MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 plasmid pAspH13-3a

Total Repeats: 11717

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_015184	CGC	2	6	565588	565593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168899
11002	NC_015184	TTC	2	6	565715	565720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168899
11003	NC_015184	CGG	2	6	565746	565751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168899
11004	NC_015184	GGC	2	6	565756	565761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168899
11005	NC_015184	CAC	2	6	565772	565777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168899
11006	NC_015184	CGT	2	6	565789	565794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168899
11007	NC_015184	CG	3	6	565829	565834	0 %	0 %	50 %	50 %	325168899
11008	NC_015184	TCCAC	2	10	565887	565896	20 %	20 %	0 %	60 %	325168899
11009	NC_015184	CGG	2	6	565915	565920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168899
11010	NC_015184	GAT	2	6	565991	565996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168899
11011	NC_015184	GAA	2	6	566171	566176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168899
11012	NC_015184	ACA	2	6	566193	566198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168899
11013	NC_015184	CTC	2	6	566244	566249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325168899
11014	NC_015184	GAAG	2	8	566277	566284	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11015	NC_015184	CAT	2	6	566287	566292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168900
11016	NC_015184	CGG	2	6	566365	566370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168900
11017	NC_015184	GGGT	2	8	566461	566468	0 %	25 %	75 %	0 %	325168900
11018	NC_015184	AC	3	6	566483	566488	50 %	0 %	0 %	50 %	325168900
11019	NC_015184	GATC	2	8	566526	566533	25 %	25 %	25 %	25 %	325168900
11020	NC_015184	AAG	2	6	566705	566710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168900
11021	NC_015184	GTC	2	6	566735	566740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11022	NC_015184	TCG	2	6	566820	566825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168901
11023	NC_015184	GC	3	6	566885	566890	0 %	0 %	50 %	50 %	325168901
11024	NC_015184	TCA	2	6	566892	566897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168901
11025	NC_015184	GCA	2	6	566915	566920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168901
11026	NC_015184	ACA	2	6	566966	566971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168901
11027	NC_015184	CCT	2	6	566991	566996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325168901
11028	NC_015184	CG	4	8	567010	567017	0 %	0 %	50 %	50 %	325168901
11029	NC_015184	TGG	2	6	567023	567028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168901
11030	NC_015184	CCG	2	6	567082	567087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168901
11031	NC_015184	AGG	2	6	567093	567098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168901
11032	NC_015184	TCG	2	6	567120	567125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168901
11033	NC_015184	CAT	2	6	567154	567159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168901
11034	NC_015184	TCG	2	6	567192	567197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168901
11035	NC_015184	ATC	2	6	567218	567223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168901
11036	NC_015184	GCC	2	6	567285	567290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168901
11037	NC_015184	GTT	3	9	567392	567400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168901
11038	NC_015184	GC	3	6	567411	567416	0 %	0 %	50 %	50 %	325168901
11039	NC_015184	TCG	2	6	567465	567470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168901
11040	NC_015184	GCC	2	6	567488	567493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168901
11041	NC_015184	GGA	2	6	567538	567543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325168901
11042	NC_015184	GC	3	6	567659	567664	0 %	0 %	50 %	50 %	325168901
11043	NC_015184	ATC	2	6	567671	567676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168901
11044	NC_015184	GTC	2	6	567680	567685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168901
11045	NC_015184	GTT	2	6	567743	567748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168901
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11047	NC_015184	CG	3	6	567800	567805	0 %	0 %	50 %	50 %	325168901
11048	NC_015184	TTG	2	6	567987	567992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168902
11049	NC_015184	CGA	2	6	568042	568047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168902
11050	NC_015184	GCC	2	6	568091	568096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168902
11051	NC_015184	CGT	2	6	568109	568114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168902
11052	NC_015184	GCCT	2	8	568124	568131	0 %	25 %	25 %	50 %	325168902
11053	NC_015184	GGA	2	6	568285	568290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11054	NC_015184	AT	3	6	568310	568315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11055	NC_015184	TTGA	2	8	568354	568361	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11056	NC_015184	TAA	2	6	568510	568515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11057	NC_015184	CCT	2	6	568592	568597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11058	NC_015184	TTC	2	6	568754	568759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168903
