MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome linear

Total Repeats: 45192

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_015508	GAG	2	6	617892	617897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332715926
12502	NC_015508	CGA	2	6	617921	617926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715926
12503	NC_015508	AGCC	2	8	617958	617965	25 %	0 %	25 %	50 %	332715926
12504	NC_015508	CGA	2	6	618052	618057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715926
12505	NC_015508	CGA	2	6	618074	618079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715926
12506	NC_015508	GAA	2	6	618205	618210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715926
12507	NC_015508	CTG	2	6	618232	618237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715927
12508	NC_015508	CTG	2	6	618309	618314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715927
12509	NC_015508	GAT	2	6	618326	618331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715927
12510	NC_015508	CGG	2	6	618403	618408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715927
12511	NC_015508	TCA	2	6	618415	618420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715927
12512	NC_015508	CTG	2	6	618425	618430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715927
12513	NC_015508	CAT	2	6	618458	618463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715927
12514	NC_015508	GAA	3	9	618467	618475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715927
12515	NC_015508	GAA	2	6	618480	618485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715927
12516	NC_015508	CG	3	6	618552	618557	0 %	0 %	50 %	50 %	332715927
12517	NC_015508	CGG	2	6	618577	618582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715927
12518	NC_015508	CCT	2	6	618625	618630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715927
12519	NC_015508	GAA	2	6	618676	618681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715927
12520	NC_015508	CGA	2	6	618682	618687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715927
12521	NC_015508	GCC	2	6	618705	618710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715927
12522	NC_015508	CGG	2	6	618712	618717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715927
12523	NC_015508	CTG	2	6	618791	618796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12524	NC_015508	GGCAA	2	10	618838	618847	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
12525	NC_015508	CCT	2	6	618898	618903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12526	NC_015508	GGC	2	6	618910	618915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12527	NC_015508	TTC	3	9	619059	619067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715928
12528	NC_015508	GCGA	2	8	619074	619081	25 %	0 %	50 %	25 %	332715928
12529	NC_015508	GCA	2	6	619095	619100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715928
12530	NC_015508	TCG	2	6	619164	619169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715928
12531	NC_015508	CGA	2	6	619300	619305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715928
12532	NC_015508	GCA	2	6	619356	619361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715928
12533	NC_015508	GAA	2	6	619373	619378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715928
12534	NC_015508	CCG	2	6	619668	619673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715928
12535	NC_015508	GCT	2	6	619678	619683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715928
12536	NC_015508	CGCC	2	8	619687	619694	0 %	0 %	25 %	75 %	332715928
12537	NC_015508	CGC	2	6	619702	619707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715928
12538	NC_015508	TTG	2	6	619782	619787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332715928
12539	NC_015508	CGAT	2	8	619852	619859	25 %	25 %	25 %	25 %	332715928
12540	NC_015508	TGG	2	6	619870	619875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715928
12541	NC_015508	AGCC	2	8	619883	619890	25 %	0 %	25 %	50 %	332715928
12542	NC_015508	TCC	2	6	619917	619922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12543	NC_015508	GTT	2	6	619924	619929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12544	NC_015508	TCC	2	6	619952	619957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715929
12545	NC_015508	CCT	2	6	620050	620055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715929
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12547	NC_015508	CCA	2	6	620158	620163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715929
12548	NC_015508	C	6	6	620244	620249	0 %	0 %	0 %	100 %	332715929
12549	NC_015508	GAG	2	6	620375	620380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332715929
12550	NC_015508	GCT	2	6	620404	620409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715929
12551	NC_015508	CCG	2	6	620412	620417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715929
12552	NC_015508	ATG	2	6	620421	620426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715929
12553	NC_015508	GCC	2	6	620502	620507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715929
12554	NC_015508	TGGAA	2	10	620534	620543	40 %	20 %	40 %	0 %	332715929
12555	NC_015508	TCA	2	6	620545	620550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715929
12556	NC_015508	CAG	2	6	620552	620557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715929
12557	NC_015508	TGG	2	6	620575	620580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715929
12558	NC_015508	TCG	2	6	620610	620615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715929
12559	NC_015508	TCGGCT	2	12	620652	620663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715929
12560	NC_015508	GCC	2	6	620703	620708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715929
12561	NC_015508	CGC	2	6	620772	620777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715929
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12571	NC_015508	CGGA	2	8	621190	621197	25 %	0 %	50 %	25 %	332715931
12572	NC_015508	CAC	2	6	621226	621231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715931
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12585	NC_015508	CCG	2	6	621831	621836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715931
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12590	NC_015508	GC	4	8	622192	622199	0 %	0 %	50 %	50 %	332715931
