MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome linear

Total Repeats: 45192

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_015508	GCG	2	6	713391	713396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716011
14502	NC_015508	CGC	2	6	713486	713491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716012
14503	NC_015508	AAT	2	6	713510	713515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332716012
14504	NC_015508	CGG	2	6	713522	713527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716012
14505	NC_015508	CCA	2	6	713547	713552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332716012
14506	NC_015508	GC	3	6	713581	713586	0 %	0 %	50 %	50 %	332716012
14507	NC_015508	CGG	2	6	713625	713630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716012
14508	NC_015508	AGC	2	6	713641	713646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716012
14509	NC_015508	CCG	2	6	713780	713785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716012
14510	NC_015508	TCC	2	6	713854	713859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332716012
14511	NC_015508	GCG	2	6	713881	713886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716012
14512	NC_015508	CAT	2	6	713919	713924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332716012
14513	NC_015508	CGGT	2	8	713959	713966	0 %	25 %	50 %	25 %	332716012
14514	NC_015508	GCA	2	6	714050	714055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716012
14515	NC_015508	CGACG	2	10	714062	714071	20 %	0 %	40 %	40 %	332716012
14516	NC_015508	CCG	3	9	714146	714154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716012
14517	NC_015508	AGGCG	2	10	714170	714179	20 %	0 %	60 %	20 %	332716012
14518	NC_015508	CCA	2	6	714185	714190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332716012
14519	NC_015508	GCC	2	6	714248	714253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716012
14520	NC_015508	GCG	2	6	714284	714289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716012
14521	NC_015508	CTC	2	6	714357	714362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332716012
14522	NC_015508	GCC	2	6	714373	714378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716012
14523	NC_015508	CGC	2	6	714396	714401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716012
14524	NC_015508	GCCC	2	8	714407	714414	0 %	0 %	25 %	75 %	332716012
14525	NC_015508	GCC	2	6	714463	714468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716012
14526	NC_015508	C	6	6	714467	714472	0 %	0 %	0 %	100 %	332716012
14527	NC_015508	GCGG	2	8	714492	714499	0 %	0 %	75 %	25 %	332716012
14528	NC_015508	GCG	2	6	714610	714615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716012
14529	NC_015508	GTT	2	6	714653	714658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332716012
14530	NC_015508	CCG	3	9	714674	714682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716012
14531	NC_015508	GCCGG	2	10	714741	714750	0 %	0 %	60 %	40 %	332716012
14532	NC_015508	CGC	2	6	714756	714761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716012
14533	NC_015508	TGC	2	6	714765	714770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716012
14534	NC_015508	GGC	3	9	714791	714799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716012
14535	NC_015508	CGG	2	6	714837	714842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716013
14536	NC_015508	GAC	2	6	714903	714908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716013
14537	NC_015508	CGC	3	9	714948	714956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716013
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14539	NC_015508	CGC	2	6	715075	715080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716013
14540	NC_015508	GCG	2	6	715099	715104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716013
14541	NC_015508	CCG	2	6	715134	715139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716013
14542	NC_015508	CGA	2	6	715263	715268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716013
14543	NC_015508	TGA	2	6	715269	715274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332716013
14544	NC_015508	AC	3	6	715334	715339	50 %	0 %	0 %	50 %	332716013
14545	NC_015508	TGC	2	6	715363	715368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716013
14546	NC_015508	CGG	2	6	715404	715409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716013
14547	NC_015508	GCC	3	9	715417	715425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716013
14548	NC_015508	AAGGC	2	10	715497	715506	40 %	0 %	40 %	20 %	332716013
14549	NC_015508	CG	3	6	715582	715587	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14550	NC_015508	GCATG	2	10	715593	715602	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14551	NC_015508	AG	3	6	715707	715712	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14552	NC_015508	ACC	2	6	715738	715743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14553	NC_015508	GGA	2	6	715812	715817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14554	NC_015508	CCG	2	6	715820	715825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14555	NC_015508	CCAT	2	8	715860	715867	25 %	25 %	0 %	50 %	332716014
14556	NC_015508	TGC	2	6	715890	715895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716014
14557	NC_015508	GCCG	3	12	715906	715917	0 %	0 %	50 %	50 %	332716014
14558	NC_015508	CT	3	6	715931	715936	0 %	50 %	0 %	50 %	332716014
