MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Archaeoglobus veneficus SNP6 chromosome

Total Repeats: 39036

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_015320	GGGC	2	8	679924	679931	0 %	0 %	75 %	25 %	327400687
14002	NC_015320	AAGA	2	8	679951	679958	75 %	0 %	25 %	0 %	327400687
14003	NC_015320	CGA	2	6	679999	680004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327400687
14004	NC_015320	TCG	2	6	680013	680018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327400687
14005	NC_015320	CAG	2	6	680073	680078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327400687
14006	NC_015320	GA	3	6	680295	680300	50 %	0 %	50 %	0 %	327400687
14007	NC_015320	TGG	2	6	680368	680373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327400687
14008	NC_015320	TAA	2	6	680406	680411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327400687
14009	NC_015320	GAA	2	6	680416	680421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327400687
14010	NC_015320	GGA	2	6	680501	680506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327400687
14011	NC_015320	GAG	2	6	680524	680529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327400687
14012	NC_015320	TCG	2	6	680544	680549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327400687
14013	NC_015320	GCT	2	6	680587	680592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327400687
14014	NC_015320	CGA	2	6	680644	680649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327400687
14015	NC_015320	AAC	2	6	680837	680842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327400687
14016	NC_015320	GCTG	2	8	680855	680862	0 %	25 %	50 %	25 %	327400687
14017	NC_015320	GTA	3	9	681053	681061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327400687
14018	NC_015320	CATA	2	8	681081	681088	50 %	25 %	0 %	25 %	327400687
14019	NC_015320	AGCA	2	8	681098	681105	50 %	0 %	25 %	25 %	327400687
14020	NC_015320	AGC	2	6	681169	681174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327400687
14021	NC_015320	AGG	2	6	681188	681193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327400687
14022	NC_015320	GAA	2	6	681208	681213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327400687
14023	NC_015320	GAC	2	6	681299	681304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327400687
14024	NC_015320	GA	3	6	681359	681364	50 %	0 %	50 %	0 %	327400687
14025	NC_015320	TCC	2	6	681525	681530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327400688
14026	NC_015320	CGTT	2	8	681559	681566	0 %	50 %	25 %	25 %	327400688
14027	NC_015320	TCA	3	9	681570	681578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327400688
14028	NC_015320	CAA	2	6	681790	681795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327400688
14029	NC_015320	T	6	6	681809	681814	0 %	100 %	0 %	0 %	327400688
14030	NC_015320	GGT	2	6	681854	681859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327400688
14031	NC_015320	TG	4	8	681860	681867	0 %	50 %	50 %	0 %	327400688
14032	NC_015320	CGCTG	2	10	681886	681895	0 %	20 %	40 %	40 %	327400688
14033	NC_015320	TCC	2	6	681998	682003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327400688
14034	NC_015320	ACG	2	6	682017	682022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327400688
14035	NC_015320	GCA	3	9	682077	682085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327400688
14036	NC_015320	CATG	2	8	682169	682176	25 %	25 %	25 %	25 %	327400688
14037	NC_015320	GAGC	2	8	682258	682265	25 %	0 %	50 %	25 %	327400688
14038	NC_015320	TTC	2	6	682268	682273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327400688
14039	NC_015320	CGCTA	2	10	682286	682295	20 %	20 %	20 %	40 %	327400688
14040	NC_015320	CCT	2	6	682331	682336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327400689
14041	NC_015320	CTT	2	6	682342	682347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327400689
14042	NC_015320	CAA	2	6	682356	682361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327400689
14043	NC_015320	TCC	2	6	682393	682398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327400689
14044	NC_015320	ACG	2	6	682406	682411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327400689
14045	NC_015320	CAC	3	9	682510	682518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327400689
14046	NC_015320	TCA	2	6	682550	682555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327400689
14047	NC_015320	CCT	2	6	682617	682622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327400689
14048	NC_015320	CCAT	2	8	682670	682677	25 %	25 %	0 %	50 %	327400689
14049	NC_015320	TTC	2	6	682710	682715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327400689
14050	NC_015320	CT	3	6	682732	682737	0 %	50 %	0 %	50 %	327400689
14051	NC_015320	CTG	2	6	682780	682785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327400689
14052	NC_015320	CGG	2	6	682876	682881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327400689
14053	NC_015320	CCAT	2	8	682949	682956	25 %	25 %	0 %	50 %	327400689
14054	NC_015320	ATC	2	6	682961	682966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327400689
14055	NC_015320	GCA	2	6	682971	682976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327400689
14056	NC_015320	GCT	2	6	682984	682989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327400689
14057	NC_015320	ACC	2	6	683147	683152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327400689
14058	NC_015320	GCA	2	6	683375	683380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327400689
14059	NC_015320	ACG	2	6	683438	683443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327400689
14060	NC_015320	AACCTC	2	12	683454	683465	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	327400690
14061	NC_015320	AGT	2	6	683519	683524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327400690
14062	NC_015320	GAA	2	6	683538	683543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327400690
14063	NC_015320	CTC	2	6	683547	683552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327400690
14064	NC_015320	CAG	2	6	683587	683592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327400690
14065	NC_015320	TTC	2	6	683668	683673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327400690
14066	NC_015320	TC	3	6	683672	683677	0 %	50 %	0 %	50 %	327400690