12591	NC_015508	CAGC	2	8	622200	622207	25 %	0 %	25 %	50 %	332715931
12592	NC_015508	CGC	2	6	622242	622247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715931
12593	NC_015508	GTTC	2	8	622257	622264	0 %	50 %	25 %	25 %	332715931
12594	NC_015508	GTCA	2	8	622270	622277	25 %	25 %	25 %	25 %	332715931
12595	NC_015508	TCG	2	6	622314	622319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715931
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12598	NC_015508	GC	3	6	622496	622501	0 %	0 %	50 %	50 %	332715931
12599	NC_015508	AGA	2	6	622508	622513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715931
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12601	NC_015508	CA	3	6	622668	622673	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12602	NC_015508	GCA	2	6	622804	622809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715932
12603	NC_015508	GAG	2	6	622823	622828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332715932
12604	NC_015508	CGTGT	2	10	622845	622854	0 %	40 %	40 %	20 %	332715932
12605	NC_015508	CCT	2	6	622861	622866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715932
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12607	NC_015508	TCGA	2	8	622890	622897	25 %	25 %	25 %	25 %	332715932
12608	NC_015508	CGG	2	6	622940	622945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715932
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12611	NC_015508	TGCCC	2	10	623100	623109	0 %	20 %	20 %	60 %	332715932
12612	NC_015508	TCA	2	6	623130	623135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715932
12613	NC_015508	CCT	2	6	623215	623220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715932
12614	NC_015508	GCG	2	6	623231	623236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715932
12615	NC_015508	GCG	2	6	623241	623246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715932
12616	NC_015508	GAA	2	6	623270	623275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715932
12617	NC_015508	GGC	2	6	623280	623285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715932
12618	NC_015508	CCA	2	6	623308	623313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715932
12619	NC_015508	CGA	2	6	623344	623349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715932
12620	NC_015508	TCG	2	6	623361	623366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715932
12621	NC_015508	GCC	2	6	623400	623405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715932
12622	NC_015508	GCT	2	6	623407	623412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715932
12623	NC_015508	GAGCG	2	10	623441	623450	20 %	0 %	60 %	20 %	332715932
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12625	NC_015508	GAC	2	6	623523	623528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715932
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12627	NC_015508	GAT	2	6	623627	623632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715932
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12673	NC_015508	GA	3	6	625847	625852	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12674	NC_015508	GCG	2	6	625913	625918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12675	NC_015508	GCC	2	6	625939	625944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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12712	NC_015508	A	6	6	627390	627395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12713	NC_015508	AT	3	6	627421	627426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12717	NC_015508	CAA	2	6	627501	627506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12718	NC_015508	ATC	2	6	627511	627516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12719	NC_015508	A	6	6	627517	627522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12720	NC_015508	CG	3	6	627531	627536	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12721	NC_015508	GGA	2	6	627621	627626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332715936
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12738	NC_015508	GCCA	2	8	628357	628364	25 %	0 %	25 %	50 %	332715936
12739	NC_015508	CCGGCG	2	12	628427	628438	0 %	0 %	50 %	50 %	332715936
12740	NC_015508	GCC	3	9	628466	628474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715936
12741	NC_015508	GCAT	2	8	628478	628485	25 %	25 %	25 %	25 %	332715936
12742	NC_015508	GC	3	6	628520	628525	0 %	0 %	50 %	50 %	332715936
12743	NC_015508	GGA	2	6	628605	628610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332715936
12744	NC_015508	CGC	3	9	628640	628648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715937
12745	NC_015508	GC	3	6	628647	628652	0 %	0 %	50 %	50 %	332715937
12746	NC_015508	TCTGC	2	10	628684	628693	0 %	40 %	20 %	40 %	332715937
12747	NC_015508	GC	3	6	628709	628714	0 %	0 %	50 %	50 %	332715937
12748	NC_015508	CCG	2	6	628721	628726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715937
12749	NC_015508	CGC	2	6	628727	628732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715937
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12753	NC_015508	GAA	2	6	628848	628853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715937
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12769	NC_015508	CTG	2	6	629763	629768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715937
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12771	NC_015508	CGC	2	6	629834	629839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715937
12772	NC_015508	GCG	2	6	629868	629873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715937
12773	NC_015508	GCT	2	6	629887	629892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715937
12774	NC_015508	CGG	2	6	629924	629929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12775	NC_015508	TGC	2	6	630018	630023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715938
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12779	NC_015508	GCG	2	6	630195	630200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715938
12780	NC_015508	CGG	2	6	630220	630225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715938
12781	NC_015508	ATTGCG	2	12	630227	630238	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	332715938
12782	NC_015508	CAT	2	6	630280	630285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715938
