0 %	50 %	50 %	0 %	332716128
17359	NC_015508	GGC	2	6	846125	846130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716128
17360	NC_015508	CGC	2	6	846143	846148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716128
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17362	NC_015508	CAA	2	6	846293	846298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332716128
17363	NC_015508	GACG	2	8	846317	846324	25 %	0 %	50 %	25 %	332716128
17364	NC_015508	CGA	2	6	846373	846378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716128
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17367	NC_015508	CAA	2	6	846710	846715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332716128
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17371	NC_015508	AGGAAG	2	12	846793	846804	50 %	0 %	50 %	0 %	332716128
17372	NC_015508	CTATGC	2	12	846854	846865	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	332716128
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17393	NC_015508	TCA	2	6	848413	848418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332716130
17394	NC_015508	ACT	2	6	848494	848499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332716130
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17405	NC_015508	TCACCT	2	12	848998	849009	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	332716130
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17407	NC_015508	CTT	2	6	849048	849053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332716130
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17410	NC_015508	CAT	2	6	849155	849160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332716130
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17425	NC_015508	CGA	2	6	849675	849680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716131
17426	NC_015508	GCG	2	6	849700	849705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716131
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17428	NC_015508	CGC	2	6	849857	849862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716131
17429	NC_015508	ATC	2	6	850030	850035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332716131
17430	NC_015508	TCG	2	6	850097	850102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716131
17431	NC_015508	GACC	2	8	850119	850126	25 %	0 %	25 %	50 %	332716131
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17433	NC_015508	GCG	2	6	850162	850167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716131
17434	NC_015508	GC	3	6	850204	850209	0 %	0 %	50 %	50 %	332716131
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17438	NC_015508	TCG	2	6	850534	850539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716132
17439	NC_015508	GC	3	6	850636	850641	0 %	0 %	50 %	50 %	332716132
17440	NC_015508	GGCG	2	8	850655	850662	0 %	0 %	75 %	25 %	332716132
17441	NC_015508	GCG	2	6	850810	850815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716132
17442	NC_015508	TCT	2	6	850861	850866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332716132
17443	NC_015508	ACG	2	6	850903	850908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716132
17444	NC_015508	TCA	2	6	850924	850929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332716132
17445	NC_015508	GC	3	6	850963	850968	0 %	0 %	50 %	50 %	332716132
17446	NC_015508	GAA	2	6	851025	851030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332716132
17447	NC_015508	AGGC	2	8	851050	851057	25 %	0 %	50 %	25 %	332716132
17448	NC_015508	CGG	2	6	851105	851110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716133
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17450	NC_015508	TGG	2	6	851161	851166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332716133
17451	NC_015508	GTGGAT	2	12	851172	851183	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	332716133
17452	NC_015508	CGG	2	6	851275	851280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716133
17453	NC_015508	CCA	2	6	851303	851308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332716133
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17457	NC_015508	GGC	2	6	851468	851473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716133
17458	NC_015508	GCTG	2	8	851486	851493	0 %	25 %	50 %	25 %	332716133
17459	NC_015508	CCT	2	6	851524	851529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332716133
17460	NC_015508	GGC	2	6	851593	851598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716133
17461	NC_015508	CCA	2	6	851602	851607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332716133
17462	NC_015508	CCT	2	6	851662	851667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332716133
17463	NC_015508	CAA	2	6	851732	851737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332716133
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17465	NC_015508	CTGCGC	2	12	851853	851864	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	332716133
17466	NC_015508	CGA	2	6	851936	851941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716133
17467	NC_015508	CGA	2	6	851986	851991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716133
17468	NC_015508	TC	3	6	852080	852085	0 %	50 %	0 %	50 %	332716133
17469	NC_015508	ATC	2	6	852087	852092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332716133
17470	NC_015508	CGG	2	6	852105	852110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716133
17471	NC_015508	GCG	3	9	852143	852151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17472	NC_015508	GCC	2	6	852155	852160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17473	NC_015508	TAT	2	6	852184	852189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17474	NC_015508	TAC	2	6	852227	852232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17475	NC_015508	CGCCT	2	10	852239	852248	0 %	20 %	20 %	60 %	332716134
17476	NC_015508	GCA	2	6	852278	852283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716134
17477	NC_015508	CCA	2	6	852320	852325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332716134
17478	NC_015508	CG	3	6	852364	852369	0 %	0 %	50 %	50 %	332716134
17479	NC_015508	GTC	2	6	852372	852377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716134
17480	NC_015508	GGC	3	9	852382	852390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716134
17481	NC_015508	CGG	3	9	852515	852523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716134
17482	NC_015508	TGG	2	6	852570	852575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332716134
17483	NC_015508	GAT	2	6	852593	852598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332716134
17484	NC_015508	TGC	2	6	852626	852631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716134
17485	NC_015508	GCC	2	6	852711	852716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716134
17486	NC_015508	CCG	2	6	852742	852747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716134
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17490	NC_015508	CGAA	2	8	852871	852878	50 %	0 %	25 %	25 %	332716134
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