14559	NC_015508	GCC	2	6	715967	715972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716014
14560	NC_015508	TCT	2	6	716055	716060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332716014
14561	NC_015508	TTCA	2	8	716123	716130	25 %	50 %	0 %	25 %	332716014
14562	NC_015508	GGC	2	6	716237	716242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716015
14563	NC_015508	TGC	2	6	716269	716274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716015
14564	NC_015508	CAT	2	6	716277	716282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332716015
14565	NC_015508	CTTC	2	8	716283	716290	0 %	50 %	0 %	50 %	332716015
14566	NC_015508	TGG	2	6	716311	716316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332716015
14567	NC_015508	TCG	2	6	716392	716397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716015
14568	NC_015508	CCGG	2	8	716421	716428	0 %	0 %	50 %	50 %	332716015
14569	NC_015508	ATC	2	6	716439	716444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332716015
14570	NC_015508	CGA	2	6	716465	716470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716015
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14572	NC_015508	GAC	2	6	716526	716531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716015
14573	NC_015508	CGG	3	9	716552	716560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716015
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14575	NC_015508	CGA	2	6	716644	716649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716015
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14577	NC_015508	GCC	2	6	716712	716717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716015
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14580	NC_015508	AGGC	2	8	716905	716912	25 %	0 %	50 %	25 %	332716015
14581	NC_015508	AGA	2	6	716918	716923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332716015
14582	NC_015508	CTCG	2	8	716948	716955	0 %	25 %	25 %	50 %	332716015
14583	NC_015508	GGC	3	9	716963	716971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716015
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14585	NC_015508	TGC	2	6	717112	717117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716015
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14587	NC_015508	GGGC	2	8	717167	717174	0 %	0 %	75 %	25 %	332716015
14588	NC_015508	CTG	2	6	717189	717194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716015
14589	NC_015508	TGG	2	6	717349	717354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332716015
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14591	NC_015508	GTGCG	2	10	717485	717494	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
14592	NC_015508	TGG	2	6	717543	717548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14593	NC_015508	GCCCTG	2	12	717601	717612	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	332716016
14594	NC_015508	CCTG	2	8	717686	717693	0 %	25 %	25 %	50 %	332716016
14595	NC_015508	GGC	2	6	717703	717708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716016
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14599	NC_015508	C	6	6	717894	717899	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14600	NC_015508	GAA	2	6	717907	717912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14601	NC_015508	CGC	2	6	717916	717921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14602	NC_015508	GCC	2	6	717952	717957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716017
14603	NC_015508	TTC	2	6	717959	717964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332716017
14604	NC_015508	GCG	2	6	718060	718065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716017
14605	NC_015508	CG	4	8	718152	718159	0 %	0 %	50 %	50 %	332716017
14606	NC_015508	GCA	2	6	718163	718168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716017
14607	NC_015508	CCG	2	6	718181	718186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716017
14608	NC_015508	TGA	2	6	718191	718196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332716017
14609	NC_015508	GTT	2	6	718197	718202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332716017
14610	NC_015508	TGCC	2	8	718260	718267	0 %	25 %	25 %	50 %	332716017
14611	NC_015508	TTGC	2	8	718348	718355	0 %	50 %	25 %	25 %	332716017
14612	NC_015508	GCA	2	6	718374	718379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716017
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14616	NC_015508	CAGC	2	8	718581	718588	25 %	0 %	25 %	50 %	332716017
14617	NC_015508	CCA	2	6	718644	718649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332716017
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14619	NC_015508	CGC	2	6	718813	718818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716017
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14621	NC_015508	TTC	2	6	718897	718902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332716017
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14738	NC_015508	CCCT	2	8	724755	724762	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
14739	NC_015508	GCA	2	6	724820	724825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14863	NC_015508	CCG	2	6	729883	729888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716028
14864	NC_015508	ACGG	2	8	729891	729898	25 %	0 %	50 %	25 %	332716028
14865	NC_015508	CGA	2	6	729935	729940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716028
