MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome linear

Total Repeats: 45192

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_015508	AGA	2	6	524919	524924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715832
10502	NC_015508	GCC	2	6	524955	524960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715832
10503	NC_015508	GCA	2	6	524971	524976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715832
10504	NC_015508	TTC	2	6	524988	524993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715832
10505	NC_015508	ATC	2	6	524994	524999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715832
10506	NC_015508	CCG	2	6	525021	525026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715832
10507	NC_015508	TGC	2	6	525079	525084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715832
10508	NC_015508	GCCA	2	8	525136	525143	25 %	0 %	25 %	50 %	332715832
10509	NC_015508	CG	3	6	525157	525162	0 %	0 %	50 %	50 %	332715832
10510	NC_015508	CAC	2	6	525251	525256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715832
10511	NC_015508	AGC	2	6	525273	525278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715832
10512	NC_015508	GC	3	6	525316	525321	0 %	0 %	50 %	50 %	332715832
10513	NC_015508	GAT	2	6	525371	525376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715832
10514	NC_015508	TGG	3	9	525427	525435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715832
10515	NC_015508	GGC	2	6	525503	525508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715832
10516	NC_015508	GAC	2	6	525623	525628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715832
10517	NC_015508	T	7	7	525744	525750	0 %	100 %	0 %	0 %	332715832
10518	NC_015508	CTG	2	6	525792	525797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10519	NC_015508	AG	3	6	525810	525815	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10520	NC_015508	CGA	2	6	525882	525887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715833
10521	NC_015508	CAG	2	6	525921	525926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715833
10522	NC_015508	GAAC	2	8	525950	525957	50 %	0 %	25 %	25 %	332715833
10523	NC_015508	GAT	2	6	526007	526012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715833
10524	NC_015508	TCG	2	6	526053	526058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715833
10525	NC_015508	GGC	2	6	526088	526093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715833
10526	NC_015508	CAAGGC	2	12	526198	526209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715833
10527	NC_015508	CGC	2	6	526210	526215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715833
10528	NC_015508	CCTT	2	8	526230	526237	0 %	50 %	0 %	50 %	332715833
10529	NC_015508	CGG	2	6	526276	526281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715833
10530	NC_015508	CGG	2	6	526285	526290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715833
10531	NC_015508	CTT	2	6	526382	526387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715833
10532	NC_015508	TGA	2	6	526393	526398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715833
10533	NC_015508	TCC	2	6	526422	526427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715833
10534	NC_015508	ATC	2	6	526479	526484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715833
10535	NC_015508	ATG	2	6	526494	526499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715833
10536	NC_015508	CGA	2	6	526582	526587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715833
10537	NC_015508	TCG	2	6	526624	526629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715833
10538	NC_015508	AAT	2	6	526642	526647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332715833
10539	NC_015508	CTT	2	6	526667	526672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715833
10540	NC_015508	CGA	2	6	526687	526692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715833
10541	NC_015508	ACCG	2	8	526694	526701	25 %	0 %	25 %	50 %	332715833
10542	NC_015508	ACG	2	6	526725	526730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715833
10543	NC_015508	CTT	2	6	526790	526795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715833
10544	NC_015508	CGCC	2	8	526816	526823	0 %	0 %	25 %	75 %	332715833
10545	NC_015508	CTT	2	6	526832	526837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715833
10546	NC_015508	GCG	2	6	527079	527084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715833
10547	NC_015508	CGG	2	6	527106	527111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715833
10548	NC_015508	TTG	2	6	527121	527126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332715833
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10550	NC_015508	AAACCG	2	12	527370	527381	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	332715834
10551	NC_015508	CGGT	2	8	527409	527416	0 %	25 %	50 %	25 %	332715834
10552	NC_015508	CGC	2	6	527455	527460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715834
10553	NC_015508	GCC	3	9	527474	527482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715834
10554	NC_015508	CCGG	2	8	527525	527532	0 %	0 %	50 %	50 %	332715834
10555	NC_015508	CGA	2	6	527563	527568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10556	NC_015508	GC	3	6	527607	527612	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10557	NC_015508	GCT	3	9	527628	527636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10558	NC_015508	CCG	2	6	527639	527644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10559	NC_015508	GCA	2	6	527694	527699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10560	NC_015508	GGCGC	2	10	527713	527722	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
10561	NC_015508	CGA	2	6	527769	527774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10562	NC_015508	CAT	2	6	527809	527814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10563	NC_015508	TGCCG	2	10	527815	527824	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10564	NC_015508	GGCG	2	8	527830	527837	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10565	NC_015508	GAC	2	6	527848	527853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10566	NC_015508	CGC	2	6	527874	527879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715835