11059	NC_015184	CGC	2	6	569075	569080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168903
11060	NC_015184	GTC	2	6	569097	569102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168903
11061	NC_015184	CTG	2	6	569111	569116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168903
11062	NC_015184	TTG	2	6	569169	569174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168903
11063	NC_015184	GAAT	2	8	569190	569197	50 %	25 %	25 %	0 %	325168903
11064	NC_015184	GGC	3	9	569229	569237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168903
11065	NC_015184	CCG	2	6	569326	569331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168903
11066	NC_015184	TCGA	2	8	569350	569357	25 %	25 %	25 %	25 %	325168903
11067	NC_015184	CAG	2	6	569384	569389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168903
11068	NC_015184	AGCGA	2	10	569402	569411	40 %	0 %	40 %	20 %	325168903
11069	NC_015184	TCG	3	9	569504	569512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168903
11070	NC_015184	GAC	2	6	569537	569542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168903
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11072	NC_015184	CGAA	2	8	569754	569761	50 %	0 %	25 %	25 %	325168903
11073	NC_015184	CGA	2	6	569903	569908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168903
11074	NC_015184	GC	3	6	569930	569935	0 %	0 %	50 %	50 %	325168903
11075	NC_015184	ACC	2	6	569940	569945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168903
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11079	NC_015184	GCCC	2	8	570167	570174	0 %	0 %	25 %	75 %	325168903
11080	NC_015184	TCGA	2	8	570181	570188	25 %	25 %	25 %	25 %	325168903
11081	NC_015184	CCA	2	6	570190	570195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168903
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11084	NC_015184	CAA	2	6	570383	570388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168903
11085	NC_015184	CCAG	2	8	570390	570397	25 %	0 %	25 %	50 %	325168903
11086	NC_015184	GCC	2	6	570402	570407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168903
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11088	NC_015184	GCC	2	6	570504	570509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168903
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11090	NC_015184	CCA	2	6	570565	570570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168903
11091	NC_015184	TTA	3	9	570622	570630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325168903
11092	NC_015184	CCG	2	6	570665	570670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168903
11093	NC_015184	CAG	2	6	570702	570707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168903
11094	NC_015184	TGC	2	6	570908	570913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168903
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11100	NC_015184	GTT	2	6	571293	571298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168903
11101	NC_015184	TTGCCG	2	12	571315	571326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168903
11102	NC_015184	TGG	2	6	571340	571345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168903
11103	NC_015184	CCG	2	6	571351	571356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168903
11104	NC_015184	GCC	2	6	571383	571388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168903
11105	NC_015184	GTC	2	6	571432	571437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168903
11106	NC_015184	TCGA	2	8	571543	571550	25 %	25 %	25 %	25 %	325168903
11107	NC_015184	GTT	2	6	571605	571610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168903
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11109	NC_015184	GGC	2	6	571690	571695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168903
11110	NC_015184	GAT	2	6	571708	571713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168903
11111	NC_015184	GAC	2	6	571747	571752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168903
11112	NC_015184	GCAG	2	8	571764	571771	25 %	0 %	50 %	25 %	325168903
11113	NC_015184	A	8	8	571787	571794	100 %	0 %	0 %	0 %	325168903
11114	NC_015184	CACCC	2	10	571863	571872	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
11115	NC_015184	TAGC	2	8	571979	571986	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11116	NC_015184	A	6	6	572002	572007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11117	NC_015184	GGC	2	6	572014	572019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11118	NC_015184	GTC	3	9	572055	572063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11119	NC_015184	CTC	2	6	572072	572077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11120	NC_015184	CGGG	2	8	572109	572116	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11121	NC_015184	CGC	2	6	572169	572174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11122	NC_015184	GC	3	6	572212	572217	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11123	NC_015184	GGC	2	6	572362	572367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11124	NC_015184	TCT	2	6	572393	572398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11125	NC_015184	AGC	2	6	572410	572415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11127	NC_015184	CAGT	2	8	572460	572467	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11128	NC_015184	GT	3	6	572466	572471	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11129	NC_015184	TCTCG	2	10	572558	572567	0 %	40 %	20 %	40 %	325168904