14067	NC_015320	CT	3	6	683695	683700	0 %	50 %	0 %	50 %	327400690
14068	NC_015320	GCTTC	2	10	683795	683804	0 %	40 %	20 %	40 %	327400690
14069	NC_015320	CCT	2	6	683840	683845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327400690
14070	NC_015320	TCC	2	6	683863	683868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327400690
14071	NC_015320	TCT	2	6	683891	683896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327400690
14072	NC_015320	TTC	2	6	683975	683980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327400691
14073	NC_015320	CTC	2	6	683981	683986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327400691
14074	NC_015320	TGA	2	6	684007	684012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327400691
14075	NC_015320	ACGC	2	8	684057	684064	25 %	0 %	25 %	50 %	327400691
14076	NC_015320	TC	3	6	684073	684078	0 %	50 %	0 %	50 %	327400691
14077	NC_015320	TGCA	2	8	684094	684101	25 %	25 %	25 %	25 %	327400691
14078	NC_015320	ATT	2	6	684126	684131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327400691
14079	NC_015320	CGA	2	6	684181	684186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327400691
14080	NC_015320	TCA	2	6	684190	684195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327400691
14081	NC_015320	CAT	2	6	684295	684300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327400691
14082	NC_015320	CGT	2	6	684302	684307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327400691
14083	NC_015320	TCG	2	6	684318	684323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327400691
14084	NC_015320	TCC	2	6	684342	684347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327400691
14085	NC_015320	TAT	2	6	684377	684382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327400691
14086	NC_015320	TCGTT	2	10	684469	684478	0 %	60 %	20 %	20 %	327400691
14087	NC_015320	TCG	2	6	684528	684533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327400691
14088	NC_015320	TTG	2	6	684559	684564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327400691
14089	NC_015320	CAA	2	6	684655	684660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327400691
14090	NC_015320	CGA	2	6	684661	684666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327400691
14091	NC_015320	CTT	2	6	684689	684694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327400691
14092	NC_015320	CAA	3	9	684712	684720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327400691
14093	NC_015320	CAG	2	6	684802	684807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327400692
14094	NC_015320	CCA	2	6	684864	684869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327400692
14095	NC_015320	CTTG	2	8	684884	684891	0 %	50 %	25 %	25 %	327400692
14096	NC_015320	CCA	2	6	684934	684939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327400692
14097	NC_015320	GTG	2	6	684951	684956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327400692
14098	NC_015320	TGC	2	6	685024	685029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327400692
14099	NC_015320	CT	3	6	685108	685113	0 %	50 %	0 %	50 %	327400692
14100	NC_015320	TTCC	2	8	685159	685166	0 %	50 %	0 %	50 %	327400692
14101	NC_015320	CT	3	6	685174	685179	0 %	50 %	0 %	50 %	327400692
14102	NC_015320	TTC	2	6	685184	685189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327400692
14103	NC_015320	TCC	2	6	685206	685211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327400692
14104	NC_015320	CCT	2	6	685237	685242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327400692
14105	NC_015320	GC	3	6	685258	685263	0 %	0 %	50 %	50 %	327400692
14106	NC_015320	CGTAT	2	10	685331	685340	20 %	40 %	20 %	20 %	327400692
14107	NC_015320	TCA	2	6	685360	685365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327400692
14108	NC_015320	ATC	2	6	685490	685495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327400692
14109	NC_015320	AAC	2	6	685517	685522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327400692
14110	NC_015320	GCT	2	6	685546	685551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327400692
14111	NC_015320	CGT	2	6	685657	685662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327400692
14112	NC_015320	GCA	2	6	685683	685688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327400692
14113	NC_015320	CT	3	6	685726	685731	0 %	50 %	0 %	50 %	327400692
14114	NC_015320	TGG	2	6	685739	685744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327400692
14115	NC_015320	GCA	2	6	685826	685831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327400692
14116	NC_015320	TGT	2	6	685846	685851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327400692
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14118	NC_015320	GTG	2	6	685899	685904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327400692
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14120	NC_015320	T	6	6	685955	685960	0 %	100 %	0 %	0 %	327400693
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14234	NC_015320	A	7	7	691476	691482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14235	NC_015320	TAT	2	6	691557	691562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327400700
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14242	NC_015320	GATGC	2	10	691994	692003	20 %	20 %	40 %	20 %	327400700
14243	NC_015320	CTG	2	6	692030	692035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327400700
14244	NC_015320	TTC	2	6	692081	692086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327400700
14245	NC_015320	GAA	2	6	692121	692126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327400700
14246	NC_015320	CGT	2	6	692132	692137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327400700
14247	NC_015320	TG	3	6	692154	692159	0 %	50 %	50 %	0 %	327400700
14248	NC_015320	CCT	2	6	692183	692188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327400700
14249	NC_015320	TC	3	6	692226	692231	0 %	50 %	0 %	50 %	327400700
14250	NC_015320	CAG	2	6	692249	692254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327400700
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14252	NC_015320	GAT	2	6	692313	692318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327400700
14253	NC_015320	TGT	3	9	692414	692422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327400700
