MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome linear

Total Repeats: 45192

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_015508	CGGCA	2	10	548994	549003	20 %	0 %	40 %	40 %	332715853
11002	NC_015508	CGA	2	6	549015	549020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715853
11003	NC_015508	CCTG	2	8	549078	549085	0 %	25 %	25 %	50 %	332715853
11004	NC_015508	ATC	2	6	549176	549181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715853
11005	NC_015508	T	6	6	549207	549212	0 %	100 %	0 %	0 %	332715853
11006	NC_015508	CGCC	2	8	549266	549273	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11007	NC_015508	TAT	2	6	549368	549373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332715854
11008	NC_015508	CGC	2	6	549390	549395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715854
11009	NC_015508	GCA	2	6	549429	549434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715854
11010	NC_015508	GC	3	6	549451	549456	0 %	0 %	50 %	50 %	332715854
11011	NC_015508	CTG	2	6	549481	549486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715854
11012	NC_015508	CTC	2	6	549512	549517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715854
11013	NC_015508	AC	3	6	549518	549523	50 %	0 %	0 %	50 %	332715854
11014	NC_015508	GCT	2	6	549524	549529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715854
11015	NC_015508	GGCT	2	8	549543	549550	0 %	25 %	50 %	25 %	332715854
11016	NC_015508	CAA	2	6	549608	549613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332715854
11017	NC_015508	GCA	2	6	549660	549665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715854
11018	NC_015508	TTC	2	6	549734	549739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715854
11019	NC_015508	CAT	2	6	549740	549745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715854
11020	NC_015508	CCT	2	6	549836	549841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715854
11021	NC_015508	TCGA	2	8	549867	549874	25 %	25 %	25 %	25 %	332715854
11022	NC_015508	GCA	2	6	549896	549901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715854
11023	NC_015508	CAG	2	6	549924	549929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715854
11024	NC_015508	CA	4	8	549961	549968	50 %	0 %	0 %	50 %	332715854
11025	NC_015508	GAG	2	6	550047	550052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332715854
11026	NC_015508	CCT	2	6	550085	550090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715854
11027	NC_015508	AAC	2	6	550128	550133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332715854
11028	NC_015508	CTG	2	6	550239	550244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715854
11029	NC_015508	CGA	2	6	550277	550282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715854
11030	NC_015508	TGC	2	6	550285	550290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715854
11031	NC_015508	TCG	2	6	550320	550325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715854
11032	NC_015508	GATC	2	8	550328	550335	25 %	25 %	25 %	25 %	332715854
11033	NC_015508	CG	3	6	550377	550382	0 %	0 %	50 %	50 %	332715855
11034	NC_015508	AAC	2	6	550410	550415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332715855
11035	NC_015508	GCGCG	2	10	550474	550483	0 %	0 %	60 %	40 %	332715855
11036	NC_015508	TTG	2	6	550502	550507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332715855
11037	NC_015508	CTG	2	6	550508	550513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715855
11038	NC_015508	TGC	2	6	550551	550556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715855
11039	NC_015508	CGC	2	6	550557	550562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715855
11040	NC_015508	CTT	2	6	550667	550672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715855
11041	NC_015508	TCG	3	9	550677	550685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715855
11042	NC_015508	GCC	2	6	550709	550714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715855
11043	NC_015508	CG	3	6	550748	550753	0 %	0 %	50 %	50 %	332715855
11044	NC_015508	GCT	2	6	550777	550782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715855
11045	NC_015508	GAT	2	6	550783	550788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715855
11046	NC_015508	TGG	2	6	550896	550901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715855
11047	NC_015508	CCT	2	6	550962	550967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715855
11048	NC_015508	CTGGC	2	10	551006	551015	0 %	20 %	40 %	40 %	332715855
11049	NC_015508	GGC	2	6	551041	551046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715855
11050	NC_015508	CCCGA	2	10	551091	551100	20 %	0 %	20 %	60 %	332715855
11051	NC_015508	TGA	2	6	551106	551111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715855
11052	NC_015508	AGG	2	6	551215	551220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332715855
11053	NC_015508	GCG	2	6	551320	551325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715856
11054	NC_015508	TTC	2	6	551327	551332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715856
11055	NC_015508	TGC	2	6	551363	551368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715856
11056	NC_015508	CGC	2	6	551373	551378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715856