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11243	NC_015184	CCG	2	6	577675	577680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168910
11244	NC_015184	TGG	2	6	577731	577736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168911
11245	NC_015184	GTCC	2	8	577845	577852	0 %	25 %	25 %	50 %	325168912
11246	NC_015184	CGA	2	6	577869	577874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168912
11247	NC_015184	CGG	2	6	577897	577902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168912
11248	NC_015184	TCGA	2	8	577907	577914	25 %	25 %	25 %	25 %	325168912
11249	NC_015184	GCC	2	6	577918	577923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168912
11250	NC_015184	CGT	2	6	577938	577943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168912
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11253	NC_015184	ATC	2	6	578036	578041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168912
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11261	NC_015184	GCA	2	6	578214	578219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168912
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11264	NC_015184	TCG	2	6	578607	578612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168914
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11269	NC_015184	TGT	2	6	578842	578847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11270	NC_015184	GCAAGG	2	12	578859	578870	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11271	NC_015184	CTTGC	2	10	578881	578890	0 %	40 %	20 %	40 %	325168915
11272	NC_015184	TAGCG	2	10	578894	578903	20 %	20 %	40 %	20 %	325168915
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11274	NC_015184	GCT	2	6	579047	579052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168915
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11277	NC_015184	GAGCA	2	10	579180	579189	40 %	0 %	40 %	20 %	325168915
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11281	NC_015184	ATC	2	6	579280	579285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11284	NC_015184	CGAAA	2	10	579520	579529	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
11285	NC_015184	AGC	2	6	579560	579565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11295	NC_015184	GCAA	2	8	579950	579957	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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11300	NC_015184	CAAT	2	8	580150	580157	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11301	NC_015184	TCG	2	6	580326	580331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11303	NC_015184	ATG	2	6	580391	580396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11322	NC_015184	TCAG	2	8	581323	581330	25 %	25 %	25 %	25 %	325168918
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11334	NC_015184	TC	3	6	581842	581847	0 %	50 %	0 %	50 %	325168919
11335	NC_015184	CCG	2	6	581861	581866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168919
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11338	NC_015184	CAT	2	6	581932	581937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168919
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11340	NC_015184	TTC	2	6	581978	581983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325168919
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11342	NC_015184	GCA	2	6	582175	582180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168919
11343	NC_015184	TCC	2	6	582195	582200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325168919
11344	NC_015184	CAT	2	6	582244	582249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168919
11345	NC_015184	T	6	6	582355	582360	0 %	100 %	0 %	0 %	325168919
11346	NC_015184	CAC	2	6	582455	582460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168919
11347	NC_015184	CCACG	2	10	582494	582503	20 %	0 %	20 %	60 %	325168919
11348	NC_015184	CGG	2	6	582505	582510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168919
11349	NC_015184	GTC	2	6	582585	582590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168919
11350	NC_015184	AC	3	6	582616	582621	50 %	0 %	0 %	50 %	325168919
11351	NC_015184	GC	3	6	582638	582643	0 %	0 %	50 %	50 %	325168919
11352	NC_015184	CTG	2	6	582701	582706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168919
11353	NC_015184	TGT	2	6	582728	582733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168919
11354	NC_015184	GAC	2	6	582809	582814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168919
11355	NC_015184	GCC	2	6	582896	582901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168919
11356	NC_015184	CTGC	2	8	582932	582939	0 %	25 %	25 %	50 %	325168919
11357	NC_015184	CT	3	6	583031	583036	0 %	50 %	0 %	50 %	325168919