14866	NC_015508	ACG	2	6	730030	730035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716028
14867	NC_015508	CGG	2	6	730063	730068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716028
14868	NC_015508	CGA	2	6	730085	730090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716028
14869	NC_015508	TCT	2	6	730120	730125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332716028
14870	NC_015508	CGC	2	6	730139	730144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332716028
14871	NC_015508	CGA	2	6	730165	730170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716028
14872	NC_015508	ATC	2	6	730206	730211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332716028
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14874	NC_015508	GCGCA	2	10	730281	730290	20 %	0 %	40 %	40 %	332716028
14875	NC_015508	TCG	2	6	730309	730314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716028
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14877	NC_015508	GTC	2	6	730434	730439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716028
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14879	NC_015508	TGA	2	6	730612	730617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332716028
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14881	NC_015508	CTG	2	6	730740	730745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716028
14882	NC_015508	GTGGCC	2	12	730746	730757	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	332716028
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14889	NC_015508	GGC	2	6	731075	731080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716028
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14898	NC_015508	ACA	2	6	731485	731490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332716028
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14910	NC_015508	CGCA	2	8	732162	732169	25 %	0 %	25 %	50 %	332716029
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14922	NC_015508	TGAACC	2	12	732769	732780	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	332716029
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14944	NC_015508	GCG	2	6	733832	733837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14945	NC_015508	GC	3	6	733861	733866	0 %	0 %	50 %	50 %	332716031
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14951	NC_015508	GC	3	6	734064	734069	0 %	0 %	50 %	50 %	332716031
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14965	NC_015508	TTC	2	6	734595	734600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332716032
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14971	NC_015508	TCCTGT	2	12	734934	734945	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14972	NC_015508	GTT	2	6	734946	734951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14973	NC_015508	GTC	2	6	734960	734965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332716033
14974	NC_015508	TATCG	2	10	734985	734994	20 %	40 %	20 %	20 %	332716033
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14976	NC_015508	AGA	2	6	735101	735106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332716033
14977	NC_015508	GC	3	6	735108	735113	0 %	0 %	50 %	50 %	332716033
14978	NC_015508	CCCG	2	8	735177	735184	0 %	0 %	25 %	75 %	332716033
14979	NC_015508	GAT	2	6	735186	735191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332716033
14980	NC_015508	ACCGA	2	10	735208	735217	40 %	0 %	20 %	40 %	332716033
14981	NC_015508	TGA	2	6	735275	735280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332716033
14982	NC_015508	GC	3	6	735316	735321	0 %	0 %	50 %	50 %	332716033
14983	NC_015508	TTC	2	6	735327	735332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332716033
14984	NC_015508	CTCGAC	2	12	735360	735371	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	332716033
14985	NC_015508	CGG	2	6	735402	735407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332716033
14986	NC_015508	ATC	2	6	735421	735426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332716033
14987	NC_015508	ATG	2	6	735451	735456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332716033
14988	NC_015508	CAG	2	6	735483	735488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716033
14989	NC_015508	ACC	2	6	735535	735540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332716033
14990	NC_015508	GAA	2	6	735552	735557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332716033
14991	NC_015508	GCA	2	6	735571	735576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332716033
14992	NC_015508	ATC	2	6	735579	735584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332716033
14993	NC_015508	AGGA	2	8	735637	735644	50 %	0 %	50 %	0 %	332716033
14994	NC_015508	AAC	2	6	735748	735753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14995	NC_015508	ACG	2	6	735763	735768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14996	NC_015508	TGC	2	6	735887	735892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14997	NC_015508	CGC	2	6	735922	735927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14998	NC_015508	CCTG	2	8	735932	735939	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14999	NC_015508	TGA	2	6	736021	736026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332716034
15000	NC_015508	GCCG	2	8	736048	736055	0 %	0 %	50 %	50 %	332716034

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