11057	NC_015508	CAG	2	6	551416	551421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715856
11058	NC_015508	CGGC	2	8	551522	551529	0 %	0 %	50 %	50 %	332715856
11059	NC_015508	ATG	2	6	551537	551542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715856
11060	NC_015508	GGC	2	6	551617	551622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715856
11061	NC_015508	TGC	2	6	551675	551680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715856
11062	NC_015508	CGA	2	6	551682	551687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715856
11063	NC_015508	TCG	2	6	551747	551752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715856
11064	NC_015508	TCCT	2	8	551767	551774	0 %	50 %	0 %	50 %	332715856
11065	NC_015508	ATG	2	6	551827	551832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715856
11066	NC_015508	CAG	2	6	551854	551859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715856
11067	NC_015508	CCGCGC	2	12	551878	551889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715856
11068	NC_015508	CGC	2	6	551900	551905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715856
11069	NC_015508	CGC	2	6	551982	551987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11070	NC_015508	ATG	2	6	552015	552020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715857
11071	NC_015508	CGA	2	6	552055	552060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715857
11072	NC_015508	GCC	2	6	552072	552077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715857
11073	NC_015508	TCA	2	6	552154	552159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715857
11074	NC_015508	TGA	2	6	552172	552177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715857
11075	NC_015508	AGA	2	6	552190	552195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715857
11076	NC_015508	CGC	2	6	552289	552294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715857
11077	NC_015508	ACC	2	6	552306	552311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715857
11078	NC_015508	GAA	2	6	552341	552346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715857
11079	NC_015508	GAT	2	6	552359	552364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715857
11080	NC_015508	GAT	2	6	552392	552397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715857
11081	NC_015508	GCCC	2	8	552398	552405	0 %	0 %	25 %	75 %	332715857
11082	NC_015508	TGA	2	6	552412	552417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715857
11083	NC_015508	TTC	2	6	552426	552431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715857
11084	NC_015508	ATG	2	6	552558	552563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715857
11085	NC_015508	TCA	2	6	552666	552671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715857
11086	NC_015508	ACG	2	6	552715	552720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715857
11087	NC_015508	TGC	2	6	552758	552763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715857
11088	NC_015508	CAG	2	6	552773	552778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715857
11089	NC_015508	GAC	2	6	552785	552790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715857
11090	NC_015508	TCC	2	6	552822	552827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715858
11091	NC_015508	AACTGG	2	12	552839	552850	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	332715858
11092	NC_015508	CCG	3	9	552977	552985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715858
11093	NC_015508	AGG	2	6	552989	552994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332715858
11094	NC_015508	TCGG	2	8	553136	553143	0 %	25 %	50 %	25 %	332715858
11095	NC_015508	CCA	2	6	553192	553197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715858
11096	NC_015508	GAC	2	6	553204	553209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715858
11097	NC_015508	GTT	2	6	553442	553447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332715858
11098	NC_015508	CAC	2	6	553450	553455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715858
11099	NC_015508	CAG	2	6	553459	553464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715858
11100	NC_015508	GCG	2	6	553563	553568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715858
11101	NC_015508	ATC	2	6	553589	553594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715858
11102	NC_015508	AAAG	2	8	553608	553615	75 %	0 %	25 %	0 %	332715858
11103	NC_015508	CTT	2	6	553669	553674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715858
11104	NC_015508	CGC	2	6	553816	553821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715859
11105	NC_015508	GAT	2	6	553847	553852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715859
11106	NC_015508	GCC	2	6	553917	553922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715859
11107	NC_015508	TCCA	2	8	554037	554044	25 %	25 %	0 %	50 %	332715859
11108	NC_015508	GCG	2	6	554064	554069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715859
11109	NC_015508	GC	3	6	554139	554144	0 %	0 %	50 %	50 %	332715859
11110	NC_015508	AG	3	6	554272	554277	50 %	0 %	50 %	0 %	332715859
11111	NC_015508	ATCG	2	8	554342	554349	25 %	25 %	25 %	25 %	332715859
11112	NC_015508	CGC	2	6	554407	554412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715859