12783	NC_015508	ATC	2	6	630287	630292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715938
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12792	NC_015508	GATG	2	8	630535	630542	25 %	25 %	50 %	0 %	332715938
12793	NC_015508	TCA	2	6	630552	630557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715938
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12815	NC_015508	GCT	2	6	631444	631449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715939
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12842	NC_015508	TCC	2	6	632544	632549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715940
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12846	NC_015508	GAT	2	6	632844	632849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715941
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12851	NC_015508	CCCG	2	8	633029	633036	0 %	0 %	25 %	75 %	332715941
12852	NC_015508	CGA	2	6	633083	633088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715941
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12854	NC_015508	CGA	2	6	633158	633163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715941
12855	NC_015508	GCAT	2	8	633232	633239	25 %	25 %	25 %	25 %	332715941
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12857	NC_015508	CCG	2	6	633364	633369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715941
12858	NC_015508	GCC	2	6	633436	633441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715941
12859	NC_015508	TGC	2	6	633458	633463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715941
12860	NC_015508	GGCGCA	2	12	633464	633475	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	332715941
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12900	NC_015508	CG	3	6	635672	635677	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12901	NC_015508	CG	3	6	635689	635694	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12902	NC_015508	CTG	2	6	635730	635735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715944
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12923	NC_015508	CGG	2	6	636743	636748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715944
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12926	NC_015508	TCA	2	6	636926	636931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715944
12927	NC_015508	TGC	3	9	636945	636953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715944
12928	NC_015508	T	6	6	636960	636965	0 %	100 %	0 %	0 %	332715944
12929	NC_015508	GTC	2	6	636986	636991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12932	NC_015508	CAC	2	6	637147	637152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715945
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12934	NC_015508	CCTT	2	8	637244	637251	0 %	50 %	0 %	50 %	332715945
12935	NC_015508	GGC	2	6	637292	637297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715945
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12942	NC_015508	GCT	2	6	637599	637604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715945
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12963	NC_015508	TCA	2	6	638573	638578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715946
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12967	NC_015508	CTCG	2	8	638759	638766	0 %	25 %	25 %	50 %	332715946
12968	NC_015508	GCC	2	6	638821	638826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715946
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12970	NC_015508	A	6	6	639121	639126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12971	NC_015508	TCC	2	6	639131	639136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12972	NC_015508	TCT	2	6	639286	639291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715947
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12974	NC_015508	TGT	2	6	639326	639331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332715947
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12976	NC_015508	CGA	2	6	639464	639469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715947
12977	NC_015508	TGATC	2	10	639494	639503	20 %	40 %	20 %	20 %	332715947
12978	NC_015508	CGG	2	6	639521	639526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715947
12979	NC_015508	CAT	2	6	639605	639610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715947
12980	NC_015508	TGA	2	6	639617	639622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715947
12981	NC_015508	CGG	2	6	639636	639641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715947
12982	NC_015508	GCG	2	6	639646	639651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715947
12983	NC_015508	TTC	2	6	639766	639771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715947
12984	NC_015508	AT	3	6	639774	639779	50 %	50 %	0 %	0 %	332715947
12985	NC_015508	TTGA	2	8	639790	639797	25 %	50 %	25 %	0 %	332715947
12986	NC_015508	GGCT	2	8	639909	639916	0 %	25 %	50 %	25 %	332715947
12987	NC_015508	CCA	2	6	639956	639961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715947
12988	NC_015508	ACGGCA	2	12	640051	640062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715947
12989	NC_015508	CGA	2	6	640106	640111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715947
12990	NC_015508	GTG	2	6	640114	640119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715947
12991	NC_015508	GCC	2	6	640134	640139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715947
12992	NC_015508	TTC	2	6	640144	640149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715947
12993	NC_015508	GA	3	6	640231	640236	50 %	0 %	50 %	0 %	332715947
12994	NC_015508	T	6	6	640287	640292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12995	NC_015508	GAC	2	6	640319	640324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715948
12996	NC_015508	CGA	3	9	640361	640369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715948
12997	NC_015508	GGACA	2	10	640371	640380	40 %	0 %	40 %	20 %	332715948
12998	NC_015508	GAT	2	6	640401	640406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715948
12999	NC_015508	ATGCCG	2	12	640468	640479	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	332715948
13000	NC_015508	GGC	2	6	640527	640532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715948

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