11358	NC_015184	GAA	2	6	583118	583123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325168919
11359	NC_015184	ATA	2	6	583151	583156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325168919
11360	NC_015184	GGCG	2	8	583195	583202	0 %	0 %	75 %	25 %	325168919
11361	NC_015184	GCA	2	6	583272	583277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168919
11362	NC_015184	CAT	2	6	583304	583309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168919
11363	NC_015184	GGT	2	6	583331	583336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168919
11364	NC_015184	CGA	2	6	583348	583353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168919
11365	NC_015184	CTC	2	6	583400	583405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325168919
11366	NC_015184	GCC	2	6	583719	583724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168919
11367	NC_015184	GCC	2	6	583760	583765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325168919
11368	NC_015184	CGA	2	6	583855	583860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168919
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11370	NC_015184	GTCG	2	8	583969	583976	0 %	25 %	50 %	25 %	325168919
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11402	NC_015184	CAGT	2	8	585473	585480	25 %	25 %	25 %	25 %	325168920
11403	NC_015184	GCCGC	2	10	585542	585551	0 %	0 %	40 %	60 %	325168920
11404	NC_015184	AGCG	2	8	585555	585562	25 %	0 %	50 %	25 %	325168920
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11408	NC_015184	TGG	2	6	585719	585724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168920
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11431	NC_015184	GCCG	2	8	586654	586661	0 %	0 %	50 %	50 %	325168921
11432	NC_015184	AGC	2	6	586686	586691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168921
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11457	NC_015184	ACG	2	6	587866	587871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168921
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11463	NC_015184	CGT	2	6	588141	588146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168921
11464	NC_015184	GAC	2	6	588179	588184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168921
11465	NC_015184	GTTCA	2	10	588248	588257	20 %	40 %	20 %	20 %	325168922
11466	NC_015184	CCA	2	6	588265	588270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168922
11467	NC_015184	AT	3	6	588319	588324	50 %	50 %	0 %	0 %	325168922
11468	NC_015184	ATC	2	6	588389	588394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168922
11469	NC_015184	TCC	2	6	588411	588416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325168922
11470	NC_015184	GA	3	6	588436	588441	50 %	0 %	50 %	0 %	325168922
11471	NC_015184	GTC	2	6	588446	588451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168922
11472	NC_015184	GCGG	2	8	588468	588475	0 %	0 %	75 %	25 %	325168922
11473	NC_015184	GTC	2	6	588476	588481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168922
11474	NC_015184	CAT	2	6	588533	588538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168922
11475	NC_015184	GGAT	2	8	588612	588619	25 %	25 %	50 %	0 %	325168922
11476	NC_015184	GCG	2	6	588646	588651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325168922
11477	NC_015184	GTAGCT	2	12	588683	588694	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	325168922
11478	NC_015184	ATCG	2	8	588731	588738	25 %	25 %	25 %	25 %	325168922
11479	NC_015184	AG	3	6	588974	588979	50 %	0 %	50 %	0 %	325168922
11480	NC_015184	TCGA	2	8	588981	588988	25 %	25 %	25 %	25 %	325168922
11481	NC_015184	CAA	2	6	589009	589014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325168922
11482	NC_015184	CTG	2	6	589040	589045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168922
11483	NC_015184	GTT	2	6	589059	589064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168922
11484	NC_015184	GCA	2	6	589098	589103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168922
11485	NC_015184	TGC	2	6	589123	589128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168922
11486	NC_015184	GCT	3	9	589160	589168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168922
11487	NC_015184	AT	3	6	589170	589175	50 %	50 %	0 %	0 %	325168922
11488	NC_015184	GGT	3	9	589217	589225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325168922
11489	NC_015184	GTC	2	6	589235	589240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168922
11490	NC_015184	AGT	2	6	589517	589522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325168922
11491	NC_015184	TGT	2	6	589562	589567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325168922
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11493	NC_015184	TCA	2	6	589581	589586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325168922
11494	NC_015184	CCA	2	6	589674	589679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325168922
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11498	NC_015184	GAC	2	6	589985	589990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325168922
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11500	NC_015184	CGT	2	6	590065	590070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325168922

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