11113	NC_015508	TGT	2	6	554415	554420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332715859
11114	NC_015508	TCC	2	6	554529	554534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715859
11115	NC_015508	AGA	2	6	554589	554594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715859
11116	NC_015508	TGC	2	6	554663	554668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715859
11117	NC_015508	TCA	2	6	554712	554717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715859
11118	NC_015508	TCA	2	6	554751	554756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715859
11119	NC_015508	GCG	2	6	554764	554769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715859
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11225	NC_015508	CCGC	2	8	560155	560162	0 %	0 %	25 %	75 %	332715863
11226	NC_015508	CGC	3	9	560160	560168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715863
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11229	NC_015508	ATT	2	6	560284	560289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11230	NC_015508	CAT	2	6	560301	560306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11231	NC_015508	T	6	6	560314	560319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11232	NC_015508	GCC	2	6	560360	560365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715864
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11234	NC_015508	CCAG	2	8	560513	560520	25 %	0 %	25 %	50 %	332715864
11235	NC_015508	CGG	2	6	560523	560528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715864
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11238	NC_015508	CAGA	2	8	560638	560645	50 %	0 %	25 %	25 %	332715864
11239	NC_015508	GCT	2	6	560667	560672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715864
11240	NC_015508	CGA	2	6	560688	560693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715864
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11242	NC_015508	TGC	2	6	560786	560791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715864
11243	NC_015508	GAT	2	6	560823	560828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715864
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11245	NC_015508	CG	3	6	560874	560879	0 %	0 %	50 %	50 %	332715864
11246	NC_015508	GCT	2	6	560883	560888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715864
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11258	NC_015508	GGC	2	6	561384	561389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715864
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11292	NC_015508	GGC	3	9	563248	563256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715865
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11297	NC_015508	GA	3	6	563428	563433	50 %	0 %	50 %	0 %	332715866
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11324	NC_015508	CGG	2	6	565088	565093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11325	NC_015508	CCAG	2	8	565156	565163	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11326	NC_015508	TGAT	2	8	565179	565186	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11327	NC_015508	CGC	2	6	565192	565197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11328	NC_015508	TCC	2	6	565252	565257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11329	NC_015508	C	6	6	565256	565261	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11330	NC_015508	CGC	2	6	565280	565285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715868
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11344	NC_015508	CGA	2	6	566241	566246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715868
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11347	NC_015508	TGC	2	6	566337	566342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715868
11348	NC_015508	GGT	2	6	566453	566458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715869
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11352	NC_015508	AGAT	2	8	566622	566629	50 %	25 %	25 %	0 %	332715869
11353	NC_015508	GAA	2	6	566639	566644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715869
11354	NC_015508	AG	4	8	566697	566704	50 %	0 %	50 %	0 %	332715869
11355	NC_015508	GCA	2	6	566707	566712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715869
11356	NC_015508	GAA	2	6	566789	566794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715869
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11358	NC_015508	ACCCA	2	10	566868	566877	40 %	0 %	0 %	60 %	332715869
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11360	NC_015508	GCA	2	6	566923	566928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715869
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11479	NC_015508	GGC	2	6	571372	571377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715873
11480	NC_015508	CGA	2	6	571422	571427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715873
11481	NC_015508	GCACC	2	10	571497	571506	20 %	0 %	20 %	60 %	332715873
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11483	NC_015508	GGAA	2	8	571721	571728	50 %	0 %	50 %	0 %	332715873
11484	NC_015508	CGC	2	6	571729	571734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715873
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