10567	NC_015508	GCAG	2	8	527946	527953	25 %	0 %	50 %	25 %	332715835
10568	NC_015508	CCG	2	6	527964	527969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715835
10569	NC_015508	GGT	2	6	527998	528003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715835
10570	NC_015508	TGC	2	6	528040	528045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715835
10571	NC_015508	CGAC	2	8	528220	528227	25 %	0 %	25 %	50 %	332715835
10572	NC_015508	ACT	2	6	528278	528283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715835
10573	NC_015508	ACACA	2	10	528309	528318	60 %	0 %	0 %	40 %	332715835
10574	NC_015508	ACGC	2	8	528332	528339	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10575	NC_015508	CGG	2	6	528431	528436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715836
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10577	NC_015508	TTCAT	2	10	528501	528510	20 %	60 %	0 %	20 %	332715836
10578	NC_015508	CAG	2	6	528521	528526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715836
10579	NC_015508	CCTT	2	8	528534	528541	0 %	50 %	0 %	50 %	332715836
10580	NC_015508	ACG	2	6	528555	528560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715836
10581	NC_015508	GCT	3	9	528661	528669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715836
10582	NC_015508	GCC	2	6	528671	528676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715836
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10584	NC_015508	CAC	2	6	528776	528781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715836
10585	NC_015508	GCC	2	6	528803	528808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715836
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10588	NC_015508	CTGG	2	8	529116	529123	0 %	25 %	50 %	25 %	332715837
10589	NC_015508	CAG	2	6	529138	529143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715837
10590	NC_015508	GAT	2	6	529242	529247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715837
10591	NC_015508	GAC	2	6	529269	529274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715837
10592	NC_015508	ACCG	2	8	529287	529294	25 %	0 %	25 %	50 %	332715837
10593	NC_015508	GGC	2	6	529352	529357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715837
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10598	NC_015508	GCA	2	6	529576	529581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715837
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10601	NC_015508	GCC	2	6	529737	529742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715838
10602	NC_015508	CTC	2	6	529743	529748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715838
10603	NC_015508	AAAG	2	8	529753	529760	75 %	0 %	25 %	0 %	332715838
10604	NC_015508	AGC	2	6	529800	529805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715838
10605	NC_015508	CGC	2	6	529871	529876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715838
10606	NC_015508	AGGTC	2	10	529879	529888	20 %	20 %	40 %	20 %	332715838
10607	NC_015508	ACG	2	6	529908	529913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715838
10608	NC_015508	GCCGA	2	10	529914	529923	20 %	0 %	40 %	40 %	332715838
10609	NC_015508	CAC	2	6	529934	529939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715838
10610	NC_015508	CAC	2	6	529985	529990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715838
10611	NC_015508	CGCC	2	8	530029	530036	0 %	0 %	25 %	75 %	332715838
10612	NC_015508	GAT	2	6	530075	530080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715838
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10615	NC_015508	AGA	2	6	530170	530175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715838
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10618	NC_015508	CAGGCG	2	12	530271	530282	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	332715838
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10620	NC_015508	CGG	2	6	530441	530446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10621	NC_015508	GAT	2	6	530469	530474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715839
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10623	NC_015508	TTG	2	6	530592	530597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332715839
10624	NC_015508	TGA	2	6	530623	530628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715839
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10727	NC_015508	CTC	2	6	535191	535196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10728	NC_015508	GCCG	2	8	535257	535264	0 %	0 %	50 %	50 %	332715843
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10982	NC_015508	ATC	2	6	547542	547547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10983	NC_015508	CAC	2	6	547640	547645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10984	NC_015508	ATGA	2	8	547721	547728	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10985	NC_015508	GCC	2	6	547787	547792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10986	NC_015508	TCG	2	6	547803	547808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10987	NC_015508	GGC	2	6	547839	547844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10988	NC_015508	GACA	2	8	547846	547853	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10989	NC_015508	ATC	2	6	548066	548071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715853
10990	NC_015508	CGC	2	6	548157	548162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715853
10991	NC_015508	GCG	2	6	548229	548234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715853
10992	NC_015508	CAC	2	6	548286	548291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715853
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10994	NC_015508	ACG	2	6	548375	548380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715853
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10998	NC_015508	GCG	2	6	548632	548637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715853
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