14254	NC_015320	TCT	2	6	692458	692463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327400700
14255	NC_015320	GTA	2	6	692490	692495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327400700
14256	NC_015320	ATT	2	6	692604	692609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14257	NC_015320	CA	3	6	692656	692661	50 %	0 %	0 %	50 %	327400701
14258	NC_015320	AGC	2	6	692689	692694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327400701
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14260	NC_015320	GAGG	2	8	692775	692782	25 %	0 %	75 %	0 %	327400701
14261	NC_015320	GCT	2	6	692835	692840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327400701
14262	NC_015320	TGC	2	6	692865	692870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327400701
14263	NC_015320	GGGAT	2	10	692897	692906	20 %	20 %	60 %	0 %	327400701
14264	NC_015320	GGA	2	6	692932	692937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327400701
14265	NC_015320	GGC	2	6	693013	693018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327400701
14266	NC_015320	TCA	2	6	693090	693095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14267	NC_015320	TCTT	2	8	693127	693134	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14268	NC_015320	CGCT	2	8	693191	693198	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14269	NC_015320	TCTG	2	8	693251	693258	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14270	NC_015320	CAA	2	6	693317	693322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14271	NC_015320	TTC	2	6	693349	693354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14272	NC_015320	CGG	2	6	693374	693379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14273	NC_015320	TC	3	6	693445	693450	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14274	NC_015320	TAC	2	6	693510	693515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14275	NC_015320	TGAT	2	8	693526	693533	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14276	NC_015320	TA	3	6	693541	693546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14277	NC_015320	CAAA	2	8	693551	693558	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14278	NC_015320	TAT	2	6	693561	693566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14279	NC_015320	ACT	2	6	693596	693601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327400702
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14282	NC_015320	TTG	2	6	693707	693712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327400702
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14284	NC_015320	GAC	2	6	693823	693828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327400702
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14288	NC_015320	TGC	2	6	694115	694120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327400702
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14310	NC_015320	GTT	2	6	695215	695220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327400704
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14312	NC_015320	TTA	2	6	695381	695386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14313	NC_015320	TAA	2	6	695402	695407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14314	NC_015320	TTA	2	6	695431	695436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14315	NC_015320	TGA	2	6	695494	695499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327400705
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14324	NC_015320	TCG	2	6	695909	695914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327400705
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14343	NC_015320	T	6	6	696899	696904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14344	NC_015320	ATA	2	6	696923	696928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14345	NC_015320	TTG	2	6	696986	696991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327400706
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14350	NC_015320	A	6	6	697217	697222	100 %	0 %	0 %	0 %	327400706
14351	NC_015320	GGA	2	6	697248	697253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327400706
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14353	NC_015320	CTT	2	6	697334	697339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327400707
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14358	NC_015320	GAA	2	6	697598	697603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327400707
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14361	NC_015320	CT	3	6	697766	697771	0 %	50 %	0 %	50 %	327400707
14362	NC_015320	GAA	2	6	697820	697825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327400707
14363	NC_015320	GTA	2	6	697922	697927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327400707
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14485	NC_015320	TTA	2	6	704208	704213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327400714
14486	NC_015320	CTG	2	6	704394	704399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327400714
14487	NC_015320	CTT	2	6	704427	704432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327400714
14488	NC_015320	T	6	6	704439	704444	0 %	100 %	0 %	0 %	327400714
14489	NC_015320	A	6	6	704469	704474	100 %	0 %	0 %	0 %	327400714
14490	NC_015320	TGG	2	6	704501	704506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327400714
14491	NC_015320	CGT	2	6	704514	704519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327400714
14492	NC_015320	CGATGT	2	12	704526	704537	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	327400714
14493	NC_015320	CTTT	2	8	704623	704630	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14494	NC_015320	ATT	2	6	704650	704655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327400715
14495	NC_015320	CATC	2	8	704658	704665	25 %	25 %	0 %	50 %	327400715
14496	NC_015320	A	6	6	704683	704688	100 %	0 %	0 %	0 %	327400715
14497	NC_015320	CTT	2	6	704750	704755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327400715
14498	NC_015320	TCCT	2	8	704780	704787	0 %	50 %	0 %	50 %	327400715
14499	NC_015320	TGT	2	6	704822	704827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327400715
14500	NC_015320	TCT	2	6	704881	704886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327400715

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